Seminar_6 (1117062)
Текст из файла
Семинар 6
Мультистационарные системы. Триггер. Силовое и параметрическое переключение триггера. Конкуренция. Отбор одного из двух равноправных видов. Генетический триггер Жакоба и Моно.
Мультистационарная система – система, имеющая несколько стационарных состояний.
Триггерная система – система, имеющая два или более устойчивых стационарных состояния, между которыми возможен переход.
Слово триггер означает переключатель. Как в терминах кинетической модели можно переключить триггер из одного в другое стационарное состояние?
Силовой способ переключения триггера (специфический) – переход системы из области действия одного аттрактора в область действия другого за счёт действия внешних сил на переменные системы.
Параметрический способ переключения триггера (неспецифический) – параметры системы изменяются таким образом, что в фазовом портрете системы остаётся только одна особая точка, в которую эта система и переходит.
Бифуркация – изменение фазового портрета системы, количества предельных множеств и их устойчивости.
Точка бифуркации (критическая точка) – значение параметров системы, при которых она меняет своё поведение.
Уравнения конкуренции
Уравнения конкуренции имеют вид:
Здесь параметры ai ‑ константы собственной скорости роста видов, ci – константы самоограничения численности (внутривидовой конкуренции), bij – константы взаимодействия видов, (i, j = 1, 2).
Введем безразмерные переменные:
Заменой переменных система приводится к виду:
Генетический триггер Жакоба и Моно
Схема взаимной регуляции двух систем синтеза ферментов изображена на рис. 9.1. Ген-регулятор каждой системы синтезирует неактивный репрессор. Этот репрессор, соединяясь с продуктом противоположной системы, образует активный комплекс, который обратимо реагируя с участком структурного гена, называемым опероном, блокирует синтез мРНК. Таким образом, продукт первой системы P1 является корепрессором второй системы, а продукт второй системы P2 – корепрессором первой. При этом в процессе корепрессии могут принимать участие одна, две и более молекул продукта.
Рис. 9.1. Схема синтеза двух ферментов по Жакобу и Моно.
При таком характере взаимодействий при интенсивной работе первой системы вторая заблокирована, и наоборот. Простейшая система уравнений, описывающая такой тип взаимодействий, имеет вид
Здесь P1, P2 - концентрации продуктов, величины A1, A2, B1, B2 – параметры, отражающие скорость прироста каждого из продуктов, q1, q2 – константы скорости оттока продуктов из сферы реакции. Показатель степени m показывает, сколько молекул активного репрессора (соединений молекул продукта с молекулами неактивного репрессора, который предполагается в избытке) соединяются с опероном для блокировки синтеза мРНК.
Для упрощения исследования, предположим, что q1 = q2 = q. Введем безразмерные переменные:
Опустив штрих у времени, перепишем систему в безразмерном виде:
Задание
1. Исследование модели конкуренции видов:
Изоклины горизонтальных касательных: ,
.
Изоклины вертикальных касательных: ,
.
1.1. Определение характера фазового портрета при разных значений коэффициентов межвидовой конкуренции b (при a = 1).
Определите типы особых точек при следующих значениях параметра b:
I | II | III | IV | режим существования видов | |
b = 0.5 | λ1 = 1 λ2 = 1 тип: | λ1 = 0.5 λ2 = -1 тип: | λ1 = 0.5 λ2 = -1 тип: | λ1 = -0.33 λ2 = -1 тип: | |
b = 2 | λ1 = 1 λ2 = 1 тип: | λ1 = -1 λ2 = -1 тип: | λ1 = -1 λ2 = -1 тип: | λ1 = 1 λ2 = 1 тип: |
Для каждого значения параметра b определите один из режимов существования видов:
1) выживает вид X;
2) выживает вид Y;
3) устойчивое сосуществование двух видов;
4) выживаемость вида зависит от начальных условий.
5) бифуркация.
Отметьте на каждой фазовой плоскости изоклины вертикальных и горизонтальных касательных, типы особых точек.
Для каждого случая укажите режим существования видов.
Укажите, какой из двух случаев является триггером.
Поместите изображающую точку в одно из устойчивых состояний триггера.
Нарисуйте путь переключения триггера.
1.2. Исследование характера фазового портрета для разных значений коэффициентов межвидовой конкуренции b при разных соотношениях констант скорости роста a.
I | II | III | IV | режим существования видов | |
λ1 = 1 λ2 = 0.3 тип: | λ1 = 0.4 λ2 = -0.3 тип: | λ1 = -1.7 λ2 = -1 тип: | |||
λ1 = 1 λ2 = 0.5 тип: | λ1=0 λ2=-0.5 тип: | λ1=-1.5 λ2=-1 тип: | λ1=-0.5 λ2= 0 тип: | ||
λ1 = 1 λ2 = 1 тип: | λ1=-1 λ2=-1 тип: | λ1=-1 λ2=-1 тип: | λ1=0.33 λ2=-1 тип: | ||
λ1 = 1 λ2 = 1.5 тип: | λ1=-2 λ2=-1.5 тип: | λ1=-0.5 λ2=-1 тип: | λ1=0.3 λ2=-1.13 тип: | ||
λ1 = 1 λ2 = 2 тип: | λ1=-3 λ2=-2 тип: | λ1=0 λ2=-1 тип: | λ1=-1 λ2=0 тип: | ||
λ1 = 1 λ2 = 2.5 тип: | λ1=-4 λ2=-2.5 тип: | λ1=0.5 λ2=-1 тип: |
Для каждого значения параметра a определите один из режимов существования видов:
1) выживает вид X;
2) выживает вид Y;
3) устойчивое сосуществование двух видов;
4) выживаемость вида зависит от начальных условий.
5) бифуркация.
Отметьте на каждой фазовой плоскости типы особых точек. Для каждого случая укажите режим существования видов.
I | II | III | IV | режим существования видов | |
λ1 = 1 λ2 = 0.3 тип: | λ1=0.85 λ2=-0.3 тип: | λ1=-0.2 λ2=-1 тип: | |||
λ1 = 1 λ2 = 0.5 тип: | λ1=0.75 λ2=-0.5 тип: | λ1=0 λ2=-1 тип: | λ1=-1 λ2=0 тип: | ||
λ1 = 1 λ2 = 1 тип: | λ1=0.5 λ2=-1 тип: | λ1=0.5 λ2=-1 тип: | λ1=-1 λ2=-0.33 тип: | ||
λ1 = 1 λ2 = 1.5 тип: | λ1=0.25 λ2=-1.5 тип: | λ1=1 λ2=-1 тип: | λ1=-1.43 λ2=-0.23 тип:л | ||
λ1 = 1 λ2 = 2 тип: | λ1=0 λ2=-2 тип: | λ1=1.5 λ2=-1 тип: | λ1=-2 λ2=0 тип: | ||
λ1 = 1 λ2 = 2.5 тип: | λ1=-0.25 λ2=-2.5 тип: | λ1=2 λ2=-1 тип: |
Для каждого значения параметра a определите один из режимов существования видов:
Характеристики
Тип файла документ
Документы такого типа открываются такими программами, как Microsoft Office Word на компьютерах Windows, Apple Pages на компьютерах Mac, Open Office - бесплатная альтернатива на различных платформах, в том числе Linux. Наиболее простым и современным решением будут Google документы, так как открываются онлайн без скачивания прямо в браузере на любой платформе. Существуют российские качественные аналоги, например от Яндекса.
Будьте внимательны на мобильных устройствах, так как там используются упрощённый функционал даже в официальном приложении от Microsoft, поэтому для просмотра скачивайте PDF-версию. А если нужно редактировать файл, то используйте оригинальный файл.
Файлы такого типа обычно разбиты на страницы, а текст может быть форматированным (жирный, курсив, выбор шрифта, таблицы и т.п.), а также в него можно добавлять изображения. Формат идеально подходит для рефератов, докладов и РПЗ курсовых проектов, которые необходимо распечатать. Кстати перед печатью также сохраняйте файл в PDF, так как принтер может начудить со шрифтами.