Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1143463), страница 24

Файл №1143463 Диссертация (Метод доминантного параметра в моделировании и анализе динамики биологических осцилляторов) 24 страницаДиссертация (1143463) страница 242019-06-23СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 24)

Здесь же есть смысл задаться обратным во­просом: различимы ли динамические паттерны, генерируемыми этой ми­нимальной сетью, на фоне больших гиппокампальных сетей? Многочис­ленные эксперименты в областях гиппокампа CA1 и CA3 однозначноподтверждают существование всех описанных колебательных состояний:гамма, тета и тета-гамма [166, 173, 281]. Кроме того, метод направленно­го поперечного сечения invitroв гиппокампе позволил выделить паттер­ны: в продольном сечении в основном реализуется тета-ритм, тогда какколебания гамма и тета-гамма типичны для поперечных и “средних” (такназываемых корональных) срезов.

Это связано с морфологией участвую­щих нейронов. Нейроны являются довольно протяженными (обла­дают разветвленной дендритной структурой) в основном в продольномнаправлении. В продольных срезах синаптическая связь этих клеток кпирамидальной и корзинчатой клеткам усвеличивается, что приводит ксинхронному тета-ритму в области CA3, см. [166, 167, 173].

В другихнаправлениях разветвление гораздо менее выражено; следовательно, от­носительное влияние нейронов становится слабее, и в основномнаблюдаются гамма и тета-гамма колебания, вызванные взаимодействи­ем пирамидальных и корзинчатых нейронов.Другие типы клеток способствуют формированию и поддержанию169ритмических паттернов: список, указанный в [285], содержит по мень­шей мере 21 класс ингибирующих интернейронов, которые участвуютв создании различных режимов. Любой из них может быть частью ми­нимального модуля.

Однако высокая синхронность между ингибиторны­ми интернейронами, ответственными за гамма-ритм [153, 173] позволя­ет ограничить моделирование только одним типом: мы выбрали корзин­чатые нейроны, взаимодействие которых с пирамидальными клеткамихорошо исследовано экспериментально. При добавлении нейронов OLM,которые необходимы для генерации тета-ритма, мы получаем только тритипа нейронов в модуле.Как такие малые модули взаимодействуют друг с другом в крупно­масштабной сети? Какие клетки опосредуют взаимодействия? Какой типсоединения -возбуждающее или ингибирующее – следует учитывать? Сточки зрения морфологических свойств, кратко изложенных выше, пред­ставляется правдоподобным, что модули обмениваются данными друг сдругом через разветвленную структуру .

Пирамидальные и кор­зинчатые клетки, как было показано, в основном участвуют в синхро­низированных гамма-колебаниях в локальных модулях [173]. В рамкахэтой гипотезы клетки -модуля могут ингибировать пирамидальныеклетки в соседних модулях [167]. Что касается взаимодействия между и корзинчатыми нейронами (ингибиторными интернейронами) вбольших сетях, то здесь еще не накоплено достаточно большого экспери­ментального материала.Пространственно-временные динамические паттерны в больших се­тях зависят от силя связи между модулями.

Для случая сильной свя­зи существует экспериментальные данные фазовых тета-волн [286]. На­против, средние значения связи приводят к пространственно-временнымгамма-колебаниям, которые модулируют медленные тета-ритмы (класте­170ры) [287]. Примечательно, что такие паттерны чувствительны к фазово­му сдвигу между нейронами .

Наконец, если взаимодействие до­статочно слабое, модули колеблются независимо друг от друга. В этомслучае, ритмы, найденные в одном модуле, сохраняются и присутствиесоседей приводит в основном к сдвигу переходов между ними.МультистабильностьГистерезисные свойства, сходные с описанным эффектом мульти­стабильности, были зарегистрированы в экспериментах с субталамиче­скими нейронами[288]. В этих экспериментах приложение различныхтоков смещения и смещение базового мембранного потенциала приводи­ли к возникновению таких разных режимов, как регулярные колебания,берстовые режимы (похожи на тета-гамма) или стационарное состояние.Согласно экспериментальным данным, мультистабильность может кон­тролироваться динамикой ионных каналов[288].

В приведенной моде­ли деполяризация исходного мембранного потенциала медленных клетокприводит сначала к режиму тета-гамма, но более сильная деполяризацияпереключает последний на чистые тета-колебания.Насколько известно, мультистабильность обсуждаемого типа еще незарегистрирована экспериментально в гиппокампальной области CA3 ине предсказывалась еще теоретически. Таким образом, представленныерезультаты в этой части служат гипотезой, предлагаемой для дальней­шей экпериментальной проверки на основе техник, при помощи которых,в частности были экспериментально обнаружены [289] метастабильныесостояния на больших участках CA3, относящихся к чередованию актив­ности различных групп нейронов.Переходы между ритмами могут быть связаны с физиологическимсостоянием клетки.

Известно, что нейроны обладают двумя кон­кретными ионными токами ответственными за включение тета-ритма171[166, 290]. Один из этих токов активируется сильной гиперполяризацией,тогда как другой, в свою очередь, включается деполяризацией. Эти со­стояния соответствуют верхней и нижней полосам в левой панели на рис.4.9, поэтому в соответствующих диапазонах потенциалов и существуеттета-режим. Для начальных условий из «средней» полосы эти токи низ­кой интенсивности, следовательно тета-ритм не может развиваться, авместо этого наблюдается тета-гамма-ритм.

Эта интерпретация, конеч­но, также требует дальнейшего экспериментального тестирования.4.3. Упрощенная дискретная модель переключениярежимов в минимальном модулегиппокампальной нейросетиНесмотря на то, что описанное выше выделение модуля, обеспе­чивающего воспроизведение переключений между тета- тета-гамма игамма-режимами на основе системы синаптически связанных осцилля­торов ФитцХью-Нагумо, позволило сделать выводы как о необходимойи достаточной минимальности структуры связанных нейронов, так и одоминантной роли синаптической связи между ними, можно поставитьдальнейшую задачу выделения единственного доминантного параметра,который может контролировать подобный тип динамики. При этом бо­лее перспективным представляется дискретный подход, более упрощен­ный по сравнению системой существенно нелинейных дифференциаль­ных уравнений, содержащих, вдобавок, целый набор подгоночных кон­стант.172Рис.

4.10:Сеть, представляющая изучаемую систему дискретных активных эле­ментов. Кружки обозначают нейроны с их аббревиатурами, помещенными внутри;линии показывают активаторные (+) и ингибиторные (-) направленые связи. Обо­значения: Е- пирамидальная клетка, I1 , I2 -корзинчатые клетки, O1 , O2 - медленныеклетки.4.3.1. Дискретная модель и ее функционированиеДля моделирования переключений гиппокампальных ритмов рас­сматривается минимальная сеть, показанная на рис. 4.10, постороеннаяна следующих биофизических предпосылках: i) O-клетки ( -клетки)являются независимыми осцилляторами и активируются пирамидаль­ными нейронами – E-клетками; ii) колебания мембранного потенциалаЕ-клеток зависят от приложенного тока, а также ингибирования О-клет­ками и корзинчатыми неройнами – I-клетками; iii) фазовый сдвиг междуО-клетками и период их колебаний зависит от полного вклада всех си­наптических связей между клетками; iv) I-клетки – автоколебательныеосцилляторы, ингибирующие друг друга.В результате, динамика всех использованных типов клеток моде­лируется системой отображений, каждая итерация которых обозначенаиндексом .173Дискретное уравнение для Е-клетокСпайки Е-клеток зависят от потенциала на предыдущем шаге дис­кретных итераций ( − 1), от шагового возрастания потенциалаrи отингибирования О- и I-клетками.Ингибирование О- и I-клетками моделируется “суммой мембранныхпотенциалов” I-клеток с временной (дискретно-шаговой) задержкой (1 ( − ), 1 ( − )) и потенциалом О-клетки на предыдущем шаге.Следует также иметь в виду, что спайк второй О-клетки сдвинут отно­сительно первой на Δ.Чтобы принять во внимание тот факт, что влияние О-клеток ведет кингибированию Е-клеток в комплексе с I-клетками, вводится множитель1 ( − ) / , равный единице только при наличии спайка I-клеток,и равный нулю в противном случае.

() = ( − 1) + Δ−1 ( − 1)[1 ( − 1) + 2 ( − 1) − (1 ( − 1) + 2 ( − 1 − Δ))] (4.3)Рис. 4.11 поясняет, как параметры модели определяются непосред­ственно на основе экспериментальных данных, представленных в работе[166]. Так как основная задача рассматриваемого нового подхода состо­ит в воспроизведении периода и типа колебаний при различных услови­ях, схема, реализуемая уравнением 4.3 содержит дискретные, но реаль­но измеримые величины: амплитуду спайка, амплитуду гиперполяриза­ции, и период межспайкого интервала для Е-клеток. В силу дискретно­сти модели, воспроизведение формы колебаний находится за пределами174Рис.

4.11:Диаграмма, показывающая взаимосвязь наблюдаемых величин (мини­мальный и максимальный потенциал, а также период колебаний Е-клеток) и пара­метров модели.внимания. Как следствие, рост потенциала от минимального значения(min( )) до максимального (max( )) рассматривается как линейноеотображение () = ( − 1) + 0 . Отношение длин сторон (разницымаксимального и минимального потенциалов, являющейся стандартнойхарактеристикой нейрона, и измеримого периода колебаний) прямоуголь­ного треугольника, изображающего это отображение, автоматически да­ет искомую скорость роста 0 .

Экперименты показывают также, что пе­риод и фазовый сдвиг между спайками Е-клеток Δ коррелированы.В результате, параметр окончательно определяется путем линейногокорреляционного анализа наборов экспериментальных данных.Третий член в уравнении 4.3 описывает процесс реполяризации всилу ингибирования со стороны I- и О-клеток. Эта петля обратной связиорганизована путем связи, заданной уравнением (4.4) ниже. Последнееутверждает, что I-клетка дает спайк, когда потенциал Е-клетки достига­ет своего максимума, или, более точно, в ходе последующей итерации.

В175то же самое время, так как шаги итераций дискретны, а наклон линиипромежуточного потенциала не есть рациональная дробь, вводится опре­деленный зазор, расширяющий Δ = на малую феноменологическуюпоправку = 0.1, что обеспечивает большую устойчивость вычислений.Наконец, оставшиеся параметры и выбраны таким образом, что­бы интервалы изменения потенциала О- и I-клеток, а также значениереполяризации за счет их вычитания из потенциала Е-клеток, согласо­вывались с экспериментальными интервалами данных.Дискретное уравнение для I-клеток⎫1 () = , ⎬2 () = ⎭orif < ( − 1) < + (1 + )⎫1 () = 1 ( − 1) − 2 ( − 1), ⎬2 () = 2 ( − 1) − 1 ( − 1) ⎭otherwise.(4.4)(4.5)Уравнения (4.4) и Eq. (4.5) описывают возбуждение I-клеток и ихвзаимное ингибирование; оно выражено как разность потенциалов напредыдущем шаге. Множитель 1+, на который умножен параметр вве­ден для корректировки малых погрешностей, возникающих вследствиеразмера дискретных шагов временных итераций.Дискретное уравнение для О-клеток⎫1 ()= , ⎬2 ( − Δ) = ⎭if () < ( − 1)&first event176(4.6)и⎫1 () = 1 ( − ), ⎬2 () = 2 ( − ) ⎭otherwise.(4.7)Уравнение (4.6) описывает возбуждение О-клеток при первом паде­нии потенциала при прохождении спайка , что выражается условием () < ( − 1).

Вторая клетка дает спайк с фазовым сдвигом Δ,что выражается условием 2 ( − Δ) ̸= 0.Уравнение (4.7) описывает осциллятор, совершающий автоколеба­ния: после первого спайка, его текущее состояние есть простое устойчи­вое повторение его же состояния за интераций до того.Реализация численного моделированияЧисленное моделирование динамики на основе сформулированныхуравнений (4.3)–(4.7) осуществлялось на основе алгоритма простых ите­раций, реализованных на языке MATLAB. Для того, чтобы избежать за­труднений с условиями задержки в (4.3) и (4.7), первые + Δ + 1 всехмассивов были заполнены нулями, в результате чего первый временнойшаг выходных данных, определяемых динамикой системы, соответствуетвнутреннему номеру = + Δ + 1 элементов программного массива.Параметры , , , , соответствуют значению параметров опре­деленных экспериментальноin vitro(амплитуда и период колбаний) дляиндивидуальных клеток [166] и фиксированы.

Характеристики

Список файлов диссертации

Свежие статьи
Популярно сейчас
Почему делать на заказ в разы дороже, чем купить готовую учебную работу на СтудИзбе? Наши учебные работы продаются каждый год, тогда как большинство заказов выполняются с нуля. Найдите подходящий учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6384
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее