Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1097599), страница 21

Файл №1097599 Диссертация (Компьютерные методы системной биологии в персонализированной лекарственной онкотерапии) 21 страницаДиссертация (1097599) страница 212019-03-13СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 21)

5-6.С целю подтверждения ингибирующего действия трастузумаб и пертузумабна разных стадиях роста опухоли было проведено сравнение теоретическихрасчетов (Рис. 5-5) с in vitro экспериментальными данными, измеренными наклеточных популяциях в течении 1 часа, когда в клетках не наблюдаетсясильного изменения экспрессии рецепторов. Эксперименты были проведены наклетки рака молочной железы MCF7 c соотношением ErbB3/ErbB2 1 и наклетках MCF7-HER2-18 c повышенной экспрессией ErbB2 рецепторов (клеткитрансфецированные ErbB2 геном). Результаты сравнения теоретических иэкспериментальных результатов показали, что пертузумаб эффективен в MCF7клетках и проявляет слабое ингибирующее действие для MCF7-HER2-18 клеток,в то время как трастузумаб проявляет ингибирующую активность в MCF7-HER218 клетках и мало эффективен для MCF7 клеток (Рис.

5-6С,D).На основе проведенных исследований можно сформулировать следующиевыводы. Метод компьютерного моделирования применен для исследованияэффекта репрограммирования клеточных сигнальных путей в результатедействия антираковых ЛП, ингибиторов клеточных рецепторов. В результатебиоинформационного анализа экспрессии более 10000 генов было показано, чтодействие ЛП вызывает активацию дополнительных сигнальных путей,приводящих к компенсации ингибирующего действия лекарства, направленногона подавления сигнальных путей, которые проявляют ингибирующуюактивность на начальной стадии терапии.

Метод применен к исследованию138действия ЛП трастузумаба, эффективного ингибитор клеточной пролиферации враковых клетках с высоким уровнем экспрессии ErbB2 рецепторов. При анализеклеток SKOV3 опухоли ксенотрансплантатных мышей с повышенным уровнемэкспрессии было обнаружено, что трастузумаб вызывает повышение экспрессиюErbB3 рецепторов, что приводит к дополнительной активации AKT и ERKсигналовпролиферациииподавлениюдействияЛП.Врезультатекомпьютерного моделирования зависимости эффективности трастузумаба ипертузумаба от соотношения клеточных рецепторов ErbB3/ErbB2 предложенмеханизм преодоления приобретенной резистентности путем комбинационнойтерапии. В работе показано, что синергетическое действие трастузумаба ипертузумаба на сигналы пролиферации клеток SKOV3 рака яичников сповышенной экспрессией ErbB2 рецепторов, обусловлено эффективнымингибированием pERK сигнала пролиферации клеток при изменении экспрессииErbB3рецептора,препаратов.индуцированногоЭффективностьданнойдействиемкомбинацииданныхлекарственныхопределяетсявысокойэффективностью трастузумаба при повышенной экспрессии ErbB2 рецепторов вначале роста опухоли.

Потеря эффективности трастузумаба происходит привозрастании экспрессии ErbB3 рецепторов в результате действия ЛП. В своюочередь, эффективность пертузумаба повышается при возрастании экспрессииErbB3 рецепторов, вызванной действием ЛП. При этом экспрессия ErbB3рецепторов является биомаркером эффективного действия пертузумаба. Такимобразом, комбинация трастузумаба и пертузумаба проявляет высокуюактивность как при повышенной экспрессии ErbB2 рецепторов, котораянаблюдается в начале роста опухоли, так и при возрастании концентрации ErbB3рецепторов, вызванной длительным действием ЛП.139Глава 6. Биомаркеры действия ингибиторов протеин-киназ прионкомутациях в PI3K сигнальной системе опухолевых клетокВ данной главе разработанная модель применяется к исследованиюэффективности действия одиночных и комбинированных ингибиторов протеинкиназ в PI3K/AKT/mTOR/S6K1 сигнальном пути (Рис.

1). В модели рассмотреныответы сигнальной сети на действия следующих ЛП: 1) ингибитора комплексаmTOR1, рапамицина; 2) ингибитора PI3K, LY294002; и 3) ингибитора двойногодействия, BEZ-235, ингибирующего комплексы mTOR1,2 и PI3K (Рис. 6-1).Проведено сравнение действий указанных ингибиторов в зависимости отмутаций в PI3K/AKT/ mTOR/S6K1 сигнальном пути для двух линий раковыхклеток яичников: в PE04 клетках без обнаруженных мутаций и A2780 клетках, вкоторой обнаружены точечных мутаций и делеции участка PTEN гена (Saito et alInt.

J. Cancer: 85, 160, 2000).Результаты моделирования действия рапамицина, LY294002 и BEZ-235 наактивацию основных сигнальных белков Ras/Raf/ERK и PI3K/AKT/mTOR/S6K1сигнальных путей в PE04 и A2780 клетках показаны на Рис. 6-1 – 6-6.Методамикомпьютерногомоделированияустановлено,чтодействиеингибиторов киназ определяется наличием отрицательных обратных связей вPI3K/AKT/mTOR/S6K1 сигнальном пути. Одна из ООС реализуется за счетактивации S6K1 киназы, которая ингибирует киназу mTOR2, что ведет кподавлению рAKT(Ser437) сигнала (Рис.

1). Другая петля ООС такжеформируется за счет активации S6K1 киназы, которая фосфорилирует субстратинсулинового рецептора, IRS1, являющийся белком-адаптером, которыйсвязывается с фосфо-сайтом ErbB2,3 рецепторов и активирует p85 субъединицуPI3 киназы. Фосфорилирование IRS1 приводит к его диссоциации от ErbB2/3140Рис. 6-1. Результаты компьютерных расчетов кинетики фосфорилированияосновных белков в Ras/Raf/ERK и PI3K/AKT/mTOR/S6K1 сигнальных путях приих активации сигнального пути HRG (черные линии) и при действиирапамицина (красные линии) для PE04 клеток.Рис.

6-2. Результаты компьютерных расчетов кинетики фосфорилированияосновных белков в Ras/Raf/ERK и PI3K/AKT/mTOR/S6K1 сигнальных путях приих активации сигнального пути HRG (черные линии) и при действииингибитора LY294002 (красные линии) для PE04 клеток.141Рис. 6-3. Результаты компьютерных расчетов кинетики фосфорилированияосновных белков в Ras/Raf/ERK и PI3K/AKT/mTOR/S6K1 сигнальных путях приих активации сигнального пути HRG (черные линии) и при действии ингибиторBEZ235 (красные линии) для PE04 клеток.Рис.

6-4. Результаты компьютерных расчетов кинетики фосфорилированияосновных белков в Ras/Raf/ERK и PI3K/AKT/mTOR/S6K1 сигнальных путях приих активации сигнального пути HRG (черные линии) и при действиирапамицина (красные линии) для A2780 клеток.142Рис. 6-5. Результаты компьютерных расчетов кинетики фосфорилированияосновных белков в Ras/Raf/ERK и PI3K/AKT/mTOR/S6K1 сигнальных путях приих активации сигнального пути HRG (черные линии) и при действии LY294002(красные линии) для A2780 клеток.Рис. 6-6. Результаты компьютерных расчетов кинетики фосфорилированияосновных белков в Ras/Raf/ERK и PI3K/AKT/mTOR/S6K1 сигнальных путях приих активации сигнального пути HRG (черные линии) и при действии BEZ235(красные линии) для A2780 клеток.143рецепторовидеградации,чтовызываетослаблениесигналавPI3K/AKT/mTOR/S6K1 сигнальном пути и образование петли ОСС pS6K1-IRS1-PI3K(Рис.

1-1).Результаты расчетов активации Ras/Raf/ERK и PI3K/AKT/mTOR/S6K1сигнальных путей и действия рапамицина на основные сигнальные белки в PE04и A2780 клетках показали, что активации pAKT в A2780 клетках более чем в 1.5раза превышает активность pAKT в клетках PE04. Это связано с частичнойпотерей активности фосфатазы PTEN при мутации гена PTEN в A2780 клетках,что ведет к повышению концентрации pAKT за счет аккумуляции PIP3 в этихклетках.Рис. 6-7. Возрастание pAKT сигнала при действии ингибитора mTOR1 киназы,рапамицина (Rap) в PE04 (А)иA2780 (Б) раковых клетках яичников. Линии 1 и2 соответствуют расчетам в отсутствии и присутствии рапамицина,соответственно.

Точки – экспериментальные данные, полученные приактивации PE04 и A2780 клеток 1 нМ HRG и при ингибировании 200 нМрапамицина.Анализ результатов расчетов также показал, что ингибирование mTOR1комплекса рапамицином приводит к существенному ингибированию двухосновных его субстратов S6K1 и 4EBP1, приводящему к подавлению трансляциибелков в раковых клетках PE04 и A2780. Вместе с тем обнаружено, что144рапамицин оказывает активирующее действие на рAKT сигнал (Рис. 6-7). Этоэффект связан с подавлением отрицательных обратных связей ppS6K1-mTOR2AKT и ppS6K1-IRS1-PI3K в результате ингибирования pS6K1 сигнала.Подавление ООС ведет к дополнительной активности PI3K за счет уменьшениястепени ингибирования mTOR2 комплекса, фосфорилирующего AKT(Ser437) ивозросшей активности IRS1.

В итоге это вызывает существенное повышениеуровня pAKT при действии рапамицина.Результаты расчетов действия ингибитора PI3K, LY294002 (Kd=0.6 мкМ),показали, что ингибирование PI3K приводит к подавлению активности основныхсигнальные белков: AKT, mTOR1, S6K1, 4EBP1 и PTEN. В теоретическихрасчетах также установлено, что LY294002 не оказывает ингибирующегодействия на RAS/RAF/ERK сигнальный путь в PE04 и A2780 клетках. Этотуказывает на отсутствие активационного взаимодействия между PI3K киназой иRAS/RAF/ERK путем, которое наблюдается в ряде опухолевых клеток приингибировании pERK сигнала в результате действии ингибитора PI3K.ВработетакжеисследованодействиеАТР-конкурентногокомбинированного ингибитора PI3K и mTOR1,2 киназ, BEZ-235, в PE04 и A2780клетках.

Характеристики

Список файлов диссертации

Свежие статьи
Популярно сейчас
А знаете ли Вы, что из года в год задания практически не меняются? Математика, преподаваемая в учебных заведениях, никак не менялась минимум 30 лет. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6510
Авторов
на СтудИзбе
302
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее