Диссертация (1145983), страница 22
Текст из файла (страница 22)
Анализ данной модели в таблицах сопряженности позволилустановить 4 комбинации генотипа повышенного риска (p>0,05) и 2 сочетания генотипапониженного риска развития гестоза. Наиболее значимым из них был генотип PAI1 (rs1799768)5G5G + MTHFR (rs1801133) CC (p=0,0003, df=1; ОШ=0,15, 95%ДИ: 0,05-0,46) (таблица 21).Модель, включающая три полиморфных сайта AGT rs699, AGTR2 rs11091046 и BKR2rs1799722, имела невысокую воспроизводимость (CVC=2/10) при сбалансированной точности0,67, чувствительности 0,56, и специфичности 0,78, χ2=23,9505 (р<0,0001) (рисунок 13, Б).Согласно данной модели к сочетаниям пониженного риска развития гестоза относятся 9вариантов генотипа (p>0,05), повышенного риска - 16 комбинаций, наиболее значимая из нихAGT (rs699) TT + AGTR2 (rs11091046) CC + BKR2 (rs1799722) CC (p=0,0113, df=1; OR=13,65,95%ДИ: 0,78-239,81) (таблица 21).85АБВГГен (полиморфный сайт)PAI1 (rs1799768)MTHFR (rs1801133)AGT (rs699)AGTR2 (rs11091046)BKR2 (rs1799722)ADRB2 (rs1042714)05G5GCCTTAATTCC15G4GCTTCACTCCG24G4GTTCCCCCCGGРисунок 13 - Модели межгенных взаимодействий при гестозеА - двухлокусная модель; Б - трехлокусная модель; В - четырехлокусная модель; Г - условноеобозначение вариантов генотипа; темно-серые ячейки — сочетания повышенного риска, светлосерые ячейки–комбинации пониженного риска, белые ячейки — отсутствуют сочетания генотипов(левые столбики в ячейках — пациентки с гестозом, правые — женщины группы сравнения).Таблица 21 – Частоты сочетаний вариантов исследуемых полиморфных сайтов,ассоциированных с риском развития гестозаГестоз,n (%)ГенотипГруппасравнения, n(%)pОШ (95%ДИ)0,011313,65 (0,78-239,81)0,020412,04 (0,68–213,83)Варианты повышенного рискаТрехлокусная модельAGT (rs699) TT + AGTR2 (rs11091046) CC +BKR2 (rs1799722) CC8 (2,26,711,2)0 (0,00,00,0)Четырехлокусная модельPAI1 (rs1799768) 5G4G + AGT (rs699) TT +AGTR2 (rs11091046) CC + ADRB2 (rs1042714) CG7 (1,75,910,1)0 (0,00,00,0)Варианты пониженного рискаДвухлокусная модельPAI1 (rs1799768) 5G5G + MTHFR (rs1801133) CC4 (0,13,46,7)17 (10,919,127,3)0,15 (0,05-0,46)0,0003Примечания1 Жирным шрифтом выделены статистически значимые различия (p<0,05, точный тест Фишера).2 ОШ - отношение шансов.3 ДИ- доверительный интервал.4 Слева и справа от значений частот в виде подстрочных индексов указаны границы 95 % ДИ.Четырехлокусная модель полиморфных сайтов генов PAI1 rs1799768, AGT rs699, AGTR2rs11091046 и ADRB2 rs1042714 показала наибольшую воспроизводимость (CVC=9/10 иточность 0,79) (χ2=67,7226, р<0,0001) (рисунок 13, В).
Чувствительность модели составила 0,76, специфичность - 0,82. В рамках данной модели выявлен 31 вариант повышенного риска,наиболее значимый из них PAI1 (rs1799768) 5G4G + AGT (rs699) TT + AGTR2 (rs11091046) CC +ADRB2 (rs1042714) CG (p=0,0204, df=1; ОШ=12,04, 95%ДИ: 0,68–213,83), и 27 вариантовпониженного риска развития (p>0,05) (таблица 21).На рисунке 14 представлена дендрограмма межгенных взаимодействий при гестозе.Рисунок 14 - Дендрограмма ген-генных взаимодействий при гестозеКак видно, модель состоит из двух независимо связанных кластеров (коричневый цвет).В состав первого кластера входит модуль с дублирующим типом взаимодействия полиморфныхсайтов генов MTHFR rs1801133 и AGTR2 rs11091046 (синий цвет линий).
Второй кластерсодержит сильно взаимодействующие (синергетические) между собой полиморфные сайты87генов AGT rs699 и ADRB2 rs1042714 (красный цвет). В состав этого кластера входят такжеrs1799768 гена PAI1 и rs1799722 гена BKR2.С помощью форсированного алгоритма (forced algoritm) программы MDR был отдельнопроведен анализ четырехлокусной модели и построена радиальная диаграмма, отражающаяхарактер взаимодействия и вклад полиморфного сайта каждого гена (рисунок 15).Рисунок 15 - Диаграмма межгенных взаимодействий четырехлокусной модели (PAI1 rs1799768,AGT rs699, AGTR2 rs11091046 и ADRB2 rs1042714)Примечание - % отражает силу и направленность фенотипического эффектаполиморфных сайтов генов и их взаимодействий.Самый большой вклад в развитие гестоза вносят варианты полиморфных сайтов геновPAI1 rs1799768 и AGTR2 rs11091046, величина энтропии составляет 2,59% и 2,01%,соответственно.
Менее выраженную роль в формировании предрасположенности к развитиюгестоза играют варианты полиморфных сайтов генов AGT rs699 и ADRB2 rs1042714, энтропия0,46% и 0,44% (соответственно).Посколькунекоторыевариантыисследуемыхсайтовпоказалиассоциациюсопределенными клиническими формами гестоза, дополнительно был проведен сравнительныйанализчастотсочетанийвариантовполиморфныхсайтовисследуемыхгеноввсоответствующих подгруппах больных и группе сравнения. Результаты анализа представлены втаблице 22.
Выявлено статистически значимое увеличение частоты генотипа PAI1 (rs1799768)5G4G + ITGA2 (rs1126643) CC в подгруппе больных с сахарным диабетом (39,3%) по сравнениюс группой женщин без осложнений беременности (10,2%) (p<0,0001, df=1; pcor<0,0003).Согласно коэффициенту отношения шансов носительство этого генотипа повышает рискразвития гестоза в 5,75 раз (ОШ=5,71, 95%ДИ: 2,48-13,12), в то время как генотип PAI1(rs1799768) 5G5G + MTHFR (rs1801133) CC обладает протективным эффектом в отношенииразвития гестоза у женщин с гипертонической болезнью (0,0% против 18,2% в группесравнения) (p=0,0002, df=1; pcor =0,0006; ОШ=0,04, 95%ДИ: 0,00-0,64).88Таблица 22 - Частоты сочетанных генотипов в подгруппах пациенток с гестозом на фонеразличных заболеванийГенотипГестоз, n (%)Группа сравнения, n (%)pОШ (95%ДИ)<0,00015,71 (2,48-13,12)0,00020,04 (0,00-0,64)Гестоз на фоне сахарного диабетаPAI1 (rs1799768) 5G4G +ITGA2 (rs1126643) CC24 (27,039,351,6)10 (4,210,216,2)Гестоз на фоне гипертонической болезниPAI1 (rs1799768) 5G5G +MTHFR (rs1801133) CC0 (0,00,00,0)18 (10,618,225,8)Гестоз на фоне заболеваний щитовидной железыPAI1 (rs1799768) 5G4G +28 (49,463,677,8)32 (24,233,743,2)0,00103,45 (1,65-7,23)LPL (rs328) CCПримечания1 Жирным шрифтом выделены статистически значимые различия (p<0,05, точный тест Фишера).2 ОШ - отношение шансов.3 ДИ- доверительный интервал.4 Слева и справа от значений частот в виде подстрочных индексов указаны границы 95 % ДИ.Сочетание PAI1 (rs1799768) 5G4G + LPL (rs328) CC чаще встречалось в подгруппебольных с заболеваниями щитовидной железы (63,6%) по сравнению с выборкой женщин безосложнений беременности (33,7%) (p=0,0010, df=1; pcor=0,0030; ОШ=3,45, 95%ДИ: 1,65-7,23).Для остальных комбинаций исследуемых полиморфных сайтов ассоциаций с развитием гестозане было выявлено (pcor>0,05).3.1.5 Прогностическая значимость выявленных генетических маркеров гестозаВ ходе выполнения работы были выявлены варианты исследуемых полиморфных сайтов,ассоциированные с риском возникновения гестоза или его отдельных клинических форм.
Дляоценки прогностических качеств этих вариантов (маркеров гестоза) вычисляли величину AUC(площадь под ROC-кривой) с помощью ROC-анализа (Recevier Operator Characteristic).Величину AUC интерпретировали согласно экспертной шкале [Румянцев и др., 2009]. Втаблице 23 представлены результаты анализа.Для генетических вариантов, показавших ассоциацию с риском развития гестоза вцелом, значения AUC оказались довольно низкими (AUC=0,52-0,57), что свидетельствует онебольшой дискриминационной способности этих маркеров.
Низкую эффективность такжеимеют маркеры, для которых была установлена ассоциация с риском развития гестоза присравнении пациенток с АД≥140/90 мм.рт.ст. и женщин без осложнений беременности(AUC=0,55-0,57). Чуть большую площадь под ROC-кривой дали варианты исследуемыхполиморфных сайтов, которые показали ассоциацию с гестозом при сравнении больных с89АД≥160/110 мм.рт.ст. и женщин группы сравнения (AUC=0,58-0,60). Более высокие значенияAUC были определены для маркеров гестоза с протеинурией ≥ 0,3 г/л (AGTR2 (rs11091046) СС,AUC=0,61) и раннего гестоза (APOA1 (rs4938303) AA, AUC=0,62), что указывает на их среднююэффективность.Таблица 23 – Значения AUC для вариантов исследуемых полиморфных сайтов,ассоциированных с риском развития гестозаПолиморфный маркер1F7 (rs6046) AAPAI1 (rs1799768) 5G5GPAI1 (rs1799768) 5G4GAGTR2 (rs11091046) СAGTR2 (rs11091046) ССMTHFR (rs1801133) CCMTHFR (rs1801133) CTPAI1 (rs1799768) 5G4G + AGT(rs699) TT + AGTR2 (rs11091046) CC+ ADRB2 (rs1042714) CGSe (95%ДИ)2Гестоз в целом0,04 (0,01-0,10)0,26 (0,18-0,36)0,57 (0,49-0,65)0,53 (0,47-0,59)0,30 (0,23-0,38)0,59 (0,48-0,68)0,49 (0,41-0,57)Sp (95%ДИ)3AUC (95%ДИ)41,00 (0,98-1,00)0,85 (0,79-0,91)0,58 (0,47-0,67)0,57 (0,49-0,64)0,84 (0,75-0,91)0,56 (0,48-0,64)0,66 (0,55-0,75)0,52 (0,46-0,58)0,56 (0,49-0,62)0,57 (0,51-0,64)0,55 (0,50-0,59)0,57 (0,51-0,63)0,57 (0,51-0,63)0,57 (0,51-0,63)0,06 (0,02-0,12)1,00 (0,96-1,00)0,53 (0,47-0,59)Гестоз тяжелой степениAGTR2 (rs11091046) СС0,37 (0,24-0,51)0,84 (0,75-0,91)0,60 (0,52-0,68)АД≥140/90 мм.рт.ст.ITGA2 (rs1126643) CTAGTR2 (rs11091046) СAGTR2 (rs11091046) ССPAI1 (rs1799768) 5G5GPAI1 (rs1799768) 5G4GMTHFR (rs1801133) CCMTHFR (rs1801133) CT0,60 (0,49-0,69)0,54 (0,48-0,59)0,31 (0,23-0,39)0,26 (0,18-0,36)0,57 (0,48-0,65)0,59 (0,48-0,68)0,48 (0,40-0,57)0,54 (0,46-0,63)0,57 (0,49-0,64)0,84 (0,75-0,91)0,85 (0,78-0,90)0,58 (0,47-0,68)0,55 (0,47-0,63)0,66 (0,55-0,75)0,57 (0,50-0,63)0,55 (0,50-0,60)0,57 (0,51-0,64)0,56 (0,49-0,62)0,57 (0,51-0,63)0,57 (0,50-0,63)0,57 (0,51-0,63)АД≥160/110 мм.рт.ст.ITGA2 (rs1126643) TTAGTR2 (rs11091046) СAGTR2 (rs11091046) ССREN (rs2368564) APAI1 (rs1799768) 5G5GAGTR2 (rs11091046) СС0,30 (0,19-0,42)0,88 (0,80-0,42)0,59 (0,50-0,67)0,57 (0,50-0,64)0,37 (0,25-0,50)0,84 (0,75-0,91)Протеинурия < 0,3 г/л0,20 (0,15-0,26)0,89 (0,84-0,93)0,31 (0,22-0,41)0,88 (0,80-0,93)Протеинурия ≥ 0,3 г/л0,38 (0,24-0,53)0,84 (0,75-0,91)0,59 (0,51-0,66)0,58 (0,52-0,63)0,60 (0,52-0,68)0,54 (0,49-0,59)0,60 (0,53-0,66)0,61 (0,54-0,68)Ранний гестозAPOA1 (rs4938303) AAPAI1 (rs1799768) 5G4GMTHFR (rs1801133) TMTHFR (rs1801133) CCMTHFR (rs1801133) CTPAI1 (rs1799768) 5G5G +MTHFR (rs1801133) CC0,63 (0,48-0,77)0,61 (0,50-0,71)Поздний гестоз0,61 (0,50-0,70)0,58 (0,47-0,68)Гестоз на фоне гипертонической болезни0,40 (0,31-0,49)0,76 (0,69-0,82)0,59 (0,48-0,68)0,71 (0,57-0,82)0,62 (0,47-0,75)0,66 (0,55-0,75)0,18 (0,11-0,27)1,00 (0,94-1,00)0,62 (0,53-0,70)0,59 (0,52-0,66)0,58 (0,52-0,63)0,65 (0,57-0,72)0,64 (0,56-0,71)0,59 (0,51-0,67)90Продолжение таблицы 231234Гестоз на фоне вегето-сосудистой дистонииPAI1 (rs1799768) 5G4GAGTR2 (rs11091046) СС0,70 (0,55-0,83)0,36 (0,22-0,51)0,58 (0,47-0,68)0,84 (0,75-0,91)0,64 (0,56-0,72)0,60 (0,51-0,68)Гестоз на фоне заболеваний почекAGTR2 (rs11091046) СAGTR2 (rs11091046) СС0,63 (0,54-0,72)0,57 (0,49-0,64)0,39 (0,27-0,52)0,84 (0,75-0,91)Гестоз на фоне ожирения5G5G PAI1 (rs1799768)0,26 (0,18-0,36)0,90 (0,80-0,95)SCARB1 (rs5888) T0,54 (0,45-0,63)0,60 (0,52-0,67)SCARB1 (rs5888) TT0,32 (0,21-0,45)0,86 (0,78-0,93)Гестоз на фоне заболеваний щитовидной железыPAI1 (rs1799768) 5G5G0,26 (0,18-0,36)0,91 (0,77-0,98)MTHFR (rs1801133) CC0,59 (0,48-0,68)0,64 (0,49-0,78)LPL (rs328) СG0,17 (0,10-0,26)0,98 (0,88-1,0)PAI1 (rs1799768) 5G4G +0,64 (0,48-0,78)0,66 (0,56-0,76)LPL (rs328) CC0,58 (0,52-0,66)0,61 (0,54-0,68)0,58 (0,50-0,66)0,57 (0,51-0,63)0,59 (0,51-0,67)0,59 (0,50-0,67)0,62 (0,53-0,69)0,57 (0,49-0,66)0,65 (0,56-0,73)Гестоз на фоне сахарного диабетаPAI1 (rs1799768) 5G5GPAI1 (rs1799768) 5G4GITGA2 (rs1126643) CTPAI1 (rs1799768) 5G4G +ITGA2 (rs1126643) CC0,26 (0,18-0,36)0,62 (0,51-0,73)0,60 (0,49-0,69)0,91 (0,82-0,96)0,58 (0,47-0,68)0,63 (0,51-0,73)0,58 (0,51-0,66)0,60 (0,52-0,67)0,61 (0,54-0,68)0,39 (0,27-0,53)0,90 (0,82-0,95)0,65 (0,57-0,72)Гестоз при отсутствии сахарного диабетаREN (rs2368564) AREN (rs2368564) GGREN (rs2368564) GA0,21 (0,15-0,29)0,89 (0,84-0,93)0,81 (0,72-0,88)0,39 (0,27-0,51)0,34 (0,23-0,46)0,84 (0,75-0,91)Гестоз на фоне варикозной болезни1,00 (0,88-1,00)0,16 (0,91-0,25)NR1H2 (rs2695121) CПримечания1 Se–чувствительность (sensitivity).2 Sp–специфичность (specificity).3 AUC – площадь под ROC-кривой (area under the ROC curve).4 ДИ- доверительный интервал.5 Жирным шрифтом выделены значения AUC>0,6.0,55 (0,50-0,61)0,60 (0,52-0,67)0,59 (0,51-0,66)0,58 (0,49-0,67)Большинство вариантов исследуемых генов, ассоциированных с гестозом в зависимостиот наличия различных фоновых заболеваний, обладали низкой прогностической ценностью(AUC≤0,6).Однако,прогностическаязначимостьмаркераPAI1(rs1799768)5G4Gувеличивалась при предсказании гестоза у женщин с некоторыми фоновыми заболеваниями.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
