Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1143463), страница 8

Файл №1143463 Диссертация (Метод доминантного параметра в моделировании и анализе динамики биологических осцилляторов) 8 страницаДиссертация (1143463) страница 82019-06-23СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 8)

Кинетические константы были выведены пу­тем фиттинга наблюдаемых в эксперименте колебаний рН: 3 =5.573е-3моль/м3 , 2 =5.51е-5 моль/м3 , 1 =1.5е-5 моль/м3 . Электрические харак­теристики мембраны были следующими: ˜=0.1 Ом−1 м−2 , =3e+3 Ом·ми = 3 микроФ·м−2 . Таким образом, параметры модели были посчитаныи фиксированы: = 0.028, = 0.6, = 0.0085.51Интенсивность света как регулирующий параметрКак было сказано выше, все процессы в подобной системе, приво­дящие к нелинейным феноменам, происходят при изменении интенсив­ности света. Это логично, так как в фотосинтезирующих клетках, светявляется “главным игроком”, запускающим процесс получения и преобра­зования энергии квантов в энергию связей органических веществ.

Еслиже говорить о макропроцессах в клетке, то при увеличении интенсивно­сти света “защелачивается” цитоплазма (внутренняя среда клетки) вслед­ствие активного тока протонов из цитоплазмы в хлоропласты [227, 228],что и приводит к дисбалансу рН и к запуску АТФ помпы на плазмал­лемме.Таким образом, в модели было бы разумно записать такую зави­симость от света следующим образом: ℎ = ℎ0 − где ℎ0 - безразмернаяконцентрация протонов в темноте. Так как в темноте рН колеблется впределах от 6.5 до 7.0, то значение ℎ0 будет принимать от 6.7 до 21.1;интенсивность света =˜0 ,где ˜- интенсивность, меняющаяся в экспери­менте от 0 до 100 Bтм−2 [15, 65, 70], при этом насыщающая интенсивность(0 ), при которой рН более не меняется, будет равна 40 Bтм−2 [65].2.2.2.

Результаты моделированияДанная модель качественно, а также количественно описывает боль­шинство экспериментально наблюдаемых нелинейных режимов. Такжебыл предложен механизм их возникновения, учитывающий влияние све­тового сигнала на мембранный транспорт. Диссипативные структуры, атакже гистерезис были довольно подробно рассмотрены в [220] в каче­стве наглядной демонстрации модели, хорошо воспроизводящей экспери­ментальные данные, и здесь на этом подробно мы останавливаться не52Рис. 2.2:Динамика мембранного потенциала (а) и концентрации протонов (b) в от­ℎ0 =21,0, =-1.28, выключение света, показановключение света, сплошная черная стрелка- =0.5вет на включение и выключение света.пунктирной стрелкой- =0,будем.

Однако в свете подхода, выделяющего интенсивность света какбиофизически-доминантный параметр, было более подробно остановить­ся именно на анализе его влияния на структуры клетки, в частности,на работу потенциал-зависимой АТФ-азы и каналов, чья активация иприводит к появлению различных нелинейных феноменов.53Локальный ответ потенциала и рН на включение ивыключение светаБыла исследована экспериментально наблюдаемая динамика мем­бранного потенциала и концентрации протонов примембранной областиснаружи клетки в ответ на выключение и включение света, которую сни­мают, фиксируя электроды на границе между “щелочными” и “кислыми”зонами [63, 64, 66, 77, 83]. Как было показано в эксперименте, и затемвоспроизведено в модели без учета диффузионных членов (см. рис.

2.2),выключение света ведет к быстрой гиперполяризации потенциала (пони­жению) до стационара с небольшой деполяризацией при низких потенци­алах (рис. 2.2а) и закислению внешней среды (повышению концентрациипротонов) с последующим насыщением (рис. 2.2b). Обратная ситуацияпроисходит при включении света: быстрая деполяризация с небольшимпонижением потенциала сопровождается быстрым понижением концен­трации протонов, то есть “защелачиванием” среды.Взаимосвязь протонного потока через АТФ-азу ( ) имембранного потенциалаДинамика переменных, показанная выше, обуславливается преждевсего работой помпы, что также коррелирует с экспериментальными ра­ботами, где было показано, что активность помпы увеличивается пригиперполяризации потенциала и снижается при деполяризации.

Как по­казано на рис. 2.3, переменные потенциала и потока колеблются впротивофазе. При сильно отрицательных значениях потенциала наблю­дается максимальный отток протонов наружу клетки, что приводит кпадению потенциала до критических значений, при этом увеличение кон­центрации протонов снаружи регулируется пассивным транспортом ℎ ,54Рис.

2.3:азу;Автоколебания мембранного потенциала и протонного потока через АТФ­ =0.18, =ℎ ℎ 3(1+ℎ )2 2 (2+3 ℎ )+(1+ℎ )2 2 ℎкоторый осуществляется через каналы, активирующиеся при повышенииконцентрации протонов снаружи клетки. Поток через протонные кана­лы приводит к деполяризации потенциала, при этом увеличивающаясядеполяризация их и отключает, что приводит снова к гиперполяризациипотенциала, и цикл повторяется, что и воспроизводит наблюдаемые вэксперименте автоколебания рН и потенциала.МультистационарностьДо сих пор описывались состояния системы при пиковых значенияхинтенсивности света, когда система находится либо в одном, либо в дру­гом стационарных состояниях (см. рис. 2.2) либо в автоколебательномрежиме.

Однако модель, по сравнению с экспериментом, дает ряд пре­имуществ, а именно, можно проследить ряд изменений биологической55Рис. 2.4: Бифуркационная диаграмма, показывающая зависимость мембранного по­тенциалаот интенсивности света. и-нижняя и верхняя ветви диаграммысоответственно. Обозначения на диаграмме следующие: s.n устойчивый узел, u.n.-неустойчивый узел, s.f.- устойчивый фокус, u.f. неустойчивый фокус, s.l.c. - устойчи­вый предельный цикл, u.l.c. - неустойчивый предельный цикл; = 0.1627-субкрити­ческая бифуркация Хопфа, рождение неустойчивого предельного цикла на ветви.

= 0.1789−0.1826- два цикла, окружающие два стационара, устойчивый и неустойчи­вый; = 0.1826, субкритическая бифуркация Хопфа, рождение неустойчивого циклавокруг устойчивого фокуса на ветви системы, как именно система приходит от одного стационара к другому,меняя регулирующий параметр интенсивность света с малым шагом,что в эксперименте в ряде случаев сделать довольно сложно. При ис­следовании локальной динамики переменных модели был применен би­фуркационный анализ, который для данной модели, в силу ее сильнойнелинейности, был выполнен в основном численно.Как показано на рисунке 2.4, на нижней ветви устойчивый узел приувеличении =0 до 0.0428 становится устойчивым фокусом до дальней­56шего увеличении =0.1826, при котором происходит субкритическая би­фуркация Хопфа. Решения нижней ветви становятся неустойчивыми придостижении значения =0.1835, где сначала неустойчивый фокус сменя­ется неустойчивый узлом вплоть до точки “перехода” на другую ветвьпри =0.188.

На верхней ветви в промежутке при > 0.1374 неустой­чивый узел становится неустойчивым фокусом. Оставаясь на верхнейветви и стартуя со значений =0.1374, неустойчивый фокус переходитв неустойчивый цикл путем субкритической бифуркации Хопфа. Придальнейшем увеличении от =0.1789 до 0.1826 возникает несколько цик­лов, два больших, устойчивый неустойчивый, окружающие два стацио­нара на “нижней” и “вехней” ветвях; далее при =0.2 устойчивый фокусисчезает, и при дальнейшем увеличении интенсивности остается устой­чивый узел.Таким образом, система демонстрирует несколько решений в про­межутке 0.1368 < < 0.188 и бистабильность в интервале 0.1627 < <0.1835.

Стартуя с нижней ветви при =0.1627 (устойчивый фокус), со­ответствующей более отрицательным значениям потенциала и достигаяточки =0.1835, система перепрыгивает на верхнюю ветвь в новый ста­ционар, устойчивый фокус, соответствующий более высоким значениямпотенциала. В интервале 0.1789 < < 0.1826 автоколебания сосуществу­ют с двумя стационарами, в которых наблюдаются затухающие колеба­ния, причем устойчивый предельный цикл охватывает оба состояния.Таким образом, переход между этими двумя стационарными состояния­ми может быть осуществлен двумя путями. В первом случае постепен­ное повышение и затем понижение интенсивности приводит к резкому“прыжку” между двумя устойчивыми состояниями.

Во втором случаеизменение начальных условий по потенциалу приводит к установлениюв системе автоколебаний и последующему периодическому изменению57мембранного потенциала.Механизм образования колебаний и зон потенциала и рНКак было показано и в модели и в эксперименте, свет запускаетвсе основные энергетические процессы в клетке, которые прежде всегосвязаны с фитосинтезом. Запуск фотосинтеза приводит к защелачива­нию цитоплазмы за счет аккумуляции протонов внутри хлоропластов,что приводит к увеличению пассивного транспорта протонов снаруживнутрь клетки (см. Рис 2.5), что приводит к деполяризации мембранно­го потенциала и закислению цитоплазмы.

Характеристики

Список файлов диссертации

Свежие статьи
Популярно сейчас
Зачем заказывать выполнение своего задания, если оно уже было выполнено много много раз? Его можно просто купить или даже скачать бесплатно на СтудИзбе. Найдите нужный учебный материал у нас!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6384
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее