Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1143463), страница 14

Файл №1143463 Диссертация (Метод доминантного параметра в моделировании и анализе динамики биологических осцилляторов) 14 страницаДиссертация (1143463) страница 142019-06-23СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 14)

Это отличается от ситуации, когда поток субстрата симметричен,здесь направление распространения волны остается постоянным вслед­ствие симметрии системы. Кроме того, как отмечено выше, коэффици­енты диффузии играют определенную роль в стабилизации фиксирован­ных фазовых сдвигов между осцилляторами.Надо отметить, что появление переходных режимов и изменение на­правления фазовых волн распространения в синхронном состоянии пока­зывает, что рассматриваемая система очень чувствительно к тонким из­менениям параметров. Внезапные изменения в динамическом поведенииможно наблюдать путем введения слабой асимметрии в распределениичастот волн или в случае, когда система “уходит” от режима гармониче­ских колебаний.В случае симметричного параболического притока (с использовани­ем тех же самых значений как на рис. 3.3 –3.5, то есть 0 = 2.55 , = 2.7но с 0 = 0.5) волны будут распространяться от границ до центра посто­янно.

Это противоречит экспериментальным выводам, в которых измене­ния направления распространения волн наблюдались в большинстве слу­чаев. Более того, даже при асиметрическом притоке, волна в принципесдвигалась просто к другому краю, но никак не меняла свое направлениес расходящейся на сходящуюся, что в общем говорит о том, что такойпереворот происходит в симметричной системе. И последнее, остаетсявопрос – насколько важна диффузия? Все реакции происходят в геле,достаточно плотной среде, и часто диффузия крайне затруднена из-за99того, что крупные ферменты практически “затыкают” свободные порыгеля, делая среду сильно гетерогенной.

Чтобы ответить на эти вопросы,система была проанализирована с точки зрения ампдитудно-фазовогоприближения.3.2.2. Переворот волны: амплитудно-фазовое приближениеУдобно переписать систему (3.3) в новых переменных. Пусть новыепеременные будут в виде: = − и = + − 0 , 0 = 2 / + /.Предполагается, что коэффициенты диффузии для субстрата и продуктаодинаковы. Следующее упрощение следует из экспериментальных усло­вий. Надо отметить, что две производные функции малы во всей обла­сти реакции, что подразумевает, что можно пренебречь пространствен­ными производными в системе 3.3 и рассматривать только координатноепреобразование, состоящее из сдвига, вращения и перемасштабирования.Следовательно, подставляя в систему 3.3 новые переменные, и для удоб­ства = , получаем: = + 2 (3.4)(︀)︀ = 2 1 + 1 − 2 2 − [Ω(1 − −1 )]2 + 2 .Параметры: =(︀)︀ − 2 −2 /2, 1 = (3 − 0 ) /22 , 2 =√−2 /2 и Ω = / .

Эта система может рассматриваться как обоб­щенное уравнение Рэлея [238]: диссипативный член также состоит изразложения до третьего порядка скорости, квадратный член также при­сутствует. Кроме того, система (3.4) содержит первый (линейный по )член в разложении по частоте.Анализируя локальную систему ( = 0 и параметр фиксирован)100можно легко показать, что при > 0 в системе существует устойчи­вый предельный цикл и неустойчивый стационар при 1 = 0, 1 = 0.Очевидно, что наличие отрицательного кубического члена приводит кограничению положительного линейного роста.

Таким образом, здесь су­ществует предельный устойчивый цикл как асимптотическое решение вэтом случае.Если > 0 мало, то линейная аппроксимация системы приведет еек виду типа гармонического осциллятора с частотой Ω. В этом случае,чтобы найти приближенное аналитическое решение, был применен методусреднения Крылова-Боголюбова (КБ) [239], который позволяет предста­вить решения в виде гармонических функций с переменной амплитудойи фазой. Заметим, что строго неотрицательный член 21 играет осо­бую роль. Он обеспечивает однонаправленное ускорение от неустойчивойстационарной точки. Это приводит к асимметрии в предельном цикле.Центр цикла сдвигается в фазовой плоскости. Также этот член влия­ет на размер цикла.

По этой причине мы добавляем сдвиг (подробныйаналитический вывод его появления, как следствия свойств рассматрива­емой динамической системы в амплитудно-фазовом приближении, будетприведен далее, в разделе 3.4, дабы не загромождать здесь основнуюфизическую картину):() = () cos (Ω − ()) + 0 ()() = −Ω() sin (Ω − ()) .В такой форме обе переменные на самом деле являются разложени­ями в ряды Фурье (четные и нечетные компоненты) до главной частотыΩ.

И первый член четных компонент Фурье-разложения 0 ()- медленноменяющийся член в зависимости от амплитуды, - показывает асиммет­101ричность предельного цикла, появляющуюся за счет нелинейных квад­ратичных членов в (3.4).Надо заметить, что как амплитуда , так и фаза слабо меняютсяво время одного периода быстрых колебаний 2/Ω. Подставляя данныерешения в (3.4), без учета диффузионных членов, понижая степени три­гонометрических функций до первой, приравнивая коэффициенты принулевой (без тригонометрических функций) и первой гармониках (с Ωв аргументе тригонометрических функций) и отбрасывая старшие (зави­сящие от 2Ω и 3Ω), получаем укороченную систему для медленно меняю­щихся амплитуды и фазы, формально совпадающих с соответствующимпредставлением уравнения Гинзбурга-Ландау:(︂)︂32 2 2 = 1 − 1 Ω ,4Ω3 2 = −2 2 .8(3.5)(3.6)где 1 = 2 /1 и 2 = 21 /2 – корректирующие параметры, учитыва­ющие дрейф цикла (см.

их детальную связь с параметрами исходнойсистемы в разделе 3.4).Имея эти решения, можно перейти к старым переменным как =2 −1 + −1 + , = −1 − −1 . В этом смысле рассмотрим два при­мера. Были выбраны значения параметров при которых существуют дватипа колебаний, гармонические и релаксационные. Начальные условиядля обоих случаев идентичны: = 0.05, Φ = 0. Рис.3.7 представляетсобой переход к предельному циклу значении параметра немного нижекритического значения для бифуркации Хопфа ( = 2.82).Видно, что полученное приближенное решение методом КБ(3.5)–(3.6) воспроизводит гармонические колебания с высокой точно­102x(t)21.51050100t150.Рис.

3.7:Сравнение приближенного (сплошная линия) и “точного” (численного)решений для переменной концентрации субстрата в локальной системе. Параметрымодели: =2.8, = 2x(t)3210Рис. 3.8:2040t.6080Сравнение приближенного (сплошная линия) и “точного” (численного)решений для переменной концентрации субстрата в локальной системе. Параметрымодели: =2.73, = 2103стью. Второй случай, представленный на рис. 3.8 соответствует колеба­ниям, близким к релаксационным.

Это видно из достаточно асимметрич­ной формы пиков. Естественно, что с учетом только первой гармоникиФурье невозможно в точности воспроизвести такое поведение. Как след­ствие, приближенное решение отклоняется от точного в области верхнихмаксимумов, где эта асимметрия наиболее видна. Тем не менее, периодыи фаза обоих решений достаточно хорошо совпадают.Надо отметить, что частота главной Фурье-гармоники Ω (так жекак фазовый сдвиг ) существенно зависит от притока, соответственно,даже у несвязанных осцилляторов будет различная динамика при раз­ных значениях втока , что приводит к мысли, что исследуемые волныможно рассматривать как фазовые волны.Теперь рассмотрим распределенную систему, то есть полную систе­му (3.4) с диффузионными членами.

Чтобы описать экспериментальныеданные, напомним, что гетерогенный поток был представлен в виде па­раболы, в данном случае симметричной: () = 0 + 4( − 0 )( − 0.5)2 ,где 0 и – коэффициенты, определяемые максимумом или миниму­мом параболы. Таким образом, параметры , 1 , 2 , Ω будут зависеть отпространственной координаты.Подставляя в систему (3.4) решения, зависящие от координаты,(, ) = (, ) cos (Ω() − (, )) + 0 ()(, ) = −Ω()(, ) sin (Ω() − (, )) .получим уравнения после усреднения для амплитуды и фазы, за­висящих от пространственной координаты.

Эти уравнения имеютформу (3.5), (3.6), дополненную пространственными производными:(︀)︀(︀)︀(/2) 2 − ( )2 будет добавлено к (3.5) и (/2) 2 − 104к (3.6).Здесь очень важно учесть, что рассмотрение неоднородного притокаприводит к пространственному распределению по частоте, где Ω зависит√от пространственной координаты как Ω() = ()/ . Такое простран­ственное распределение по частотам позволяет получить наблюдаемые вэксперименте фазовые волны.Уравнения для (, ), (, ) были решены численно, при этом коор­дината варьировалась в интервале [0, 1]. Нулевые потоки на границах,как и выше, использовались в качестве граничных условий.

Для пара­болы были выбраны следующие коэффициенты: 0 = 2.8 и = 2.73.Локальные колебания для этих значений рассматривались в параграфахвыше и показаны на рис. 3.7, 3.8. Было исследовано влияние различныхначальных распределений реагентов на динамику волн. Для простотыбыли изменены начальные условия для амплитуды и фазы. Можно по­лучить волновые решения, распространяющиеся в одном направлениидля (рис. 3.9 (слева)), а также для начального распределения фаз, вы­пуклого вверх. Чтобы получить изменение направления волны нужновзять распределение, выпуклое вниз.

При этом параметры параболы неменялись (например, см. рис. 3.9 (справа)).При численном моделировании было также показано, что динами­ческое поведение имеет слабую зависимость от диффузии. Это, по всейвидимости, отличается от свойств диффузионных волн и антиволн (тоесть расходящихся от центра сосуда или же сходящихся к нему) в ре­акции Белоусова-Жаботинского [240, 241]. Таким образом, можно в пер­вом приближении пренебречь диффузией и объяснить происхождениеобращения волны при фиксированном распределении () другими при­чинами. В этом случае, возвращаясь к уравнениям (3.5) и (3.6), можно105Рис.

3.9:0 = 2.8Пространственно- временная динамика бегущих волн при = 2.73 и различныхволны: (, 0) = 1, (, 0) = 1.параметры: 0 = 2.8, = 2.73и = 2.5 · 10−3 ,начальных условиях. Левая панель: РасходящиесяПравая панель:(, 0) = 1, (, 0) = 2( − 1),получить решение для распределенной фазы:Ω()3(, ) = 0 () − 28()2∫︁2 (, ).(3.7)0Отсюда видно, что интеграл – монотонно убывающая функция, ско­рость изменения которой зависит от распределенного притока. Так как() имеет максимум, это соответствует минимуму скорости измененияфазы, и начальное распределение фазы ведет в образованию сходящихсяволн, однако со временем рост фазы приводит к переключению волны(рис. 3.10).Чтобы оценить требование параметра для переключения фазы, рас­смотрим простейший случай, когда все распределенные осцилляторы до­106−2.0φ(r,t)−2.5−3.0−3.50Рис.

Характеристики

Список файлов диссертации

Свежие статьи
Популярно сейчас
А знаете ли Вы, что из года в год задания практически не меняются? Математика, преподаваемая в учебных заведениях, никак не менялась минимум 30 лет. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6390
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее