Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1139658), страница 12

Файл №1139658 Диссертация (Персонифицированная ранняя диагностика и стратификация рисков прогрессирования туберкулезной инфекции у детей) 12 страницаДиссертация (1139658) страница 122019-05-31СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 12)

По результатам пробы с АТР у всех (100%) установилиотрицательные реакции.Таким образом, группы наблюдения отражали закономерности всейсовокупности, т.е. были репрезентативны и являлись достаточными дляполучения достоверных результатов наших исследований.2.3. Методы исследованияУ всех пациентов проводилась комплексная оценка состояния здоровья.Обследованиевключалостандартныеобщеклинические,клинико-рентгенологические и лабораторные исследования [68; 124], в том числеиммунологическиеимолекулярно-генетическиеисследования,которыепроводились при поступлении в стационар и взятии на учет в КПТД, на базеФБУН«Омскийинфекций»научно-исследовательскийРоспотребнадзора,оноинститутвключало:природно-очаговыхопределениеуровняиммуноглобулинов (Ig) G, А, М (по методу Manchini и др., 1970) и Ig Е(иммуноферментным методом) в сыворотке крови; оценку фагоцитарнойактивности нейтрофилов по их способности поглощать инертные частицы латекса(по методическим рекомендациям Б.

В. Пинегина с соавт., 1987) и в тесте снитросинимтетразолием(НСТ-тест)спонтанномистимулированном,сопределением коэффициента прироста (по методу B. H. Park et al, 1970); оценкусубпопуляционногосоставаТ-клеток(CD)сиспользованиемпанелимоноклональных антител фирмы DAKO (Дания), определение уровня ИФН-γспонтанного и стимулированного специфическими антигенами (ППД-Л, CFP32B,64Rv2660c, ESAT6, 85а, ESAT6-CFP10) [104], выделение ДНК и генотипированиедвух полиморфных маркеров С-2508Т гена МСР1 и T-1488C гена IFNG.Специфические антигены ППД-Л, CFP32B, Rv2660c, ESAT6, 85а, ESAT6CFP10 были выделены в лаборатории трансляционной биомедицины отделагенетикиимолекулярноймикробиологииименибиологииН. Ф.

Гамалеи,бактерийг.НИЦМосква.Дляэпидемиологиииколичественногоопределения ИФН- использовали ИФА тест-системы, предназначенные дляопределения ИФН- («Вектор-Бест» г. Новосибирск) в супернатантах. Результатоценивали в пг/мл и индексе стимуляции (и.с.). Референсные значения уровеньИФН- для специфических антигенов представлены в таблице 2.4.Таблица 2.4 – Референсные значения уровня ИФН-γ для ППД-Л, CFP32B,Rv2660c, ESAT6, 85а, ESAT6-CFP10Антигенотрицательный результат, пг/млотрицательный результат, и.с.ППД-ЛESAT6Rv2660cЕSAT6-CFP1085аCFP32B<90<150<160<100<85<85≤1≤2≤2≤1≤1≤1Выделение ДНК из периферической крови проводили согласно инструкциинабора«ДНК-кровь»специфической(«ТестГен»,полимеразнойРоссия),цепнойсреакциииспользованием(ПЦР)былоаллель-проведеногенотипирование полиморфных маркеров T-1488C гена IFNG (rs2069705) и С2508Т гена МСР1 (rs1024611) (таблица 2.5).

Генотипирование проводилось сиспользованием наборов для ПЦР в модификации FLASH (производитель«ТестГен», Россия) и амплификатора iQ5 (производитель «BioRad», США)согласно инструкциям производителей. Условия амплификации: 1. 95° – 2 мин (1цикл); 2. 94° – 10 сек, 58° – 1 мин (40 циклов). Определение генотиповпроводилось c использованием программного модуля iQ5 «Дискриминацияаллелей».65Таблица 2.5 – Характеристика исследуемых полиморфизмов генов IFNG и МСР1ГенЛокализация нахромосомеПолиморфизмЛокализация вгенеФерментрестрикцииIFNG12g14T-1488CпромоторHpaIMCP117q11.2-q12C-2508T5’-UTRPvuIIРаспределение частот генотипов по исследованным локусам проверяли насоответствие закону Харди-Вайнберга. Отклонений распределения наблюдаемыхчастот генотипов исследуемого полиморфного участка гена IFNG (T-1488C) игена МСР1 (С-2508Т) от равновесия Харди-Вайнберга не наблюдалось.Оценку чувствительности к туберкулину по пробе Манту с 2ТЕ ППД-Лпроводили в динамике и при поступлении.

Оценка результатов пробы Манту с 2ТЕпроводилась поПриказу МЗРФот 21.03.2003№109.Оценкучувствительности к АТР (Приказ МЗ РФ №855 от 29 октября 2009 г. «О внесенииизменений в приложение № 4 к Приказу МЗ РФ от 21.03.2003 № 109») проводилипри поступлении в стационар или взятии на учет в КПТД.Результативной вакцинация БЦЖ или БЦЖ-М считалась при наличии рубца4 мм и более и ПВА.2.4. Статистические методы исследованияСтатистическаяобработкаданныхпроводиласьнаперсональномкомпьютере с использованием программ OpenEpi версия 3, Statistica 6,0 и StatPlusPro 5.9.8.Расчет выборки (n) был определен в программе OpenEpi версия 3, с учетомчисленностигенеральнойсовокупностииожидаемогоуровняраспространенности изучаемого явления.

Размер общей выборки составил 271человек при минимальном количестве в группе до 12 человек.66Длявсехизученныхполиморфныхвариантовгеновввыборкахпопуляционного контроля распределение генотипов проверялось на соблюдениеравновесия Харди-Вайнберга (р2АА + 2рqАа + q2аа = 1).Определяли среднее арифметическое (М); стандартная ошибка среднего(±SEM); доверительный интервал с уровнем р=0,95 (95% CI или 95% ДИ) принормальном распределении или медиану (МЕ); квартиль верхний и нижнийр=0,25 и р=0,75 (Q25%:Q75%) при распределении значений, отличном отнормального. Достоверность различий оценивалась по критерию Стьюдента (t)(при нормальном типе распределения переменных) и по критериям длямножественных сравнений.

Использовали однофакторный дисперсионный анализ,непараметрические критерии: Манна-Уитни (U), Краскела-Уоллиса (H), хиквадрат (χ2, Пирсона). Различия считались статистически достоверными приуровне значимости р≤0,05. Анализ связи нескольких переменных проводили спомощью подсчета коэффициента корреляции Спирмена (r): принято считать, чтопри r≤0,25 – корреляция слабая, 0,25<r≤0,75 – умеренная, при r>0,75 – сильная.[75; 76; 87; 128,].

Для классификации информации при формировании групп покачественному и количественному сходству применяли кластерный анализ, вчастности, метод k-средних (результаты кластеризации считались успешными,при больших значениях Between SS, больших значениях F, малых значениях p)[128]. Чувствительность и специфичность диагностических тестов с 95% ДИ (CI),а также расчет рисков (коэффициент риска, RR) и отношение шансов (ОШ илиOR) (если шанс (риск) был выше 1, то развитие заболевания считалосьстатистически значимо), в том числе при оценке генетических маркеров,определялись в соответствии с подходами, описанными А.

Е. Платоновым (2000)и А. Петри с К. Сэбин (2010) [75; 76].Теорема Байеса [60] применялась для оценки вероятности наличия ЛТИ илиТБ в конкретном симптомокомплексе, оценивали шансы (ОШ (OR) илилогарифмические отношения правдоподобия (L), если шанс конкретногосимптома больше единицы, то данный симптом встречается чаще, чем в половинепроцентов случаев. Байесовская модель была использована в разработанных67диагностическихкомпьютерныхпрограммах(алгоритмах)дляобработкипоступающей информации о пациентах с подозрением на ТБ или ЛТИ. Оцениваявыбранную модель для компьютерной программы (алгоритма), использовалиметод «точек разделения» для расчета порогового уровня принятия решения (вслучае превышения порога рискового значения обследуемым может бытьрекомендована консультация специалиста).

«Точки разделения» для трехпрограммбылиполученыпутемрасчетасоотносящихсяснимичувствительности, специфичности и прогностичности. Для оценки операционныххарактеристик Байесовской модели был применен ROC-анализ [87]. ПостроеннаяROC-кривая основана на всех точках-разделения, которые дают уникальную парузначений для чувствительности и специфичности, что позволяет вычерчиватьзависимость чувствительности от величины 1 минус специфичность (сравнивая,таким образом, вероятности положительного результата диагностического тестаили алгоритма у больных и здоровых пациентов).

Два или более теста можносравнивать путем рассмотрения площади (AUC) под каждой кривой. Согласношкале значений AUC (табл. 2.6), чем выше показатель, тем более качественнаямодель.Таблица 2.6 – Шкала значений AUCИнтервал AUC0,9-1,00,8-0,90,7-0,80,6-0,70,5-0,6Качество моделиОтличноеОчень хорошееХорошееСреднееНеудовлетворительноеТаким образом, работа выполнена на достаточном объеме выборке сиспользованием современных статистических методов.68ГЛАВА 3. ОСОБЕННОСТИ РАЗВИТИЯ ЛАТЕНТНОЙ ТУБЕРКУЛЕЗНОЙИНФЕКЦИИ И ФАКТОРЫ ЕЕ ПРОГРЕССИРОВАНИЯ У ДЕТЕЙС целью изучения прогностической ценности факторов риска развития ТБ удетей с ЛТИ провели сравнительный анализ результатов наблюдений за 156пациентами с ЛТИ (группа «ЛТИ»), 44 – не инфицированными МБТ (группа«НТ») и 110 – больными ТБ детьми (группа «ТБ»).

Проанализировалиособенности онтогенеза (учитывали биологический и социальный анамнез),физическогоразвития,уровеньрезистентностиорганизмаребенка,функционального состояния органов и систем, а также наличие или отсутствиехронических заболеваний [84].3.1. Особенности социального анамнеза при развитии ЛТИ и еепрогрессировании у детейДети, инфицированные МБТ, формируют группу риска по ТБ [124],реализация риска, по исследованиям многих авторов, возможна при сочетаниимедико-биологических и социально-эпидемиологических факторов [40; 78; 93;105; 116; 124], при этом вклад каждого фактора неравнозначен [59; 123; 124], чтотребует их дополнительной оценки.Результаты социального анамнеза позволили выделить социальные факторыриска, которые представлены в таблице 3.1.Таблица 3.1 – Результаты социального анамнеза в группах сравненияДанныесоциальногоанамнезасемья неполнаясемьямногодетнаяТБ,n=110абс(%)ЛТИ,n=156абс(%)НТ,n=44абс(%)45(40,9)19(12,2)9(20,5)37(33,6)10(6,4)4(9,1)RRТБЛТИ,95%CI3,359;2,0845,4145,247;2,72710,1Критерийχ2ТБ-ЛТИ, р29,14;<0,000000132,87;<0,0000001RRЛТИ НТ,95%CI0,595;0,2901,2220,705;0,2322,140Критерийχ2ЛТИ-НТ, р1,952;0,0810,379;0,26969Продолжение таблицы 3.1воспитываютсяопекунамииз учрежденийсоциальнойзащиты16(14,5)00----4(3,6)00----56(50,9)10(6,4)11(25)7,942;4,24214,8768,47;<0,00000010,256;0,1170,56412,62;0,0002164(94,3)n=17496(32,8)n=29359(74,7)n=792,877;2,4323,403167,3;<0,00000010,439;0,3560,54044,99;<0,0000001занятость матери:не работает73(71,6)n=10272(46,2)n=15620(45,5)n=44занятость отца: неработает27(37,5)n=7219(13,9)n=1373(8,6)n=35в семьезлоупотребляюталкоголем илинаркотиками24(21,8)1(0,6)1(2,3)34,040;4,647247,8133,98;<0,00000010,282;0,0184,4180,923;0,16853(48,2)42(26,9)12(27,3)1,790;1,2962,47212,7;0,00020,987;0,5711,7070,002;0,482жилищнобытовые условиянеудовлетворительные53(48,2)6(3,8)8(18,2)12,530;5,58328,11173,47;<0,00000010,212;0,0780,57710,83;0,0005ребенок неорганизован32(29,1)30(19,2)39(88,6)1,513;0,9802,3353,509;0,0310,217;0,1550,30473,16;<0,0000001семьямалообеспеченнаяобразованиеродителейсреднее илисреднеспециальноев семье курят1,551;1,2581,9112,704;1,6194,51616,18;0,0000315,35;0,000041,015;0,7051,4631,618;0,5075,1590,007;0,4670,701;0,201Как видно из таблицы 3.1, оценивая риски социальных факторов в развитиитуберкулеза, установили, что наибольший вклад связан со злоупотреблением всемье алкоголя и употреблением наркотиков (RR 34,04) [124], с безработицейродителей (при этом выше риск, связанный с отцом RR 2,704, чем с матерью RR1,551) [124].

Не меньший – при неудовлетворительных жилищно-бытовыхусловиях (RR 12,53) [7; 47; 55; 63; 91; 123], а также при среднем или среднеспециальном образовании родителей (RR 2,877) [63; 91; 123], неполной семье (RR3,359) [55; 91], малообеспеченной семье (RR 7,942) [55; 91; 105; 123], при наличиикурящих в семье (RR 1,790) [7; 47; 55], многодетной семье (RR 5,247) [55; 105;70123]. Дополнительно выделили такой социальный фактор риска ТБ, как статус«неорганизованного» ребенка (RR 1,513), что ранее не отмечалось.При определении рисков инфицирования МБТ, не было установлено связи ссоциальными факторами, за исключением занятости родителей (отсутствиепостоянной работы у отца RR 1,618 и у матери RR 1,015).3.2. Особенности биологического анамнеза при развитии ЛТИ и еепрогрессировании у детейПорезультатамбиологическогоанамнеза(антенатальногоиинтранатального периодов развития) также были выделены факторы риска,которые представлены в таблице 3.2.Таблица 3.2 – Результаты антенатального и интранатального периодов развитиядетей в группах сравненияДанныебиологическогоанамнезаВозраст материмладше 18 лет истарше 25 летВредныепривычкиматери:-курение,ТБ,n=105абс(%)ЛТИ,n=156абс(%)НТ,n=44абс(%)RRТБЛТИ,95%CIКритерийχ2ТБ-ЛТИ, рRRЛТИ - НТ,95%CIКритерийχ2ЛТИ-НТ, р52(49,5)107(68,6)21(47,7)0,722;0,5790,9009,582;0,0011,437;1,0361,9936,483;0,0057,131;2,81018,10024,54;<0,00000040,705;0,1423,5110,183;0,335----0,940;0,7701,1480,377;0,2700,864;0,6951,0741,481;0,11224(22,9)5(3,2)2(4,5)3(60)n=51(20)n=52(100)n=2-злоупотребление алкоголем,8(33,4)n=2411(45,8)n=24-употреблениенаркотиков5(20,8)n=241(20)n=50Наличиехроническихзаболеваний(экстрагенитальных) у матери62(59)98(62,8)32(72,7)071Продолжение таблицы 3.2Патологиятечениябеременности:-токсикозы,угрозапрерывания62(59)88(56,4)34(77,3)- анемия17(16,2)20(12,8)11(25)-инфекции(во времябеременности):19(18,1)60(38,5)11(25)ОРВИВГСВИЧсифилистуберкулезВПЧветряная оспаПатология впериод родов(преждевременные, запоздалые,затяжные)Оперативныероды:-кесарево сечениеНаследственностьпо туберкулезу:-отягощена51346534001119221(20)23(14,7)6(13,6)11(10,5)21(13,5)068(61,8)n=11012(7,7)1(2,3)1,047;0,8481,2920,179;0,3360,730;0,5910,9026,279;0,0061,263;0,6952,2950,586;0,2220,513;0,2660,9883,887;0,0240,471;0,2990,779(хр.инф3,467;1,3768,732)12,33;0,0002(7,983;0,002)1,538;0,8892,664(остр.инф1,692;0,9093,150)2,716;0,049(3,19;0,037)1,357;0,7932,3221,237;0,1341,081;0,4702,4890,034;0,4270,520;0,235«неопределеннный»6,618;0,00589,87;<0,00000013,385;0,45325,3201,659;0,0990,778;0,3921,5468,036;4,57614,110Из таблицы следует, что в антенатальном периоде основными факторамириска ТБ выступали наличие вредных привычек матери во время беременности(беременность, протекающая на фоне хронической никотиновой интоксикации,злоупотребления алкоголя и употребления внутривенных наркотиков – героина)(RR 7,131), что согласуется с данными Крюковой А.

Характеристики

Список файлов диссертации

Персонифицированная ранняя диагностика и стратификация рисков прогрессирования туберкулезной инфекции у детей
Свежие статьи
Популярно сейчас
Как Вы думаете, сколько людей до Вас делали точно такое же задание? 99% студентов выполняют точно такие же задания, как и их предшественники год назад. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6418
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее