Диссертация (1139658), страница 8
Текст из файла (страница 8)
(2010) былоустановлено, что иммуногенетическим фактором, обладающим протективнымэффектом в отношении подверженности ТБ легких, является аллель Т игомозиготный генотип ТТ полиморфизма +874А/Т гена INFG. Подверженностьтуберкулезной инфекции ассоциирована с аллелем А, а также с генотипами АА иAT полиморфизма +874А/Т гена INFG [8]. А. В. Поспелов (2011) в исследованиитакже указал, что гомозигота по аллелю С сайта INT4 гена Nrampl и гомозиготапо аллелю Т сайта +874 гена INFG достоверно чаще встречаются у здоровогоконтингента европейской части России по сравнению с больными ТБ детьми иподростками, а гомозигота по аллелю А сайта +874 гена INFG достоверно чащевстречается у больных ТБ детей и подростков европейской популяции посравнению с не болеющими ТБ [81].
Имеющиеся на сегодняшний день данные офенотипическомпроявленииполиморфныхвариантовгеновносятпротиворечивый характер и не позволяют сделать однозначных выводов об ихвкладевразвитиеиспользованиеинфекционныхзаболеваниймолекулярно-генетических,биоинформационныхполиморфныхподходоввариантовдлягеновоценки[372;445].Совместноеэпидемиологическихфункциональнойпозволяетобеспечитьизначимостивысокуювоспроизводимость и точность полученных ассоциаций между генотипами изаболеванием.ВисследованииД. С. Ожеговой(2009)быливыбраныфункционально значимые полиморфные варианты С-2508Т гена МСР1, T-1488Cгена IFNG, G-1704del гена IFNGR2 с помощью биоинформационной программыMatInspector: уровень экспрессии генов по этим полиморфным вариантамсущественно меняется в зависимости от генотипа.
Было установлено, что уносителей одних и тех же генотипов гена MCP1 по исследуемым полиморфизмамразные виды стимуляторов с неизменной концентрацией вызывали разныеэкспрессионные ответы в культурах клеток. Так гомозиготные генотипы -2508ССи -2508ТТ гена обладали протективной ролью в развитие ТБ. Также былоустановлено, что аллель -1488С гена IFNG играет протективную роль в развитиииммунитета против МБТ [72]. Поэтому данные о функциональной значимости41полиморфных вариантов промоторной области генов МСР1, IFNG и IFNGR2могут служить основой для дальнейшего изучения их ассоциации с рискомразвития внутриклеточных инфекционных заболеваний.1.3. Методы выявления и диагностики ЛТИ (специфические антигены)В то время как у взрослых ТБ развивается обычно из-за реактивации,педиатрический ТБ обычно представляет собой первичное заболевание.
Крометого, существуют значительные различия в иммунных реакциях между взрослымии детьми. Полученные результаты свидетельствуют о нетипичном клиническомпроявлением ТБ у детей с малочисленными классическими признаками исимптомами, что приводит к значительным трудностям в постановке диагноза[141].
У детей младшего возраста ТБ часто генерализованный и может быстропрогрессировать в начале жизни, пока иммунная система только формируется[137]. Диагностическая задержка быстро приводит к повышенной заболеваемостии смертности, поэтому экспресс-диагностика становится особенно важной. Тем неменее различия в проявлении заболевания у детей и взрослых приводит кснижению чувствительности диагностических тестов ТБ. Например, полостныезаболевания редко встречаются у детей, в то время как до 30% имеютвнелегочные проявления, свидетельствующие о распространении инфекции наранних стадиях заболевания [137]. Микроскопия мокроты на МБТ, наиболеечастый метод выявления ТБ среди взрослых (до 50%), составляет от 10 до 15%, ачасто менее, чем 10%, положительных результатов у детей при развитии ТБ [140;187]. Даже метод посева, золотой стандарт для взрослых, обнаруживает максимумот 30 до 40% случаев ТБ у детей, а также в большинстве случаев уровеньобнаружения ниже 20% [140; 187; 207].
Недавнее исследование, оценивающееобнаружение нуклеиновой кислоты одобренного ВОЗ теста Xpert MTB/RIF(Cepheid, CA), у южноафриканских детей продемонстрировало повышеннуючувствительность (13%) этого экспресс-метода по сравнению с микроскопиеймокроты (6%) [140]. Еще больше осложняет дело младший возраст детей: они42часто не в состоянии предоставить образец мокроты [237]. Альтернативнымиматериалами могут быть, например, индуцированная мокрота или желудочноесодержимое, что еще труднее собрать, при этом методы не имеют высокойчувствительности [237]. Поэтому оптимальный диагностический тест дляпедиатрического ТБ должен обеспечивать быстрые результаты и использоватьлегкодоступные образцы независимо от места заболевания, такие как кровь илимоча.Усиления мощности системных иммунных реакций потенциально можетобнаружить инфекцию при низком пороге антигенной нагрузки и даже удаленныхот места инфекции.
Анализы, которые обнаруживают туберкулезную инфекциюпутем измерения IFN-γ-циркулирующих лимфоцитов в ответ на специфическиеантигены (IGRA), являются более точными, чем ТСТ [301]. Тем не менее, онитребуют культивирования клеток, что не позволяет их использовать в качестверутинных методов, в большинстве случаев из-за ограниченных ресурсов.Значение тестов по высвобождению IFN-γ в выявлении ЛТИ и ТБ у детей былонедавно рассмотрено [417]. По сравнению с ТСТ, IGRA показывают подобнуючувствительность в выявлении ТБ у детей (от 70 до 90%) [181]. Тем не менеечувствительность IGRA для ТБ уменьшается в странах с низким уровнем дохода(от 40 до 80%); данные несоответствия до сих пор не объяснены [181].Исследования показывают пониженную чувствительность и более высокийуровень неопределенных IGRA у детей в возрасте до 5 лет [300; 416].Недостаточно данных, чтобы адекватно оценить производительность IGRA посравнению с ТСТ у детей младше 5 лет, однако недавнее исследование показало,что продукция IFN-γ у маленьких детей приводит к немного большейчувствительности IGRA по сравнению с TСT [299].
Что наиболее важно, так же,как и у взрослых, ни ТСТ, ни IGRA не может отличить ТБ от бессимптомногосостояния инфекции [315; 338].Серологические реакции на антигены МБТ у детей широко варьируют причувствительности и специфичности в пределах от 14 до 85% и от 40 до 100%соответственно. Эта широкая изменчивость обусловлена несколькими факторами,43в том числе детским возрастом, который оказывает наиболее сильное влияние наответы AТ, при этом в исследовании результаты оценивались независимо отантигена.
До тех пор пока оценивать и интегрировать основные различия виммунных реакциях и патофизиологии ТБ между взрослыми и детьми не будут,потенциал серодиагностики в педиатрии будет оставаться неопределенным [141].При интерпретации серологических данных у детей полезно сначала понять, какразвивается их иммунная система. Некоторые из проблем в педиатриисерологическихисследованийможнообъяснитьмедленнымразвитиемгуморальных иммунных реакций у младенцев и детей младшего возраста [367;410]. Подтверждающие данные замедленного гуморального иммунного ответаисходят из данных вакцинации детей [204; 409; 481].Важной вехой в современной истории изучения ТБ стало окончаниесеквенирования генома МБТ [195; 386]. Для установления полной нуклеотиднойпоследовательности был выбран хорошо изученный лабораторный штамм МБТH37Rv.
На настоящий момент в геноме МБТ длиной 4411532 п.о. насчитывают4012 генов, 7 псевдогенов, 48 генов стабильных РНК и 25 генов малых РНК (M.tuberculosis annotation, release R21, http://tuberculist.epfl.ch/). Несомненный интереспредставляетсобойтотфакт,чтогеномМБТбогатIS-элементами.Предполагается, что различающаяся функциональная активность IS-элементовможет являться причиной различий в экспрессии некоторых генов у рядаштаммов МБТ. Примерно 4% генома участвует в кодировании белков двухродственных семейств PE и PPE, характерных только для МБТ [154; 163; 195;390].
Аннотирование генома МБТ штамма H37Rv показало, что он содержит 3995открытых рамок трансляции (ОРТ), но лишь для 52% из них удалось предсказатьфункциональную активность [386]. Все выявленные гены получили порядковыеномера, следующие за аббревиатурой Rv. Анализ протеома МБТ с применениемметодов двумерного электрофореза в сочетании с MALDI-MS фингерпринтингом[178] позволил выявить не менее 1800 клеточных и 800 секретируемых белков.По-видимому, именно среди секреторных белков в первую очередь следуетискать антигены, перспективные для создания новых вакцин и диагностических44тестов[177].Однакоидентификациятакихпотенциальныхантигеновпредставляет собой непростую задачу, поскольку, с одной стороны, все ещеотсутствуютточныеданныеополномспектресекретируемыхбелков,выделяемых МБТ в организме больного, а, с другой стороны, известно, что ихколичественный и качественный составы могут существенно изменяться взависимости от реакции организма при инфицировании и от течения заболевания[311].Семейство ESAT6.
К семейству ESAT6 относят низкомолекулярныеранние секретируемые белки, которые кодируются более чем 20 генами [251]. Ких числу относят не только собственно ESAT6 (синонимы: esxA, Rv3875,MT3989, MTV027.10), но и белки, кодируемые рамками Rv0287, Rv0288 (TB10.4),Rv2346c, Rv2347c, Rv3619c, Rv3620c, Rv3890c (Mb3919c), Rv3905c (Mb3935c) иCFP10 (Rv3874) [251; 415], по нуклеотидным последовательностям которыхмежду M.