Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1090326), страница 11

Файл №1090326 Диссертация (Структурные и каталитические свойства ферментов перекисного окисления липидов – 1215-липоксигеназ) 11 страницаДиссертация (1090326) страница 112018-01-18СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 11)

16). Масштабирование хроматографической методикипозволяло выделить оптически чистые энантиомеры 16НЕТЕ (оптическая чистота>99%)вколичестведонесколькихдесятковмиллиграмм.Конфигурациюасимметрической ОН-группы подтверждали измерением угла оптического враще1Введениерадиоактивной метки проводили в Институте молекулярной генетики РАН53ния с последующим сравнением экспериментальных данных с литературными(21а): метиловый эфир 16(R)-НЕТЕ []D21 +6 (с 0,7, ацетон); 21b, 16(S)-энантиомер[]D21 -6 (с 0,7, ацетон) (лит. данные []D23 -5.4 [205]). Для определенияконфигурации хирального центра в соединениях 25а и 25b использовалигидрированиеэнантиомероввсоответствующиететраеноаты,идентичныесоединениям 21а и 21b.

17(S)-НЕТЕ (33b) и ее моноацетиленовый аналог (34b)получалинаоснове(R)-энантиомераинверсиейхиральногоцентрасиспользованием реакции Мицунобу [205, 219] или полным химическим синтезомисходя из (R)-эпихлоргидрина как описано для соединений 31 и 32.В силу того, что высокая удельная радиоактивность [5,6,8,9,11,12,14,15-3H8]17(R)-НЕТЕ (30), необходимая для ряда биологических исследований, затрудняетее использование при проведении дальнейших модификаций в препаративноммасштабе, 14,15-дегидро-16- (26) и 14,15-дегидро-17-НЕТЕ (34) были выбраны вкачестве предшественников азидов.

Введение азидогруппы проводили черезсоответствующие п-толуолсульфонаты [220], что приводило к инверсии хиральногоцентра.Синтезчерезбромидысохранялисходнуюконфигурациюасимметрического центра, однако замещение бромида на азид происходило неполностью. Важно отметить, что каталитическое восстановление тройной связиазидов 38а и 38b на катализаторе Линдлара в сухом бензоле не затрагивалоазидогруппу, тогда как использование метанола приводило к восстановлениюазида в амин [221, 222]. Кислоты [14,15-3Н]-17-N3-ЕТЕ (39а и 39b) были получены свысокой удельной активностью ~40 Ки/моль и по своим свойствам идентичнынемеченым производным 36а и 36b, синтезированным на основе 17-НЕТЕ [212].Использование энантиомеров 16-НЕТЕ (21) и их 14,15-дегидроаналогов (25) врамках предложенной схемы приводило к образованию лишь следовых количествцелевых продуктов вследствие низкой стабильности и высокой реакционнойспособности аллильных ипропаргильных азидов.синтетическихипроблемнизкойВ силу вышеуказанныхстабильности,-4замещенныеазидопроизводные АК в проведении дальнейших исследований не использовались.4.1.3.

Синтез терминальных и 2 субтерминальных замещенныхпроизводныхарахидоновойкислоты.Восновусинтезановыхазидо-производных 46 и их меченых тритием аналогов 47 положена методология,разработанная для соединений 16- (22) и 17-НЕТЕ (33) (Схемы 4 и 5). rac(5Z,8Z,11Z,14Z)-19-(44b)иrac-(5Z,8Z,11Z,14Z)-18-Гидрокси-5,8,11,14-эйкоза-тетраеновые (44а) кислоты использовались в качестве ключевых промежуточныхсоединений (Схема 6). (5Z,8Z,11Z,14Z)-20-Гидрокси-5,8,11,14-эйкозатетраеновая54кислота (44с) была использована в работе без дальнейших модификаций.

Изсоображений безопасности введение азидогруппы в молекулу радиоактивномеченыхгидроксикислот45[радиохимическаячистота>95%иудельнаярадиоактивность в 160 Ки/ моль] проводилось с использованием образцовразбавленных немечеными аналогами 44 в соотношении 1:100. Конечные продукты47 были получены с выходом ~26% по 2-м стадиям с удельной радиоактивностью винтервале0,79-1,6Ки/моль[217].Идентичностьрадиоактивно-меченыхсоединений 47 их немеченым аналогам 46 показана с помощью аналитическойВЭЖХ.Схема 6Условия: (a) CBr4, PPh3, CH2Cl2, 20oC, 1 ч; (b) 8, CuI, NaI, K2CO3, ДМФ, 20oC; (c) H2/3H2катализатор Линдлара, бензол, 10oC; (d) NaOH, MeOH-H2O, 20oC; (e)TsCl, CH2Cl2,Py, 20oC, 24 ч; (f) NaN3, ДМФ, 75-80 oC, 3,5 ч4.2.

Синтез зондов активного центра на основе ингибиторов r12/15-LOXИспользование ингибиторов является распространенным подходом приисследованиикаталитическогоцентрафермента,связывающихдоменоврегуляторных белков и пр. С целью изучения механизмов взаимодействия в рядуr12/15-LOX–лиганд были получены новые соединения 48-52, дизайн которыхоснован на сходстве с известными ингибиторами 5-LOX и r12/15-LOX (рис. 17),55Рис. 17. Структуры ингибиторов r12/15-LOХтаких как целутон (53) [23], эбселен (54) [223, 224] и салициловая кислота (55) [225].(Z)-Изомер метилового эфира 2-бензилиден-3-оксо-2,3-дигидробензо[b]тиофен-7карбоновой кислоты (BODTCM) (48)2 получали реакцией тиондоксила (56) сбензальдегидом (57) (Схема 7) [226].

Облучение раствора (Z)-BODTCM в ДМСОпри405нмприводилокизомеризациидвойнойсвязис образованиемфотостационарной смеси (pss). Определение количественного соотношения Z- и Eизомеров в смеси pss (Z/E=38:62) проводили с помощью 1Н-ЯМР спектроскопиисравнением интенсивности сигналов винильных протонов с химическим сдвигомСхема 7Условия: (a) бензальдегид (57), 4М HCl в диоксане, 20oC; (b) MeOH, 70oC, 1,5 ч; (c)облучение при 405 нм.2Выполненосовместно с Институтом химии Технического университета, г. Берлин,Германия.56=7,96 и =7,73 м.д.

для Z- и E- изомеров, соответственно. (Е)-BODTCM (48b)выделяли хроматографическм разделением смеси pss препаративной ВЭЖХ. УФспектры каждого из изомеров 48а и 48b характеризовались наличием двухмаксимумов поглощения при 320 и 436 нм, и 320 и 455 нм, соответственно.Соединения, содержащие связи типа Se-N, Se-O, помимо связывания сактивным центром фермента (прямое ингибирующее действие), обладают такжередокс-потенциаломи,следовательно,могутоказыватьнепосредственноевоздействие на степень окисления каталитического железа, восстанавливаяфермент в его в неактивную Fe2+-форму. С целью создания новых потенциальныхселеносодержащихингибиторовLOX,обладающихвосстанавливающимисвойствами, предложен синтез новых 5-селенопроизводных салициловой кислоты49-52 с использованием тетрахлорида селена (Схема 8) [227, 228].

ВодныйСхема 8Условия: (a) SeCl4, TГФ, 20oC, 1 ч; (b) H2О, 20oC, 24ч; (c) SeCl4, TГФ, 70oC, 1 ч.гидролиз промежуточных 5-арилтрихлоридов селена, полученных в мягкихусловиях, приводил к образованию 5-арилпроизводных селенистой кислоты (50c-e)и/или ангидридов (49a-b). В отличие от ранних исследований [229], используясовременные методы физико-химического анализа (ЯМР, масс-спектроскопиювысокогоразрешенияирентгеноструктурныйанализ)образования5-арилтригидроксида селена обнаружено не было. Следует отметить, что только в57случае, когда монозамещенные амиды салициловой кислоты (55) содержалисвободную карбоксильную группу, в реакции образовывались соответствующиеангидриды 49a-b (Схема 8).

Эти данные свидетельствовали о возможностипротекания так называемой самопроизвольной этерификации в присутствиизаместителя, содержащего свободную карбоксильную группу. Это предположениекосвенно подтверждалось данными масс-спектрометрии высокого разрешениясоединения 50e, для которого массовое число (m/z 264,96031), соответствующеемолекулярному иону метилового эфира, было получено при использованииметанола в качестве растворителя (рис 18).

В более жестких условиях прикипячениивТГФпромежуточные5-трихлорселенильныепроизводныесалициловой кислоты разлагались с образованием смеси «желтого» диселенида51 и «белого» моноселенида 52, которые разделяли с помощью флешхроматографи и охарактеризовывали с помощю спектровдвумерной гетеро-ядернойсоединениябыли77Se-ЯМРС-ЯМР и13H/ C корреляции (HMQC) (рис. 19 и 20). Все1выделены13вспектральными данными включаякристаллическомвиде,охарактеризованыSe-ЯМР (таблица 2), физико-химическими77константами и данными рентгеноструктурного анализа (для соединений 50c-e).Таблица 2.

Физико-химический анализ соединений 49-52.Соединение(брутто формула)49a(C18H15N2O11Se2)49b(C26H32N2O11Se2)50c(C7H7NO4Se)50d(C9H10O5Se)50e(C7H6O5Se)51(C14H10O6Se2)52(C14H10O6Se)Элементный анализнайдено / вычисленоМасс-спектрывысокого разрешения77Se-ЯМРH(%)2,71/2,34C(%)36,38/36,51N(%)4,71/4,45найдено(m/z)594,9009вычислено(m/z)594,9012(м.д.)11824,85/4,5744,24/44,203,88/3,97709,0409709,040611772,86/2,8434,16/33,895,65/5,65247,9474247,946811773,45/3,6439,07/39,01-276,96209276,9620711762,72/2,4333,46/33,75-248,93021248,9307711752,23/2,3338,86/38,91-432,87284432,873505022,82/2,8547,48/47,61-352,95614352,9569839758Рис.

18. Масс-спектр высокого разрешения соединения 50e в MeOH59Рис. 19. 77Se-ЯМР спектры соединений 51 (верхняя панель) и 52 (нижняя панель).60Рис. 20. 13С-ЯМР спектры соединения 51 (верхняя панель) и фрагмент ЯМР-спектрадвумерной гетеро-ядерной 1H/13C корреляции (HMQC) соединения 52 (нижняяпанель).61Глава 5. Изучение взаимодействия r12/15-LOX с лигандом3,45.1. Исследования r12/15-LOX с использованием аналогов их природныхсубстратов5.1.1.Введениеразработаннойфотоаффиннойстратегииисследованияметкивструктурныхr12/15-LOX.элементовВосновуфермента,непосредственно взаимодействующих с молекулой ПНЖК, положен принципподобия структур природного субстрата LOX – АК и синтезированных азидо-ETE.Кинетический анализ параметров окисления фотоаффинных зондов 36 и 46a-bпоказал, что параметры окисления 19-азидо-ETE (46b), КМ* 10,9 мкМ и kcat 20 сек-1,наиболее близко сопоставимы с характеристиками, полученными для АК (рис.

21А).Анализ ВЭЖХ продуктов окисления соединения 46b подтвердил образованиеосновного продукта с максимумом поглощения при 235 нм (рис. 21Б), чтохарактерно для сопряженного диенового хромофора с (Z,E)-конфигурацией.Присутствиенезначительныхколичествпобочногопродуктасовременемудерживания 9,9 мин и максимумом поглощения при 231 нм свидетельствовало оналичии (Е,Е)-геометрии двойных связей в его структуре. Хотя, в случае 17-азидоЕТЕ (36) и 18-азидо-ETE (46а) основная доля продуктов окисления и содержалаОН-группуприC-15,наличиерядапобочныхизомерныхпродуктовсвидетельствовало о более низкой степени субстратной специфичности реакции.Таким образом, на основе высокого субстратного сходства с АК 19-азидо-ETE и еемеченый тритием аналог (46b и 47b) были выбраны в качестве фотоаффинногомаркера.

Вследствие более низкой субстратной специфичности 17-азидо- и 18азидо-ETE для проведения дальнейших экспериментов не использовались. Вцелях оптимизации процесса (рис. 21В) было исследовано влияние температуры,продолжительности УФ-облучения, а также мольное соотношение количеств[фермент/зонд] в диапазоне от 1:1 до 1:1000 на эффективность введения метки. Воизбежание неспецифической маркировки было выбрано соотношение 1:50. В этих3Выполненов Институте биохимии Медицинского университета Charité, г.

Характеристики

Список файлов диссертации

Свежие статьи
Популярно сейчас
Почему делать на заказ в разы дороже, чем купить готовую учебную работу на СтудИзбе? Наши учебные работы продаются каждый год, тогда как большинство заказов выполняются с нуля. Найдите подходящий учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6384
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее