Frenkel, Smit - Understanding molecular simulation - 2002 (523144), страница 57
Текст из файла (страница 57)
ТЬе Еоппи1а Еог ЕЬеае ехрапаюпа аге 8?чеп, Еог ехатр?е, т [328]; Ьеге ъче 8?че а хогг деаспрйоп оЕ ЕЬе Еоиг Еоппи1аа ЕЬаг аге иаей. ?п Ейе ъ?еаспрйоп оЕ йъе а!допйип ъче геЕег Ео ЕЬе орегайоп Ьу ЕЬе ъчогйа ?п ?га??са. ° Ми!ЕЕро!е еграпа?оп оЕ Ейе сЬагйеа 1п а се11. Бирроае ъче Ьаче а сЪЬ?- Ъи?юп оЕ )с сЬагдеа аг 1оса6оп гъ = (тъ, 9ъ, ф,) ъч?ФЬ сЬагде цъ, ЕЬеп ЕЬе ро?епйа? аг а ро?пг г' = (г', 9', ф ') ви?йс! еп??у Еаг аъчау Еа 8?чеп Ьу СЬаргег 12. Еоп8-Яап8е !и!стас!(опв сеПв. ТЬ)в !пчо1чев а сопчегяоп оЕ ЕЬе пш16ро1е ехрапяопв !пго а 1оса1 ехрапяоп ЕЬаг сопчег8ев !и ЕЬе гее!оп оЕ !пгегев!.
8)псе, !п йеве пш)Е!ро1е ехрапяопв, йе с!ове-Ьу се11в аге ехс1идед, ъч!Нип а се11 йе рогепГ!а! епегеу доев по! сЬапде пшсЬ; ЕЬегеЕоге И гв ас1ъапгацеоив Ео гпа1се а Тау1ог ехрапяоп оЕ ЕЬе 1оса! Яе1д Еп еасЬ се11. ТЬь йе1д сап ЕЬеп Ье овес! Ео са1си1аге 6ъе епегеу Еог а11 агопъв !и ЕЬЬ се11. ТЪ!в ехрапяоп сап Ье ивес1 оп!у Еог роя6опв !и йе вагпе се!1. ° Тгапв!а!оп оЕ'Яе !оса! ехрапыоп. 1Е ъче Ьаче са1си)агед ЕЬе 1оса1 ехрап яоп ъч!ЕЬ геврес! Ео а 8!чеп ог!8!и, Еог ехагпр1е, йе 1оса1 ехрапвюп оЕ ЕЬе рагепг Ьох, ъче сап Егапв1аге 66в 1оса1 ехрапвюп Ео, Еог ехагпр1е, ЕЬе сепгег оЕ Ьв сЬ!1дгеп се11в. ТЬе Сгеепдагд апд РъоИ~!!и а!дог!Нип сопв!в!в оЕ йе Ео11оъч!п8 вгерв: 1. Ап ос!а! Егее оЕ 1ече1 х !в сопвггисгед; ЕЬе сЬагее д!въг!Ьи6оп !п еасЬ оЕ ЕЬе 8~ се11в !в девспЬед ъч!й а пш!6ро1е ехрапяоп (12.2,1) аЬоиг ЕЬе сепгег оЕ а Ьох. 2.
ТЬе пш16ро1е ехрапяоп оЕ еасЬ оЕ ЕЬе су61дгеп оЕ а рагеп! Ев Егапв- 1агед Ео а пш16ро1е ехрапвюп агоипд йе сепгег оЕ ЕЬе рагепЕ Ьох. ТЬ(в ргоседиге !в гереагед ип6! 1ече1 иего Ьав Ьееп геасЬес1. 3. ТЬе са1си1а6оп оЕ йе епегцу Ев допе ш Еъчо вгерв. СопвЫег а раг 6с1е !п !ече! Р се!1 С! ~. ТЬе са1си1абоп оЕ ЕЬе !пгегас6опв ъч!ЕЬ ЕЬе рагг!с!ей йе вагпе сей апд т ЕЬе 26 пе!8ЬЬог!пц 1ече1-К сеБв !в регЕоппед г6гесбу: ъгс1о г!ъг!! гц иО56 ТЬе иъгегас6опв ъч!й ЕЬе гегпа!пг1ег оЕ ЕЬе раг6с!ев аге допе Ъу са1- си)а6пд 6ъе )оса1 Яе1д ехрапяоп ш сеП С, .
То са1си)аге й!в 1оса1 Йе1д, ЕЬе Ео11оъчиъ8 вЕерв аге ивед вЕагЕ!пе Егопь 1ече1 !ъчо (Еог 1ече1в лего апд опе, а 1оса1 ехрапяоп доев по! ех!вЕ, апд ЕЬеге(оге ЕЬеу аге Ъу г(ейп6!оп гаго, япсе йеге аге по се11в виЕ6с!епг1у Еаг аъчау). (а) Рог еасЬ се11 !п 1еъ е1 г, ЕгапвЕоггп йе 1оса1 ехрапв!оп оЕ 6ъе рагеп! се11 Ео ЕЬе сепЕег оЕ ЕЬе сиггеп! се!!. (Ъ) АсЫ Ео ЕЬе 1оса1 роЕепЕ!а1в йе ЕгапвЕоппа6оп оЕ ЕЬе пш16ро1е рогеп6а1в оЕ ЕЬе вагпе 1ече1 се11в ЕЬа! Еи1611 йе Ео!1оьч!пд сопд1- 6опя ° ТЬе се11 пшвЕ Ье виЕЕ!с!епбу Еаг аъчау Еог ЕЬе гпи)Е!ро1е ехрапвюп Ео Ье ча1Ы; ЕЬ!в ехс1идев йе пе!8ЬЪог!п8 се1!в. ° ТЬе се11в пшвЕ Ье виЕйс!еп11у с1ове ЕЬаг ЕЬе!г сопгпЬи6оп Ьав по! Ьееп !пс1иг(ег( иъ ЕЬе 1оса1 йе1д оЕ ЕЬе рагепг оЕ ЕЬе се11; 309 12.2 Раа! Ми! ЕЕро!е ЛЕеЕ)го Е Р!аиге 12.4: ТЬе аале 1ече1 сеПа (вЬаде6) оЕ гчЫсЬ ЕЬе пш16ро1е рогепИа1а аге ггапа(еггед Ео ЕЬе сиггеп! сеП Ео 8(че ЕЬе 1оса1 ехрапяоп.
ТЬе сиггеп! сеП !а с1епогес1 Ьу С, ЕЬе пе!8ЬЬога оЕ С Мо по! сопгг!Ьиге Ьесаиье !Ьеу ЕоисЬ С. ТЬе гчЬИе сеПа оЕ ЕЬе рагеп! !ече1 й6 по! ЕоисЬ ЕЬе рагеп! сеП оЕ С (!п6!сагед и ИЬ а ЕЫс)г Ипе) ап6 ЕЬегеЕоге й6 сопгг!Ьиге Ео ЕЬе 1оса1 ехрапяоп оЕ ЕЬе рагеп! сеП. Ниа ехс1идеа ЕЬе сеПа ЕЬа! сопгпЬиге Ео 1оса1 ро!еп6а1 !шИа1гае6 !и аЕер За. 1п Р!бриге 12.4 !Пей сеПь аге аЬогчп.
1п ЕЬгее 6!шепа!опт, 8 х 27 — 27 = 189 оЕ ЕЬеае сеПа Еи166 ЕЫа сопдИюп. АЕЕег 1ече! К Ьаь Ьееп геасЬе6 ЕЬе Еаг-гчау сопЕг!Ьибоп оЕ ЕЬе сЬагдев !и сеП С~ ~ !а са1си1аге6 Егот ЕЬе 1оса1 ехрапяоп (Е""'. ~ цго( 1! !а ипроггап! Ео поЕе ЕЬа! ЕЬе 1оса1 ехрапяоп 1(со! а' сап Ье иве6 Еог аП рагбс1еа !и ЕЬе ватпе сеП. ТЬегеЕоге !и ргас6се ЕЬе са1си!а6оп оЕ !Ыь Еепп !а ивиаПу Мопе айег аргер 2 оЕ ЕЫь а1еог!ЕЬгп. ТЬе ргесейщ а18опМпп !а Еог а ИпИе ауЯет оЕ сЬаг8е.
То арр1у ЕЫа а1допМип Ео а ауагет ил!И рег!о6!с Ьоипс1агу сопс(Июпь, ЕЬе ЕоПогч!пд той(1- саг!опа Ьаче Ео Ье табе. 1п а ауЯет ичЕЬ рег!ойс Ъоипс1агу соп6!Иопв ЕЬе 1ече1-аего сеП !а ьиггоипбес1 Ьу рег!осИс !шалея ЕЬа! Ьаче ЕЬе ьагпе пшЫ- ро1е ехрапа!оп агоипс1 ЕЬе!г сепЕег. !и ЕЬе а18ог!ЕЬш ъче Ьаче вЕагЕес1 ьЕер За, аааипипе ЕЬа! ЕЬе !оса1 Е!е16 оЕ 1ече1 аего !а О. Рог ЕЬе рег!о6!с ьуьЕет, ЕЫь 3!О СЫР!ег 12. !.оп -Яапче !и!егас!)опв Ьав го Ъе гер!асей Ъу !Ье 1оса1 ехрапяоп о! 1Ье рогепйа! !гогп аП ипатьев ехсер! гЬе пеагеЯ 26 пе!ВЬЪогв. !! ъче Ьаче са1си1а!ест Мив гегт, йъе гетатс1ег о! !Ье а1Вог!Мът гетатв гЬе вате.
ТЬе вшшпайоп очег аП рег!од!с !тадев !в йопе ив!пВ ап Еъча1Й яппта6оп гесЬп!с(ие (вее [332] !ог с1е!айв). %псе йив тчо!чев йъе ти)йро1е ехрапяоп о! 1Ье рагеп! сеП (ъчЫсЬ йоев по! Мерепй оп гЬе питЪег о! раг6с!ев), йъе очегЬеай !п сотри!ег !ипе !в ъ.егу япаП. Ноъчечег, гЬе йттйв о! БсЬгп!й! апс1 !.ее с(о вЬоъч !Ьа! !о агпче а! Мъе вагпе ассигасу ав !ог йъе попрегюй!с вуяет опе пеейв го иве а ЫПЬег ос!а1 !гее ог тоге пш16ро1е тотепйх 12.3 Раг6с1е Мейй АрргоасЬев ТЬе СРБ 6гпе гес[шгей !ог а !ийу орйт)лей Еъча1д вшшпайоп вса1ев ъч!!Ь !Ье пшпЪег о! рагйс1ев ав 0()Чв~г). 1п тапу аррйсайопв ъче по! оп1у Ьаче !Ье !опВ-гапке !и!егасйопв Ъи! вЬогГ-гапйе !пгегасйопв ав ъчеП. Рог висЬ вув!етв й тау Ъе сопчетеп! го иве йъе вате си!о!! гамаша !ог йъе геа1-врасе вит т йъе Еъча16 випипайоп ав !ог йъе вЬогг-гапке т!егас6опв.
Рог а йхей си!о!1, Ьоъчечег, йъе са1си1а!!оп о! гЬе Роипег раг! о! Мъе Еъча16 виъптайоп вса1ев ав 0 ( М ~ ), ъчЫсЬ та1сев гЬе Еъча1с1 яиптайоп 1пеН!с!еп! !ог 1агйе вувгегпв. 1ъ)о!е гЬа! й !в оп1у йъе гес!ргоса!-врасе раг! о! !Ье Еъча16 япп гЬа! ви!!егв !гот !Ь!в йгаъчЪас)с, С1еаг1у, й ъчои16 Ъе айчапгайеоив !о Ьаъе ап арргоасЬ !Ьа! Ьапсйев !Ье Роипег раг! пюге е!Пс!еп!!у. Вечега! всЬетев !ог во!чу йив ргоЫегп Ьаче Ъееп ргоровес1. ТЬеу аП ехр1ой !Ье !ас! Мъа! !Ье Ро!ввоп ег!иайоп сап Ъе во!чей пшсЬ тоге ейас!епйу П гЬе сЬагдев аге дгв!пЪшей оп а тевЬ.
ТЬе е!!!Непсу апй ассигасу о! висЬ тевЬ-Ъавей а1- Пог!!Ьтв с1ерепд в!гопй1у оп йъе ъчау т ъчЫсЬ !Ье сЬагйев аге айпЪи!ес1 го тевЬ ро!пйе Ве1оьч, ъче Ъпейу й!всивв гЬе Ъаясв о! 1Ье рагйс1е-тевЬ ар- ргоасЬ. Ноъчечег, а !иП с(евспрйоп о! Мъе !есЬп!са1 дегайв !в Ъеуопд гЬе всоре о! Мив Ъоо)ъ. ТЬе еагйев! рагйс1е-тевЬ всЬете !ог гпо1еси1аг япш1а6опв ъчав Мече)- орес1 Ъу Нос1спеу апс1 Еав!ъчоос1 [24). ТЬе сЬагйев !п !Ье вув!етв ъчеге тгегро!а!ей оп а Вг!й го агпче а! а сйвсгейкед Ро1ввоп ес(иайоп.
Рог а гейи1аг Вг!й йив ес)иаг!оп сап Ъе во1чес1 е!Пс!епг1у ив!пй !Ье Рав! Роипег Тгапв!опп (РРТ) [ЗЗ). ТЬе сотри!ег 6те аввос!а!ес1 ъчИЬ !Ье РРТ гесЬпн)ие вса1ев ав 0()ъ! 1оВ )ъ!), ъчЬеге М с1епо!ев гЬе пшпЪег о! рот!в о! й!веге!е Роипег !гапв(опп. 1п йв в!тр1ев! ипр1етеп!а6оп, !Ье рагйс1е-гпевЬ теряй !в !ав6 Ъи! по! чегу ассигаге. ТЬе !есЬп!г(ие ъчав виЪвес!иепйу ипргочес1 Ъу врйй!пй йъе са1си1айоп !и!о а вЬогГ-гапйе апд а 1опВ-гапке сопгг!Ъийоп.
1п !Ье вр1гй о! !Ье Еъча1Й те!Ьой, !Ье вЬог1-гапйе раг! !в гЬеп са1си)а!ей й!гесйу !гот !Ье рагйс1е-раг6с1е т!егасйопв ъчЫ1е !Ье рагйс1е-тевЬ гесЬп!г)ие !в ивес1 !ог гЬе 1опй-гапйе сопгг!Ъийоп. 12.3 РагИс!е Меана Ар таас)сев Ве1отч, сче Ъпейу сБвсивв !Ье рагИс1е-тевЬ шеЕЬоИв апс1 Ите!г ге1аИоп Ео ЕЬе Есча1д-вшп арргоасЬ. ЪЧе и Б! по! аИетр! Ео ргевеп! ап ехЬаивИче йевспрИоп оЕ аБ ех!вИпа рагИс1е-тевЬ шеЕЬоИв. ТЬе геавоп )в ЕъчоЕо16: йгвг оЕ аБ, а вувсетаИс ргевепсаИоп оЕ Иив виЪ!ес! — ав Е(чеп, Еог !пвЕапсе, Еп а рарег Ъу Ревегпо апй НоЬп [334] — счои1И тес(шге а сЬар!ег оп Ив осчп. ЕесопсБу, Ревегпо апс1 Но1тп [334] Ьаче вЬосчп ЕЬа! тпов! оЕ !Ье "доосГ' а11егпаИче теЕЬоИв, висЬ ав ЕЬе РагИс1е МевЬ ЕсчаЫ (РМЕ) [317] апй ЕгпооЕЬ РагИс!е МевЬ Есча1д (ИРМЕ) [335], аге чету япи1аг ш вр(гИ апй сап Ъе вееп ав чапаИопв оЕ !Ье опЕ!па1 рагИс!е-рагИс1е/рагИс1е-тпевЬ (РРРМ) !есЬгис(ие оЕ Нос)спеу апй ЕавФи оос1 [24).
ТЬе сЬо(се оЕ ЕЬе те!Иод Ео иве, о!!оп с1ерепИв оп ЕЬе аррБсаИоп. Рог ехашр1е, Моп!е Саг1о япш1аИопв тес(шге ап ассигасе евг!гпасе оЕ ЕЬе епегду, счЬБе Еп Мо1еси1аг Рупаписв япш1аИопв сче пеей Ео сотри!е !Ье !огоев ассигаге1у. Иошпе рагИс1е-тевЬ всЬегпев аге ЪеИег вш!ест !о с1о опе, вогпе со с1о ЕЬе оИтег. ТЬе Ыеа оЕ ЕЬе РРРМ теЕЬос1 Ев !о вр!й !Ье Сои1огпЪ росепИа( нйо Есчо рагсв Ьу ива ЕЬе ЕоБоилпе (Ег!ч(а1) !Иену: — + 1 Е(т) ! — Е(т) (12.3.1) т т т ТЬе Ыеа оЕ ившд а всч(гсЬшц ЕипсИоп !в япи1аг Ео ЕЬе вр1НИпЕ оЕ !Ье Етча1д вшпгпаИоп !пго а вЬогргапее апс1 а 1опЕ-гапде рагИ РоБос)с апс1 С1овБ [336] Еоипд ЕЬа! ИЕЕЕегеп! сЬо(сев Еог Е(т) у!ей сотрагаЬ(е геви1!в, а1ЕЬоиаЬ ЕЬе еЕЕ(с(епсу оЕ ЕЬе гпеЕЬой с1оев с1ерепй в!гопа1у оп а сагеЕи1 сЬоке оЕ Иив Еипсг(оп.
Рап(еп е! а!. [317) Ьаче вЬои п ЕЬаИ И опе ивев !Ье вагпе Саивяап всгеепшЕ ЕипсИоп ав !п ЕЬе Есча1д вшшпаИоп, ЕЬе РРРМ ЕесЬгис(ие Ьесогпев швеей чету япи1аг Ео ЕЬе ЕсчаЫ теЕЬод. !! 1в шв!гисИче Ео гесаБ ЕЬе Роипег-врасе сопгпЬиг!оп оЕ ЕЬе епегау: ЕЕ~ = — ~ — ~рЩ ехр( — !с 74а). ! 4п г г 2У ~г аао РоБоичщ Ревегпо апс1 Но1тп [334], ъче счг1!е ЕЬе Роипег-врасе сопгпЬиИоп ав и, = — ~ ас — ~ [)(цу(Ь)р(Ь) — мао ! с(сф (гс), (12.3.2) с=-1 счЬеге фс(гс) сап Ье ЬИегрге!ед ав ЕЬе е1есЕговваИс ро!епг(а! Иие Ео ЕЬе весопс1 Еепп ш ес(иаИоп (12.3.1): ф" (гс) = — 2 д((с)%1с Ф 0)Р()с) ехр(Бс гс). СЬар)ет 72. Етттт8-Яаи8е !тт1етаст!оттв Ав а ргот1ист 1п Роипег врасе соггевропс(в Ео а сопчо1Шюп 1п геа1 врасе, тче вее йа1 1Ье ротепба1 ф (гт ) !в т!ие 1о йе от!8ша1 сЬаг8е 61втпЬШюп р(х), сопчо1итес1 Ъу а втпеатшд Ьтпсбоп у(т). ТЬе Етча16 випипа6оп !в тесочете6 !Е тче сЬоове а Саивяап япеапп8 Еипсбоп; й тч16сЬ саве Е(т) 1в 81чеп Ъу ап еггог Еипс6оп.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
