Frenkel, Smit - Understanding molecular simulation - 2002 (523144), страница 54
Текст из файла (страница 54)
ТЬза за з(опе ш ехасбу ЕЬе ааше зчау аа Еог ЕЬе гпопошег; ЕЬаз Еа, ЕЬе ачегаде пшпЬег оЕ гПшега ЕЬа1 йеасепба Егош пюпошег 1 1а В(чеп Ьу (пз(Ц) = зззЬз(Ц, зчЬеге зтз, !иаз 1йе па Ье(оге, за а сопьзапз зо Ъе аресзйес1 ]аЕег. ТЬе пшпЬег оЕ дипега Вепега1е6 шау еПЬег Ье 1агВег ог япаПег ЕЬап 6зе ог1Вша! пшпЬег оЕ шопошега. Хе позч ргосеес( зчззЬ ЕЬе ааше гес(ре Еог ЕЬе пех1 Вепегаз(оп (Ег[шега) апс1 ао оп.
1п ЕасЬ аа зчзЕЬ ЕЬе аепи-ПехПз1е зпо1еси1еа йасиааед ш аесг(оп 11.2.1, 6 Еа сопчеп(епг Зо шс1ис1е 1Ье Епггапю1еси1аг Ьопз(-ЬепйпВ, Ьопс1-аЗтегсЬзпВ, апд Еога(опа1 епегВзеа 1п ЕЬе ргоЬаЪПЕЗу 61аЗг(Ьи6оп ЕЬаг з(езеппшеа зч(ЕЬ зчЬаз опепзаз(оп пезч аеВшепза аЬои16 Ъе агЫес1. ТЬе ачегаВе пшпЪег оЕ аигч(ч1пВ пю1еси1еа аг 1Ье еп6 оЕ ЕЬе ЕЗЬ аЕер Еа (]~е) = (Дззз (ехр[ — РЕЕе(г П), з,з.=зз зчЬеге ЕЕз (г~ ) Еа Пзе 1ога! ш1егасбоп оЕ ЗЬе сЬаш пю1еси!е зчНЬ ЗЬе ]Ч ао1- чеп1 шо)еси1еа (апд зЬе попЬопбес1 шзгапю!еси1аг шзегасз(опт).
ТЬе апВи1аг Ъгас[се1ь 6епоге а салоп(са1 ачегаВе очег ЕЬе соогйла1еа ап6 очег ЕЬе шзгапю!еси!аг Во11ашапп Еасзога оЕ ЕЬе Ыеа1 (попае1Е-ачо(йпВ) сЬазл. 1п Е 62 Яоаепб)ий 5атр(|ич 285 отЬег ъчогс(а, / (Мт) = ~П, ехр[-Вн,„(Е)). тс а Непсе, ЕЬе ехсеаа сЬеписа1 ротеппа1 1ь В|чеп Ьу ттех(Е) = )са| 1п Е' (м,) | ~п,'.;1 (11.2.2б) ТЬе сопатапта ттт ьЬои1с( Ье сЬоаеп аисЬ ЕЬат ЕЬеге |а пеИЬег а рори1апоп ехр1ояоп пот тпааа ех6пспоп.
1Е ъче Ьаче а алоис| диеаа Еог и,„(Е) ЕЬеп ъче сап иае 6иа то еьбшате ттт. 1п цепега1, Ьоъчечег, ттт тпиат Ье с|етегпппет| Ьу тпа1 апд еггог. ТЫа гесигяче а1аоптЬтп Ьаа аечега1 шее Ееаитгеа. Р|гат оЕ а11, И |а сотритабопа11у с|и(те е(6с|епт (ш аоте сааеа, пюге ЕЬап ап огс1ег оЕ тпадп|тис(е Еаатег 1Ьап ЕЬе КоаепЫитЬ асЬетпе, Еог ЕЬе залпе ата6апса1 ассигасу). 1п Еасп |п асита1 са1си1а6опь, ЕЬе а1аоптЬтп аеагсЬеа ш т(е)тй 6гае гаЕЬег ЕЬап |п (ттеа Ет)т.
ТЬат |а то аау, ъче тгу то дгоъч а ро1ушег ип61 И Ьаа Ъееп сошр1е|ес1 (ог Ьаа с|1ет|). Хе ЕЬеп соптшие Егош ЕЬе 1аат ЬгапсЬ оЕ ЕЬе тгее Егош ъчЬеге ъче аге а11оъчес1 |о Вгоъч апоЕЬег тг|а1 сопЕоппаЕ|оп. 1п Ниа ъчау, ъче ъчог1с оиг ъчау Ьас1с то ЕЬе гоот оЕ ФЬе тгее. ТЬе атЬ аптаде оЕ 6ъ|а ьсЬеше Еа ЕЬат ЕЬе шепюгу гес|шгешеп|а аге пипппа1. Могеочег, 1Ье аттис|иге оЕ 6те ргоагат |а чету а|шр1е |пс1еес1 (ш 1апдиаВеь ЕЬа| а11оъч гесигяче са)|а). Е.аат Ьит по| 1еаа|, ЕЬе гесигяъе асЬеше Вепегатеа ап ииЬ(ааеЫ (т.е., Во1ткптапп) рори1апоп оЕ сЬа|п соп|оппапопа [310].
11.2.5 Ргипед-Епгк[ъей КовепЫп$[т Ме([той Ап Ешрог|апт ехтепяоп оЕ ЕЬе КоаепЫи|Ь асЬеше Ьаа Ьееп ргороаес1 Ъу СгаааЬегВег [311]. И Еа са11ес1 Въе ртиттет(-еттг(сйеН КоаепЪ|итЬ шейюс( (РЕКМ). Опе оЕ ЕЬе геааопа ъчЬу ЕЬе сопчеппопа1 КоьепЪ|итЬ тпебъос| Еат1ь Еог 1опд сЬаша ог ат Ь|ВЬ с1епв|6еа |а ЕЬат ЕЬе с(1атг(Ъипоп оЕ КовепйитЬ ъче|ВЬть Ьесотпеа чету Ьгоас1. Аь а сопает|иепсе, И сап Ьарреп ЕЬа1 а Ееъч соп(оппаИопа ъч|ЕЬ а Ь|ВЬ КоаепЫШЬ ъче|ВЬЕ сошр1ете1у с(оппшате ЕЬе ачегаае.
1Е ЕЫа 1а |Ье саае, ъче аЬои16 ехрест Ео аее 1агВе ата6а6са1 6истиа1|опа тп ЕЬе ачегаде. И ъчои1с|, оЕ соитие, Ье с1еягаЫе Фо Еосиа ЕЬе вши)ат|опь оп ЕЬове с1аааеь оЕ сопЕоппапопь ЕЬа| соптг|Ьи|е шоат то ЕЬе ачегаае, апс( арепт| 1161е типе оп сопЕоппат|опа ЕЬат Ьаъ е а чету 1оъч КоаепЫитЬ ъче|ВЬЬ ТЬе РЕКМ а1цоптЬтп 1а а депега1|теабоп оЕ ЕЬе тесин(че-ьатпр1|па асЬеше т||асиавес( аЬоче. И а1ьо аепегатеа а дори!акоп оЕ сЬашь ъчИЬ с||ЕЕегепт сопЕоппапопя Апс( И аЬагеа ФЬе ас(чаптаде ЕЬаЬ с1ие то ЕЬе гесигяче патиге оЕ ЕЬе а1доптЬтп, ъче пеес1 по1 1сеер пюге ЕЬап опе сопЕоппа6оп (р1иь а ьет оЕ роштега) ш шетпогу.
ТЬе "Ь|ттЬ" апс( "т|еатЬ" ги1еа оЕ ЕЫа а1еопТЬш аге ьисЬ ЕЬат 286 СЬпрЕег !1. аггее ЕпегКу аЕС)я(п Мо!еси!ев Н ВепегаЕев тьпу сор!ев оЕ сопЕолпа!юпв ъчНЬ а Ь!ВЬ КовепЫиЕЬ ъче!ВЬЪ ъчЬ!1е 1оъч-ъче!ВЫ вггис!игев Ьаъ е а Ь!ВЬ ргоЪаЪ!1Ну оЕ "сну!пй." ТЬе КовепЫирй ъче!ВЬ! оЕ ЕЬе гетаиипд сопЕоппайопв 1в ай)ивгес1 ш висЬ а ъчау ЕЬа! оиг Ыгйь-деаЕЬ ги1ев йо по! айес! ЕЬе йев!ген ачегайе. Аь Ейе РЕКМ а1- допйпп !в гесигяче, Н ивев 1Нйе тепюгу. То виттаг!ье Ейе а1догН1пп ш а Ееъч ъчогйя сопЕоппабопв ъчНЬ а 1щЬ КовепЫиЕЬ ъче1ВЫ аге ти16р1!ес1 Ъу а Еасгог !с апй йъеН ъчеъВЫ !в гес(исед Ъу ЕЬе вате Еасгог. СопЕоппайопв ъч!ЕЬ а 1оъч ъче!ВЬ! аге "ргипей" — Ьа1Е ЕЬе 1оъч-ъче!ВЫ сопЕолпаЕюпв аге д!всагйед, ъчЫ1е ЕЬе ъче!ВЬ! оЕ ЕЬе геташйег 1в йоиЫед.
Опсе а11 сЬашь ЕЬа! Ьаъ е вЕагЕей Егот а сопипоп "апсевгог" Ьаче Ъееп Вгоъчп Ео сотр1ебоп (ог Ьаче Ъееп с1!ьсагс1ед), ъче ятр1у асЫ Ейе (геьса1ей) КовепЫиЕЬ ъче!ВЬЕв оЕ а11 вигч!чшй сЬа!пв. Ве1оьч, ъче Ълейу в)ъегсЬ Ьоъч ЕЬе а!йопйип Ев !тр1етепгес1. 1.е! ив шЕгойисе ап иррег апс1 а 1оъчег ЕЬгевЬо!6 оЕ ЕЬе КовепЫиЕЬ ъче!ВЬ! оЕ а сЬаш ъчНЬ !епВЕЬ 1, И'ъ '" апд ~~~, гевресйче1у. 1Е ЕЬе рагйа1 КовепЫиЕЬ ъче!ф1 оЕ а рагЕки1аг сЬаш сопЕогтайоп оЕ 1епдЬ! ъ, И'ъ, ехсеейв ЕЬе !ЬгевЬо16, И'ъ > ~~~, ЕЬеп ЕЬе вшй1е сопЕоппа6оп !в гер!асед Ъу !с сор!ев.
ТЬе рагйа1 КоьепЫиЕЬ ъче!ВЫ оЕ ечегу сору !в ве! ег)иа1 Ео И';Лс. 1Е, оп Ейе оЕЬег Ьапд, йъе рагйа1 КовепЫиЕЬ ъче!ВЫ оЕ а рагбси1аг сопЕоппайоп, И'о !в Ъе1оъч Ейе 1оъчег ЕЬгевЬо1с1, И'ъ < И~;""", ЕЬеп ъче "ргипе." ХНЬ а ргоЪаЫВЕу оЕ 50'4 ъче йе1еге йъе сопЕогтаЕ!оп. Ви! !Е Ейе соп(олпабоп вигч!чев, ъче йоиЫе Нв КовепЫиЕЬ ъче!ВЬ!. ТЬеге !в сопв!йегаЫе Егеейот ш Ейе сЬоке оЕ И~ъ '", И~ъ '", апс1 !с. 1п Еасг, ай оЕ Ейет сап Ъе сЬовеп "оп Ейе ВУ" (ав 1опй аь ЕЫв сЬоке доев по! йерепд оп ргорегйев оЕ соп(оппайопв ЕЬа! Ьаче Ъееп Вгоъчп Егот ЕЬе вате апсевгог). А Нега!!ей 6!ьсивв!оп оЕ ЕЬе а1йог!йип сап Ъе Еоипс1 !п ге(я (311, 312).
ТЬе 1ппНайоп оЕ ЕЬе гесигяче ВгоъчЕЬ а1йогНЬт !в Ейа! Н !в шЕппв!са11у а в!а!!с МопЕе Саг1о ЕесЬпи(ие; ечегу пеъч сопЕ!Вигайоп !в ВепегаЕед Егот всгаЕсЬ. ТЬ!в !в ш соп!гав! Ео 6уиаиас (Маг1соч-сЬа!и) МС всЬетев ш ъчЫсЬ ЕЬе Ъаяс Ела1 пъоь е 1ь ап айетр! Ео той!Еу ап ехгвйлй сопййигаЕ!оп. Т)упагшс МС всЬетеь аге Ъейег вийес1 Еог Ейе яти1а6опв оЕ гпапу-рагйс1е вувгеть Ейап ЕЬе(г ага!!с соипгеграгЕв. ТЬе геавоп Ев ягпр1е: Н !в еаву Ео тоба а гпапу-раг6с1е сопййигайоп !о та1се оЕЬег "ассерЕаЫе" сопййигайопв (Еог !пвгапсе, Ъу д!вр1асшй опе рагйс1е очег а япа11 6!вЕапсе).
1п сои!гав!, Н !в чегу 6)Ейси1! Ео Вепегаге висЬ сопйдигайопв Егот всгаЕсЬ. Оп ЕЬе оЕЬег Ьапс1, опсе а пеъч сопййигайоп Ев виссеввЕи11у Вепега!ей ш а Яайс всЬете, Н !в сотр1еЕе1у !пс1ерепс1еп! Ьогп а11 еаг1!ег сопйдигайопв. 1п сопЕгавЕ, виссеьяче сопйдигаг!опв !п с1упапис МС аге в!голд!у согге1аЕес1. СВМС !в, !п а вепве, а ЬуЪлс1 всЬете: Н !в а с1упапис (Маг1соч-сЬа!и) МС тейъос1. Ви! ЕЬе сЬаш-гейгоъчшй вгер !в пюге япи1аг Ео а вЕа6с МС всЬете. Ноъчечег, !л ЕЬ!в вЕер Н !в 1евь "япаг!" ЕЬап Ейе гесигяче а1допЕЬтв 6!всиввес( аЪоче, Ъесаиве Н !в гаЕЬег "туорк." ТЬе всЬете 1оо)ьв оп1у опе вгер аЬеай. 1! гпау Ьарреп ЕЬа! ъче врепй а!о! оЕ !иле дгоъчшй а сЬа!и а1- 77.2 ттовеа(т)ит)т Батр!те 287 пюьт то сошр1е6оп, оп1у то скот ег 1Ьат тЬеге 1а яппр1у по красе 1етт 1ог 1Ье 1аат (етч шопотпега.
Т7иа ргоЫетп сап Ье а))етт(атес( Ьу ивпа а ясапп(па тпетЬой о1 бте 1уре 1п1гос1исес1 Ьу Ме(тот 11сЬ т373т. ТЫа 1а Ьаа(саПу а вта6с, КовепЫитЬ-1йе шейют1 Еог цепега6лд ро1ушег сопйВига6опь. Вит, ш соп1гаа1 то тЬе ЕоаепЫибт асЬеше, 1Ье всапгищ шейюй 1оо(та аеиега1 итера аЬеат1. 11 тЫа арргоасЬ 1а тгапйеггет( па(т е1у то а сопЕоппа6опа1-Ь(аа Мопте Саг1о ргоагатп, й тт ои1т( у1е1т( ап епЬапсес1 депега6оп оЕ ассертаЫе тг(а1 соп(оппа6опь, Ьи1 Вте сошрша6опа1 соьт тт ои1Й г(ае ь1еер!у (ехропеп6а11у) ичтЬ бте с(ербт о1 1Ье асап.
Т7иа аесопт( дгатт Ьас1с сап Ье алло(т(ет1 Ьу Шсогрога6па а гесига(т е асаппша шетЬос1 тЬат сЬеар1у е1шипатеа т(оошес1 тпа! сопйдига6опь, и ИЬш а т(упаш(с Мопте Саг1о асЬеше. 1п аес6оп 13.7 и е т(1асиаь а т1упапис МС а1доптЬш (гесо11 аготт тЬ), бтат 1а Ьаает1 оп Низ арргоасЬ. СЬар1ег 12 Еощ-Каще 1Ыегас6опь Ав согпрпбпВ рои"ег сопбпиев Ео !псгеаве, и е сап япш1аге енег !агат вувЕепгв.
Рог !пвгапсе, а Еур!са! птог!е! оЕ а Ыо1ое!са! вув!ет гпау сопга!и ав гпапу ав ! О рагбс1ев. 1п впсЬ вувгегпв !! Ъесогпев стас!а1 Ео ано!6 согпрпг!пе а11 ра!г !и!егасбопв, ав оЕЬеги !ве ЕЬе сотрогабопа1 еЕЕог! нноы16 Ъе ргорог6опа1 Ео йе вс)паге оЕ йе пшпЪег оЕ раг6с1ев. ТЬ!в !вам Ев рагбси1аг1у ге1енап! Еог !ой-тапсе !пгегас6опв (е.д., Соы1огпЫс апд д!ро1аг рогепба)в) ав, Еог висЬ шоде1в, Египса6оп оЕ йе рогеп6а! !в пенег а11оънед.
!! ЕЬеп Ъесогпев еввеп6а1 Ео Впг$ ап еЕВс!еп! ЕесЬп!с(ие Еог сотри6пд ЕЬе 1ощ-тапа раг! оЕ ЕЬе !пгегпго1еси1аг !пгегасбопв. 1п весбоп 3.2.2, и е вЬои ес1 ЕЬаЪ !Е и е Егппсаге ЕЬе ро!еп6а1 а! а г!!вгапсе т„ЕЬе сопгпЪибоп оЕ йе Еа!1 оЕ йе рогепба1 и(т) сап Ъе еяппагес1 (!и ЕЬгее с(!пгепв!опв) ив!щ И"в = — ~ дт и(т)от~, 2 и Ьеге р !в ЕЬе анетте пшпЪег с(епв!Еу.
ТЫв ес(иабоп вЬои в ЕЬа! ЕЬе Еа!1 соггес6оп Ео йе рогепба1 епегду с(!негдев, ип1евв йе рогеп6а! епегду Еппсбоп гг(т) с)есаув Еавгег !Ьап т ~. ТЫв !в иЬу опе саппо! иве Егппса6оп ров Еа!1 соггес6оп Еог Сои1огпЫс апс1 6!ро1аг !и!егасбопв. 1п ЕЬе 1!Еегапгге, опе сап Впг1 пшпегоив ехагпр1ев и Ьеге ЕЬе сопгрога6опа1 сов! оЕ ена1иабщ 1ощ-тапсе !пгегасбопв !в гег!исес( ш а гаЕЬег с!гав6с и ау. ? ! !в вппр1у аввшпес( ЕЬа! ЕЬе 1ощ-тапа раг! оЕ ЕЬе роЕепба1 гв по! ппрогЕапп ТЬе ргоЫегп оЕ ЕЬе !ой-тапсе !пгегасбопв !в ЕЬеп "во1негГ' Ъу Егппса6оп. ТЫв деЕв пс1 оЕ йе ехрепяне рагС оЕ !Ье са1си1а6оп, Ъо! !! е!нев пве Ео вепоив Епасспгас!ев.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
