Frenkel, Smit - Understanding molecular simulation - 2002 (523144), страница 50
Текст из файла (страница 50)
ТЬ)в $в по1 сотпр1ете1у Ег)ч$а1, ав 1Ье сопсер1 оЕ а ро)п1 беЕес1 $в Епех1псаЫу !$п)себ 1о 1Ьа1 оЕ а 1ат бее вце, Апб !ат Исе вйев 1ове 1Ье!г тпеапй8 $п а б!вогбегеб втате. 5о, и е вЬоиЬЕ Вгвт аббгевв 1Ье т)иевбоп: ъчЬеп $в 6 регппвяЫе 1о соип1 вта1ев ъч$1Ь а б!ЕЕегепт пшпЪег оЕ 1а/6се я1ев ав б)вбпс1? ТЬе апви ег $в, оЕ соигве, йа1 ЕЬ)в !в оп1у тгие 6 1Ьеве тИЕЕегеп1 вта1ев сап Ъе авв!Впеб 1о сцв6пс1 чо1шпев !и рЬаве врасе. ТЫв Ев рояИЫе тЕ ъче $пърове 6тат ечегу рат6с1е Еп а сгув1а1 !в сопВпес1 1о Йв Х$8пег-Ве!Ек сец. !и 1Ьгее-с1ппепвюпа1 сгувта)в, 1Ь)в сопвтга)п1 оп 1Ье роябопв оЕ ац рагбс1ев Ьав 166е еЕЕест оп 1Ье Егее епегцу (тп соптгав1, !и а //ди/б !1 !в по1 а1 ац репп)вв!Ые).
Ве1ои, ъче бег) че ап ехргевяоп Еог 1Ье ъ асапсу сопсеп1га6оп ш а сгув1а1, Еоцоълпц 1Ье арргоасЬ Е)гвт 8!чеп Ъу Веппеп апб А1бег [281]. 10.4.1 атее Епегуез ТЬе ет)иц!Ъпитп сопсеп1та6оп оЕ часапстев !п а стув1а1 )в ивиаПу чету !оиъ Ъъе вЬац ЕЬегеЕоге тпа1се йе арргохипа1юп 1Ьат часапс)ев т)о по1 $птегас1.
264 СЬар!ег !О. Гтсе Еаегреа оЕ Бо!ч(а ТЫа аааишрйоп !а по! аа геаьопаЫе аь 6 аеас, ав йъе шгегас6оп оЕ часапс(еь ЕЬгоийЬ ЕЬе!г вггеаа Е!е1да !а с(и!ге !ой гапйе. ТЬе ааашпрйоп 1Ьат часапс(еа аге гйеа! ипрйев йъаг Р! "1, ГЬе НейпЬо11л Егее епегду оЕ а сгуага1 ъчИЬ п часапс1ев аЕ аресфег( Рояйопз, сап Ье ъчпйеп аа Г'"' = РЯ' — пЕ~ = МЕа — пЕп (10.4.1) ъчЬеге М 1а 1Ье пшпЬег оЕ 1а61се а!геа оЕ ЕЬе сгУага1, Еа !а Ейе Егее епегДУ Рег раг6с1е !и ЕЬе с!е(ест-Егее сгуага), апс1 — Е~ 1в 1Ье сЬапйе !и Егее епегду оЕ а сгуага1 с(ие Ео 1Ье сгеа6оп оЕ а япй1е насапсу аг а арес(йс 1а16се роЫЕ. Е.ег иа поъч сопрет ЕЬе ейес1 оЕ часапс1еа оп Ейе С(ЬЬв Егее епегду оЕ а ьуатетп оЕ !'! раг6с1ев а1 сопзгапг ртеааиге апй гегпрегатиге. Р1гаЬ ъче с!ейпе д'"' аа Ейе чапа6оп ш ЕЬе С(ЪЬа Етее епегду оЕ а сгуага! оЕ М рагг(с!ей йие Го ЕЬе ЫЕгос1исйоп оЕ а ыщ1е часапсу а! а вресфс!аййсе роа(!!оп д"": — 6мъи~ ()ъ), Р, Т) — См,о()ъ(, Р, Т) Р .„Ь,()~м„и,)-тм,('(гм,.)+Р(1Г .„,,— Чм,.).
(10.4.2) !п ЕЬе аЪоче ес(иайоп, Ейе Е(ганг виЬасг!рг геЕега Го ЕЬе питпЬег оЕ 1агйсе а!Ееа т Ейе ауатет, апс1 Ейе аесопс1 ьиЬвсг(рг го Ейе пшпЬег оЕ часапс1ея С1еаг1у, ЕЬе пшпЬег оЕ раг6с1ев )Ч !а ег!иа! Ео Ейе 6!ЕЕегепсе Ьегъчееп ЕЬе йгаг апс1 аесопс! аиЬвспртя ТЬе пехт атер 1а го ъчпге "мъи~()гмьи~) — Ем,о(ъгм,о) = Рмъи~()тм~-Ь~) — Рмъи~(~'мъио) +Ем~и~ (Ъ'~~г,а) — Рм ьо()гм+ъ,а) +Р, .М .ъа)-Р,.(),.) (10.4.3) ТЬе Е!гь! Ьпе оп 1Ье г(дЬЕ-Ьапд яде оЕ ЕЫа ес!иа6оп 1а ег!иа! Ео — Ран, ъчЬеге Лн га н"' — нч'" !а ЕЬе 6)ЕЕегепсе !п Ейе чо1шпе оЕ Ейе сгувга! аа опе раг6с1е !а гер1асес1 Ьу а часапсу, а1 сопагапг ргеааиге апс1 сопа1апг пшпЬег оЕ 1а16се айея ТЬе аесопс1 йпе оп Ейе пдЫ-Ьапс) а!де 1а а!тр1у ес!иа! го — Еи с1ейпес1 Ы ег!иаг!оп (10.4.1): — Е~ — = Рм~-ь~ (чмъъ,а) — Рмъг,а(~гмъио) То геъчпте ЕЬе йигг1 Ьпе оп ЕЬе пдЫ-Ьапс1 яс1е оЕ ес)иа6оп (10.4.3), ъче поте 1Ьаг 1Ье Не1пъЬо11к Егее епегеу га ехгепяче.
%е ехргеаа 1Ыа Ьу !п1гос1исЫй Ея ЕЬе Не!тпЬойг Егее епегеу рег рагйс1е оЕ а с1еЕесй(гее сгуага1, апс1 ънп6пй Рм,о(Ъ'м,о) = МЕо. ОЬчюив1у, Рмъьо(~гм; г,а) — Рм,о(1'м,о) = Ео СотпЬйипй 1Ьезе Ейгее гегша, ъче йпс! 1Ьаг , (Чмъ, ) — Рмя(Ъ'мя) = — РЛ вЂ” Е +Е,. (10.4.4) 70.4 1 агапе(ев апг( ЬИегвЕЕЕ(а!е 265 ТЬе чо!шпе !в а!во ап ехгепв(че г!папНгу; Ьепсе М ъ'м,о = ъ'мапо.
М41 11 ЕЬеп Ео11оъчв ЕЬа1 Р(Чм+П~ — 1~м,о) = Р(Ъмъп~ — Ъм~по~-!7м+По — Тгм,о) Р(~Ы -!- ЧГХ). Непсе, ЕЬе С!ЪЬв Егее епегду Н!ЕЕегепсе аввос1а1ес1 ъч!ЕЬ ЕЬе Еоппа1юп оЕ а ъ асапсу а1 а врес!Яс 1аЕНсе в!Ее, ег(иаНоп (10.4.2), !в Нъеп 9"' = Р(Ум~из — Ъ'м,о) — Е~ + (Ьч -ъ- Тг7)'4)Р+ Ео Р(Ч!)ъ1) — Е~ + Ео (РГр+ Ео) — Е~ Но — Еп ъчЬеге ъче Ьаче г(еЯпес1 !го = (Р/р+Ео). Ь)оьч ъче Ьаче го !пс1ийе ГЬе еп1гор(с сопгпЬи1!оп с1ие Ео Нъе с1!вГг!ЬиНоп оЕ и ъ асапс!ев очег М 1аЕНсе в!Гев. ТЬе гога! С!ЬЬв Егее епегЯу ЕЬеп Ьесогпев 6 = 6о()ъ!) ъ- ид"*'+ М!свТ ~ — )п ( — ) + (1 — — ) )п (1 — — )1! 6о(!ъ!) '- и9"" + и!свТ1п — — и!свТ.
М 1Е ъче ппп!пъ!ге ЕЬе С!ЬЬв Егее епегду ъчИЬ гевресг Ео и, ъче Япс1 ЕЬа1 (и) = Мехр(-~39'"), ъчЬеге ъче Ьаче ЕЯпогед а япа11 соггес1юп с1ие Ео ЕЬе ъ"апаНоп оЕ 1п М ъч!ЕЬ и. 11 ъче !пвег1 Нпв ча1ие !п ЕЬе ехргевяоп Еог ЕЬе 1о1а1 С!ЬЬв Егее епегду, ъче Е!пд ЕЬаг 6 = 6о()ъ!) + (и) д"" — (и) 9"' — (и) !свТ = 6о — (и) !свТ. ТЬе Еога1 пшпЪег оЕ рагНс1ев !в М вЂ” (и). Непсе ЕЬе С!ЪЬв Егее епегду рег РагЯс1е !в 6о — (и) !свТ (и) !свТ !ъ = „„= !гав ю !ъо — х !свТ. (10.4.5) Непсе Нъе сЬапЯе !п сЬепйса! рогепНа! оЕ Нъе во1гН йпе го ЕЬе ргевепсе оЕ часапс1ев !в Л!г = — х,!свТ (10.4.6) Егогп ъчЬ!сЬ Н Ео11оьчв ЕЬаг 1Ье сЬапде ш ргеввиге оЕ ЕЬе во!!Н а! 1!хек сЬеппса1 ро1епНа! !в ег)па! Ео ЛР =х„р !свТ. (10.4.7) 266 ОгарЕег !О. атее Епет8Еев оЕЯо!и(в 10.4.2 Хигпепса1 Са1си1а11опв Часапс1ев Ь)ишег)са!!у, й Ев вгга18ЬЕЕоги агс1 Ео сотргйе ЕЬе ес!ш1!Ъпшп часапсу сопсепгга6оп.
ТЬе сепЕга1 г)иапйгу ЕЬаг пеебв Ео Ье сотригед Ев — Еп ЕЬе сЬап8е 1п Егее епег8у оЕ а сгувЕа! с1ие Ео ЕЬе сгеа6оп оЕ а в!п81е часапсу аг а вресййс 1атйсе роий. 1п Еасг, И Ев июге сопчеп!епг Ео сопвЫег 4ЕИ Ейе сЬап8е !и Егее епег8у с1ие Ео ЕЬе геена! оЕ а часапсу аг а врес!Ис 1атйсе роий. ТЬ)в г!пап!(гу сап Ье сотригей !и вечега1 гнаув. Рог Епвгапсе, гне сои!6 иве а раг6с!е-1пвегбоп теЕЬос1. )Че вЕагг и~ИЬ а сгуяа! сопЕашш8 опе яп81е часапсу апс1 айегпр! а Ьйа1 швегбоп !п ЕЬе И68пег-8ейв се11 виггоипбш8 Ейа! часапсу.
ТЬеп Е~ 1в 81чеп Ьу Е Чггв (ехР( — РЛП) (10.4.8) гнЬеге Ч нв)в ЕЬе чо1шпе оЕ Ейе !Ч18пег-8е(гв се11, апс1 сШ )в Ейе сЬап8е !и рогепг!а! епег8у аввос(а!ей чнИЬ ЕЬе 1пвегйоп оЕ а Ег(а! рагбс1е. Рог Ьагй рагбс1ев Е = — 1сТ1 Ла гчЬеге Р„, (Ч~нв) 1в Ейе ргоЬаЬ11йу Ейа! ЕЬе Епа1 1пвегйоп Еи ЕЬе Х18пег-Бейт се11 гн111 Ье ассергед. Ав гпов! оЕ ЕЬе чч18пег-хейг се11 1в по! ассевв!Ь!е, И 1в гпоге еЕЕ!с)еп! Ео айегпр! 1пвег6оп (и а виЬчо1шие (ЕурЕса11у оп ЕЬе ог6ег оЕ Ейе се!1 чо1шпе !и а 1ай(се-8ав июс1е1 оЕ ЕЬе во1Ы).
Ноъчечег, Ейеп и е а1во вЬои1с1 сопвЫег ЕЬе гечегве гиоче — Ейе геиюча1 оЕ а рагбс!е Его а виЬно!шпе ч оЕ ЕЬе \Ч18пег-Бейл се11, ш а сгувга! гнИЬоиг часапс(ев. ТЬе оп!у ЕЬ)и8 ч~е пеес1 Ео сотриЕе ш ЕЬЬ саве 1в Р„(ч), Ейе ргоЬаЬ!1йу ЕЬа! а раг6с1е Ьаррепв Ео Ье Епяде ЕЬ в чо1шпе. ТЬе ехргеввюп Еог Е~ 1в ЕЬеп Е~ = — !свТ1п '" е ОЕ соигве, 1п ЕЬе йпа1 ехргеввюп Еог ЕЬе часапсу сопсеп!табоп, Ейе Еасгог Ла дгорв ои! (ав й вЬои16), Ьесаиве й Ев сапсе))ед Ьу ЕЬе ваше Ееип 1п ЕЬе Ыеа1 рагг оЕ ЕЬе сЬегп(са! рогепг)а1. А 66гес! са1си1айоп оЕ ЕЬе часапсу сопсепгга6оп (281, 282) ви88евгв ЕЬа! ЕЬ!в сопсепгта6оп Еи а Ьагб-врЬеге во1Ы пеаг соехййепсе Ев арргох(шаге!у 2.6 х 10 ~. Ье! ив аввшпе ЕЬа! ГЬе деЕеси Егее сгувга! 1в 1п ес(ш1!Ьпшп гнИЬ ЕЬе 11с(шс1 а! а ргеввиге Р апс1 сЬеииса1 роЕепг!а! и.
ТЬеп й 1в еаву Ео чепЕу Ейа! ЕЬе МаЕ! ш ЕЬе соехййепсе ргеввиге с1ие Ео Ейе ргевепсе оЕ часапс(ев Ев — х(0)!свТ 6~ соех— чг н5 СЬар$ег 11 Ггее Епеп„у о1 СЬаы Мо1еси1еь !и СЬаргег 7, чче !пггос1исед ЕЬе !ей! раг6с1е Епаег6оп всЬетпе аа ап еЕ6с(его гпеЕЬог! Еог де!спи(п!пд ЕЬе сЬепбса1 роГепЕ(а1.
Нотчечег, ЕЫа гпеЕЬог! Еа!1а и Ьеп ЕЬе ргоЪаЪ11йу оЕ ассер6пц а !па! шаегг!оп Ъесотеа чегу япа11. Опе сопаег(иепсе !а ГЬаГ ЕЬе ьипр1е раг6с1е !паег6оп пгейюг! !а !емче!1 аи!Гег( Еог гпо1еси!аг ЕЬап Еог агош(с ауагешя ТЫа !а ао Ъесаиае ЕЬе ргоЪаЫЬгу оЕ ассерМпд ЕЬе гапдогп гг(а! 1пвег6оп оЕ а 1агее пю1еси1е ш а Е)и!г! !а иаиа11у ехггете1у япа11. РоиипаГе1у, й !а роаяЫе го очегсоте ЕЫа ргоЫет, аГ 1еааг раг6а11у, Ъу регЕогш!пе попгапс1от аагпр1$па. Неге, и е с1!асзж аечега1 оЕ ЕЬе гесЬ- пи)иеа ЕЬаг Ьаче Ъееп ргороаед го согприге ЕЬе сЬеписа1 рогепг(а! оЕ сЬа!и то1еси1ея ТЬгее г$1ЕЕегеп! арргоасЬеа Ьаче Ъееп ргоровег( Ео !шргоь е ЕЬе еЕЕ!с~епсу оЕ ЕЬе ог(а!па! гчгс!от асЬегпе.
ТЬе аюдаг 6!гесг оЕ ЕЬеае гесЬ- и!г(иея !п еааепсе, Еа ЕЬеппос1упапис пйеага6оп асЬетея Ь(ехЪ хе гбя сиаа а гпегЬос1 Ъааед оп (депега(!га6опа оЕ) ЕЬе йоаепЫигЬ а!дог!Внп Еог депега6пе ро1угпег соп(оппа6опя Апс1, Япа11у, ше гпеп6оп а гесигяче а1- доп6ип. 11.1 СЬЕППСа1 РО1ЕП6а1 аь ЕЕ(7ЕГЯЫЕ ЪЧОК1С ТЬе ехсеаа сЬепйса1 роГепг(а1 оЕ а (сЬа(п) то1еси1е Еа а!тр1у ЕЬе гечегяЪ!е и'ог(с пеес1ес1 го агЫ висЬ а пю1еси1е го а 1!с(и!с1!п шЬ!сЬ Ь! оЕЬег (роМЫу гбеп6са1) гпо1еси1еа аге а!геабу ргеьепп 1Е чче сЬоове Го Ъгеа(с ир ГЬе шьег6оп оЕ ЕЬе гпо1еси1е !пго а пшпЪег оЕ а!ерш, ЕЬеп с1еаг1у ЕЬе гечега!Ые ччог1с пеейег! Ео !паегг ГЬе гчЬо!е пю!еси!е !ь ес(иа! Ео ЕЬе аигп оЕ ЕЬе сопГг!ЪиГ!опа оЕ ЕЬе аиЪвЕеря А! ЕЫа а!аде, ъче аге вг!11 Егее го сЬооае ЕЬе е1етепгагу егерь, 270 СйарЕет 17. Гтсе Епег8у оЕ СЬат Мо1еси!ев ]ив! аь тле аге Егее го сЬооае и Ьагеъег гетега!Ые раЕЬ и е х!аЬ иЬеп регЕогпип8 ЕЬепподупапис тЕе8гаИоп.
Опе оЪч!оиь роаяЬг1йу !а Ео ь!аг! и НЬ ап 16еа1 (поп!пгегас6п8) сЬат пю1еси1е апй ЕЬеп в1оМу ви ИсЬ оп ЕЬе !пгегас6оп оЕ ЕЬ!а то1еси1е и ИЬ ЕЬе ьштоип6!п8 раг6с1еа (аист ЕЬе попЬопдег! тггато1еси!аг !пгегасИопа). ТЬЬ сои!6 Ье с1опе т ЕЬе и ау деаспЬей т ьесИоп 7.1. 1п ЕасЕ, ЕЫь арргоасЬ и аа Ео11ои ед Ьу М61!ег апИ Раи1 (288], хЬо регЕоппес1 а япш!а6оп т ь ЫсЬ ЕЬе ро1утег !пЕегасИоп !а ячйсЬес1 оп 8гадиаБу. А1Июи8Ь Низ япш1а6оп сои1г1 Ьаче Ьееп регЕоппей и ИЬ аЕга!фМоги~агс1 ЕЬегтоИупапис тге8гаИоп, а ти11!Р1е-ЫвЕо8гат тегЬод (аее аесИоп 7.3.1) и аа паем ттагеас$, Ьи! ЕЬ!в с1оеь по! сЬап8е ЕЬе оиега11 па!иге оЕ ЕЬе са1си1а6оп.