Frenkel, Smit - Understanding molecular simulation - 2002 (523144), страница 45
Текст из файла (страница 45)
Ночченег, геа$ соПо)ба) зо!изопв аге печег ребесбу топоб(врегзе. ТЬе ро)уб)врегв)$у о1 со))о)ба! зиврепзюпв пав а з1гопд еНес! оп йе )оса1юп о1 йе 1геегбпд 1гапвдюп. $1 )в йеге1оге о1 сопв)бегаЫе )п1егев1 1о в1ибу йе еНес$ о1 ро!уб)врегв)1у оп йе )осадоп о1 йе 1геегбпд 1гапз)1(оп. Н ччои)б веет йа1 йе дгапб-сапоп)са! епветЫе )в 1пе па1ига( опе 1о в1ибу ро)уб)врегзе зуз1етз. )п й)в епзегпЫе чче сап )трове йе спегп)са) ро1епИа) б)в1г)Ьи1)оп йа1 депега1ев а сопдпиоив з)хе б)в1г)Ьи1)оп.
Рог йе питепса! в1ибу о1 1геез(пд, 1Ыз арргоасп )в по1 иве(и), ав 1пе ргоЬаЫИ1у о1 а виссевв1и! )пвег$)оп/бе)е1)оп о1 а раг1)с)е )п йе во!к$ рпаве (зчегу )очг. То ачо)б 1Ыв ргоЫет, Во)пи)в апб Ко(ке [260,261] ивеб йе вегп)дгапб епветЫе 1о з1ибу йе 1геегбпд сигче о1 ро)уб)врегве Ьагб врпегев. То 1гасе ои1 йе воПб-Ии(б соех)в1епсе сигче, йеу согпЫпеб йе вет)дгапб епвегпЫе (вее вес1юп 9Л) чч(1Ь йе 6$ЬЬв-0ипет й1едга1юп 1есппк)ие (вее вес1юп 9.2). )п ехрег)теп1з, йе ро)уб(врегз)3у о1 а зиврепв)оп )в спагас1ег)леб Ьу (Ье ргоЬаЬ3)Ну бепв)3у р(с), ччпеге о )в 1пе б)агпе(ег о1 а Ьагб зрпеге. )п соп1гав1, )п а дгапб-сапоп)са) в)ти)а1(оп, опе ччои!б )трове гг(о.), (.е., йе спегп3са! ро1епиа! ав а (ипсИоп о1 з)дта. ТЫв )тр))ез 1па1 р(о) )з по1 )гпрозеб а рг(оп Ьи1 1о!!оччз 1гот 1пе в)ти)а1)оп.
1п а вет)дгапб-епзетЫе в)ти)а1юп йе спегп)са( ро(еп1)а(в аге Ихеб чч(й геврес1 1о йе спет)са! ро(еп1)а)ггг о1 ап агЬ(1гап!у сповеп ге1егепсе согпропеп1. А 1ур)са! зет)дгапб-епзетЫе Моп1е Саг!о точе )в 1о ве)ес1 а раг1)с)е а1 гапбогп апб спапде йе с$)ате1ег о1 й$з раг1!с)е. 1п 1Ь)з ччау, йе )пзегдоп апб бе)е1)оп о1 еп1(ге рагбс)ез аге ачо)беб. Н чге з$гпи(а1е )п а з)т))аг чгау а весопб зув1егп а1 йе вагпе ргеззиге апб 1етрега1иге (чче изе йе МРТ чегв$оп 1ог Ьой вуз1етв), апб ве вотепочг гпападе 1о епвиге йа1 йе ге1егепсе спегп$са! ро1еп1$а)в аге С(!ар!ег 9. Огггег МеГ(гос(е го 9!ис(у Соехгегепсе 238 С - Е Хс(нс - И!)+ М1Н! с=! т ПЪ ~ НсНс — ~Не(~;-Н )=~ Нси! с=! (с(гс! .
с=! с=! Рог а ро(уб(врегве вув1еп! чче паче а сией(са) ро1епМа( б)в1г)Ьи1)оп, чгЫси (пзр((ев йа1 чче сап гер(асе 1ие вии!гпа1(оп Ьу ап (п1едгабоп очес си г' = 6 — Н бо р(о) ((с(о) — гс! (оП = Н(х(о). Тие б(3(егеп1(а! 1оггп о1 й(в ес(иа1(оп учев йе 1опбагпеп1а! йеипобупагЫс ес(иа1(оп (1983 б(ру) = Нб(3+ 53Гбр — М бор(о)33о ((с(а) — 3с! (о)) + (3М(с(о! )бМ, ччиеге о гергевеп1в а 1опс1(опа! б(((егеп1(а!. Во(ио(в апб Ко()се ивеб а с(иабга1(с 1огп! 1ог йе сиегЫса! ро1епба( 1о ехргевв йе ро(уб(врегв(1у: 33 (гс(о) — гс! (о)] =— (о — о! ) 2ч (9.2.6) (п 1пе 3(гп(1 ч — ! 0 чче гесочег а вув1ет о1 риге(у июпоб(врегве Ьагб-вриегев с3(аде!ег о!. уу)1Ь й(в ес(иа1(оп 1ог йе сиегп(са( ро1еп13а(, йе 1ипбагпеп1а! йеггпобупагЫс ес(иа1(оп сап Ье ччг)3(еп ав б(8У) = Нб8 + р'сгбРР(с(гс(о!)сГХ вЂ” бо! — бч (9.2.7) гпа1сиеб, йеп чге (спочч йа1 йе 1ччо вув1епзв аге (и ес(и(3(Ьг(ии!. ТИ(в гпахев й(в гпейоб (беа( 1ог риаве ес(и(33Ьг(иги са)си)а1)опв.
То рег(оггп а 6(ЬЬв-33оиеги 3п1едга1юп всиейе, чче пеес3 1о с3ег(че йе ес(и)ча(еп1 о1 йе С(аивгов-С(ареугоп ес(иа1(оп 1ог а ро(уб(врегве вув1еп!. Рог ап огб)пасу й(х1иге апбег (воЬаис сопб(1(опв, йе (3(ЬЬв 1гее епегду пав 31в гп(и(гпий ча(ие а1 ес(и(3(Ьг(игп. Тие 6(ЬЬв 1гее епегду (в а па1ига( 1ипсбоп о1 йе 1егпрега1иге, ргеввиге, апб пигпЬег о1 раг1(с(ев о1 1ие чаг)оив согпропеп1в: 6 = С(Т,Р,М„Мх,...,Х ). (и йе веги(дгапб епвегпЫе, Иочгечег, чге Меер йе 1о1а( пийЬег о1 раг((с(ев дхеб ()с( = 2," ! (ч!), апб чче ппрове йе сиегп(са! ро1епда( б(1(егепсев чи1Ь геврес1 1о а ге1егепсе спеги)са( ро1еп6а(, вау согпропеп1 !. То Лпб йе 1опбагпеп1а! йеггпобупагп(с (опс1)оп о1 в1а1е йа1 соггевропбв 1о 1Ыв епветЫе, чче паче 1о рег!огги а Ьедепбге 1гапв1оппадоп 1о сиапде йе (с(! берепбепсе (п1о а гсс — (с! берепбепсе 1ог а(! согпропеп1в ехсер1 йе ге1егепсе сои! ропеп1 3: 9.2 Тгагт Соег(51еггге Сигге5 239 09 ег Га 0~ и! 00 0.9 0.0 0.1 0.9 0.3 0.4 0.5 3 г(диге 9.2: Соех(56пд ИиЫ апг( во1Ы рЬазез (п йе чо(игпе (галоп ро1уг($5- регв(1у р!апе.
Рог ЫИЬ ро1уг((врегз(1у ш ег(иаИоп (9.2.7) (щЬег огг(ег геппз !п о Ьаче Ьееп агЫег(, зее геЕ. (261] Еог г(ега(15. ччИЬ тп„= ~г(о (о — о~ )"р(о). Тпе сопчеп1(опа( Еопп о( йе С1аиз(ив-С1ареугоп ег(иа1(оп ехргеввев Ьочч, а1 соех(в1епсе, йе ргеввиге спапдев И опе спапдев 1пе 1етрега1иге. (и йе ргевеп1 саве, чче аге (п1егев1ег((и йе г(ерепг(епсе о( йе соех1в1епсе сигче оп йе ро(угйврегвИу рагагие1ег ч. И !в в1га(дЬИоп5гагг(1о г(епче йе соггевропг(!пд С(аивяз-С1ареугоп ег(иа1(оп. 8(псе Ду = Д$4~Ь(, чче паче д((ЗУ) = Ь$4$(9$4(о~ )] + (1и(о$ )г()М, И чче сотЬ(пе й1в ег(иа1(оп ччИЬ ег(иа1(оп (9.2.7), чче оЫа(п 4$[Д]4(о$)] = 7и(Д+ Ичг(Р— — с1о0 — — г(ч.
т~ т4 'ч 29 И 19чо риаве аге (и ег(ид(Ьг1ит 1пе спет(са! ро1еп1(а(в тиз1 Ье йе загпе (и йе Ьмо рпазев. ТЬ(в (в йе сазе И и(о$ ) (в 1пе загпе 1п йе 19чо рпавез апг$ йе ро1еп11а( с((Иегепсе ЕипсИопв аге йе вате; (.е., чче впоиЫ иве ег(иа1юп (9.2.6) 991й йе вате ч апг( о~ Еогйе 1ччо рпазев. Непсе, Еог йе 19чо рпазев иге паче г(о~ = О апс( ЙД = О, д(ч(пд йе г(ев1гег( С1аиз(ив-С1ареугоп ег(иа11оп; ЙР ггтг с(ч 2ч4 ДгЬ Аввит(пд йа1 чче Мпочч опе ро(п1 оп йе соех1в1епсе сигче, чче сап иве й(в ег(иа11оп 1о 1гасе йе соех(з1епсе сигче ав а Еипс11оп о( йе ч.
СЬар1ег 10 Ггее Епегд1ев о1 Ьо1Ыь Оп соо1т8 ог сотргевв!оп, а!пюв! а11 11!!шсЬ ппс)ег8о а Е!гв1-огс)ег рЬаве )тапяпоп Ео йе воРЫ вгаге. 1! Ев оЕ сопяс1егаЫе ргасбса! ппроггапсе Ео Ье аые Ео ргали!с! йе !оса!!оп оЕ йе Егеелп8 ро!и!. 1п !Ь)в сЬар!ег, и е с1евспЬе чапоив теЕЬос)в Еог 1осагт8 во1Ы-1к)шд соех!в!епсе Ьу в!тп1а6оп. ТЬе геас)ег гпау и опс1ег и Ьу а врес)а! сЬарЕег Ев с1ечо!ес1 Ео пшпепса1 всЬетев Еог !оса!)п8 ЕЬе во1Ы-1Ес)шд соех!вгепсе сигче.
АЕ!ег а11, !есЬгпс)иев Еог !оса!Еп8 а Е)гвг-огс)ег соех1вгепсе сигче игеге а1геас)у с)1всиввег1 гп СЬар!ег 8 гп йе соп!ех! оЕ йе 1!с)пЫ-чарог !сапа!Е)оп. ТЬе геавоп 1в, оЕ соигве, йа! пюв! оЕ йе ЕесЬгпг!пев йа! ячог)с Еог пюс1ега!е1у с1епве 1!г1шсЬ апс1 8авев с!о по! гчог1с Еог воЬс)в. СопвЫег, Еог ехагпр1е, йе СЕЪЬв епветЫе гпейой Рог й|в теЕЬос) Ео и ог)с, 1! !в еввепЕ!а) йа! 1! Ъе ровяЫе !о ехсЬап8е рагпс1ев Ьессчееп ЕЬе Е!чо соех)вйп8 рЬавев. ТЬе 1п)гос)асс!)оп оЕ а рагЕ!с1е тго йе во!Ы рЬаве гесулгев йе ргевепсе оЕ а часапсу гп йе !а!псе. 8исЬ с1еЕесгв с)о оссиг т геа1 во1кЬ, Ьи! йе)г сопсеп!га6оп гв во 1огч (Еог ехатр1е, гп йе саве оЕ а Ьагй-врЬеге сгувга1 пеаг те111п8, йеге Ев оп ачега8е опе с1еЕес! т а вув!егп оЕ 8000 раг6с1ев) гЬа! опе и оиЫ пеег1 а чету 1аг8е сгув!а! !о оЪвегче а геавопаЫе пшпЬег оЕ Ьо1ев !п а япш!а!Еоп.
Непсе, йе С!ЪЪв епветые )есЬп1с)ие, а1ЕЬои8Ь вбей ча1Ы т рппсгр1е, и оиЫ по! Ъе чегу ргас!!са! Еог йе апас)у оЕ во1Ы-1!г)шй ог во1Ы-во1Ы соех1в!епсе.' гог тоге с1е!а11в апс) !Ьеоге6са! Ьас)с8гоипс1 сопсеппп8 йе пшпепса1 вгис1у оЕ воЬсЕ-Е1и!с! соех)в!епсе, и'е геЕег !Ье геас1егв Ео йе геЫеи оЕ Мопвоп апс) КоЕ)се 1262!. '!и яогпе ярес)а! саяе Г)ге гпес)гог! о! ')))ггап! апс) ИГи 1199! (яее С Ьарсег В) пг)В)г! гпа)се а а)гес! С!)я)яя епяепг)г)е я)ппг)ааоп Ееая)Ые.
242 СЬаРЕег 1О. Ггге Епеге(ев оЕ 5о!вЕв 10.1 ТЬепподупаптес 1п$ера6оп ТЬеппос1 упаппс т!ецга6оп !в ЕЬе теИюс1 тов1 сопипоп1у ивес1 т ЕЬе вЬЫу оЕ йе во!Ы-1!с!иЫ Егапв!Иоп. Рог йе Ис)и!6 рЬаве, Иив са!си1а6оп Ев в1гафЬЬ Еогюагс( апс1 гчав а1геас1у савсиввес1 т вес6оп 7.1; йе Не1тЬоаа !гее епегду г оЕ йе ИсугЫ Ев с1е1егпипес1 Ьу ттведгабпд ЕЬ!в ес!иа6оп оЕ вЕаге, в!агбпд а! 1онн с1епя6ев ччЬеге !Ье Ишь ЪеЬачев еЕЕес6че)у ав ап Ыеа1 дав: Цр) гга(р) ! Ер, /Р(р') — р'!свт'1 (10.1.1) )х!)св™вт 1свт 1а [, Р" чнЬеге йе ес]иа6оп оЕ в!а!е ав а Еипс6оп оЕ йе с1епя1у (р) Ев с!епо!ед Ьу Р(р), апс1 Ра(р) Ев йе Егее епегду оЕ ап Ыеа1 дав а1 с(епвИу р. Ап ипрогЕап! сопс!6оп !в йа1 !Ье т!еИга6оп рай !п ес]иа6оп (10.1.1) вЬоиЫ Ье гечегв(Ые.
1Е йе !и!еИга6оп раЕЬ сговвев а вЕгопд Игвпог6ег рЬаве Иапв!Иоп, Ьувгегев!в тау оссиг, ап6 ес)иа6оп (10.1.1) сап по !опдег Ье ивей Рог а 1и)- и!д рЬаве, Иив ргоЫет сап Ъе ачо!Иеб Ьу рег(огт!пд 1Ье !и!ецга6оп !п Егчо в!ерв. 5!агЕ !Ье япш1а!юп а! а !етрега!иге чнеБ аЬоче йе сп6са1 ЕетрегаСиге апд де!егт(пе йе еоиа6оп оЕ вга1е Еог согпргевяоп а!опт ап ЕвоЕЬепп Ео йе с1евИед депяЕу. 1п ЕЬе весопд вгер, йе вувгет 1в соо1ес1 аг сопвгапг Иепв!Еу Ео !Ье с1ев!гед Еетрега1иге. ТЬе Егее епегду сЬап5е !п 116в вгер гв учеп Ьу 3! — 6(17т)ц(т, ь1,17).
(10л.2) )свта )свт~ г, ТЬе во66-Ис(и!6 соехааепсе сигче Иае1Е боев по! еп6 !п а ст16са1 ро!пе апс1 Ьепсе йеге ех!в!в по "па1ига1" гечегв!Ь!е рай Егот !Ье во1Ы !о йе Ыеа1 дав ЕЬа! Иоев по! сговв а Игввогдег рЬаве !тапябоп. И гв ивиа11у рова!Ъ)е, Ьоччечег, Ео сопв!гис1 а гечегв!Ь!е рай !о ойег вгагев оЕ (спогчп Егее епегау. ТЬе сопвЕгисбоп оЕ висЬ райв !в йе гпа!и !ор1с оЕ йе ргевеп! сЬар1ег.
'чаг!оив гои!ев агг!че а1 а в!а!е оЕ )споили Егее епегИу. 1п йе пис1-1960в, Ноочег апс1 Кее !пЕгос1исе6 !Ье во-са1!ед вшие-оссирапсу сеИ вгейод [252, 263]. 1п ЕЬе в!пц!е-оссирапсу се!1 тейос1, йе во1Ы !в тос1е1ес( ав а 1ауасе аав; еасЬ раг6с1е !в авв!дпе6 Ео а в!пц!е 1аИ!се ро!пг апс1 1в а11очнес1 !о пюче оп1у !и Ив "сеП" агоипс1 йгв 1аЕИсе ро(п1. ТЬе 1авасе вИев со!псЫе гч!й йе ачегаде ровгаопв оЕ йе аЕотв оЕ ЕЬе ипсопв1га!пес1 во1Ы. 1Е ЕЬе Иепв!Еу 1в виЕЕк!еп11у Ь(ф — висЬ йа! йе ъна11в оЕ !Ье се1!в Ьане а пе56а!Ые !пйиепсе оп ЕЬе ргорег6ев оЕ йе вуввегп — ЕЬе Егее епег5у оЕ !Ь(в 1аЕИсе пюс1е1 1в Ыеп6са1 !о !Ьа1 оЕ !Ье ог!5!па1 во1Ы. ТЬе в!пд1е-оссирапсу сеИ тос1е1 сап Ье ехрапс1ес1 ипМопп1у кайои1 те!ба (ог, тоге ргес!ве1у, чнИЬоиг !иова Ив !гапв1абопа1 опЛег). 1п й!в гчау, чне оЬЕа!и а (ргевшпаЪ!у гечегв!Ые) !пЕе5габоп ра!Ь Ео а 66иге 1авбсе аав, ЕЬе Егее епегду оЕ гч)асЬ сап Ье са!си1а1ес1 апа!у6са11у.
ТЬе еагЬев! арр1ка6оп оЕ йе в!щ1е-оссирапсу сеИ теЕЬо6 ънав ЕЬе са1си1абоп Ьу Ноочег апс1 Иее оЕ йе Егее епегеу оЕ йе Ьагс1-сИв1с [263] апд Ьагс1-врЬеге во! Ы [252]. 243 10.2 Ггее Епегч(ев 0[50!и(в Ап аИегпа6че !ог !Ье ящ1е-оссирапсу сеИ тейог! тчав а1во г(ече1орес( Ьу Ноочег апс1 со-итог(сегв [254,256). 1п Иив арргоасЬ йе во1Ы 1в соо1ес1 Ео а !етрегаШге виЕЙс!еп6у 1огч Еог И !о ЬеЬаче ав а Ьаппошс сгув!а1.
ТЬе Не!ш1юИл Егее епег8у оЕ а Ьагпюшс сгувга! сап Ье са1си1а!ег( апа1убсаИу, ив!п8 1аЕЙсе с(упаш!св. ТЬе Егее епег8у оЕ йе во1Ы а1 Еи8Ьег !етрегагигев !Ьеп ЕоИоччв Егогп !п1е8га6оп оЕ ес[иа6оп (10.1.2).2 1п ргас6се, Ьой йе в!п81е-оссирапсу сеИ шейос1 апс1 1Ье тейос1 ияп8 йе Ьаппошс во1Ы Ьаче воте Ипи1а6опв йа! ша1се а пюге 8епега1 всЬете с1еягаЫе. Рог ехагпр!е, ЕЬеге !в вснпе ечЫепсе 61а! йе !войегша! ехрапяоп оЕ !Ье яп81е-оссирапсу сеИ шос(е! шау по! Ье сошр1е!е1у Егее оЕ Ьув!егеяв [258]: а! 1Ье с(епв!Еу и~Ьеге 1Ье воИЙ и ои!6 Ьесоте тесЬашса1!у ипв!аЫе !п !Ье аЪвепсе оЕ йе аг6Е!сна! сеИ гчаИв, йе ес!иабоп оЕ в1а1е оЕ йе яп81е-оссирапсу сеИ пюг!е! арреагв !о дече!ор а совр ог рова!Ыу ечеп а и~еа(с Йгвг-огг(ег рЬаве !гапя6оп.