Frenkel, Smit - Understanding molecular simulation - 2002 (523144), страница 47
Текст из файла (страница 47)
)ЛЪеп 1Ье 1а61се 1в ехрапс1е6, йе йгегпю1есп1аг 1пГегас6опв Ьебчееп йе гпо1есп1ев сЬапее. ТЬю 1в Ьев1 вееп Ьу ехргевяпе 1Ье сепгег-о1-агава соог6)паГе о1 раг6с1е 1 ав г; = угад+ Лгг, и Ьеге Г1гг 1в 1Ье роябоп идй гевресг го а !а66се яге о! йе ехрапс(ест Е1п- вГей сгувГа!. гог йе с(1вГапсе Ье1и ееп 1и о рагбс!ев, тче сап гчг(ге г„; = Ь(га, — гсд) + гггг — Л1г,. (10.3.3) 1п 1еппв о! 1Ьеве соогг(1паГев, йе рогеп6а) епегеу о1 йе ехрап6е6 сгувга! 1в йп(г,а; у) = Д ир„,(гц,аг,а;) + Д сг(Лгг) . (1034) )х)о1е гьаг оп1у гье 1пгегто!еси!аг !п1егас6опв с(ереп6 оп и (гьгопеь го).
тье г(ег(набне о1 1Ье 1гее епеглу гч)й гевресг го и 1в Оп!у а!66в агаве с1о и е пга)се иве о! йе аввпгпрг(оп йа1 1Ье й1еппо1есп!аг рогеп6а! 1в ра(ги 1ве асЫ16не. Хе в1гевв, Ьои енег, йагйе аввшпрбоп 1в по! еввеп6а1 — 6)пвг у(е16в а вппр1ег 1опп 1ог 1Ье йпа! ехргевяоп. Ргогп ег)пабоп (10.3.3) 6 !о!!ои в 1Ьаг , о дгц о ' 0 ду гц СИаргет 10. Ртее Епетг!еа оЕ 5о!иЬ ТЬе сЬапде Еп Егее епегду с1ие !о йе ип)Еогш ехрапяоп Еа еГ" — е(л = ),т = 1) Г" (-'") диев.(тц, Х2г, П;) гц гц ф' 1 г(! дтц тц (10.3.5) Ноге йа1 11, !п йе ргесес(1щ ег)иа6оп, тче гер1асе г~; Ьу тц, ЕЬе ехргеаяоп !и апул1аг Ъгас1сега гег(исеа го йе ч!г)а), Хе !Ьеге(оге геЕег !о !Ье 1пЕедгапс( !и ес(иаиоп (10.3.5) аа а шог(1йег( ч!г!а1.
р!па!!у, тче шпаг еча1иа1е йе Егее епегду оЕ йе геЕегепсе яа!е: ап Е1па!ей сгуага1 сопа!аг)щ оЕ попитгегасЕ(пд пю1еси1ея Аа ЕЬе 1пггапю1еси1аг сопгг(Ьииоп Ео йе Егее епегду 1а а сопа!ап! йа! с(ерепг)а оп1у оп ЕешрегаЕиге, тче аЬа11 15поге гв ТЬе ехргеаяоп Еог !Ье !о!а! !гее епегду оЕ !Ье шо1еси1аг ао1Ы йеп Ъесогпеа ~гпо! иа! Ряп ЛЕ1 — ЛГп (10.3.б) Рог пю1еси1аг ао1Ыа тч1!Ь (рагиа!) опепЕа6опа! оп1ег, а аиш1аг асЬете сап Ье иаей 'тче ЕгапаЕогш йе ао1Ы Ьу 1шроящ а соир!!пав оЕ йе сеп!ега оЕ гпааа оЕ йе пю1еси1еа !о5е!Ьег тч(ЕЬ а соир!!пав оЕ йе оЫетед г)едгееа оЕ Егеег)ош. ЪйЕЬ йе сошЬ!пег( соир1~щ йе ао1Ы Еа ехрапг(ег(.
ТЬе с(е!а1!а оЕ йва асЬеше г(ерепс( оп йе па!иге оЕ йе опеп1аИопа1 огг(ег. 10.3.1 АЕопис Ьо1Ыв итИЫЭ(всоп6пиоив Ро1еп6а1в и(л) =и. +ли =иа+л~(гг-г.,г)', (10.3.7) тчЬеге 1Ч г(епо!еа йе го!а! пшпЪег оЕ раг!!с1еа апс1 га,г йе роя!1оп оЕ йе !а!6се яве Ео тчЬ(сЬ раг11с1е 1 Еа ааа1дпег(. ТЬе Егее епегду г(1ЕЕегепсе ЬеЬчееп ?.ег иь йпа!!у сопяс1ег а ауа!еш оЕ аЕоша !Ьа! 1и!егасг ч(а а Ьагс(-соге рогеп!!а! иа. Аа ЬеЕоге, тче !гу Ео сопа!гисг а гечегяЬ!е рай Ьегтчееп йЬ ауагет апс( а пошп!егас6п5 Еыь!е(п сгуага!. ТЬе ргоыеш 1а йа1, ш й)а саве, 11 1а по! роьяЫе !о иве а Ешеат соир1!пд асЬеше 1Ьа! япшЬапеоиа1у атч1!сЬеа оп йе Ейа!е(п арг)пд сопа!апга апг( атч(гсЬеа оЕЕ !Ье Ьагс1-соте 1п!егасИопя Опе ао1и6оп тчои1Й Ъе 1о иве йе 1айсе-ехрапа!оп !есЬп)г!ие г(еаспЪес( 1п аес6оп 10.3.
Ап а11егпа!Ече 1а !о сопаЫег а ауа!ет и~Ьеге тче сап атч1!сЬ оп йе арг(п5 сопа!ап!я и Ы1е !еач(п5 йе Ьагг(-соге 1п!егасиопа Ъегтчееп йе рагис1еь ипаЕЕес!ес(: ! 0.3 Угге Епег8Еев оЕ Мо!еси!ат 8а!х(в 249 ЕЬе вувгет лч(ЕЬ соирбп8 Л апд ЕЬе Ьагс1-врЬеге Йшд 1в ЕЬеп гл... Е, = ЦЛ,„) — ~" дЛ(и(*~,Л)),. о (10.3.8) 10З.2 Сепега1 1гпр1епгеп(аЕ1оп 1ввпев ЕЕ а11 рагбс1ев аге соир1ед Ео йе Е(пвЕе(п 1аЕИсе, йе сгувга1 ав а лчЬо1е доев по! июне. Нолчечег, 1п йе 1!пи! Л вЂ” ~ О, йеге Ев по репа!!у Еог тон)п8 ЕЬе раг6с!ев алчау Егот йе(г "Е1пвЕет" 1аЕИсе роя6оп. Ав а сопвег)иепсе, ЕЬе сгувга! ав а лчЬо1е тау вгаг! Ео дг(ЕЕ апс1 ЕЬе гпеап-вг!иагед рагИс1е д!вр1асетепг (г~) Ьесотев оп ЕЬе огдег Е~.
1Е Иив Ьаррепв, йе!пЕе8гапд Еп ег(иабоп (10.3.8) Ъесотев вЬагр1у реа)сед агоипд Л = О. ТЬ)в лноиЫ веет Ео ипр1у ЕЬаЕ ЕЬе пшпепса1 !пге8гаИоп оЕ ег)иабоп (10.3.8) гег)шгев гпапу випи!абопв Еог 1онч ча1иев оЕ Л. ТЬЬ ргоЫет сап Ье ачоЫед !Е лче рег(опп йе япш1абоп шЫег йе сопвЕга!пг ЕЬаЕ ЕЬе сепгег оЕ тавв оЕ ЕЬе во1Ы геташв Яхед. 1п Иав саве, (г~) Еепдв Ео (г~)в, йе теап-вг)иагед д(вр1асетепЕ оЕ а рагбс!е Егогп 1Ев 1аЕИсе в!Ее 1п ЕЬе поппа1 (1.е., Епгегасбп8) сгувга!.
То регЕопп а МопЕе Саг1о япш1абоп ипдег ЕЬе сопвЕта)пЕ оЕ а Е)хед сеп!ег оЕ тавв ъче Ьаче Ео епвиге ЕЬаИ 1Е а рагбс1е 1в 8!неп а гапдогп д!вр!асетеп6 а11 рагбс1ев аге виЬвег)иеп!!у в)ИЕЕед 1п йе орроя!е д!гесИоп висЬ ЕЬаЕ йе сепгег оЕ тавв гета1пв Е!хес1. 1п ргас6се, 6 гв по! чегу сопчеп(епг Ео (плеер йе сеп!ег оЕ тавв т р!асе Ъу гпочгп8 аП рагбс!ев ечегу 6те а вт81ерагИс!е !па1 гпоче Ев сагпес1 оие Кайег, тче ирдаЕе йе сепгег-оЕ-гпавв ровпюп ечегу Еипе а яп81е-раг1(с!е Епа1 пюче !в ассерЕед. Хе пеес1 Ео соггесг Еог ЕЬе в)ИЕЕ оЕ йе сепгег оЕ тавв оп1у лчЬеп сотриИп8 йе роЕепИа1 епег8у оЕ ЕЬе Ьаппотс врпп8в соппес6п8 ЕЬе рагбс1ев Ео ЕЬе(г 1агбсе в!Еев. 1п сопггав6 йе са1си1абоп оЕ ЕЬе тЕегто!еси1аг рогеп6а! сап Ье сагпес1 оиЕ лчШюиг )споън1ед8е оЕ йе роя6оп оЕ йе сепгег оЕ тавв, ав а в)ИЕ! оЕ йе сепЕег оЕ тавв с1оев по! сЬап8е йе д!вгапсе Ьеггчееи рагбс1ев.
!Е !в сопчеп(еп! Ео д!в11п8и!вЬ ЪеЕлчееп ЕЬе "аЬво1иге" соогсбпа!ев (г) оЕ а рагбс1е (!.е., йове ЕЬаг Ьаче Ьееп соггесЕес1 Еог сепгег-оЕ-тавв то!!оп) апд йе ипсоггесгед соогдтагев (г! и'). ггЬеп сотриИп8 ЕЬе рогепба! епег8у оЕ ЕЬе Ьагпютс вргт8в, лче пеед Ео Есполч ~~, (г; — гв,) ~. То сотриЕе ЕЬе АЕ виЕИс!епИу Ь!8Ь ча1иев оЕ Л,„, ЕЬе Ьагд рагИс1ев до по! "Еее!" еасЬ ойег апд йе Егее епег8у гедисев Ео !ЬаЕ оЕ а потп1егас6п8 ЕтвЕет сгувЕа1. С1еаг1у, йе на1ие оЕ ЕЬе врг!п8 сопв1апг Л вЬои1д Ье виЕИс!епИу 1аг8е Ео епвиге ЕЬаЕ йе Ьагтоп!са11у Ьоипс1 сгувга! 1в 1пс1еед ЪеЬач!п8 ав ап Е!ив!ею сгувга1. АЕ йе вате 1ипе, Л вЬоиЫ по! Ье Еоо 1аг8е, Ьесаиве Иив лчои1д та)ге йе пшпепса1 ипе8габоп оЕ е~)иабоп (10.3.8) 1евв ассигаге.
1п 8епега1, йе сЬо1се оЕ ЕЬе ор6та1 на1ие Еог Л с1ерепс1в оп ЕЬе дега!!в оЕ ЕЬе тос1е!. 1п Саве 8!иду 17, лче вЬолч Ьолч Ео сЬоове Л Еог а рагбси1аг пюде1 вувЕет апс1 лче епвсивв ойег ргасИса1 гввиев айаг аге врес16с Еог Ьап(-соге тгегасИопв. СБаргет 1О. Ргсе Епетрев оЕ5о!иЬ 250 с11в!апсе оЕ а рагбс1е 1 Ео !Ев 1а!6се вЙе, г, — га и и е пшв! !сеер !гас)с оЕ йе вЫЙ оЕ йе сепЕег оЕ тавя Лгг = гг гав = гг га г ЛКсм~ пп 00 иЖеге ЛКсм с1епоЕев йе асспти1аге6 вЫЙ оЕ !Ье сепЕег оЕ глава оЕ ЕЬе вувЕет. Ечегу 6гпе а раг6с1е !в пючес1 Егот гп 0 — ~ г'Ш + Лг, ЛВсм сЬап5ев Ео Лксм + Л ()х).
ТЬе сотриГа6оп оЕ йе сЬап5е т епегцу оЕ ЕЬе Ьаппотс т!егасЕ!оп Ье!и ееп а11 раг6с1ев апс1 !Ьей !агбсе вйе гв с!ш!е Ет!ч)а1. 5иррове ЕЬа! и е а!- гетр! Ео тоне рагбс1е ! йа! !в а! а ЕЙвгапсе Лг; Йот !Ев 1аЕЙсе я!е та о Ъу ап атолл! Лг. ТЫв сайдаев а вЫЙ Л;()х) !п йе сепгег оЕ тавв. ТЬе сЬап5е !и йе Ьаппотс роЕеп6а! епег5у 1в и ЛЕЕн„, (Л) = Л ~ ~(Лг! — Лг/)М) — Лгг~ гаг +Л ~(Лгг+ !! — 1,ЛЧ)Лг)~ — Лгг~ г' Л 2Лг, . Л; + — Л;), (10.3.9) иЬеге,1пйе1ав11!пе, иерей ЕЬеЕасЕЕЬа12 ~, Лг; = О. Опе гпоге сачеа! вЬоц16 Ье сопвЫегес1: погта11у, и Ьеп а рагбс1е точев ои! оЕ йе рег!о6!с Ьох, йе рагбс1е !в рц! Ьас1с а! йе ойег яс1е оЕ йе Ъох.
Нои ечег, и Ьеп в!тп1а6л5 а вувгет ъч!ЕЬ а Е!хе6 сепЕег оЕ тавв, точт5 а рагбс1е Ьас)с 1пго йе оп5та! япш1абоп Ьох сгеагев а 6!всопбпиоив сЬапце !л ЕЬе роябоп оЕ йе сепгег оЕ тпавв ап6 Ьепсе а вш!с)еп сЬапде оЕ йе епегцу оЕ ЕЬе Етвге!и 1агбсе. ТЬегеЕоге, т а япш!абоп ит!ЕЬ а Йхед сеп!ег оЕ тавв, раг6с1ев ЕЬа! гпоче ои! оЕ йе ог!5та! япш1а6оп Ьох вЬои16 по! Ье ри! Ъас)с т. 1п апу ечеп6 йе ехсигв!оп ЕЬа! а Ьагтоп!сну Ьоипб раг6с1е сап та)се !в втаП апд ЕЬегеЕоге ЕЬеге !в по геа! пее6 Ео рог йе раг6с1ев Ъас1с !и ЕЬе япш1а6оп Ьох. А1цопйтв 20 апс1 21 в)сегсЬ Ьотч йе Благе!п-сгувга! теЕЬос1 !в ипр1етепгес1 1п а Мопге Саг!о япш1а6оп. СопвЕга!пЕв апд Р!п!Ее-5!хе ЕЕЕесвв ТЬе сопвЕгат! ЕЬа! йе сепгег оЕ тавв оЕ йе вувгет !в Йхес1 е1!пппагев а пшпЬег оЕ бе5геев оЕ Егеес1от Егот ЕЬе вувгет, апс1 ЕЬ!в Ьав ап еЕЕес! оп ЕЬе Егее епегцу.
5гг!сбу вреа)с!пц, ЕЬе сЬап5е 1п Егее епег5у с1ие Ео алу Ьагс1 сопвЕга)п! !в тйпйе. Ноччечег, ав ие вЬа11 аЬчаув сопяс1ег бфегепсев !и Егее епегду, ЕЬе !пйпШев с1гор оо6 ТЬе гета!п1п5 сЬап5е 1п йе Егее епег5у Ьесотев пе51!51Ые !и ЕЬе ЕЬеппо6упапис 1ппй. Нои~ечег, ав япш1абопв аге песеввап1у регЕоппес1 оп Япйе вувгетв, Й 1в !троггап! !о Ьаче ап евбтасе 70.3 аггее Епегчг'ев ОЕ )чЕО!еси!аг 5о!Ег(в 257 А1дог)ЕЬгп 20 (МопЕе Саг1о Ягпи!акоп чч11Ь Р)хек Сеп$ег оЕ Мавв) а!(етр(в (о гпочв а рагбс)е Кеер)пд (Ье сеп(ег о! тавв ()хес) вес ир (Ье ге(егепсе )а(()се ве)ес( рагдс)е а( гапс)от уче рагбс)в гапг)от 0)вр!. виЬтсисвпе есеоче са11 вет1ат о=гпт(таис()*пратт)+1 с)гв=(таис()-0.5)*бе1х хп=х(с)+61в г)х=х(с)-хс(с)-г)хсе бе1=1аеЬг)а*(2*с)х*бгв+ + бгв*с)гв*(пратт-1)/пратт) атд1=-Ьета*бе1 ЬГ (таис().1т.ехр(ат91)) Спеп са11 епет(х(с),епс) са11 епет(хп,епп) ат92=-Ьета"(епп-епо) гт(таис().1т.ехр(ат92)) СЬеп с)хоп=с)хспн.(хп-х(с))/пратт х(о) =хп епс)ге епс)1Г тетитп епс) са)си)а(е Лг; епегду с))((егепсе чг)(Ь )а(()се в()иа()оп (10.3.9) епегду о)д сопддига)юп епегду сваг сопддига)юп пеаг вЬ)(Г сеп(ег о! тавв ассвр(есд гер)асе х (с) Ьу хп Соттепги оп й|в а!Вог()Ьт: 7.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
