Диссертация (1174209), страница 18
Текст из файла (страница 18)
Ассоциация полиморфных вариантов в исследуемых генах с ППРС анализировалась с применением трех моделей:доминантной (сравнение NN vs (Nn+nn)), рецессивной (nn vs (Nn+NN)) и сверхдоминантной (Nn vs (NN+nn)), где NN – частота носительства мажорного генотипа, nn –минорного генотипа, а Nn – гетерозиготного генотипа. В каждом случае для вычисления значения p использовался двухсторонний критерий Фишера. Значимые ассоциациивыделены жирным шрифтом.119Таблица 3.11.2 - Сочетания аллелей/генотипов исследуемых генов,частоты носительства которых значимо различаются в группах больныхППРС и здоровых контролей.Сочетаниеаллелей/генотиповCLEC16A*G/G +PSMB9*GIL4*C/C + PSMB9*GНосители(%)/не носители(%)ЗдоровыеиндивидыБольные ППРС(контрольная(n=111)группа)(n=234)27(24.5)/24(10.8)/83(75.5)198(89.2)84(75.7)/130(58.8)/27(24.3)91(41.2)ОШ – отношение шансов, ДИ – доверительный интервал.рОШ[95% ДИ]0.00122.68 [1.46-4.92]0.00162.18 [1.31-3.63]120Таблица 3.11.3 - Сравнительный анализ между группами ППРС, АВРС и РРС вовлеченности полиморфныхвариантов генов иммунного ответа в патогенезгенHLA-DRB1rs3135388IL4 rs2243250IL6 rs1800795PSMB9rs17587CLEC16Ars6498169CLEC16ASOCS1rs1640923IL17Ars2275913генотип15(+)/15(-)15(-)/15(-)15(+)/15(+)C/ТС/СТ/ТС/СС/GG/GA/GG/GA/AA/GA/AG/AA/AA/GG/GG/GA/GA/AППРС(111 пац)41,44% (46 пац)51,35% (57 пац)7,21% (8 пац)20,72% (23 пац)76,58% (85 пац)2,7% (3 пац)18,02% (20 пац)45,05% (50 пац)36,94% (41 пац)45,95% (51 пац)52,25% (58 пац)1,8% (2 пац)45,95% (51 пац)30,63% (34 пац)23,42% (26 пац)70,27% (78 пац)28,83% (32 пац)0,9% (1 пац)35,14% (39 пац)52,25% (58 пац)12,61% (14 пац)РРС(группаконтроля)(135пац)35,56% (48 пац)60,74% (82 пац)3,7% (5 пац)33,33% (45 пац)62,96% (85 пац)3,7% (5 пац)24,44% (33 пац)48,15% (65 пац)27,41% (37 пац)37,04% (50 пац)56,3% (76 пац)6,67%(9 пац)51,11% (69 пац)31,85% (43 пац)17,04% (23 пац)75,56% (102 пац)24,44% (33 пац)0%40% (54 пац)42,96% (58 пац)17,04% (23 пац)РРСvsППРСрРРСvsАВРСрППРСvsАВРСрАВРС(100 пац)Pearson Chi-PearsonPearson Chi-squareChi-squaresquare29% (29 пац.)66% (66 пац)5% (5 пац)37% (37 пац)55% (55 пац)8% (8 пац)23% (23 пац)52% (52 пац)25% (25 пац)32% (32 пац)58% (58 пац)10% (10 пац)57% (57 пац)30% (30 пац)13% (13 пац)78% (78 пац)22% (22 пац)0%36% (36 пац)51% (51 пац)13% (13 пац)0,400,610,762,780,960,000,970,091,320,830,122,100,220,021,040,130,350,010,280,750,690,52810,43430,38320,09550,32720,94790,32560,76970,25110,36210,73040,14690,63540,88180,30890,71360,55440,92530,59820,38530,40550,570,150,020,160,391,120,040,110,100,310,020,370,240,050,530,030,120,44940,69460,88880,68600,53430,29070,84010,73580,75170,57680,89150,54050,62380,82570,46540,87360,72990,170,540,530,67630,46140,4654*Chi-square, при значениях менее 10 применялась Yates correlated chi—square; ** Критическое значение χ2 при уровне значимости p<0,05 составляет 3, 8411,701,220,123,812,241,770,530,351,841,880,204,520,830,012,630,240,770,000,010,010,010,19210,26940,73380,0500,13420,18370,46610,55180,17520,17020,65180,03360,36270,94200,10510,62140,38150,95470,92800,91830,94111213.12.
Сравнение кластеризации факторов между группами ППРС, АВРСи РРСС целью выявления возможных различий по степени воздействия тогоили иного фактора на формирование типа течения РС (ППРС, АВРС и РРС(группа контроля)) проведен кластерный анализ внутри каждой группы.Кластерами являются однородные группы, которые имеют сходства поизучаемому признаку (в данном случае по типу течения РС). Вначале былапроведена кластеризация генетических маркеров, согласно которой приППРСотмеченовыделениевотдельныйкластерIL4rs2243250,PSMB9rs17587, IL6rs1800795, CLEC16A-SOCS1rs1640923 и IL17A rs2275913,в котором наиболее тесное взаимодействие отмечается между IL4rs2243250 иPSMB9rs17587 (рисунок 3.13.1).
В группе больных АВРС соотношениеданных генетическим маркеров выглядит другим образом: выделениеотдельным кластером IL4 rs2243250, IL6 rs1800795, CLEC16A rs6498169,CLEC16A-SOCS1 rs1640923 и IL17A rs2275913, в котором наиболее тесноевзаимодействие отмечено между IL4 rs2243250 и IL17A rs2275913 и междуCLEC16A rs6498169 и CLEC16A-SOCS1 rs1640923 (рисунок 3.13.2). В группеРРС (группа контроля) был выделен кластер из IL4 rs2243250, PSMB9rs17587 и CLEC16A-SOCS1 rs1640923 (рисунок 3.13.3).Далее, был проведен более расширенный кластерный анализ свключением всех факторов, изучаемых в данной работе. В группе ППРСотмечено выделение в отдельный кластер совместно с IL4rs2243250 иPSMB9rs17587 такие факторы как «место жительства до 15 лет», «курение до15 лет», «наличие острой стрессовой ситуации до 15 лет», «приготовлениепищи до 15 лет», «приготовление пищи после 15 лет и до заболевания»,«место жительства в возрасте после 15 лет до заболевания», «употреблениекопчений до 15 лет» и «употребление копчений с 15 лет до заболевания»(рисунок 3.13.4).
Следующими по влиянию выделены IL6 rs1800795,122CLEC16A-SOCS1 rs1640923, «употребление кофе, какао и шоколада с 15 летдо заболевания», IL17A rs2275913, «наличие острой стрессовой ситуации с15 лет до заболевания» и «курение с 15 лет до заболевания». CLEC16Ars6498169 выделен отдельным фактором.В группе АВРС кластеризация распределение факторов по кластерамотмечалось иное. Отдельным кластером выделена группа IL4 rs2243250,IL17A rs227591, «употребление молока и молочных продуктов до 15 лет» и«употребление молока и молочных продуктов с 15 лет до заболевания»(рисунок 3.13.5). Следующий по влиянию выделен кластер, включающийCLEC16Ars6498169,CLEC16A-SOCS1rs1640923,«наличиеостройстрессовой ситуации до 15 лет», «приготовление пищи до 15 лет»,«приготовление пищи с 15 лет до заболевания», «место жительства до 15лет», «курение до 15 лет», «место жительства с 15 лет до заболевания»,«употребление копчений до 15 лет» и «употребление копчений с 15 лет дозаболеваний».
Обращает на себя внимание, что в данном кластере CLEC16ASOCS1 rs1640923 наиболее тесно скомбинирован с фактором «наличиеострой стрессовой ситуации до 15 лет». IL6 rs1800795 и PSMB9 rs17587группируются с выше перечисленными факторами уже на следующейступени кластерного анализа.Среди факторов риска развития РРС (группа контроля) также былпроведен кластерный анализ, который показал, что в отдельную группувыделяются IL4 rs2243250, «длительный контакт с вредными веществами иматериалами с 15 лет» и PSMB9 rs17587 (рисунок 3.13.6). В данном кластереобращает на себя внимание, что IL4 rs2243250 больше сопряжен именно с«длительный контакт с вредными веществами и материалами с 15 лет», а не сPSMB9 rs17587 как при ППРС или с IL17A rs227591 как при АВРС.
Вотдельный кластер сгруппированы CLEC16A-SOCS1 rs1640923, «местожительства после 15 лет», «курение до 15 лет», «приготовление пищи до 15лет», «приготовление пищи с 15 лет до заболевания», «место жительства до15 лет» и «употребление копченостей до 15 лет».
Следующим этапом123отмечается воздействие отдельно IL17A rs227591, IL6 rs1800795 и CLEC16Ars6498169.124Рисунок 3.12.1 - Дендрограмма соотношения генетических маркеровППРСРисунок 3.12.2 - Дендрограмма соотношения генетических маркеровАВРС125Рисунок 3.12.3 - Дендрограмма соотношения генетических маркеров РРСРисунок3.12.4-формирования ППРСДендрограммасоотношенийфакторовриска126Рисунок3.12.5-ДендрограммасоотношенияфактороврискаДендрограммасоотношенияфактороврискаформирования АВРСРисунок3.12.6-формирования РРС1273.13.Анализассоциациикомбинацийаллелей,изучаемыхполиморфизмов, и внешних факторов риска развития ППРС, РРС иАВРСИспользуя алгоритм APSampler с целью определения значимыхассоциаций с риском развития ППРС, АВРС или РРС комбинаций аллелей,изученных полиморфизмов, и внешних факторов, был выявлен рядособенностей (рисунки 3.13.1, 3.13.2, 3.13.3):1.
IL6 rs1800795*С/С для РРС (группа контроля) в комбинации с частымупотреблением «кофе, какао и шоколада до 15 лет» (ОШ=4,91892 [2,18700 –11,06342], р=0,00685);2. IL6 rs1800795*G/G для АВРС значимые сочетания с CLEC16Ars6498169*А/А (ОШ=11,90582 [3,85059 – 36,81210], р=0,00646); для РРС(группа контроля) значимые комбинации с частым употреблением «молока имолочных продуктов до 15 лет» и частым «употреблением яиц до 15 лет»(ОШ=3,21398 [1,77352 – 5,82441], р=0,00844);3. IL4 rs2243250*Т/Т для ППРС значимые комбинации с преобладанием врационе питания «животного белка до 15 лет» (ОШ=3,88235 [1,86764 –8,07044], р=0,00331); для АВРС значимая комбинация с наличием «остройстрессовой ситуации после 15 лет» (ОШ=9,0 [2,58505 – 31,33399],р=0,00125).4.
IL4rs2243250*С/СдляППРСзначимоесочетаниесналичием«промышленных предприятий в районе проживания (до 5 км) до и после 15лет» (нефтеперерабатывающие и металлургические) (ОШ=3,65659 [1,83978 7,26754], р=0,00053), в сочетании с IL17A rs227591*A/G (ОШ=3,10972[1,44780 – 6,67934], р=0,0057); для РРС (группа контроля) в сочетании счастым «употреблением молочных продуктов до 15 лет» (ОШ=3,10972[1,44780 – 6,67934], р=0,0057);1285.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
