Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1150004), страница 14

Файл №1150004 Диссертация (Синтез и изучение фрагментов РНК-полимеразы вируса гриппа А) 14 страницаДиссертация (1150004) страница 142019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 14)

Синтез защищенного фрагмента 14-20№реагенты12-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocAsp(O-t-Bu)OHFmocTyr(t-Bu)OHDICHOBt*H2O2М,г/мольν, ммоль0.391.550.20.40.480.48129.2411.5459.6126.2153.188m, мг/ V,мкл250200/2568218461/7574t, ч2234567FmocThr(t-Bu)OHFmocGln(Trt)OHFmocArg(Pbf)OHFmocGlyOHFmocGln(Trt)OHПоследеблокирования397.4610.7648.8297.4610.70.40.40.40.40.4Fmoc-группызащищенный15924426011924423323фрагмент14-20использовали для дальнейших реакций, не отщепляя от полимерного носителя.Синтез защищенного фрагмента 6-20 конденсацией фрагментов 6-13 и 14-20H-Gln(Trt)-Thr(t-Bu)-Arg(Pbf)-Met-Asp(O-tBu)-Lys(Boc)-Leu-Thr(t-Bu)-Gln(Trt)Gly-Arg(Pbf)-Gln(Trt)-Thr(t-Bu)-Tyr(t-Bu)-Asp(O-tBu)-OHК смоле, содержащей 0.2 ммоль фрагмента 14-20 был добавленпредварительно охлажденный раствор 1.13 г (0.58 ммоль) защищенногофрагмента 6-13, 0.16 г (1.17 ммоль) HOAt и 0.18 мл (1.17 ммоль) DIC в 10 млDMF.

Реакционную смесь перемешивали в течение 7 суток. Контроль за ходомреакции осуществляли каждые 2 суток с помощью теста Кайзера на свободныеаминогруппы. После завершения реакции смола была отфильтрована и промыта7х10 мл DMF, деблокирование Fmoc-группы осуществляли описанным ранееспособом. Полученный фрагмент 6-20, не выделяя, использовали длядальнейших реакций.Получение целевого соединения - конденсация фрагментов 6-20 и 1-5К смоле, содержащей 0.20 ммоль фрагмента 6-20 был добавленпредварительно охлажденный раствор 685 мг (0.6 ммоль) защищенногофрагмента 1-5, 245 мг (1.8 ммоль) HOAt и 280 мкл (1.8 ммоль) DIC в 10 млDMF.

Реакционную смесь перемешивали в течение 14 суток. После завершенияреакции смола была отфильтрована и промыта 7х10 мл DMF. Контроль заходом реакции, деблокирование Fmoc-группы, а также стадию финальногодеблокирования осуществляли описанным ранее способом. Получено: 375 мг(77 %). После очистки пептида с помощью препаративной ВЭЖХ ипоследующей лиофилизации получено 155 мг (общий выход 32 %), чистота89продукта по данным аналитической ВЭЖХ составила 94.5 %. HRMS (ESI+), m/z:2427.1849 ([М+Н]+), рассчитано 2427.1755.Синтез фрагмента 271-290 белка РВ1H-Leu1-Pro2-Val3-Gly4-Gly5-Asn6-Glu7-Lys8-Lys9-Ala10-Lys11-Leu12-Ala13-Asn14Val15-Val16-Arg17-Lys18-Met19-Met20-OHДанный пептид был синтезирован последовательным наращиваниемпептидной цепи по описанной ранее общей методике (таблица 25).Таблица 25.

Синтез фрагмента 271-290 белка РВ1№реагенты12-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocMetOHFmocMetOHDICHOBt*H2OFmocLys(Boc)OHFmocArg(Pbf)OHFmocValOHFmocValOHFmocAsn(Trt)OHFmocAlaOH*H2OFmocLeuOHFmocLys(Boc)OHDICHOBt*H2OFmocAlaOH*H2OFmocLys(Boc)OHFmocLys(Boc)OHFmocGlu(O-tBu)OHFmocAsn(Trt)OHFmocGlyOHFmocGlyOHFmocValOHFmocProOHFmocLeuOH234567891011121314151617181920НачинаясостаткаМ,г/мольν,ммоль0.7753.10.350.70.840.840.70.70.70.70.70.70.71.051.261.261.051.051.051.051.051.051.051.051.051.05129.2371.5371.5126.2153.1468.5648.8339.4339.4596.7313.3353.4468.5126.2153.1313.3468.5468.5443.5596.7297.4297.4339.4337.4353.4аспарагина-14доm, мг/ V,мкл500401/512130260106/131129328454238238418220247492159/196193329492492466627312312356354371остаткаt, ч21.51.5331524152648121748244862244867;360лейцина-1длядеблокирования Fmoc-группы использовали 3 промывки 20% растворомдиэтиламина в DMF (5, 20 и 10 мин). В случае остатков аспарагина вположениях 6 и 14 наряду с диэтиламином использовали DBU, как было90описано ранее.

Финальное деблокирование и последующее восстановлениепроводили описанным ранее способом. Получено: 344 мг (45 %).очисткицелевогосоединенияспомощьюпрепаративнойПослеВЭЖХипоследующей лиофилизации получено 105 мг (общий выход 14 %), чистотапродукта по данным аналитической ВЭЖХ составила 97.2 %.

HRMS (ESI+), m/z:2183.2597 ([М+Н]+), 2183.2515 рассчитано.Синтез защищенного фрагмента 381-390 белка РВ1Fmoc-Phe-Asn(Trt)-Glu(O-tBu)-Ser(t-Bu)-Thr(t-Bu)-Arg(Pbf)-Lys(Boc)-Lys(Boc)Ile-Glu(O-tBu)-ОНЦелевое соединение было получено по описанной ранее общей методике,количество реагентов, использованных на каждой стадии, приведено в таблице 26.Таблица 26.

Синтез защищенного фрагмента 381-390 белка РВ1№реагенты12-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocGlu(O-tBu)OHFmocIleOHDICHOBt*H2OFmocLys(Boc)OHFmocLys(Boc)OHFmocArg(Pbf)OHFmocThr(t-Bu)OHFmocSer(t-Bu)OHFmocGlu(O-tBu)OHFmocAsn(Trt)OHFmocPheOH2345678910М,г/мольν, ммоль1.244.960.81.61.921.921.61.61.61.61.61.61.61.6129.2425.5353.4126.2153.1468.5468.5648.8397.4383.4425.5596.7387.4m, мг/ V,мкл800641/820340565242/3002947507501038636613681955620t, ч2222223543После присоединения остатка фенилаланина в положении 1 смола былапромыта дихлорметаном (4х10мл), высушена в вакууме и разделена на 2 равныечасти.

Часть смолы, содержащую 0.4 ммоль пептида, использовали дляотщепления пептида от полимерного носителя с сохранением защитных группсогласно описанной ранее методике. Получено: 690 мг (72 %).Синтез фрагмента 381-390 белка РВ1H-Phe1-Asn2-Glu3-Ser4-Thr5-Arg6-Lys7-Lys8-Ile9-Glu10- OH91Деблокированиезащитныхгруппфрагмента381-390белкаРВ1проводили описанным ранее способом. Данные по синтезу приведены втаблице 26; для обработки использовали смолу, содержащую 0.4 ммользащищенного пептида.

Получено: 415 мг (83 %).После очистки целевогосоединения с помощью препаративной ВЭЖХ и последующей лиофилизацииполучено 185 мг (общий выход 37 %), чистота продукта по данныманалитической ВЭЖХ составила 95.2 %. HRMS (ESI+), m/z: 1251.6646 ([М+Н]+),1251.6692 рассчитано.Синтез фрагмента 391-400 белка РВ1H-Lys1-Ile2-Arg3-Pro4-Leu5-Leu6-Val7-Glu8-Gly9-Thr10-OHЦелевое соединение было получено по описанной ранее общей методике,количество реагентов, использованных на каждой стадии, приведено в таблице 27.Таблица 27. Синтез фрагмента 391-400 белка РВ1№реагенты12-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocThr(t-Bu)OHFmocGlyOHDICHOBt*H2OFmocGlu(O-tBu)OHFmocValOHFmocLeuOHFmocLeuOHFmocProOHFmocArg(Pbf)OHFmocIleOHFmocLys(Boc)OH2345678910М,г/мольν, ммоль0.622.480.40.80.960.960.80.80.80.80.80.80.80.8129.2397.4297.4126.2153.1425.5339.4353.4353.4337.4648.8353.4468.5m, мг/V,мкл400321/410159238121/150147340272283283270519283375t, ч222331635185Получено: 353 мг (78 %).

После очистки целевого соединения с помощьюпрепаративной ВЭЖХ и последующей лиофилизации получено 150 мг (общийвыход 33 %), чистота продукта по данным аналитической ВЭЖХ составила 96.5%. HRMS (ESI+), m/z: 1125.6948 ([М+Н]+), 1125.6990 рассчитано.92Синтез фрагмента 381-400 белка РВ1 конвергентным способомH-Phe1-Asn2-Glu3-Ser4-Thr5-Arg6-Lys7-Lys8-Ile9-Glu10-Lys11-Ile12-Arg13-Pro14-Leu15Leu16-Val17-Glu18-Gly19-Thr20-OHРазбивка целевого соединения на фрагменты была проведена по остаткамаргинина и пролина в положениях 6 и 14, были синтезированы и выделенызащищенные фрагменты 1-6 и 7-14 (Таблицы 28 и 29 соответственно).Защищенный фрагмент 15-20 (таблица 30) не подвергали деблокированию сполимерного носителя.Синтез защищенного фрагмента 1-6Fmoc-Phe-Asn(Trt)-Glu(O-tBu)-Ser(t-Bu)-Thr(t-Bu)-Arg(Pbf)-ОНТаблица 28.

Синтез защищенного фрагмента 1-6№123456реагенты2-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocArg(Pbf)OHFmocThr(t-Bu)OHDICHOBt*H2OFmocSer(t-Bu)OHFmocGlu(O-tBu)OHFmocAsn(Trt)OHFmocPheOHМ, г/мольν, ммоль2.128.51.653.33.963.963.33.33.33.3129.2648.8397.4126.2153.1383.4425.5596.7387.4m, г/ V, мл1.371.1/1.41.071.310.5/0.620.611.261.41.971.28t, ч222332После присоединения остатка фенилаланина в положении 1 смола былапромыта дихлорметаном (4х10мл), высушена в вакууме и разделена на 2 части,соответствующие 1.25 и 0.4 ммоль пептида. Часть смолы, содержащую 1.25ммоль пептида, использовали для отщепления пептида от полимерногоносителя с сохранением защитных групп согласно описанной ранее методике.Получено: 1.46 г ( 72 %).Синтез защищенного фрагмента 7-14Fmoc-Lys(Boc)-Lys(Boc)-Ile-Glu(O-tBu)-Lys(Boc)-Ile-Arg(Pbf)-Pro-ОНТаблица 29.

Синтез защищенного фрагмента 7-14№1реагенты2-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocProOHМ, г/моль129.2337.493ν, ммоль1.325.271m, г/ V, мл0.850.68/0.870.34t, ч22FmocArg(Pbf)OHDICHOBt*H2OFmocIleOHFmocLys(Boc)OHFmocGlu(O-tBu)OHFmocIleOHFmocLys(Boc)OHFmocLys(Boc)OH345678648.8126.2153.1353.4468.5425.5353.4468.5468.522.42.42222221.30.3/0.370.370.710.940.850.710.940.9422333153Получено 1.17г (64 %).Синтез защищенного фрагмента 15-20H-Leu-Leu-Val-Glu(O-tBu)-Gly-Thr(t-Bu)-OHТаблица 30. Синтез защищенного фрагмента 15-20№реагенты12-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocThr(t-Bu)OHFmocGlyOHDICHOBt*H2OFmocGlu(O-tBu)OHFmocValOHFmocLeuOHFmocLeuOH23456М, г/мольν, ммоль129.2397.4297.4126.2153.1425.5339.4353.4353.40.562.230.250.50.60.60.50.50.50.5m, мг/ V,мкл360288/37010014976/9492213170177177t, ч223335Защищенный фрагмент 15-20 использовали для дальнейших реакций, неотщепляя от полимерного носителя.Синтез защищенного фрагмента 7-20 конденсацией фрагментов 7-14 и 15-20H-Lys(Boc)-Lys(Boc)-Ile-Glu(O-tBu)-Lys(Boc)-Ile-Arg(Pbf)-Pro-Leu-Leu-ValGlu(O-tBu)-Gly-Thr(t-Bu)-OHК смоле, содержащей 0.25 ммоль фрагмента 15-20 был добавленпредварительно охлажденный раствор 1.11 г (0.61 ммоль) защищенногофрагмента 7-14, 0.166 г (1.22 ммоль) HOAt и 0.19 мл (1.22 ммоль) DIC в 12 млDMF.

Реакционную смесь перемешивали в течение 7 суток. Контроль за ходомреакции осуществляли с помощью теста Кайзера на свободные аминогруппы.После завершения реакции смола была отфильтрована и промыта 7х10 мл DMF,94деблокирование Fmoc-группы осуществляли описанным ранее способом.Полученный фрагмент 7-20, не выделяя, использовали для дальнейшихреакций.Получение целевого соединения - конденсация фрагментов 1-6 и 7-20К смоле, содержащей 0.25 ммоль фрагмента 7-20 был добавленпредварительно охлажденный раствор 1.41 г (0.875 ммоль) защищенногофрагмента 1-6, 0.24 г (1.76 ммоль) HOAt и 0.27 мл (1.76 ммоль) DIC в 12 млDMF.

Реакционную смесь перемешивали в течение 3 суток. Контроль за ходомреакции осуществляли с помощью теста Кайзера на свободные аминогруппы.После завершения реакции смола была отфильтрована и промыта 7х10 мл DMF,финальное деблокирование 5осуществляли описанным ранее способом.Получено: 460 мг (78 %). После очистки целевого соединения с помощьюпрепаративной ВЭЖХ и последующей лиофилизации получено 115 мг (общийвыход 19 %), чистота продукта по данным аналитической ВЭЖХ составила 96.3%. HRMS (ESI+), m/z: 2358.3594 ([М+Н]+), 2358.3503 рассчитано.Синтез фрагмента 381-386 белка РВ1H-Phe1-Asn2-Glu3-Ser4-Thr5-Arg6 -OHФинальное деблокирование пептидил-полимера, содержащего 0.4 ммользащищенного фрагмента 381-386 белка РВ1 (таблица 28) проводили описаннымранее способом. Получено: 265 мг (88 %).

Характеристики

Тип файла
PDF-файл
Размер
2,32 Mb
Предмет
Высшее учебное заведение

Список файлов диссертации

Синтез и изучение фрагментов РНК-полимеразы вируса гриппа А
Свежие статьи
Популярно сейчас
Как Вы думаете, сколько людей до Вас делали точно такое же задание? 99% студентов выполняют точно такие же задания, как и их предшественники год назад. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6447
Авторов
на СтудИзбе
305
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее