Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1150004), страница 12

Файл №1150004 Диссертация (Синтез и изучение фрагментов РНК-полимеразы вируса гриппа А) 12 страницаДиссертация (1150004) страница 122019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 12)

Защищенный фрагмент 14-25 (таблица 11) не подвергалидеблокированию с полимерного носителя.Синтез защищенного фрагмента 1-5Fmoc-Met-Asp(O-tBu)-Val-Asn(Trt)-Pro-ОНТаблица 9. Синтез защищенного фрагмента 1-5№реагенты12-Cl-Trt-смолаDIPEAМ,г/моль129.273ν, ммольm, г/ V, млt, ч1.556.210.8/1.0222345FmocProOHFmocAsn(Trt)OHDICHOBt*H2OFmocValOHFmocAsp(O-tBu)OHFmocMetOH337.4596.7126.2153.1339.4411.5371.5122.42.42220.341.190.3/0.370.370.680.820.742322Получено 746 мг (68%).Синтез защищенного фрагмента 6-13Fmoc-Thr(t-Bu)-Leu-Leu-Phe-Leu-Lys(Boc)-Val-Pro-ОНТаблица 10. Синтез защищенного фрагмента 6-13№12345678реагенты2-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocProOHFmocValOHDICHOBt*H2OFmocLys(Boc)OHFmocLeuOHFmocPheOHFmocLeuOHFmocLeuOHFmocThr(t-Bu)OHМ, г/мольν, ммоль2.5910.35244.84.8444444129.2337.4339.4126.2153.1468.5353.4387.4353.4353.4397.4m, г/ V, мл1.671.34/1.70.681.360.61/0.750.741.871.411.71.411.411.59t, ч2321.52151724Получено 1.47 г (59%).Синтез защищенного фрагмента 14-25 H-Ala-Gln(Trt)-Asn(Trt)-Ala-Ile-Ser(tBu)-Thr(t-Bu)-Thr(t-Bu)-Phe-Pro-Tyr(t-Bu)-Thr(t-Bu)-OHТаблица 11.

Синтез защищенного фрагмента 14-25№реагенты12-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocThr(t-Bu)OHFmocTyr(t-Bu)OHDICHOBt*H2OFmocProOHFmocPheOHFmocThr(t-Bu)OH2345М,г/моль129.2397.4459.6126.2153.1337.4387.4397.474ν, ммольm, г/ V, млt, ч1.556.21.12.22.642.642.22.22.210.8/1.020.4371.010.33/0.40.40.740.850.87222226789101112FmocThr(t-Bu)OHFmocSer(t-Bu)OHFmocIleOHFmocAlaOH*H2OFmocAsn(Trt)OHFmocGln(Trt)OHFmocAlaOH*H2O397.4383.4353.4313.3596.7610.7313.32.22.22.22.22.22.22.20.870.840.780.691.311.340.69225751614После деблокирования Fmoc-группы смола была промыта дихлорметаном(4х10мл), высушена в вакууме и разделена на 2 части, соответствующие 0.5 и0.6 ммоль пептида.

Часть пептидил-полимера, соответствующую 0.5 ммольпептида, использовали для синтеза защищенного фрагмента 6-25.Синтез защищенного фрагмента 6-25 конденсацией фрагментов 6-13 и 14-25H-Thr(t-Bu)-Leu-Leu-Phe-Leu-Lys(Boc)-Val-Pro-Ala-Gln(Trt)-Asn(Trt)-Ala-IleSer(t-Bu)-Thr(t-Bu)-Thr(t-Bu)-Phe-Pro-Tyr(t-Bu)-Thr(t-Bu)-OHК смоле, содержащей 0.5 ммоль фрагмента 14-25 был добавленпредварительно охлажденный раствор 1.25 г (1 ммоль) защищенного фрагмента6-13, 0.31 г (2 ммоль) HOBt и 0.31 мл (2 ммоль) DIC в 30 мл NMP.

Реакционнуюсмесь перемешивали в течение 13 суток. Контроль за ходом реакцииосуществляли каждые 3 суток с помощью теста Кайзера на свободныеаминогруппы, каждый раз добавляя в реакционную смесь 0.22 мл (1.4 ммоль)DIC. После завершения реакции смола была отфильтрована и промыта 3х10 млNMP и 5х10 мл DMF, деблокирование Fmoc-группы осуществляли описаннымранее способом. Полученный фрагмент 6-25, не выделяя, использовали длядальнейших реакций.Получение целевого соединения - конденсация фрагментов 6-25 и 1-5К смоле, содержащей 0.25 ммоль фрагмента 6-25 был добавленпредварительно охлажденный раствор 746 мг (0.666 ммоль) защищенногофрагмента 1-5, 205 мг (1.33 ммоль) HOBt и 208 мкл (1.33 ммоль) DIC в 3.5 млDMF.

Реакционную смесь перемешивали в течение 21 часа. После завершенияреакции смола была отфильтрована и промыта 7х10 мл DMF. Контроль за75ходом реакции, деблокирование Fmoc-группы, а также стадию финальногодеблокирования осуществляли описанным ранее способом.Получено:518мг(75%).Послеочисткипептидаспомощьюпрепаративной ВЭЖХ и последующей лиофилизации получено 188 мг (общийвыход 27 %), чистота продукта по данным аналитической ВЭЖХ составила 97.9%.

HRMS (ESI+), m/z: 2781.4643 ([М+Н]+), рассчитано 2781.4532.Синтез фрагмента 14-25 белка РВ1H-Ala1-Gln2-Asn3-Ala4-Ile5-Ser6-Thr7-Thr8-Phe9-Pro10-Tyr11-Thr12-OHФинальное деблокирование пептидил-полимера, содержащего 0.6 ммользащищенногофрагмента14-25белкаРВ1сосвободнойN-концевойаминогруппой (данные по синтезу приведены в таблице 11) проводилиописанным ранее способом.

Получено: 478 мг (61 %). После очистки целевогосоединения с помощью препаративной ВЭЖХ и последующей лиофилизацииполучено 231 мг (общий выход 29 %), чистота продукта по данныманалитической ВЭЖХ составила 98.1 %. HRMS (ESI+), m/z: 1313.6428 ([М+Н]+),1313.6372 рассчитано.Синтез фрагмента 6-25 белка РВ1H-Thr1-Leu2-Leu3-Phe4-Leu5-Lys6-Val7-Pro8-Ala9-Gln10-Asn11-Ala12-Ile13-Ser14Thr15-Thr16-Phe17-Pro18-Tyr19-Thr20-OHФинальное деблокирование пептидил-полимера, содержащего 0.25 ммользащищенногофрагмента6-25белкаРВ1сосвободнойN-концевойаминогруппой (синтез описан на стр.

75) проводили описанным ранееспособом. Получено: 435 мг (78 %). После очистки целевого соединения спомощью препаративной ВЭЖХ и последующей лиофилизации получено 155мг (общий выход 28 %), чистота продукта по данным аналитической ВЭЖХсоставила 97.5 %. HRMS (ESI+), m/z: 2225.2127 ([М+Н]+), 2225.2216 рассчитано.Синтез фрагмента 1-5 белка РВ1H-Met1-Asp2-Val3-Asn4-Pro5-ОНЦелевое соединение было получено по описанной ранее общей методике,количество реагентов, использованных на каждой стадии, приведено в таблице12.76Таблица 12. Синтез фрагмента 1-5 белка РВ1№реагенты12-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocProOHFmocAsn(Trt)OHDICHOBt*H2OFmocValOHFmocAsp(O-tBu)OHFmocMetOH2345М,г/мольν, ммоль0.7753.10.61.21.441.441.21.21.2129.2337.4596.7126.2153.1339.4411.5371.5m, мг/ V,мкл500401/512202716182/225220407494446t, ч32322Получено: 260 мг (76%).

После очистки целевого соединения с помощьюпрепаративной ВЭЖХ и последующей лиофилизации получено 221 мг (общийвыход 64 %), чистота продукта по данным аналитической ВЭЖХ составила95.1 %. HRMS (ESI+), m/z: 575.2512 ([М+Н]+), 575.2494 рассчитано.Синтез фрагмента 6-13 белка РВ1H-Thr1-Leu2-Leu3-Phe4-Leu5-Lys6-Val7-Pro8-OHЦелевое соединение было получено по описанной ранее общей методике,количество реагентов, использованных на каждой стадии, приведено в таблице 13.Таблица 13. Синтез фрагмента 6-13 белка РВ1№реагенты12-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocProOHFmocValOHDICHOBt*H2OFmocLys(Boc)OHFmocLeuOHFmocPheOHFmocLeuOHFmocLeuOHFmocThr(t-Bu)OH2345678М, г/мольν, ммоль129.2337.4339.4126.2153.1468.5353.4387.4353.4353.4397.40.7753.10.350.70.840.840.70.70.70.70.70.7m, мг/ V,мкл500401/512118238106/131129328247271247247278t, ч2321.52151724Получено: 254 мг (78 %). После очистки целевого соединения с помощьюпрепаративной ВЭЖХ и последующей лиофилизации получено 103 мг (общий77выход 32 %), чистота продукта по данным аналитической ВЭЖХ составила98.6 %.

HRMS (ESI+), m/z: 930.6038 ([М+Н]+), 930.6023 рассчитано.Синтез N-ацетилированного фрагмента 6-13 белка РВ1Ac-Thr1-Leu2-Leu3-Phe4-Leu5-Lys6-Val7-Pro8-OHЦелевое соединение было получено по описанной ранее общей методике,количество реагентов, использованных на каждой стадии, приведено в таблице 14.Таблица 14. Синтез N-ацетилированного фрагмента 6-13 белка РВ1№реагенты12-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocProOHFmocValOHDICHOBt*H2OFmocLys(Boc)OHFmocLeuOHFmocPheOHFmocLeuOHFmocLeuOHFmocThr(t-Bu)OHDIPEAAc2O23456789М, г/мольν, ммоль129.2337.4339.4126.2153.1468.5353.4387.4353.4353.4397.4129.2102.10.7753.10.450.91.081.080.90.90.90.90.90.91.81.8m, мг/ V,мкл500401/512152305136/170165422318349318318358233/300184/170t, ч232.5142.5317241.5Получено: 319 мг (73 %).

После очистки целевого соединения с помощьюпрепаративной ВЭЖХ и последующей лиофилизации получено 65 мг (общийвыход 15 %), чистота продукта по данным аналитической ВЭЖХ составила94.8 %. HRMS (ESI+), m/z: 972.6128 ([М+Н]+), 972.6098 рассчитано.Синтез амида фрагмента 6-13 белка РВ1H-Thr1-Leu2-Leu3-Phe4-Leu5-Lys6-Val7-Pro8-NH2Целевое соединение было получено по описанной ранее общей методике,количество реагентов, использованных на каждой стадии, приведено в таблице 15.Таблица 15.

Синтез защищенного фрагмента 6-13 белка РВ1№реагенты12-Cl-Trt-смолаDIPEAМ, г/мольν, ммоль129.20.7753.178m, мг/ V,мкл500401/512t, ч22345678FmocProOHFmocValOHDICHOBt*H2OFmocLys(Boc)OHFmocLeuOHFmocPheOHFmocLeuOHFmocLeuOHBocThrOH337.4339.4126.2153.1468.5353.4387.4353.4353.4219.20.450.91.081.080.90.90.90.90.90.9152305136/1701654223183493183181972.52231553Пептид, содержащий защитные группы, был отщеплен от полимерногоносителя по методике, описанной ранее.

Получено 260 мг (51 %). Реакциюамидирования проводили по следующей схеме:Boc-Thr1-Leu2-Leu3-Phe4-Leu5-Lys6(Boc)-Val7-Pro8-OH1) DIC/NH4OBt2) TFA/TIS/H2OH-Thr1-Leu2-Leu3-Phe4-Leu5-Lys6-Val7-Pro8-NH2К раствору 260 мг (0.23 ммоль) защищенного фрагмента 6-13 белка РВ1 в20 мл тетрагидрофурана и 5 мл воды при перемешивании было добавлено 105мг (0.69 ммоль) аммиачной соли 1-гидроксибензотриазола (NH4OBt) и 47 мкл(0.3 ммоль) DIC. Через 17 часов в реакционную смесь было добавлено 35 мг(0.23 ммоль) NH4OBt и 60 мкл (0.38 ммоль) DIC, перемешивание продолжали втечение 48 часов, контроль за ходом реакции осуществляли с помощьюаналитической ВЭЖХ.

Спустя указанное время реакционная смесь былаупарена досуха, финальное деблокирование проводили, как было описаноранее. После очистки целевого соединения с помощью препаративной ВЭЖХ ипоследующей лиофилизации получено 115 мг (общий выход 27 %), чистотапродукта по данным аналитической ВЭЖХ составила 93.5 %.

HRMS (ESI+),m/z: 929.6202 ([М+Н]+), 929.6183 рассчитано.Синтез N-ацетилированного амида фрагмента 6-13 белка РВ1Ac-Thr1-Leu2-Leu3-Phe4-Leu5-Lys6-Val7-Pro8-NH2Целевое соединение было получено по описанной ранее общей методике,количество реагентов, использованных на каждой стадии, приведено в таблице 16.79Таблица 16. Синтез N-ацетилированного амида фрагмента 6-13 белка РВ1№реагенты1Fmoc-Rinkамидная смолаDCM20% Et2NH/DMFFmocProOHDICHOBt*H2ODIPEAAc2OFmocValOHDICHOBt*H2OFmocLys(Boc)OHFmocLeuOHFmocPheOHFmocLeuOHFmocLeuOHFmocThr(t-Bu)OHDIPEAAc2O23456789101112М, г/мольν, ммольm, мг/ V,мкл7000.4510 мл2х10 мл; 5 и 20 мин2.257592.7341/4212.74141.8233/2971.8184/1700.93051.08136/1701.081650.94220.93180.93490.93180.93180.93581.8233/3001.8184/170337.4126.2153.1129.2102.1339.4126.2153.1468.5353.4387.4353.4353.4397.4129.2102.1t, ч13.51.532142.551632Получено: 400 мг (91 %).

После очистки целевого соединения с помощьюпрепаративной ВЭЖХ и последующей лиофилизации получено 148 мг (общийвыход 34 %), чистота продукта по данным аналитической ВЭЖХ составила97.2 %. HRMS (ESI+), m/z: 971.6256 ([М+Н]+), 971.6288 рассчитано.Синтез фрагмента 6-14 белка РВ1H-Thr1-Leu2-Leu3-Phe4-Leu5-Lys6-Val7-Pro8-Ala9-OHЦелевое соединение было получено по описанной ранее общей методике,количество реагентов, использованных на каждой стадии, приведено в таблице 17.Таблица 17. Синтез фрагмента 6-14 белка РВ1№1234реагенты2-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocAlaOH*H2OFmocProOHDICHOBt*H2OFmocValOHFmocLys(Boc)OHМ, г/мольν, ммоль1.866.21.22.42.882.882.42.4129.2313.3337.4126.2153.1339.4468.580m, г/ V, мл1.20.96/1.230.380.810.36/0.450.440.811.12t, ч233256789FmocLeuOHFmocPheOHFmocLeuOHFmocLeuOHDICHOBt*H2OFmocThr(t-Bu)OH353.4387.4353.4353.4126.2153.1397.42.42.42.43.64.324.323.60.850.930.851.270.55/0.670.661.43231435;3Для деблокирования Fmoc-группы с остатка треонина в положении 1наряду с диэтиламином использовали DBU, как было описано ранее.

Послеэтого смола была промыта дихлорметаном (4х10мл), высушена в вакууме иразделена на 2 равные части. Одну часть использовали для финальногодеблокирования, вторую - для получения ацетилированного производного,синтез которого описан ниже. Получено: 457 мг (76 %). После очистки целевогосоединения с помощью препаративной ВЭЖХ и последующей лиофилизацииполучено 154 мг (общий выход 26 %), чистота продукта по данныманалитической ВЭЖХ составила98.8 %. HRMS (ESI+), m/z: 1001.6354([М+Н]+), 1001.6394 рассчитано.Синтез N-ацетилированного фрагмента 6-14 белка РВ1Ac-Thr1-Leu2-Leu3-Phe4-Leu5-Lys6-Val7-Pro8-Ala9-OHСмолу, содержащую 0.6 ммоль защищенного фрагмента 6-14 белка РВ1со свободной N-концевой аминогруппой (данные по синтезу приведены втаблице 17) перемешивали в течение 1 часа в растворе 0.4 мл (2.4 ммоль)DIPEA и 0.23 мл (2.4 ммоль) ангидрида уксусной кислоты в 10 мл DMF, послечего смола была отфильтрована и промыта DMF (7х10мл).

Характеристики

Тип файла
PDF-файл
Размер
2,32 Mb
Предмет
Высшее учебное заведение

Список файлов диссертации

Синтез и изучение фрагментов РНК-полимеразы вируса гриппа А
Свежие статьи
Популярно сейчас
А знаете ли Вы, что из года в год задания практически не меняются? Математика, преподаваемая в учебных заведениях, никак не менялась минимум 30 лет. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6390
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее