Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1150004), страница 13

Файл №1150004 Диссертация (Синтез и изучение фрагментов РНК-полимеразы вируса гриппа А) 13 страницаДиссертация (1150004) страница 132019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 13)

Финальноедеблокирование проводили, как было описано ранее. Получено: 419 мг (67 %).После очистки целевого соединения с помощью препаративной ВЭЖХ ипоследующей лиофилизации получено 120 мг (общий выход 19 %), чистотапродукта по данным аналитической ВЭЖХ составила 93.6 %. HRMS (ESI+),m/z: 1043.6528 ([М+Н]+), 1043.6499 рассчитано.Синтез 6-(9-флуоренилметилоксикарбонил)аминогексановой кислоты(FmocAhxOH)2.62 г (0.02 моль) 6-аминогексановой кислоты растворили в 17 мл воды вприсутствии 0.76 г (0.019 моль) гидроксида натрия. К данному раствору при81перемешивании одной порцией была добавлена суспензия 6.48 г (0.0192 моль)FmocOSu в 17 мл тетрагидрофурана. Реакционную смесь перемешивали втечение 1 часа, поддерживая рН = 8 добавлением триэтиламина, после чегореакционную смесь сконцентрировали с помощью ротационного испарителя идобавили одной порцией в 100 мл 1.5N раствора соляной кислоты.

Выпавшийосадок был отфильтрован и промыт на фильтре водой (4х по 10 мл), после чеговысушен и перекристаллизован из 60 % этанола. Получено 4.71 г (67 %). Поданным аналитической ВЭЖХ, параметры удерживания полученного веществасовпадают с таковыми для имеющегося стандарта целевого соединения.Синтез амида фрагмента 6-14 белка РВ1H-Thr1-Leu2-Leu3-Phe4-Leu5-Lys6-Val7-Pro8-Ala9-NH2Целевое соединение было получено по описанной ранее общей методике,количество реагентов, использованных на каждой стадии, приведено в таблице 18.Таблица 18.

Синтез амида фрагмента 6-14 белка РВ1№1234567891011реагентыFmoc-Rinkамидная смолаDCM20% Et2NH/DMFFmocProOHDICHOBt*H2ODIPEAAc2OFmocValOHDICHOBt*H2OFmocLys(Boc)OHFmocLeuOHFmocPheOHFmocLeuOHFmocLeuOHDICHOBt*H2OFmocThr(t-Bu)OHМ, г/мольν, ммоль1.1m, г/ V, мл1.7210 мл2х10 мл; 5 и 20 мин4.41.485.280.67/0.825.280.814.40.57/0.734.40.45/0.422.20.752.640.33/0.412.640.42.20.1032.20.782.20.852.20.783.31.173.960.5/0.623.960.613.31.31337.4126.2153.1129.2102.1339.4126.2153.1468.5353.4387.4353.4353.4126.2153.1397.4t, ч131.52232.55416Начиная с остатка лейцина в положении 2 для деблокирования Fmocгруппы смолу промывали 3 раза 20% раствором диэтиламина в DMF (5, 20 и 1082мин). В случае остатка треонина в положении 1 наряду с диэтиламиномиспользовали DBU, как было описано ранее.После деблокирования Fmoc-группы смола была промыта дихлорметаном(4х10мл), высушена в вакууме и разделена на 3 части, соответствующие 0.45,0.45 и 0.2 ммоль пептида.

Часть пептидил-полимера, соответствующую 0.45ммоль пептида, использовали для финального деблокирования. Получено: 425мг (94 %). После очистки целевого соединения с помощью препаративнойВЭЖХ и последующей лиофилизации получено 264 мг (общий выход 59 %),чистота продукта по данным аналитической ВЭЖХ составила 97.3 %. HRMS(ESI+), m/z: 1000.6561 ([М+Н]+), 1000.6554 рассчитано.Синтез N-ацетилированного амида фрагмента 6-14 белка РВ1Ac-Thr1-Leu2-Leu3-Phe4-Leu5-Lys6-Val7-Pro8-Ala9-NH2Смолу, содержащую 0.45 ммоль защищенного фрагмента 6-14 белка РВ1со свободной N-концевой аминогруппой (данные по синтезу приведены втаблице 18) перемешивали в течение 1 часа в растворе 0.3 мл (1.8 ммоль)DIPEA и 0.17 мл (1.8 ммоль) ангидрида уксусной кислоты в 10 мл DMF, послечего смола была отфильтрована и промыта DMF (7х10мл).

Финальноедеблокирование проводили, как было описано ранее. Получено: 420 мг (89 %).После очистки целевого соединения с помощью препаративной ВЭЖХ ипоследующей лиофилизации получено 137 мг (общий выход 28 %), чистотапродукта по данным аналитической ВЭЖХ составила 95.2 %. HRMS (ESI+),m/z: 1042.6628 ([М+Н]+), 1042.6659 рассчитано.Синтез флуоресцеин-меченого амида фрагмента 6-14 белка РВ1FITC-Ahx1-Thr2-Leu3-Leu4-Phe5-Leu6-Lys7-Val8-Pro9-Ala10-NH2Смолу, содержащую 0.2 ммоль защищенного фрагмента 6-14 белка РВ1со свободной N-концевой аминогруппой (данные по синтезу приведены втаблице 18) перемешивали в течение 15 часов в растворе 0.35 г (1 ммоль) FmocAhx-ОН, 0.18 г (1.2 ммоль) HOBt и 0.19 мл (1.2 ммоль) DIC в 5 мл DMF, послечего смолу отфильтровали и промыли DMF (7х10мл).

После деблокированиеFmoc-группы, проведенного описанным ранее способом, к смоле был добавлен83раствор 0.117 г (0.3 ммоль) флуоресцеин-5-изотиоцианата (FITC) в 4 мл смесипиридина, диметилформамида и дихлорметана в соотношении 12:7:5, реакциюпроводили при перемешивании в течение 24 часов, после чего смолуотфильтровали и промыли DMF (7х10мл).

Финальное деблокированиепроводили описанным ранее способом. Получено: 266 мг (88 %). После очисткицелевого соединения с помощью препаративной ВЭЖХ и последующейлиофилизации получено 91 мг (общий выход 30 %), чистота продукта поданным аналитической ВЭЖХ составила 94.3 %. HRMS (ESI+), m/z: 1502.7805([М+Н]+), 1502.7752 рассчитано.Синтез фрагмента 26-30 белка РВ1H-Gly1-Asp2-Pro3-Pro4-Tyr5-OHЦелевое соединение было получено по описанной ранее общей методике,количество реагентов, использованных на каждой стадии, приведено в таблице 19.Таблица 19.

Синтез фрагмента 26-30 белка РВ1№реагенты12-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocTyr(t-Bu)OHFmocProOHDICHOBt*H2OFmocProOHFmocAsp(O-tBu)OHFmocGlyOH2345М, г/мольν, ммольt, ч129.2459.6337.4126.2153.1337.4411.52.329.31.83.64.324.323.63.6m, г/ V,мл1.51.2/1.540.831.210.55/0.670.661.211.48297.43.61.072222.53После деблокирования Fmoc-группы смола была промыта дихлорметаном(4х10мл), высушена в вакууме и разделена на 2 равные части. Одну частьиспользовали для финального деблокирования, вторую - для полученияацетилированного производного, синтез которого описан ниже.

Получено: 420мг (85 %). После очистки целевого соединения с помощью препаративнойВЭЖХ и последующей лиофилизации получено 380 мг (общий выход 77 %),чистота продукта по данным аналитической ВЭЖХ составила 96.4 %. HRMS(ESI+), m/z: 548.2332 ([М+Н]+), 548.2351 рассчитано.84Синтез N-ацетилированного фрагмента 26-30 белка РВ1Ac-Gly1-Asp2-Pro3-Pro4-Tyr5-OHСмолу, содержащую 0.9 ммоль защищенного фрагмента 26-30 белка РВ1со свободной N-концевой аминогруппой (данные по синтезу приведены втаблице 19) перемешивали в течение 1 часа в растворе 0.6 мл (3.6 ммоль)DIPEA и 0.34 мл (3.6 ммоль) ангидрида уксусной кислоты в 10 мл DMF, послечего смола была отфильтрована и промыта DMF (7х10мл). Финальноедеблокирование проводили, как было описано ранее.

Получено: 360 мг (68 %).После очистки целевого соединения с помощью препаративной ВЭЖХ ипоследующей лиофилизации получено 263 мг (общий выход 50 %), чистотапродукта по данным аналитической ВЭЖХ составила 98.1 %. HRMS (ESI+),m/z: 590.2466 ([М+Н]+), 590.2457 рассчитано.Синтез амида фрагмента 26-30 белка РВ1H-Gly1-Asp2-Pro3-Pro4-Tyr5-NH2Целевое соединение было получено по описанной ранее общей методике,количество реагентов, использованных на каждой стадии, приведено в таблице 20.Таблица 20.

Синтез амида фрагмента 26-30 белка РВ1№реагенты1Fmoc-Rink-амиднаясмолаDCM20% Et2NH/DMFFmocTyr(t-Bu)OHDICHOBt*H2ODIPEAAc2OFmocProOHDICHOBt*H2OFmocProOHFmocAsp(O-t-Bu)OHFmocGlyOH2345678М,г/мольν, ммоль1.48459.6126.2153.1129.2102.1337.4126.2153.1337.4411.5297.4m, г/ V,мл2.3110 мл2х10 мл; 5 и 20 мин5.922.727.10.9/1.17.11.095.920.76/0.985.920.6/0.562.961.003.550.45/0.553.550.542.961.002.961.222.960.88t, ч121232.52После деблокирования Fmoc-группы смола была промыта дихлорметаном(4х10мл), высушена в вакууме и разделена на 2 равные части. Одну часть85использовали для финального деблокирования, вторую - для полученияацетилированного производного, синтез которого описан ниже. Получено: 380мг (94 %).

После очистки целевого соединения с помощью препаративнойВЭЖХ и последующей лиофилизации получено 154 мг (общий выход 38 %),чистота продукта по данным аналитической ВЭЖХ составила 97.7 %. HRMS(ESI+), m/z: 547.2497 ([М+Н]+), 547.2511 рассчитано.Синтез N-ацетилированного амида фрагмента 26-30 белка РВ1Ac-Gly1-Asp2-Pro3-Pro4-Tyr5-NH2Смолу, содержащую 0.74 ммоль защищенного фрагмента 26-30 белка РВ1со свободной N-концевой аминогруппой (данные по синтезу приведены втаблице 20) перемешивали в течение 1 часа в растворе 0.49 мл (2.96 ммоль)DIPEA и 0.28 мл (2.96 ммоль) ангидрида уксусной кислоты в 10 мл DMF, послечего смола была отфильтрована и промыта DMF (7х10мл). Финальноедеблокирование проводили, как было описано ранее.

Получено: 401 мг (92 %).После очистки целевого соединения с помощью препаративной ВЭЖХ ипоследующей лиофилизации получено 148 мг (общий выход 34 %), чистотапродукта по данным аналитической ВЭЖХ составила 96.2 %. HRMS (ESI+),m/z: 589.2595 ([М+Н]+), 589.2616 рассчитано.Синтез фрагмента 111-130 белка РВ1 последовательным наращиваниемпептидной цепиH-Met1-Glu2-Val3-Val4-Gln5-Gln6-Thr7-Arg8-Met9-Asp10-Lys11-Leu12-Thr13-Gln14Gly15-Arg16-Gln17-Thr18-Tyr19-Asp20-OHСинтез проводили по описанной ранее общей методике, количествореагентов, использованных на каждой стадии, приведено в таблице 21.Таблица 21.

Синтез фрагмента 111-130 белка РВ1№реагенты12-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocAsp(O-tBu)OHFmocTyr(t-Bu)OH2М,г/мольν, ммольt, ч129.2411.50.7753.10.35m, мг/V,мкл500401/512144459.60.732228623456789101112131415DICHOBt*H2OFmocThr(t-Bu)OHFmocGln(Trt)OHFmocArg(Pbf)OHFmocGlyOHFmocGln(Trt)OHFmocThr(t-Bu)OHFmocLeuOHDICHOBt*H2OFmocLys(Boc)OHFmocAsp(O-tBu)OHFmocMetOHFmocArg(Pbf)OHFmocThr(t-Bu)OHFmocGln(Trt)OHDICHOBt*H2O126.2153.1397.4610.7648.8297.4610.7397.4353.4126.2153.1468.5411.50.840.840.70.70.70.70.70.71.051.261.261.051.05106/131129278428454208427278371159/196193492432371.5648.8397.4610.7126.2153.11.051.051.051.051.752.12.13906814176411069265/327322221221517;254181424520;2516Финальное деблокирование проводили с использованием EDT, как былоописано ранее.

Получено: 470 мг. На хроматограмме полученной смесиприсутствовало два основных пика. HRMS (ESI+), m/z: 1712.8342 ([М+Н]+),1840.8924 ([М+Н]+).Синтез фрагмента 111-130 белка РВ1 конвергентным способомH-Met1-Glu2-Val3-Val4-Gln5-Gln6-Thr7-Arg8-Met9-Asp10-Lys11-Leu12-Thr13-Gln14Gly15-Arg16-Gln17-Thr18-Tyr19-Asp20-OHРазбивка целевого соединения на фрагменты была проведена по остаткамглутамина и треонина в положениях 5 и 13 соответственно, былисинтезированы и выделены защищенные фрагменты 1-5 и 6-13 (таблицы 22 и 23соответственно).

Защищенный фрагмент 14-20 (таблица 24) не подвергалидеблокированию с полимерного носителя.Синтез защищенного фрагмента 1-5Fmoc-Met-Glu(O-tBu)-Val-Val-Gln(Trt)-ОНТаблица 22. Синтез защищенного фрагмента 1-5№реагентыМ,ν, ммоль87m, мг/ V,t, чг/моль123452-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocGln(Trt)OHFmocValOHDICHOBt*H2OFmocValOHFmocGlu(O-tBu)OHFmocMetOH1.14.40.81.61.921.921.61.61.6129.2610.7339.4126.2153.1339.4443.5371.5мкл700570/727490543242/30029454371059522322Получено 660 мг (72%).Синтез защищенного фрагмента 6-13Fmoc-Gln(Trt)-Thr(t-Bu)-Arg(Pbf)-Met-Asp(O-tBu)-Lys(Boc)-Leu-Thr(t-Bu)-ОНТаблица 23. Синтез защищенного фрагмента 6-13№реагенты12-Cl-Trt-смолаDIPEAFmocThr(t-Bu)OHFmocLeuOHDICHOBt*H2OFmocLys(Boc)OHFmocAsp(O-t-Bu)OHFmocMetOHFmocArg(Pbf)OHFmocThr(t-Bu)OHFmocGln(Trt)OH2345678М,г/моль129.2397.4353.4126.2153.1468.5411.5371.5648.8397.4610.7ν, ммольm, г/ V, млt, ч2.329.31.533.63.63333331.51.2/1.540.61.060.45/0.560.551.41.231.111.951.191.8322216524520Получено 1.976 г (67%).Синтез защищенного фрагмента 14-20Fmoc-Gln(Trt)-Gly-Arg(Pbf)-Gln(Trt)-Thr(t-Bu)-Tyr(t-Bu)-Asp(O-tBu)-ОНТаблица 24.

Характеристики

Тип файла
PDF-файл
Размер
2,32 Mb
Предмет
Высшее учебное заведение

Список файлов диссертации

Синтез и изучение фрагментов РНК-полимеразы вируса гриппа А
Свежие статьи
Популярно сейчас
Зачем заказывать выполнение своего задания, если оно уже было выполнено много много раз? Его можно просто купить или даже скачать бесплатно на СтудИзбе. Найдите нужный учебный материал у нас!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6447
Авторов
на СтудИзбе
306
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее