Диссертация (1145807), страница 23
Текст из файла (страница 23)
Сродство сайта Садлоу II БСА к п-нитрофенилацетату в 2раза выше по сравнению с КСA и ЧСA. Ибупрофен - аллостерическийингибитор карбоксил- и арилэстеразной активности сайта Садлоу I, этот эффектв максимальной степени выражен у КСА и ЧСА, но на порядок меньше у БСА.2) Каталитическая эффективность сайта Садлоу I БСА по отношению кпараоксону в 4 раза меньше, чем по отношению к п-нитрофенилацетату; дляКСА и ЧСА эти отличия составляют 100 и 65 раз, соответственно.Фосфорилирование сайта Садлоу II всех трех видов альбумина привзаимодействии с параоксоном происходит быстрее ацетилирования этихсайтов.Ибупрофен-аллостерическийингибиторфосфотриэстеразнойактивности сайта Садлоу I; максимальный эффект выявлен у КСА и ЧСА, но в2 раза меньше у БСА.3) Методом остаточного ингибирования ацетилхолинэстеразы с последующимприменениемформализмаСкетчарда,Михаэлиса-Ментениметодовмолекулярного моделирования установлено более высокое сродство зомана ксайту Садлоу II на первой стадии взаимодействия с альбумином илимитирующий характер второй стадии взаимодействия, что обусловливаетпреимущественнотранспортныефункциисайтаСадлоуIIпритоксикологически релевантных концентрациях зомана.4) Согласно предложенной схеме (1), данные молекулярного моделированияхарактеризуют вторую стадию взаимодействия ФОС с сайтами альбумина.
Поданным молекулярного докинга, параоксон и токсические P(-) изомеры зоманалучше связываются с Tyr150, чем с Tyr411 ЧСА. Для продуктивногосвязывания зомана с Tyr411 необходимо депротонирование тирозина, при этомсродство к Tyr411 выше у нетоксичных P(+) изомеров зомана. Помимо Tyr150 иTyr411, параоксон и токсичные изомеры зомана могут взаимодействовать сSer193 и Lys402 ЧСА.1335) По данным сравнительного биохимического анализа in vitro и in silico,функциональные характеристики ЧСА и КСА отличаются между собой вменьшей степени по сравнению с характеристиками БСА.
Полученные данныеподтверждают консерватизм сайта Садлоу II по отношению к сайту Садлоу Iвсехисследованныхвидовальбумина,аконсерватизме БСА по отношению к КСА и ЧСА.такжесвидетельствуюто134СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫБелинская Д.А. Молекулярное моделирование связывания лиганда сактивным центром холинэстераз: дис. … канд.биол.наук. С.-Петербург,20092. Белинская Д.А., Шмурак В.И., Прокофьева Д.С., Гончаров Н.В.Исследование связывания зомана с альбумином методами молекулярногомоделирования // Токс. вестник. – 2012. – №6.
– С.13-19.3. Белинская Д.А., Таборская К.И., Гончаров Н.В. Модуляция жирнымикислотами сайтов взаимодействия альбумина с параоксоном: анализметодами молекулярного моделирования // Биоорг. Химия. – 2017. – Т.43.– №4. – С.347-356.4. Белинская Д.А., Йуффер А.Х., Шестакова Н.Н Роль электростатическихвзаимодействий в процессе сорбции лигандов в активные центрыхолинэстераз по данным молекулярного моделирования // Биоорган.химия. – 2010. – Т.36. – С.200-205.5. Белинская Д.А., Шмурак В.И., Прокофьева Д.С., Гончаров Н.В.Сывороточный альбумин: поиск новых сайтов взаимодействия сфосфорорганическимисоединенияминапримерезомана//Биоорганическая химия. – 2014.
– V.40. – №5. – P.541-549.6. Гончаров Н. В., Белинская Д. А., Разыграев А. В., Уколов А. И. Оферментативной активности альбумина // Биоорг. химия. – 2015. – Т.41. –С.131-144.7. Дарбре, А. Практическая химия белка: Пер. с англ. // Под ред. А. Дарбре.— М.: Мир, 1989. — 623 с.8. Курдюков И.Д., В.И.
Шмурак, А.Д. Надеев, Н.Г. Войтенко, Д.С.Прокофьева, Н.В. Гончаров «Эстеразный статус» организма привоздействии токсических веществ и фармпрепаратов // ТоксикологическийВестник. – 2012. – Т.6 –. С.6-13.9. Прокофьева Д.С. Разработка и сравнительный анализ микропланшетныхбиохимических методов определения фосфорорганических отравляющихвеществ на примере зомана // Токс. вестник.
– 2009. – №6. – С.39-46.10. Пырков Т.В., Озеров И.В., Балицкая Е.Д., Ефремов Р.Г. Молекулярныйдокинг: роль невалентных взаимодействий в образовании комплексовбелков с нуклеотидами и пептидами // Биоорганическая химия. – 2010. –Т.36. - №4. – С.482-492.11. Abedi Karjiban R., Abdul Rahman M.B., Basri M., Salleh A.B., Jacobs D.,Abdul Wahab H. Molecular dynamics study of the structure, flexibility anddynamics of thermostable-1 lipase at high temperatures // Protein J. – 2009. –V.28.
– №1. – P.14-23.12. Acay, A., Erdenen, F., Altunoglu, E., Erman, H., Muderrisoglu, C., Korkmaz,G.G., Gelisgen, R., Tabak,O., Uzun, H. Evaluation of serum paraoxonase andarylesterase activities in subjects with asthma and chronic obstructive lungdisease // Clin. Lab. – 2013. – V.59. – P.1331-1337.1.13513. Agarwal R.P., Phillips M., McPherson R.A., Hensley P.Serum albumin and themetabolism of disulfiram // Biochem.
Pharmacol. – 1986. – V.35. – P.33413347.14. Aldridge W.N. Serum esterases. I. Two types of esterase (A and B) hydrolysingp-nitrophenyl acetate, propionate and butyrate, and a method for theirdetermination // Biochem. J. – 1953. – V.53. – №1. – P.110-117.15. Aldridge W.N.
Serum esterases. II. An enzyme hydrolysing diethyl pnitrophenyl phosphate (E600) and its identity with the A-esterase of mammaliansera // Biochem. J. – 1953. – V.53. – №1. – P.117-124.16. Antoni G., Casagli M.C., Bigio M., Borri G., Neri P.Different interactions ofhuman and bovine serum albumin with Cibacron Blue and Blue Dextran // Ital.J. Biochem. – 1982. – V.31.
– P.100-106.17. Ascenzi P., Bocedi A., Notari S., Fanali G., Fesce R., Fasano M. Allostericmodulation of drug binding to human serum albumin // Mini Rev. Med. Chem. –2006. – V.6. – №4. – P.483-489.18. Ascenzi P., Fasano M Allostery in a monomeric protein: the case of humanserum albumin // Biophys.
Chem. – 2010. – V.148. – P.16-22.19. Ascenzi P., Leboffe L., di Masi A., Trezza V., Fanali G., Gioia M., Coletta M.,Fasano M. Ligand Binding to the FA3-FA4 Cleft Inhibits the Esterase-LikeActivity of Human Serum Albumin // PloS one. – 2015. – V.10. – №3. – P.1-16.20. Ascenzi P., Gioia M., Fanali G. et al. Pseudo-enzymatic hydrolysis of 4nitrophenyl acetate by human serum albumin: pH-dependence of rates ofindividual steps // Biochem Biophys Res Commun. – 2012. – V.424. – №3. –P.451-455.21. Ascenzi P., Fasano M. Pseudo-enzymatic hydrolysis of 4-nitrophenyl myristateby human serum albumin // Biochem. Biophys.
Res. Commun. – 2012. – V.422.– №2. – P.219-223.22. Atli M. Serum paraoxonase activity and lipid hydroperoxide levels in adultfootball players after three days football tournament // Afr. Health Sci. – 2013. –V.13 – P.565-570.23. Augustinsson K.B., Heimburger G. Enzymatic hydrolysis of organophosphoruscompounds. I. Occurrence of enzymes hydrolysing dimethyl-amido-ethoxyphosphoryl cyanide (Tabun) // Acta Chem. Scand. – 1954. – V.8.
– P.753-761.24. Augustinsson K.B., Heimburger G. Enzymatic hydrolysis of organophosphoruscompounds. II. Analysis of reaction products in experiments with Tabun andsome properties of blood plasma tabunase // Acta Chem. Scand. – 1954. – V.8. –P.762-767.25. Augustinsson K.B., Heimburger G. Enzymatic hydrolysis of organophosphoruscompounds. IV. Specificity studies // Acta Chem. Scand. – 1954. – V.8. –P.1533-1541.26. Aviram M., Vaya J. Paraoxonase 1 activities, regulation, and interactions withatherosclerotic lesion // Curr.
Opin. Lipidol. – 2013. – V.24. – P.339-344.13627. Banerjee S.K., Kregar I., Turk V., Rupley J.A. Lysozyme-catalyzed reaction ofthe N-acetylglucosamine hexasaccharide. Dependence of rate on pH // J. Biol.Chem. – 1973. – V.248. – P.4786-4792.28. Bar-Or D., Rael L.T., Lau E.P., Rao N.K.R., Thomas G.W., Winkler J.V., YuklR.L., Kingston R.G., Curtis C.G. An analog of the human albumin N-terminus(Asp–Ala–His–Lys) prevents formation of copper-induced reactive oxygenspecies // Biochem. Biophys.
Res. Commun. – 2001. – V.284. – P.856-862.29. Bender M.L., Kezdy F.J., Wedler F.C. Alpha-Chymotrypsin: Enzymeconcentration and kinetics // Journal of Chemical Education. – 1967. – V.44. –№2. – P.84-88.30. Benschop H.P., de Jong L.P. Eds Somani S.M., Romano J.A.Jr. Boca RatonChemical warfare agents: toxicity at low levels // CRC Press. – 2001. – P.25-82.31. Benschop H.P., Konings C.A., van Genderen J., de Jong L.P. Studies using amonoclonal antibody against soman.
// Fundam. Appl. Toxicol. – 1984. – V.4. –P.84-95.32. Benschop H.P., De Jong L.P. Toxicokinetics of soman: species variation andstereospecificity in elimination pathways // Neurosci. Biobehav. Rev. – 1991. –V.15. – №1. – P.73-77.33. Berendsen H.J.C., van der Spoel D., van Drunen R. GROMACS: A messagepassing parallel molecular dynamics implementation // Comp. Phys. Comm. –1995. – V.91.
– №1. – P.43-56.34. Berendsen H.J.C., Postma J.P.M., van Gunsteren W.F., HermansJ.Intermolecular forces // Ed Pullman B. Dordrecht: Reidel D. PublishingCompany. – 1981. – P.331-342.35. Berendsen H.J.C., Postma J.P.M., di Nola A., van Gunsteren W.F., Haak J.R.Molecular dynamics with coupling to an external bath // J. Chem. Phys. – 1984.– V.81. – P.3684-3690.36. Berendsen N.J.C., Hayword S.
Collective protein dynamics in relation tofunction // Curr. Opin. Struct. Biol. – 2000. – V.10. – №2. – P.165-169.37. Berman H.M., Westbrook J., Feng Z., Gilliland G., Bhat T.N., Weissig H.,Shindyalov I.N., Bourne P.E. The protein data bank // Nucleic Acids Res. –2000. – V.28. – P.235-242.38. Black R.M. Harrison J.M., Read R.W. The interaction of sarin and soman withplasma proteins: the identification of a novel phosphonylation site // Arch.Toxicol. – 1999. – V.73. – P.123-12639. Briggs G.E., Haldane J.B.S.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
