Диссертация (1144820), страница 41
Текст из файла (страница 41)
Acc. – сбалансированная точность; CVC –повторяемость результата; SE – чувствительность; SP – специфичность.Таблица 60. Комбинации аллелей повышенного и пониженного рискаразвития МСО.Группа/генотипМСКонтрольpOR(N=192), (N=290), N(95%ДИ)N (%)(%)2-х локусная модельВарианты комбинаций аллелей повышенного рискаAGTR2 (C/C) x LPL (C/C)6 (3,1)3 (1)0,173,10 (0,650- 19,000)Варианты комбинации аллелей пониженного риска3-х локусная модельВарианты комбинаций аллелей повышенного рискаAPOE (E2/E3) x BR16 (3,1)1 (0,3)9,30 (1,1000,02(BDKRB2) (C/C) x LPL (C/C)- 430,000)APOE (E3/E4) x BR17 (3,6)4 (1,4)0,122,70 (0,680(BDKRB2) (T/T) x LPL (C/C)- 13,000)Варианты комбинаций аллелей пониженного рискаAPOE (E2/E3) x BR12 (1)8 (2,8)0,330,37 (0,038(BDKRB2) (T/C) x LPL (C/C)- 1,900)APOE (E2/E3) x BR10 (0)4 (1,4)0,150,00 (0 275276(BDKRB2) (T/C) x LPL (C/G)2,300)APOE (E3/E4) x BR11 (0,5)9 (3,1)0,060,16 (0,004(BDKRB2) (C/C) x LPL (C/C)- 1,200)Примечание.
Жирным шрифтом выделены статистически значимыеразличия (p<0,05); OR - отношение шансов; ДИ - доверительный интервал.АБРисунок 36. Диаграммы моделей взаимодействий генов при МСО умальчиков. А - двухлокусная; Б - трехлокусная. Примечание: темно-серыеячейки соответствуют комбинациям повышенного риска, светло-серыеячейки - пониженного риска, белые ячейки - отсутствуют сочетаниякомбинации аллелей. Левые столбики в ячейках - пациенты с МС, правые –контроль (школьники).Трехлокусная модель МСО у мальчиков (см. табл.
61) - APOE(E2/E3/E4) x BR1 (BDKRB2) (T/C) x NOS3 (T/C) не имеет высокуювоспроизводимость (CVC=4/10) при сбалансированной точности 0,86,276277чувствительности 0,92, и специфичности 0,80, χ2=95,14 (р<0,0001). Кповышенному риска МСО у мальчиков (см. табл. 62) отнесены четыресочетания, и только одно - к пониженному риску. Наиболее значимаякомбинация повышенного риска - APOE (E2/E3) x BR1 (BDKRB2) (T/T) xNOS3 (T/C) (p=0,05, OR = Inf, 95%ДИ: 0,710-Inf).Таблица 61.
Анализ межгенных взаимодействий при МСО умальчиков, рассчитанный методом исчерпывающего поиска с помощьюпрограммы MDR v3.0.2.ЧислоМодель межгенныхлокусоввзаимодействий2APOE (E2/E3/E4) x AGT(M/T)Bal.Acc.0,85CVCSESP7/101,00 0,69288,20(p <0,0001)3APOE (E2/E3/E4) x BR10,864/10 0,92 0,80 95,14(BDKRB2) (T/C) x NOS3(p <(T/C)0,0001)Примечание. Bal. Acc. – сбалансированная точность; CVC –повторяемость результата; SE – чувствительность; SP – специфичность.Таблица 62. Комбинации аллелей повышенного и пониженного рискаМСО у мальчиков.Группа/генотипМСКонтрольpOR (95%CI)(N=72), (N=123),N (%)N (%)2-х локусная модельВарианты комбинаций аллелей повышенного рискаAPOE (E3/E3) x AGT (M/M)10 (13,9)6 (4,9)3,10 (0,9800,03- 11,000)APOE (E3/E3) x AGT (M/T)19 (26,4)12 (9,8)0,004 3,30 (1,400- 8,000)APOE (E2/E3) x AGT (M/T)5 (6,9)2 (1,6)0,14,50 (0,710- 48,000)APOE (E3/E4) x AGT (M/T)4 (5,6)2 (1,6)0,23,50 (0,490- 40,000)Варианты комбинаций аллелей пониженного риска2772783-х локусная модельВарианты комбинаций аллелей повышенного рискаAPOE (E3/E3) x BR14 (5,6)2 (1,6)0,23,50 (0,490(BDKRB2) (C/C) x NOS3 (T/C)- 40,000)APOE (E3/E3) x BR15 (6,9)2 (1,6)0,14,50 (0,710(BDKRB2) (C/C) x NOS3 (T/T)- 48,000)APOE (E3/E3) x BR13 (4,2)1 (0,8)0,145,30 (0,410(BDKRB2) (T/T) x NOS3 (T/T)-280,000)APOE (E2/E3) x BR13 (4,2)0 (0)Inf (0,710 0,05(BDKRB2) (T/T) x NOS3 (T/C)Inf)Варианты комбинаций аллелей пониженного рискаAPOE (E3/E3) x BR15 (6,9)9 (7,3)10,95 (0,240(BDKRB2) (T/C) x NOS3 (T/T)- 3,300)Примечание.
Жирным шрифтом выделены статистически значимыеразличия (p<0,05); OR - отношение шансов; ДИ - доверительный интервал.Лучшей двухлокусной моделью риска МСО у девочек (см. табл. 63,рис. 37) была комбинация локусов APOE (E2/E3/E4) x BR1 (BDKRB2) (T/C) схорошейстепеньюсбалансированнойвоспроизводимоститочностьюCVC=10/10,0,79,сспецифичностьютестируемой0,92ичувствительностью 0,65 и χ2=76,90 (р<0,0001). Анализ данной модели втаблицах сопряженности (табл. 64), установил одно сочетание повышенногориска и четыре - пониженного риска развития МС. Наиболее значимая из них- комбинация повышенного риска: APOE (E2/E3) x BR1 (BDKRB2) (C/C)(p=0,0035, OR=14,00, 95%ДИ: 2,700-620,000).Трехлокусная модель МСО у девочек из (см. табл.
63) - APOE(E2/E3/E4)x BR1 (BDKRB2)воспроизводимость(CVC=7/10)(T/C) xприNOS3(T/C) имеет среднеютестируемойсбалансированнойточности 0,83, чувствительности 0,94, и специфичности 0,71, χ2=100,03(р<0,0001). К сочетаниям повышенного риска этого заболевания у девочек(см. табл. 64) отнесены два варианта, и восемь - к комбинациям пониженногориска. Значимых комбинаций выявлено не было.Таким образом, лучшей моделью риска МСО является комбинациялокусов APOE (rs7412) x BR1 (BDKRB2) (rs1799722) x LPL (rs328) с хорошей278279степенью воспроизводимости CVC=9/10 и с тестируемой сбалансированнойточностью 0,76. В пользу данной модели свидетельствуют и результатыассоциативных исследований генов-кандидатов при однолокусном сравнении(см.
п. 3.2.2.1.2). Анализ данной модели в таблицах сопряженности,представляющей собой комбинации всех возможных вариантов 3-х локусноймодели, позволил установить одно сочетание повышенного риска APOE(E2/E3) x BR1 (BDKRB2) (C/C) x LPL (C/C).АБРисунок 37. Диаграммы моделей взаимодействий генов при МСО удевочек. А - двухлокусная; Б - трехлокусная. Примечание: темно-серыеячейки соответствуют комбинациям повышенного риска, светло-серыеячейки - пониженного риска, белые ячейки — отсутствуют сочетаниякомбинации аллелей.
Левые столбики в ячейках — пациенты с МС, правые— контроль (школьники).279280Лучшей двухлокусной моделью риска МСО у мальчиков былакомбинациялокусовAPOE(E2/E3/E4)xAGT(M/T)сосреднейвоспроизводимостью CVC=7/10, с тестируемой сбалансированной точностью0,85. Наиболее значимые из них были комбинации повышенного риска:APOE (E3/E3) x AGT (M/M), APOE (E3/E3) x AGT (M/T). С другой стороны,лучшей двухлокусной моделью риска МСО у девочек была комбинациялокусов APOE (E2/E3/E4) x BR1 (BDKRB2) (T/C) с отличной степеньювоспроизводимостиCVC=10/10истестируемойсбалансированнойточностью 0,79. Наиболее значимой была комбинация повышенного риска:APOE (E2/E3) x BR1 (BDKRB2) (C/C).Таблица 63. Анализ межгенных взаимодействий при МСО у девочек,рассчитанный методом исчерпывающего поиска с помощью программыMDR v3.0.2.ЧислоМодель межгенныхлокусоввзаимодействий2APOE (E2/E3/E4) x BR1(BDKRB2) (T/C)Bal.Acc.0,79CVCSESP10/100,92 0,65276,90(p <0,0001)3APOE (E2/E3/E4) x BR10,837/10 0,94 0,71 100,03(BDKRB2) (T/C) x NOS3(p <(T/C)0,0001)Примечание.
Bal. Acc. – сбалансированная точность; CVC –повторяемость результата; SE – чувствительность; SP – специфичность.Таблица 64. Комбинации аллелей повышенного и пониженного рискаразвития МСО у девочек.Группа/генотипМСО КонтрольpOR (95%CI)(N=90), (N=163),N (%)N (%)2-х локусная модельВарианты комбинаций аллелей повышенного рискаAPOE (E2/E3) x BR17 (7,8)1 (0,6)0,0035 14,00 (1,700(BDKRB2) (C/C)620,000)280281Варианты комбинаций аллелей пониженного рискаAPOE (E2/E3) x BR11 (1,1)3 (1,8)10,60 (0,011(BDKRB2) (T/T)7,600)APOE (E2/E3) x BR11 (1,1)6 (3,7)0,430,30 (0,006 (BDKRB2) (T/C)2,500)APOE (E3/E4) x BR13 (3,3)6 (3,7)10,90 (0,140 (BDKRB2) (T/T)4,400)APOE (E3/E4) x BR12 (2,2)8 (4,9)0,50,44 (0,045 (BDKRB2) (T/C)2,300)3-х локусная модельВарианты комбинаций аллелей повышенного рискаAPOE (E3/E3) x BR13 (3,3)1 (0,6)0,135,50 (0,440 (BDKRB2) (T/C) x NOS3 (C/C)290,000)APOE (E2/E3) x BR13 (3,3)1 (0,6)0,135,50 (0,440 (BDKRB2) (C/C) x NOS3 (T/C)290,000)Варианты комбинаций аллелей пониженного рискаAPOE (E3/E3) x BR11 (1,1)4 (2,5)0,660,45 (0,009 (BDKRB2) (T/T) x NOS3 (T/C)4,600)APOE (E3/E3) x BR11 (1,1)5 (3,1)0,430,36 (0,007 (BDKRB2) (C/C) x NOS3 (T/C)3,300)APOE (E3/E3) x BR15 (5,6)9 (5,5)11,00 (0,260 (BDKRB2) (T/C) x NOS3 (T/C)3,500)APOE (E2/E3) x BR10 (0)3 (1,8)0,550,00 (0,000 (BDKRB2) (T/T) x NOS3 (T/C)4,400)APOE (E2/E3) x BR11 (1,1)3 (1,8)10,60 (0,011 (BDKRB2) (T/C) x NOS3 (T/T)7,600)APOE (E2/E3) x BR10 (0)3 (1,8)0,550,00 (0,000 (BDKRB2) (T/C) x NOS3 (T/C)4,400)APOE (E3/E4) x BR11 (1,1)3 (1,8)10,60 (0,011 (BDKRB2) (T/T) x NOS3 (T/C)7,600)APOE (E3/E4) x BR10 (0)6 (3,7)0,090,00 (0,000 (BDKRB2) (C/C) x NOS3 (T/T)1,500)Примечание.
Жирным шрифтом выделены статистически значимыеразличия (p<0,05); OR - отношение шансов; ДИ - доверительный интервал.Таким образом, анализ межгенных взаимодействий генов-кандидатовМСО показал, что наряду с генами APOE, BDKRB2 и LPL, определенныйвклад в развитие данной патологии у детей может вносить ген AGT.2812823.2.2.1.5.5. GLM модель для оценки риска артериальной гипертензии.При построении GLM модели для оценки риска артериальнойгипертензии в расчет были включены следующие гены: REN, AGT, ACE,AGTR1, AGTR2, BDKRB2, MTHFR, а так же клинические данные: возраст (В),наличие повышенного АД у матери (АД М), наличие повышенного АД уотца (АД О), наличие хронических заболеваний при беременности у матери(ХЗ Б), наличие АГ в период беременности у матери (АГ Б), вес, рост, ИМТ ипол (см. табл. 65-67).
Затем был проведен анализ моделей с различнымипараметрами как в группе в целом (табл. 65), так и для мальчиков (табл. 66) идевочек (табл. 67) в отдельности.В табл. 65 приведены шесть таких моделей. Первая включает толькогены, вторая – анамнестические данные, третья – данные преморбидногофона, четвертая – генетические данные и анамнестические данные (заисключением данных о наличие повышенного АД у отца (АД О), наличиехронических заболеваний при беременности у матери (ХЗ Б), пятая генетическиеиклиническиеданныеспреморбиднымфоном(заисключением АД О и ХЗ Б), шестая – аналогично пятой, но включает такойпараметр как «пол».В формулу первой модели вошли параметры: ~ REN + AGTR2.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
