Диссертация (1144820), страница 43
Текст из файла (страница 43)
Параметры и характеристики регрессионных моделей МСО у мальчиков, полученные на основаниигенетических и клинических данных.№12Параметры моделиREN, AGT, AGTR1,AGTR2, BDKRB2, MTHFRВозраст (В), наличиеповышенного АД уматери (АД М), наличиеповышенного АД у отца(АД О), наличиехронических заболеванийпри беременности уРазмервыборкиМодель176~ REN116ХарактеристикиПараметрыЗначени PекоэффициентаСвободныйчленуравненияREN-0,9201,376*10-60,42480,0900,3330,1180,76616,0000,1700,991~ АД М + АД О Свободный+ ХЗ БчленуравненияАД МАД ОЧувств Специительно фичностьстьСбалансированнаяточность0,0100,050,0100,04,452,2293294матери (ХЗ Б)3REN, AGT, AGTR1,AGTR2, BDKRB2, MTHFR,возраст (В), наличиеповышенного АД уматери (АД М)136~ АД МХЗ Б-17,3100,9917СвободныйчленуравненияАД М-0,5350,0070,8720,05726,887,557,1Таблица 70.
Параметры и характеристики регрессионных моделей МСО у девочек, полученные на основаниигенетических и клинических данных.№12Параметры моделиREN, AGT, AGTR1,AGTR2, BDKRB2, MTHFRВозраст (В), наличиеповышенного АД уматери (АД М), наличиеповышенного АД у отца(АД О), наличиехронических заболеванийРазмервыборкиМодель221~ AGTR2173~ В + АД М +АД ОХарактеристикиПараметрыЗначени PекоэффициентаСвободныйчленуравнения-1,2511,545*10-6AGTR2Свободныйчленуравнения0,3201,6460,1310,021В-0,1140,028Чувств Специительно фичностьстьСбалансированнаяточность0,0100,050,057,862,760,2294295при беременности уматери (ХЗ Б)3REN, AGT, AGTR1,AGTR2, BDKRB2, MTHFR,возраст (В), наличиеповышенного АД уматери (АД М)219~ АД М +AGTR2АД М-1,2120,031АД О16,3900,988СвободныйчленуравненияАД М-1,1621,063*10-5-1,3270,083AGTR20,3260,1280,0100,050,0В табл.68 приведены пять таких моделей.
Первая из них включает только гены, вторая – только анамнестическиеданные, третья – клинические данные преморбидного фона, четвертая – генетические данные + анамнестические данные(за исключением данных о повышенном АД у отца (АД О), наличие хронических заболеваний при беременности уматери (ХЗ Б), пятая - генетические данные + клинические данные + преморбидный фон (за исключением АД О и ХЗ Б)с включением такого параметра как «пол».В модель №1 включала только ген ~ AGTR2. Ее сбалансированная точность составила всего 50,0%. Она являетсянизкой и не позволяет предсказывать риск болезни.Так же как модель 1, модели №2 (~ В + АД О) и №4 (~ В) имели сбалансированную точность только около 50% ине позволяли предсказывать риск заболевания.Напротив, в моделях №3 (~ В + РОСТ, ИМТ + АД О) и №5 (~ В + ВЕС + РОСТ + ИМТ + REN + BDKRB2)сбалансированная точность оказалась высокой, составила 93,2% и 89,4%, соответсвенно, и позволяет надежнопредсказывать заболевание.295296Таким образом, наиболее высокие показатели сбалансированной точности получены для третьей и пятой модели,т.е.
моделей, в которых, помимо клинических и генетических параметров, обязательно есть показатели преморбидногофона. Использование данных моделей позволяет расчитать риск заболевания по аналогии с тем, как рассчитывают рискразвития гестоза, однако формулы для формирования группы риска не существует (см. п. 3.2.1.1.4.3).В табл. 69 приведены три модели оценки риска МСО у мальчиков. Первая из них включает только гены, вторая –только клинические (анамнестические) данные, третья генетические данные и анамнестические данные (за исключениемАД О и ХЗ Б). Все три модели: №1 (~ REN); №2 (~ АД М + АД О +ХЗ Б), №3 (~ АД М) имели низкую сбалансированнуюточность, варьрующую от 50.0% до 57,1%, которая не позволят предсказать риск болезни.В табл. 70 приведены три модели оценки риска развития МСО у девочек.
Первая из них включает только гены,вторая – только клинические (анамнестические) данные, третья генетические данные и анамнестические данные (заисключением АД О и ХЗ Б).Сблансированная точность испытанных параметров низкая и варьирует от 50,0% до 60.2%.Таким образом, все изученные модели, как для девочек, так и для мальчиков имели низкие показателисбалансированной точности, и непригодны для оценки риска развития МСО.Поэтому для предсказания риска заболевания мальчиков, и у девочек целесообразно использовать общие моделис высокой сбалансированной точностью (табл. 68).2962973.2.2.1.5.7.Эффективностьпредсказанияфенотипанаоснованиигенетических и клинических показателей (ROC-анализ).Анализ классификаций наиболее значимых моделей, представленных втабл.
65 и 68 был произведен с применением ROC-кривых (см. рис. 38, 39).Пригодность метода классификации оценивали по площади, ограниченнойROC-кривой и осью доли ложных положительных классификаций показателю AUC (см. табл. 71).Рисунок 38. ROC-кривые для оценки риска предсказания АГ наосновании пяти моделей: гены (1), клинические (анамнестические) данные(2), клинические данные (включая преморбидный фон) (3), генетические ианамнестические данные (4), генетические и клинические данные спреморбидным фоном (6).297298Рисунок 39.
ROC-кривые для оценки риска предсказания МСО наосновании пяти моделей: гены (1), клинические (анамнестические) данные(2), клинические данные (включая преморбидный фон) (3), генетические ианамнестические данные (4), генетические и клинические данные спреморбидным фоном (5).Таблица 71. Значение показателя AUC для регрессионных моделей АГи МСО.Показатели, включенные в модельГеныКлинические (анамнестические) данныеАГ:0,5860,810МСО:0,5610,587Клинические данные (включая преморбидныйфон)Генетические и анамнестические данныеГенетические и клинические данные спреморбидным фоном0,9180,9710,7660,8890,5650,969Исходя из экспертной шкалы для значений AUC, модели, основанныетолько на «генетике», обладали не высоким качеством теста. Числоправильно классифицированных положительных примеров АГ от числаневерно классифицированных равнялось - 0,586.298299Модели, учитывающие только клинические (анамнестические) данные,обладали большей предсказательной силой, чем «гены».
Так, для АГзначение показателя AUC составило 0,810, и было существенно выше, чеманалогичное для МСО (AUC=0,587).Показатели AUC для моделей, включающих как генетические, так иклинические показатели, были разными и составили 0,766 и 0,565 для АГ иМСО, соответственно.При добавлении к клиническим данным данных преморбидного фона(первых симптомов заболевания) качество предсказания риска для АГ иМСО резко возрастало (AUC>0,918).Таким образом, до начала заболевания и при наличии некоторойклинической информации о пациенте можно предказывать риск развития АГу детей.
Риск МСО у детей можно предсказывать только при наличииинформации о преморбидном фоне, когда заболевание уже прогрессирует.3.2.2.2. Поиск новых генетических маркеров артериальной гипертензии иметаболического синдрома и ожирения.3.2.2.2.1. Реконструкция первичной генной сети артериальной гипертензии иметаболического синдрома и ожирения.Реконструкцию генной сети АГ и анализ её ассоциации с геннымисетямиожирения(«obesity»),метаболическогосиндрома(инсулинорезистентности) («syndrome x» и «insulin resistance»), проводили спомощью программы ANDVisio. Сеть редуцировали, фиксируя тольковзаимодействия по типу «ассоциация» («association»).Ассоциативная сеть включала 154 гена (см. рис. 40), и каждоезаболевание было ассоциировано с разным числом генов.
Максимальноечисло генов было связано с гипертензией и ожирением, несколько меньше – синсулинрезистентностью,иединичныегеныассоциированысметаболическим синдромом. В большинстве случаев выбранные гены были299300связаны только с одним заболеванием, и только некоторые из них былиассоциированы с несколькими патологиями одновременно.Метаболический синдром (МС) оказался наиболее изолированнымзаболеванием, т.е.
имел только один общий ген (SREBF1), связанный сожирением.Гипертензия,ожирениеиинсулинрезистентностьимелинесколько общих генов. В зависимости от особенностей взаимодействия этигены были подразделены на четыре группы. В первую (зеленый цвет) вошлигены ADRB3, ADIPOQ, ADRB2, LPL, которые были непосредственнововлечены в патогенез заболеваний.Рисунокгипертензии40.Генетическаяассоциативнаясожирениеми(инсулинрезистентностью).ассоциированныесОваламинесколькимисетьартериальнойметаболическимсиндромомвыделеныобщиепатологиямигруппы(желтым–гены,группа«цитокинов», красным – группа «проопиомеланокортина», фиолетовым –группа «гормона роста», зеленым – независимые гены).Во вторую группу (фиолетовый цвет) были включены ген гормонароста (GH1), который был связан с ожирением и гипертензией, и,300301взаимодействующий с ним, ген фосфоенопируват карбоксилазы (PCK2),который был связан с инсулинрезистентностью. Третью группу (желтыйцвет) составили гены «цитокинов»: ген фактора некроза опухоли (TNFA),который был связан со всеми заболеваниями, а также с геном IL10 и геномFOS, связанным с гипертензией; ген IL10, который помимо связи с геномTNFA, взаимодействовал с ожирением и геном IL6, который, в свою очередь,был связан с ожирением, инсулинрезистентностью и геном хемокиновоголиганда(CCL2),взаимодействующимсинсулинорезистентностьюигипертензией.