Диссертация (1139571), страница 22
Текст из файла (страница 22)
pyogenes к макролидам и линкозамидамв период 2011-2016 ггВ настоящей главе проведен анализ уровня устойчивости изолятов S.pyogenes к макролидным антибиотикам и выявление ведущих молекулярногенетических механизмов резистентности.Изучение частоты и молекулярных механизмов резистентности S. pyogenesк макролидам и линкозамиду проходило в 3 периода: 1-й - 2011- 2012 гг (246штаммов), 2-й - 2013 -2014 (273 штамма) и 3-й - с января 2015 по декабрь 2016 г(267 штаммов). Все 786 исследованных за эти периоды штаммы S. pyogenes быливыделены при культуральном исследовании 27011 мазков из зева, носа, вагины,отделяемого среднего уха и др., полученных от детей при консультативныхполиклинических осмотрах и в соматических отделениях клиник. Источникивыделения S. pyogenes представалены в таблице 7.14.Таблица 7.14Источники выделения S.
pyogenes в период 2011 – 2016 ггМатериал/локусМазки из зева, носа иносоглоткиОтделяемое из вагины ивульвыОтделяемое раны и кожныхпокрововОтделяемое из среднего ухаМокрота и трахеальныйаспиратИтогоВсего, nВыделеноS. pyogenes, nЧастотавыделения (%)190775933,11325977,31206282,3983394,04420290,7270117862,9153Данныеисследованияпериода2015-2016гг(третийпериод)антибиотикочувствительности S.
pyogenes к препаратам, относящимся к разнымгруппам(Таблица7.15.),показали,чтоуровеньнечувствительностимикроорганизма к макролидам составил 15,7%, к клиндамицину – 9,4%, к котримоксазолу - 14,3% и тетрациклину - 8,4%. Самые низкие значениянечувствительности S. pyogenes выявлены к хлорамфениколу – у 2,6% штаммов илевофлоксацину - 4,5%.Таблица 7.15Устойчивость S. pyogenes к антибиотикам (2015-2016 гг)АнтибиотикВсего, nЭритромицин267Из них НЧ,n, ( %)42 (15,7)Клиндамицин26729 (10,1)Хлорамфеникол2657 (2,6)Ко-тримоксазол24541 (16,7)Тетрациклин23920 (8,4)Левофлоксацин24315 (6,1)Поскольку макролиды и линкозамиды рассматриваются как альтернативныепрепараты для лечения пенициллин устойчивых стрептококков, необходиммониторинг устойчивости данных микроорганизмов к этой группе антибиотиков.Нами была прослежена динамика роста устойчивости S.
pyogenes к макролидам илинкозамидам в течение 2011-2016 гг.Результаты исследования, полученные при анализе уровней устойчивости S.pyogenes в течение 6-летнего периода (2011 - 2016 гг), позволили выявить ростнечувствительностимикроорганизмакаккотдельнымпредставителяммакролидных препаратов, так и к линкозамидам (клиндамицину) (рисунок 7.8). В1542011-2012 гг доля штаммов S. pyogenes, нечувствительных (резистентные иумеренно резистентные) к эритромицину, азитромицину, кларитромицину иклиндамицину (маркеру устойчивости к джозамицину и другим 16-членныммакролидам), находилась на низком уровне и составила 4,9%, 6,5%, 2,8% и 2,4%соответственно.
В 2013 - 2014 гг частота выделения устойчивых штаммоввыросла более чем в 2 раза и составила для перечисленных антибиотиков 13,5%,13,5%, 9,2%. Однако к клиндамицину и 16-членным макролидам она по-прежнемусохранялась на низком уровне (3,8%). Для последнего наблюдаемого периода(2015 - 2016 гг) был характерен продолжающийся небольшой рост устойчивостиS. pyogenes к эритромицину, достигший 15,7% и резкий подъем устойчивости кклиндамицину (до 9,4%).18% 16141210Эритромицин8Клиндамицин64202011-20122013-20142015-2016ПериодыРис. 7.8 Динамика устойчивости S.
pyogenes к макролидам иклиндамицину в течение 2011-2016 гг155Молекулярные механизмы устойчивости S. pyogenesк эритромицину и линкозамидамРезультаты определения фенотипа устойчивости у 46 эритромицинрезистентных изолятов, выделенных в 2014 – 2016 годах (6 изолятов выделены в2013-2014 г и 40– в 2015 -2016 гг), показали, что 11 (24%) из них имели Мфенотип, столько же (24%) - iMLSВ фенотип и 52% - сMLSВ фенотип.У изолятов с М-фенотипом резистентности МПК эритромицина колебаласьот 4 до 32 мг/л, у 33 штаммов с iMLSВ и сMLSВ фенотипами МПК эритромицинасоставляла 128-256 мг/л и лишь у одного изолята она была на уровне 4 мг/л.
Дляизолятов с М-фенотипом также были характерны низкие показатели МПКклиндамицина. Они составляли от 0,047 мг/л до 0,125 мг/л, что позволяло отнестиих к категории чувствительных. У 11 изолятов с iMLSВ-фенотипом МПКклиндамицина была в пределах 0,064 - 0,38 мг/л, и они также входили вкатегорию чувствительных микроорганизмов.Высокие (≥256 мг/л) значения МПК эритромицина имели изоляты с сMLSВфенотипом устойчивости, а МПК клиндамицина у таких изолятов не отличаласьединообразием, поскольку у половины из них уровень МПК находился насравнительно низких значениях (от 0,75 до 3 мг/л).
У одного изолята МПКклиндамицина составляла 0,5 мг/л, т.е. находилась на пороговом уровне, но поданнымдиско-диффузионногометодаэтотизолятбылопределенкакнечувствительный к антибиотику. У остальных 12 штаммов с сMLSВ-фенотипомустойчивости показатели МПК клиндамицина были ≥256 мг/л (таблица 7.16).156Таблица 7.16Распределение фенотипов, генов резистентности и показателей МПКERY и CLI у макролид-резистентных изолятов Streptococcus pyogenes (n=46)Фенотипрезистентности,nГенрезистентности, nМ-фенотип*n=11mefn=11iMLSВ**n=11сMLSВ***n=24Диапозон МПК (мг/л)Верхняя строка ERYНижняя строка CLI, n4 – 320,047 – 0,125 (11)ermBn=6ermB+ /mef +n=3ermB -/ mefn=2≥256 (5); 4 (1)0,064 – 0,19≥256 (3)0,19 - 0,3812; ≥2560,064; 0,125ermBn=16128 (1); ≥256 (15)0,75 – 3 (7)≥256 (9)ermB+ /mef +n=8≥256 (8)0,5 - 3 (5); ≥256 (3)Примечания:* эффлюкс, обусловлен наличием гена mef, эффлюксу подвергаются только14- и 15-членные макролиды, но сохраняется чувствительность к 16-членныммакролидам и линкозамидам** Индуцибельный фенотип проявляется устойчивостью к 14- и 15-членныммакролидам при чувствительности или резистентности к 16-членным макролидами линкозамидам*** Конститутивный фенотип проявляется устойчивостью микроорганизмана все группы макролидов и линкозамидыСледует отметить, что изоляты с М-фенотипом были резистентны ко всемисследованным 14- и 15-членным макролидам при сохранении чувствительностик 16-членному макролиду и клиндамицину.
Изоляты с iMLSВ-фенотипом (n=11)также были нечувствительны к 14- и 15-членным макролидам, чувствительность к16-членным макролидам была отмечена у 2-х из них. Штаммы S. pyogenes с157сMLSВ-фенотипом были нечувствительны ко всем макролидным антибиотикам ик клиндамицину.Результаты детекции генов, кодирующих резистентность S.
pyogenes кмакролидным антибиотикам, показали, что только у 11 из 46 изолятов (24%) былаэкспрессия mef гена, кодирующего эффлюксный механизм устойчивости. Всештаммы с mef-зависимым эффлюксом относились к М-фенотипу. У 22 (48%)эритромицин-резистентных S. pyogenes был обнаружен ermB-ген в качестве однойдетерминанты, а в 11 (24%) случаях ermB-ген находился в ассоциации с mefгеном. У двух (4%) изолятов гены резистентности не были идентифицированы.Эритромицин-резистентные изоляты с ermB-геном, а также с комбинацией mef –гена имели iMLSВ и сMLSВ фенотипы устойчивости.158ЗАКЛЮЧЕНИЕВ нашей работе мы проанализировали колонизацию респираторного трактавовремяпребываниябольныхнаИВЛвОРИТ.Доминирующимипредставителями нозокомиальной микробиоты трахеального аспирата были A.baumannii, K. рneumoniae и B.
серacia. В то же время особенности динамикиколонизациитрахеальногоаспиратаP.аeruginosa,характеризующиесяпостепенным заселением слизистых оболочек данного локуса независимо отгруппы госпитализированных детей, указывают на его локальное происхождениеи циркуляцию патогена в исследованном стационаре.А. baumanniiПредставленный молекулярно-генетический анализ карба-Р изолятов А.baumannii, выделенных у пациентов трех стационаров г. Москвы показалследующее.Подавляющеебольшинствоизолятовпринадлежалодвумклональным линиям, СС92Oxf/СС2Pas и СС944Oxf/ST78Pas, представленным 14различными Oxford-сиквенс-типами.
Только один исследованный изолят ST441Oxf(CC109Oxf)относилсякIC1.КлонСС92Oxf/СС2Pasимеетглобальноераспространение и принадлежит к IC2 [227, 391]. Клон СС944Oxf/ST78Pas,напротив, является сравнительно редким. Впервые он был описан как синглетонST78Pasв нескольких стационарах Италии в 2010 году, в связи с чем получилназвание «итальянский клон» [128, 308, 189].
Изоляты А. baumannii ST78Pasизредка выявляли в других странах Средиземноморья, а также в США (одинизолят в госпитале Майами, 2009 г.), Германии (2012-2013 гг.), Кувейте (20112012 гг.), Французской Гвиане (во время вспышки в ОРИТ, 2010 г.) [159, 279].Согласно базе данных МЛСТ А. baumannii [93], ST78Pas являетсяэквивалентом ST944Oxf. В исследованной нами коллекции доля изолятов ST944Oxfи его двух новых SLV (ST1103Oxf и ST1104Oxf), которые также были идентичны159ST78Pas, составила 30%. Кроме того, СС944Oxf был представлен во всех трехстационарах.Таким образом, клон СС944Oxf/ST78Pas стал одним из доминирующихгенотипов среди карба-Р изолятов А. baumannii, циркулировавших в Москве впериод исследования.Все охарактеризованные нами изоляты СС944Oxf/ST78Pas были носителямигена карбапенемазы blaOXA-72, а один изолят дополнительно имел ген blaOXA-23.Оригинальный «итальянский клон» ST78Pas продуцировал карбапенемазу OXA-58,позднее сообщалось о его вариантах, имевших OXA-23-подобные карбапенемазы[128, 189].