Диссертация (1139571), страница 23
Текст из файла (страница 23)
ST78Pas-изоляты, выделенные во Французской Гвиане, также обладалиOXA-23-подобной карбапенемазой, в то время как ST78Pas-изоляты, полученные вМайами, Германии и Кувейте, были носителями blaOXA-40-подобного гена [279,297]. Основным механизмом резистентности к карбапенемам среди изолятов A.baumannii,исследованныхнами,сталапродукцияОХА-40-подобнойкарбапенемазы OXA-72: ген blaOXA-72 был выявлен у 85% изолятов,представлявших 12 из 15 Oxford-сиквенс-типов.Молекулярные характеристики клона СС944Oxf/ST78Pas, представленные внастоящей работе, были идентичны описанию двух изолятов A.
baumannii,полученных от пациентов из России немецкими авторами [297]. Эти изолятыпринадлежали к ST78Pas, являлись носителями генов blaOXA-72 и blaCTX-M-115. Крометого, в нашей лаборатории мы выполнили МЛСТ двух карба-Р изолятов A.baumannii, выделенных в двух разных стационарах г. Перми в 2014. Эти изолятытакже принадлежали к СС944Oxf/ST78Pas (изоляты №945 и 946 в базе данныхМЛСТ A. baumannii) [93]. Отсюда следует, что клон СС944Oxf/ST78Pas,являющийся носителем генов ОХА-40-подобной карбапенемазы blaOXA-72 и βлактамазы расширенного спектра blaCTX-M-115, может быть эндемичным для карбаРA. baumannii в России.Механизмы, которые способствуют приобретению и распространениюопределенных групп OXA-карбапенемаз, остаются неясными. Генетическое160окружение и характеристики плазмид гена blaOXA-40 отличаются от таковых угенов blaOXA-23 или blaOXA-58.
В частности, blaOXA-40-подобные гены локализуются нетолько на хромосомах, но и на самопередающихся (self-transmissible) плазмидах,что обеспечивает возможность для горизонтального распространения этих генов.Кроме того, экспериментально было показано, что кодируемые плазмидамиblaOXA-40-подобные гены могут секретироваться в составе бактериальных везикул(экзосом), образованных наружной мембраной [147].Наконец,плазмиды,несущиеblaOXA-40,содержатгенысистемытоксин/антитоксин, что предполагает их стабильность. Таким образом, высокаятрансмиссивность плазмид, содержащих blaOXA-40-подобные гены, в сочетании сих стабильностью может объяснить появление и распространение различныхгенотипов A.
baumannii, продуцирующих OXA-40-подобные карбапенемазы.Наши данные о выраженном разнообразии генотипов (12 различных Oxfordсиквенс-типов) среди изолятов, несущих blaOXA-40-подобный ген blaOXA-72,поддерживают эту гипотезу.Помимо устойчивости к антимикробным препаратам, распространениюэпидемически значимых клонов A. baumannii могут способствовать другиесвойства бактерий. Так, устойчивость к высыханию, повышенная способность кэпителиальнойадгезиивсочетаниисозначительнымпотенциаломкбиопленкообразованию поддерживали циркуляцию и персистенцию подобныхклонов в госпитальной среде [189].
Наши результаты не показали значимыхотличий по биопленкообразованию у карба-Р и внеклональных карба-Ч изолятовA.baumannii.Этопредполагаетограниченныйвкладспособностикбиопленкообразованию в клональную экспансию карба-Р A. baumannii.В заключение, наши данные показали доминирование двух клонов средикарба-Р изолятов A. baumannii в г. Москве. Один из них, СС92Oxf/СС2Pas,распространен по всему миру. Второй клон, СС944Oxf/ST78Pas, несущий геныblaOXA-72 и blaCTX-M-115, может оказаться эндемичным для московского региона и,возможно, для России в целом. Таким образом, не исключено, что отдельныеклоныA.baumannii,обладающиеподходящимгенетическимфоном,161спорадически возникают и независимо эволюционируют на разных территориях,приобретая дополнительные конкурентные преимущества, например, генырезистентности.
Очевидно, что такие клоны могут распространяться как внутристраны, так и между странами. Для мониторирования изменений эпидемиологиикарба-РA. baumannii и улучшения контроля за распространением этих опасныхбактерий необходимы дальнейшие исследования.K. pneumoniaeВ нашей работе мы исследовали профиль антибиотикорезистентности имеханизмы устойчивости у госпитальных штаммов K. pneumoniae, полученных вдвух детских ОРИТ в Москве. Все исследованные карба-Ч и карба-Р изолятыбыли резистентны к цефалоспоринам III-IV поколений, что совпадает с даннымиисследования МАРАФОН (2013-2014 гг), которое сообщало о 90% клебсиеллрезистентных цефалоспоринам [82]. Доля клебсиелл, устойчивых к карбапенемам,составила 83%. Распространённость устойчивых к карбапенемам штаммов K.pneumoniae, выделенных в 2004-2012 гг. в детских стационарах Европы, непревышала 1-3% [228].
Таким образом, наши данные указывают на то, что запоследние несколько лет частота устойчивости K. pneumoniae к карбапенемамзаметновозросла,особенновдетскихОРИТ.Основныммеханизмомустойчивости к карбапенемам стала продукция карбапенемазы OXA-48. Ееносителями были 76% исследованных карба-Рштаммов, и 8% изолятов K.pneumoniae, относящиеся к категории карба-Ч.
В подавляющем числе случаевкарбапенемаза ОХА-48 сочеталась с БЛРС CTX-М и/или ТEM. В исследованииМАРАФОН нечувствительность к карбапенемам у K. pneumoniae также былаобусловлена наличием OXA-48 (14,5%) [82].Наши данные показали доминирование среди карба-Р изолятов K.pneumoniae четырех сиквенс-типов: ST395, ST307, ST49 и ST377. ST395, несущийген blaOXA-48, распространен в Европе [305, 236]. ST307 впервые былзарегистрирован в базе данных МЛСТ в 2008 году, и за последние годы широко162распространился во многих странах [364]. Первоначально он был связан спродукцией глобально распространенной БЛРС CTX-M-15.
В нашей работеизученные ST307-штаммы имели такой генотип в сочетании с OXA-48.В ходе исследования нами были выявлены два штамма K. pneumoniae ST11,относящихся к категории карба-Ч изолятов, который относится к CG258 (SLVST258). В базе данных МЛСТ K. pneumoniae среди относившихся к ST11 (n=206)изолятовбылозарегистрированонесколькоштаммов-носителейKPC-2,выделенных в странах Южной Америки.В 2011-2013 гг.
были зарегистрированы первые сообщения о появленииштаммов-носителей МБЛ NDM в России. В этот период в Санкт-Петербурге быливыявлены множественные случаи инфекций, вызванные K. pneumoniae, несущимиNDM-1; большинство таких изолятов относилось к ST340 [107, 4]. В нашей работештаммы K. pneumoniae ST340 обнаружены не были.
У трех изолятов разныхсиквенс-типов ST307, ST147 и ST461 ген blaNDM был выявлен в качествеединственной детерминанты резистентности к карбапенемам или в комбинации сдругимигенамикарбапенемазиБЛРС,чтообуславливалофенотипмножественной устойчивости к антибиотикам.Снижение активности β-лактамов в отношении K. pneumoniae отмечается сначала 2000 гг. [67] и обусловлено продукцией β-лактамаз различных типов,включая CTX-M, TEM, SHV, а также их комбинаций [163, 75, 65], чтоподтверждают и наши данные. Сочетание носительства карбапенемаз и БЛРСформирует МЛУ-фенотип и существенно ограничивает выбор препаратов дляэффективного лечения инфекций, вызванных K.
pneumoniae.Как показало наше исследование, наибольшую активность в отношениикарба-Рштаммов K. pneumoniae проявлял тигециклин, относящийся к группеглицилциклиновдолянечувствительныхизолятовнепревышала18%.Тигециклин становится препаратом «последней надежды» для лечения инфекций,связанныхсполирезистентнымивозбудителями,чувствительность к этой группе препаратов [218].сохраняющими163Таким образом, в последние годы появились и распространились изоляты K.pneumoniae, обладающие МЛУ и сложными сочетаниями молекулярныхмеханизмов резистентности.
Циркуляция таких штаммов сильно сужает спектримеющихся антимикробных препаратов, особенно в ОРИТ, и несет в себе угрозудальнейшего распространения антибиотикорезистентности. Все вышесказанноедиктует необходимость проведения постоянного мониторинга фенотипических игенотипическихмониторингасвойствдинамикивозбудителейивнутрибольничныхраспространенияинфекций.резистентностиштаммовДляK.pneumoniae необходимо проведение дальнейших многоцентровых исследований санализомклональнойструктурыпопуляциииизучениемгенетическихособенностей резистентных изолятов. Полученные результаты будут полезны дляпланирования и модификации схем эмпирической антимикробной терапии упациентов педиатрических ОРИТ.P.
aeruginosaВ настоящей работе мы проанализировали клональную структуру карба-Ризолятов P. aeruginosa, полученных в двух педиатрических стационарах г.Москвы. В исследованной популяции отмечалось большое разнообразиегенотипов, включавшее 21 индивидуальный сиквенс-тип, однако доминировалонебольшое число международных клонов высокого эпидемического риска ST111,ST235, ST654 и ST357 (последний был представлен впервые описаннымоднолокусным вариантом ST2592).Ведущим генотипом в исследованной нами выборке стал ST654, которыйприсутствовал в обоих стационарах и в целом составил долю в 30%. Все ST654изоляты являлись носителями blaVIM.
Этот сиквенс-тип относится к числумеждународных клонов, хотя его распространенность ограничена по сравнению сST111 и ST235 [383]. ST654 появился в циркуляции не позднее 2006 г. и описан вВеликобритании, Польше, Франции и Сингапуре, для которого данный генотип164эндемичен [323] Единичные изоляты ST654 были импортированы в Швецию (какпредполагается, из Туниса) и Канаду (изолят от пациента, находившегося надлительном лечении в Индии) [204, 216]. В цитированных работах описаны ST654P. aeruginosa с различными типами МБЛ, включая IMP, КРС, NDM и VIM.
Внашей выборке ST654-изоляты впервые получены в 2013 г. в стационаре С1, а в2014г.появилисьвС2,ставнаиболее распространеннымгенотипомисследованных карба-Р P. aeruginosa.В ходе работы мы выявили новый ST2592, который является однолокуснымвариантом международного клона высокого риска ST357. Клон ST357 получилраспространение в центральной Европе, Дании, Великобритании, Китае, Японии[204, 216, 223, 257]. ST357-изоляты, несущие карбапенемазу IMP-7, доминируют вструктуре МБЛ-продуцирующих госпитальных изолятов P.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
