Главная » Просмотр файлов » Г.Ю. Ризниченко - Лекции по математическим моделям в биологии (2-е издание)

Г.Ю. Ризниченко - Лекции по математическим моделям в биологии (2-е издание) (1117248), страница 55

Файл №1117248 Г.Ю. Ризниченко - Лекции по математическим моделям в биологии (2-е издание) (Г.Ю. Ризниченко - Лекции по математическим моделям в биологии (2-е издание)) 55 страницаГ.Ю. Ризниченко - Лекции по математическим моделям в биологии (2-е издание) (1117248) страница 552019-05-09СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 55)

Так, например, перио- Б. П. Белоусову подическое изменение окраски можно наблюдать в 10 мл водного смертно была присуждена Ленинская прераствора следующего состава: лимонная кислота 2.00 г, сульфат мия. Реакция Белоусоцерия 0.16 г, бромат калия 0.20 г, серная кислота (1:3) 2.00 мл. ва–Жаботинскоговошла в золотой фондВоды до общего объема 10 мл».науки XX века.ЛЕКЦИЯ 17348Жаботи́нский Анатолий Маркович (19382008) — cоветскийи американский биофизик, физико-химик.Один из основателейнелинейной химическойдинамики, исследовали описал с помощьюматематической модели реакцию Белоусова–Жаботинского, лауреат Ленинской премии(1980).

С 1991 годаработал в США.Наблюдать колебания и автоволновые процессы такжеможно в аналогах этой реакции, сконструированных путемзамещения бромата на иодат, лимонной кислоты на малоновую или броммалоновую. В качестве катализаторов вместоцерия могут быть использованы многие другие переходныеметаллы.

Для демонстраций часто используются системы ферроин–ферриин, содержащие ион Fe в комплексе с фенантролином, так как переход Fe(II) → Fe (III) сопровождается изменением цвета с красного на синий. В качестве органическогосоединения чаще всего используется малоновая кислотаHOOCCH2COOH.РЕАКЦИЯ БЕЛОУСОВА–ЖАБОТИНСКОГО349трация [Br–] падает, тем самым снимается блокировка реакции I. Скорость реакции I возрастает, и возрастает концентрация [Ce4+]. При достижении верхнегопорогового значения [Ce4+] концентрация [Br–] также достигает больших значений, и это приводит снова к блокировке реакции I, и так далее (рис. 17.2).ЭкспериментВ замкнутом сосуде при интенсивном перемешивании после короткого индукционного периода возникают колебанияконцентраций [Br–] и [Ce4+].

Типичные экспериментальныекривые представлены на рис. 17.1. Начало колебаний имеетхарактер «жесткого возбуждения». В терминах главы 8, система проходит черезсубкритическую бифуркацию Андронова–Хопфа. Колебания концентрации ионов[Ce4+], регистрируемые на платиновом электроде, имеют постоянную амплитуду.Бромидный электрод фиксирует увеличение амплитуды, максимальное значениеее соответствует разнице концентраций ионов [Br–] на два порядка, форма колебаний несколько меняется с течением времени, период удлиняется до 2 минутчерез 1.5 часа. После этого амплитуда колебаний постепенно уменьшается, онистановятся нерегулярными и очень медленно исчезают.Первая модель наблюдаемых процессов была предложена А. М. Жаботинским.

Рассмотренный им цикл реакции состоит из двух стадий. Первая стадия (I) — окисление трехвалентного церия броматом:Рис. 17.1. Экспериментально наблюдаемые показания, снятые с платинового электрода[Ce4+] (а) и электрода, регистрирующего ток ионов бромида [Br–] (б). Начальные концентрации реагентов: [BrO3–] = 6.25·102 M, [малоновая кислота] = 0.275 M, [Ce(IV)] == 2·10–3 M. Максимальная амплитуда колебаний на электроде — 100 мВ, что соответствует изменению концентрации в 100 раз, период колебаний — около 1 мин [5].−BrO3Ce3+ ⎯⎯⎯→ Ce 4 + (I).Вторая стадия (II) — восстановление четырехвалентного церия малоновой кислотой:Ce 4 + + CHBr(COOH)2 → Ce3+ + Br − + другие продукты (II).Продукты восстановления бромата, образующиеся на стадии I, бромируют МК.Получающиеся бромпроизводные МК разрушаются с выделением [Br–].

Бромидявляется сильным ингибитором реакции. Схема автоколебательной реакции может быть качественно описана следующим образом. Пусть в системе имеютсяионы [Ce4+]. Они катализируют образование [Br–] (стадия II), который взаимодействует с частицами Y реакции I и выводится из системы.

Если концентрация [Br–]достаточно велика, реакция I полностью заблокирована. Когда концентрация ионов [Ce4+] в результате реакции II уменьшится до порогового значения, концен-Рис. 17.2. Схема автокаталитической реакции окисления малоновой кислоты (МК).ЛЕКЦИЯ 17350РЕАКЦИЯ БЕЛОУСОВА–ЖАБОТИНСКОГО351Локальные модели. Поведение концентраций реагентовво времени. Модель ЖаботинскогоПредложенная В. М. Жаботинским для описания процесса модель [14] включает три переменных: концентрацию ионов [Ce4+] (x), концентрацию автокатализатора стадии I — промежуточный продукт восстановления бромата до гипобромита (y) и концентрацию бромида — ингибитора стадии I (z).Схема процессов представляется в видеВ модели учитывается, что общая концентрация ионов церия является постоянной величиной: [Ce4+] + [Ce3+] = с. Предполагается, что скорость автокаталитической реакции пропорциональна концентрации [Ce3+].

Модель для безразмерныхконцентраций имеет видdx= k1 y (c − x) − k3 x,dtdy= −k1 y (c − x) − k2 yz + k5 ,dt(17.1)dz2= k3 x + k6 ( k7 y − k8 ) x − k4 z ,dtгде k1 = k1´ – k3, а член k6(k7y – k8)2x подобран эмпирически таким образом, чтобыпороговые значения x в модели соответствовали экспериментальным значениям.Учет иерархии констант скоростей реакций позволяет заменить дифференциальное уравнение для переменной z алгебраическим и после введения безразмерных переменных прийти к системе двух уравнений:dx= y (1 − x) − δ x,dt{}Рис. 17.3. а) Фазовый портрет системы (17.2).

Пунктиром обозначены нуль-изоклины,жирной линией — предельный цикл; x — безразмерная концентрация ионов Се4+, y —безразмерная концентрация автокатализатора — быстрая переменная. б) Кинетика концентрации ионов Се4+ — релаксацонные колебания. N, M — наименьшее и наибольшеезначение переменной, Т1, Т2 — время нарастания и убывания концентрации ионов Се4+ ,Т — период колебаний [14].(17.2)dy2ε= y 1 − x ⎡1 − α + ( y − α ) ⎤ + c.⎣⎦dtВ уравнениях (17.2) ε — малый параметр, поэтому форма колебаний — релаксационная. Фазовый портрет системы представлен на рис.

17.3а. На рис. 17.3бпоказаны колебания переменной x, соответствующей безразмерной концентрацииионов Се4+.Модель «орегонатор»Недостатком модели Жаботинского является наличие переменной y — «автокатализатора», не соответствующего какому-либо реальному химическому соединению. Впоследствии были предложены несколько моделей, описывающихмеханизм BZ-реакции. Наиболее популярной из них является схема реакции,предложенная Филдом, Керешем и Нойесом [3], состоящая из 10 реакций с семьюпромежуточными соединениями.

Позже Филд и Нойес [4] предложили болееЛЕКЦИЯ 17РЕАКЦИЯ БЕЛОУСОВА–ЖАБОТИНСКОГОпростую схему, получившую название «орегонатор» по имени университета штата Орегона (США), в котором она была разработана. Схема реакций имеет видk3k1k2A + Y ⎯⎯→ X, X + Y ⎯⎯→ P , B + X ⎯⎯→ 2X + Z ,k4k52X ⎯⎯→ Q , Z ⎯⎯→ fY(17.3)Здесь А, B — исходные реагенты, P, Q — продукты, X, Y, Z — промежуточныесоединения: HBrO2 (бромистая кислота), Br– (бромид-ион), и Се4+.Концентрации исходных реагентов полагают в модели неизменными.

Обозначим малыми буквами переменные, соответствующие концентрациям реагентов, и запишем уравнения для их изменений во времени в соответствии с закономдействующих масс:dx= k1ay − k2 xy + 2k3bx − k4 x 2 ,dtdy= −k1ay − k2 xy + fk5 z ,(17.4)dtdz= k3bx − k5 z.dtЧисленные значения констант скоростей прямых реакций были оценены авторами из экспериментальных данных.

Их значения:Анализ устойчивости этого стационарного состояния [4] позволил найти область,в которой решение (17.8) теряет устойчивость. Бифуркационная диаграмма системы для плоскости параметров f, k5 приведена на рис. 17.4 а; на рис. 17.4 б показана форма колебаний переменной. Значения параметров приведены в пояснениик рисунку.352353[A] = [B] = 0.06 M,k1 = 1.34 M/c, k2 = 1.6·109 M/c,3(17.5)7k3 = 8·10 M/c, k4 = 4·10 M/c.Стехиометрический множитель f и константу k5, параметры, связанные с расходом реагентов, варьировали.Безразмерная форма записи модели орегонатор имеет видdx= s ( y − xy + x − qx 2 ),dtdy − y − xy + fz=,(17.6)dtsdz= w( x − z ).dtЗдесь безразмерные концентрации: x — [BrO2], y — [Br–], z — концентрация ионаметалла, параметр f рассматривали в диапазоне 0 < f < 2 [4].Система (17.6) может иметь нулевое стационарное состояниеx = 0, y = 0, z = 0,(17.7)которое всегда неустойчиво, и одно положительное стационарное состояние:x=1− f − q +f xy=,1+ x(1 − f− q ) + 4q( f + 1)2qz = x.2,(17.8)Рис.

17.4. а) Область устойчивости А и неустойчивости Б положительного стационарного решения (17.8) модели орегонатор (17.4), (17.6). б) Высокоамплитудные колебанияпеременной x. Значения параметров: s = 77.27, q = 8.375·106, w = 0.161 k5 [4].Соотношение параметров в системе таково, что имеет место иерархия характерных времен изменения переменных (см. лекцию 6). Из рис. 17.4б также видно,что x — быстрая переменная, для которой дифференциальное уравнение можетбыть заменено на алгебраическое. Приравняв правую часть первого уравнениясистемы (17.6) нулю, получим:y − xy + x − qx 2 = 0.(17.9)Из уравнения (17.9) получим x как функцию y:x = x( y ) =1− y +(1 − y )2q2+ 4qy.(17.10)Подставим выражение (17.10) во второе и третье уравнение системы (17.6), получим редуцированную модель «орегонатор» из двух уравнений:dy − y − yx( y ) + f z=,dts(17.11)dz= w ( x( y ) − z ) .dt354ЛЕКЦИЯ 17РЕАКЦИЯ БЕЛОУСОВА–ЖАБОТИНСКОГО355Система (17.11) имеет устойчивый предельный цикл большой амплитуды, а внутринего — неустойчивый предельный цикл малой амплитуды (Rinzel and Troy, 1982).Именно в таком (или сходном) виде система уравнений Филда–Нойеса былаисследована многими авторами как локальный элемент распределенной системытипа реакция–диффузия.

В связи с возможностью наблюдать в BZ-реакции в эксперименте различные виды автоволновых режимов, на модели имитировали различные типы воздействий на параметры системы (например, периодическое),рассматривались режимы в двумерной и трехмерной системах при наличии разного рода границ.Пространственно-временные режимы в системеБелоусова–ЖаботинскогоНа рис. 17.5 показана последовательность развития во времени разного родарежимов на поверхности чашки Петри в ходе реакции Белоусова–Жаботинского.В лекции 16 мы говорили, что если локальный элемент системы обладает колебательными свойствами, распределенная система может демонстрировать ведущиецентры (а), спиральные волны (в), сложные пространственно-временные распределения (б, г).На каждой серии рисунков показано последовательное развитие процессов вовремени (Жаботинский, 1975).Встает вопрос: можно ли с помощью внешних воздействий влиять на развитие этих сложных структур во времени и пространстве? Воздействия заключаются в изменении скорости притока конечных и промежуточных веществ в сферуреакции, различных режимах постоянного и периодического освещения, радиоактивном облучении частицами высокой энергии.

Такие исследования имеютбольшой практический смысл. Они позволяют находить способы управления автоволновой активностью и помогают искать режимы воздействия на спиральныеволны в активной ткани сердца, распад которых приводит к фибрилляциям. Действительно, уже в первых аксиоматических моделях активных сред (см. лекцию18) было обнаружено, что если в среде имеется спиральная волна, выход ее «кончика» на границу активной области приведет к затуханию такой волны [15].

Характеристики

Тип файла
PDF-файл
Размер
13,33 Mb
Тип материала
Высшее учебное заведение

Список файлов лекций

Свежие статьи
Популярно сейчас
Зачем заказывать выполнение своего задания, если оно уже было выполнено много много раз? Его можно просто купить или даже скачать бесплатно на СтудИзбе. Найдите нужный учебный материал у нас!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6381
Авторов
на СтудИзбе
308
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее