Главная » Просмотр файлов » Автореферат

Автореферат (1097598), страница 7

Файл №1097598 Автореферат (Компьютерные методы системной биологии в персонализированной лекарственной онкотерапии) 7 страницаАвтореферат (1097598) страница 72019-03-13СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 7)

В экспериментах были обнаружены осцилляции pERK с периодом 20 мин (Рис.12), что согласуется с результатами теоретических расчетов (Рис. 12А). Также в экспериментахна MCF-7 клетках, обработанных CXH, были обнаружены колебания pAKT сигнала спериодом близким к 20 мин (Рис. 12). Синхронизация между осцилляциями pAKT и pERKуказывает на существование связи между RAS/MEK/ERK и PI3K/PTEN/AKT сигнальнымипутями.

Для описания этой взаимосвязи в модели было учтено взаимодействие киназ RAS иPI3K, приводящее к дополнительной активации PI3K киназы (Рис. 1). В результате учета этойсвязи модель воспроизводит осцилляции pAKT сигнала, индуцированные колебаниями pERK,в исходных клетках и усиление колебаний в клетках, обработанных ингибиторомтранскрипции CXH (Рис. 11B).Результаты компьютерных расчетов также показали, что связанные pAKT/pERKосцилляций возникают в системе при повышенном входном сигнале, который формируетсяпри активации рецепторов (Рис. 11C,D, сплошные линии). Установлено, что ингибированиерецепторного сигнала пертузумабом приводит к подавлению осцилляций в системе (Рис.2311C,D, пунктирные линии). С целью экспериментального исследования этого эффекта былипроведены эксперименты на MCF-7/HER2 клетках с повышенной экспрессией HER2рецепторов (клетки трансфецированные HER2 геном). В экспериментах были обнаруженыколебания pERK и pAKT сигналов (Рис.

12B, черные линии), а также подавление колебанийпри действии ингибитора HER2 рецептора, петрузумаба (Рис. 12B, серые линии)Рис. 13. Экспериментальное наблюдение осцилляторных режимов в связаннойPI3K/PTEN/AKT, RAS/MEK/ERK сигнальной сети в MCF-7 и MCF-7/HER2 линиях опухолевыхклеток молочной железы. (A) - экспериментальные данные для pERK (слева) и pAKT (справа)сигналов (черные линии) и осцилляции pERK и pAKT при действии ингибитора транскрипции10 мкМ CXH (серые линии).

(B) pERK (слева) и pAKT (справа) осцилляции в клетках MCF7/HER2 с повышенной экспрессией HER2 рецепторов в отсутствие (черные линии) и вприсутствии 100 нМ пертузумаба, 2С4 (серые линии). Экспериментальные точки полученыв результате оцифровки данных Вестерн-блоттинг анализа для pERK (T202/Y204) и pAKT(S473) в клетках при их активации 1 нМ HRG [10].Таким образом, активация связанных pAKT/pERK осцилляций подтверждаетсуществование положительной связи между RAS/MEK/ERK и PI3K/PTEN/AKT сигнальнымипутями в MCF-7 опухолевых клетках.

Активационный характер колебаний при нарушениигенетической регуляции указывает на роль генетической ООС в подавлении осцилляторныхрежимов в этих сигнальных путях при их активации.В пятой главе представлены результаты по исследованию механизмоврепрограммирования сигнальных систем в результате действия антираковых лекарственныхпрепаратов. В процессе репрограммирования сигнальных системах происходит активациядополнительных сигнальных путей пролиферации раковых клеток, что приводит ккомпенсации ингибирующего действия лекарственных препаратов и тем самым крезистентности к их действию. Компенсаторные сигнальных путей клетки активируются,главным образом, за счет экспрессии генов, находящихся под управлением сигнальной24системы, которая является мишенью данного лекарственного препарата.

В работепредполагалось, что наблюдаемые изменения экспрессии генов при лекарственной терапиимогут быть происходить в результате активации адаптационного ответа клетки налекарственную интервенцию. Исследование подобных компенсаторных механизмов являетсяважной задачей при исследовании приобретенной резистентности к новым ЛП ивозникновения побочных эффектов при их применении.Механизм репрограммирования сигнальных систем был исследован на клеточнойлинии SKOV3 опухоли яичников с высоким уровнем экспрессии ErbB3 (HER2) рецепторовпри действии лекарственных препаратов трастузумаба, пертузумаба и их комбинации.Разработанная модель сигнальных путей применена к анализу in vivo экспериментальныхданных, полученных коллабораторами проекта на опухолях SKOV3 ксенотрансплантатныхмышей.

Измерение объема трансплантатной опухоли в течении 35 дней показало, чтопертузумаб оказывает слабый ингибирующий эффект, трастузумаб существенно замедляетрост опухоли в течении 2 недель, после чего рост возобновляется в то время, как комбинациятрастузумаба и пертузумаба вызывает полную регрессию опухоли (Рис. 14А).Для описания полученных экспериментальных данных было проведено исследованиеответа генетической регуляции клетки на лекарственную терапию. С этой целью проведенстатистический анализ экспрессии генов при действии трастузумаба, пертузумаба и ихкомбинации в экспериментах на SKOV3 опухоли ксенотрансплантатных мышей.Результаты статистического анализа более 12000 транскрипт представлены на Рис.

14Б,где приведены уровни экспрессии для генов со статистически значимым изменениемэкспрессии (р<0.05) по сравнению с контролем при действии пертузумаба, трастузумаба и ихкомбинации. Результаты статистического анализа также представлены в виде диаграмм наРис.14В-Д, на которых приведены уровни экспрессии генов по оси ординат (log2) и р-значенияпо оси абсцисс. Из полученных данных видно, что ЛП и их комбинация по-разному влияют наэкспрессию генов.

Обнаружено увеличение экспрессия гена ErbB3 в 2 и 1.3 раз при действиикомбинации ЛП, и трастузумаба, соответственно. Механизм возрастания экспрессии генаErbB3 при ингибировании pAKT и pERK сигналов заключается в активации фактортранскрипции FOXO, под контролем которого находится экспрессии гена ErbB3.В модели учтено, что повышенная концентрации ErbB2 рецепторов в клетках SKOV3приводит к спонтанной гомодимеризации ErbB2 рецепторов и активации сигнальных путей вотсутствии рецепторных лигандов. Полученные результаты моделирования показали, чтоингибирующее действия трастузумаба, пертузумаба и их комбинации на уровни pAKT и pERKсигналов существенно зависят от отношения концентраций ErbB3 и ErbB2 рецепторов в клетке,ErbB3/ ErbB2 (Рис.

15). Как показали расчеты, при низком соотношении ErbB3/ErbB2(высокий уровень ErbB2 рецепторов) трастузумаб оказывает существенное ингибирующеедействие на pERK сигнал за счет ингибирования лиганд-независимой гомодимеризацииErbB2/ErbB2 рецепторов (Рис. 15А). При возрастании экспрессии ErbB3 рецепторов егодействие на pERK сигнал ослабевает за счет активации сигнала, формирующегося приErbB3/ErbB2 гетеродимеризации. Также в расчетах было выявлено отсутствие действиятрастузумаба на pAKT сигнал. Этот эффект связан со слабой активацией PI3K/AKTсигнального пути по сравнению с активацией RAS/MEK/ERK пути при гомодимеризации25AВDБAГEДРис.

14. (А) Экспериментальные данные по действию трастузумаба, пертузумаба и ихкомбинации на рост опухоли SKOV3 ксенотрансплантатной мыши. (Б) Результатыстатистического анализа экспрессия генов при действии лекарств и их комбинации.Приведены гены со статистически значимым изменением экспрессии (log2) по сравнению сконтролем. (В)-(Д) Экспрессия генов в результате действия трастузумаба (В),пертузумаба (Г) и их комбинации (Д) в образцах опухоли. Результаты измерений уровнейmRNA представлены в виде диаграмм «уровень экспрессии (log2) – р-значение».ErbB2/ErbB2 рецепторов в SKOV3 клетках, что обусловлено отсутствием фосфо-сайтовErbB2 рецепторов для прямого связывания и активации p85 сигнальной субъединицы PI3K.Активация pAKT сигнала в модели происходит в основном за счет гетеродимеризацииErbB3/ErbB2 рецепторов и фосфорилирования фосфо-сайтов ErbB3, являющихся местамисвязывания p85 субъединицу PI3K.На основе проведенных расчетов исследован механизм синергетического действиякомбинации трастузумаба и пертузумаба при ингибировании роста SKOV3 опухоли посравнению с их действием в отдельности.

Показано, что комбинация двух ЛП проявляетвысокую эффективность по отношению к ингибированию pERK как при высокой экспрессии26Рис. 15. Результаты расчетов ингибирующего действия трастузумаба (A), пертузумаба (B)и их комбинации (C) на уровни pAKT (красные линии) и pERK (черные линии) сигналов взависимости от отношения концентраций HER3 (ErbB3) и HER2 (ErbB2) рецепторов вклетке HER3/HER2.ErbB2 рецепторов (низкое отношение ErbB3/ErbB2), так и при повышенной экспрессии ErbB3рецепторов (HER3/HER20.6).

В отличии от действия комбинации ЛП пертузумаб проявляетслабую активность на начальной стадии роста SKOV3 опухоли, клетки которой имеютповышенную экспрессии ErbB2 рецепторов. Его эффективность повышается при возрастанииэкспрессии ErbB3 рецепторов, вызванной действием ЛП. В свою очередь, трастузумабпроявляет высокую эффективность при повышенной экспрессии ErbB2 рецепторов в началероста опухоли и теряет свою эффективность при возрастании экспрессии ErbB3 рецепторов врезультате действия ЛП.Таким образом, комбинация трастузумаба и пертузумаба проявляет высокуюактивность как при повышенной экспрессии ErbB2 рецепторов, которая наблюдается в началероста опухоли, так и при возрастании концентрации ErbB3 рецепторов, вызваннойрепрограммированием сигнальной системы при длительном действии ЛП [20].Чтобы показать, что трастузумаб и пертузумаб проявляют ингибирующий эффект наразных стадиях роста опухоли, в работе было проведено сравнение теоретических расчетов сin vitro экспериментальными данными, измеренными на клеточных популяциях в течении 1часа, когда в клетках не наблюдается сильного изменения экспрессии рецепторов (Рис.

16).Для сравнения были выбраны клетки MCF7 c соотношением HER3/HER21 и MCF7-HER2-18клетки c повышенной экспрессией HER2 рецепторов (клетки трансфецированные HER2геном). Результаты сравнения показали, что пертузумаб эффективен в MCF7 клетках ипроявляет слабое ингибирующее действие для MCF7-HER2-18 клеток, в то время кактрастузумаб проявляет ингибирующую активность в MCF7-HER2-18 клетках и малоэффективен для MCF7 клеток (Рис. 16).Таким образом, в работе установлено, что синергетическое действие комбинациилекарственных препаратов трастузумаба и пертузумаба на ингибирование роста опухоли,образованной клеточной линией SKOV3 рака яичников с повышенной экспрессией ErbB2рецепторов, обусловлено эффективным ингибированием pERK сигнала пролиферации клетокпри изменении экспрессии ErbB3 рецептора в результате репрограммирования сигнальнойсистемы, индуцированного длительным действием лекарственных препаратов.

Характеристики

Список файлов диссертации

Свежие статьи
Популярно сейчас
А знаете ли Вы, что из года в год задания практически не меняются? Математика, преподаваемая в учебных заведениях, никак не менялась минимум 30 лет. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6384
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее