Главная » Просмотр файлов » Автореферат

Автореферат (1097598), страница 8

Файл №1097598 Автореферат (Компьютерные методы системной биологии в персонализированной лекарственной онкотерапии) 8 страницаАвтореферат (1097598) страница 82019-03-13СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 8)

При этомэкспрессия ErbB3 рецепторов является биомаркером эффективного действия пертузумаба вкомбинации [20].27Рис. 16. Сравнение результатов расчетов ингибирующего действия трастузумаба,пертузумаба и их комбинации на pAKT и pERK сигналы с экспериментальными данными,полученными в клетках с различным уровнем экспрессии HER2 и HER3 рецепторов. A, B– сравнение теоретических данных (белые столбцы) для pAKT и pERK при соотношенииHER3/HER2=0.6 с in vivo экспериментальными данными (синие столбцы) для измерений,сделанных в образцах опухоли SKOV3 ксенотрансплантатных мышей.

C, D - Сравнениепри соотношении HER3/HER2=0.1 (столбцы с красной границей) и 1 (столбцы с синейграницей) с in vitro экспериментальными данными для pAKT (C) and pERK (D) для MCF7(красные столбцы) клеток и MCF7-HER2-18 клеток с повышенной экспрессией HER2рецепторов (синие столбцы) [20].В шестой главе представлены результаты применения разработанной моделисигнальных систем к исследованию эффективности действия одиночных и комбинированныхингибиторов протеин-киназ в PI3K/AKT/mTOR/S6K1 сигнальном пути раковых клетках.Рассмотрены ответы сигнальной сети на действия следующих ЛП: ингибитора комплексаmTOR1, рапамицина; ингибитора киназы PI3K, LY294002; и ингибитора двойного действия,BEZ- 235, ингибирующего комплексы mTOR1,2 и PI3K киназу (Рис.

1). Проведеноисследование действия указанных ингибиторов для двух линий раковых клеток яичников:PE04 и A2780 с точечными мутациями и делецией участка PTEN гена.Методами компьютерного моделирования установлено, что действие ингибиторовкиназ определяется наличием отрицательных обратных связей в PI3K/AKT/mTOR/S6K1сигнальном пути. Одна из ООС реализуется за счет активации S6K1 киназы, котораяингибирует киназу mTOR2, что ведет к подавлению рAKT(Ser437) сигнала (Рис. 1). Другаяпетля ООС также формируется за счет активации S6K1 киназы, которая фосфорилируетсубстрат инсулинового рецептора, IRS1, являющийся белком-адаптером, который связываетсяс фосфо-сайтом ErbB2,3 рецепторов и активирует p85 субъединицу PI3 киназы.Фосфорилирование IRS1 приводит к его диссоциации от ErbB2/3 рецепторов и деградации,что вызывает ослабление сигнала в PI3K/AKT/mTOR/S6K1 сигнальном пути и образованиепетли ОСС pS6K1-IRS1-PI3K (Рис.

1).28Результаты расчетов активации PI3K/AKT/mTOR/S6K1 сигнального пути и действиярапамицина на основные сигнальные белки в PE04 и A2780 клетках показали, что активацииpAKT в A2780 клетках более чем в 1.5 раза превышает активность pAKT в клетках PE04. Этосвязано с частичной потерей активности фосфатазы PTEN при мутации гена PTEN в A2780клетках, что ведет к повышению концентрации pAKT за счет аккумуляции PIP3 в этих клетках.Рис.

17. Возрастание pAKT сигнала при действии ингибитора mTOR1 киназы, рапамицина(Rap) в PE04 (А) и A2780 (Б) раковых клетках яичников. Линии 1 и 2 соответствуютрасчетам в отсутствии и присутствии рапамицина, соответственно. Точки –экспериментальные данные, полученные при активации PE04 и A2780 клеток 1 нМ HRG ипри ингибировании 200 нМ рапамицина.Анализ результатов расчетов также показал, что ингибирование mTOR1 комплексарапамицином вызывает существенное ингибирование двух основных его субстратов S6K1 и4EBP1, которое приводит к подавлению трансляции белков в раковых клетках PE04 и A2780.Вместе с тем обнаружено, что рапамицин оказывает активирующее действие на рAKT сигнал(Рис.

17). Это эффект связан с подавлением отрицательных обратных связей ppS6K1-mTOR2AKT и ppS6K1-IRS1-PI3K в результате ингибирования pS6K1 сигнала, вызывает существенноеповышение уровня pAKT при действии рапамицина.В работе также исследовано действие АТР-конкурентного комбинированногоингибитора PI3K и mTOR1,2 киназ, BEZ-235, в PE04 и A2780 клетках. Как показали расчеты,действие BEZ-235 соединяет в себе основные свойства ингибиторов mTOR1 и PI3K. BEZ-235оказывает существенное ингибирующее действие на основные субстраты mTOR1 комплекса:S6K1 и 4EBP1. При его действии не происходит дополнительной активации AKT сигнала,механизмы которой обсуждались выше. Ингибирование PI3K (Kd=1.6 нМ) и комплекса mTOR2(Kd=0.56 нМ) при действии BEZ-235 предотвращает активацию AKT и приводит кэффективному подавлению pAKT сигнала.С целью исследования связи между действием лекарственных препаратов насигнальные пути и рост клеточных популяций раковых клеток был проведен анализэкспериментальных данных по ингибированию роста PE04 и A2780 клеток (Рис.

18А).Согласно результатам анализа экспериментальных данных, полученных коллабораторамипроекта в Центре Исследования Рака Эдинбургского Университета, клетки A2780 обладаютболее высокой скоростью роста по сравнению с PE04 клетками (0.79 1/сут. и 0.27 1/сут). Этосвязано с частичной потерей активности PTEN гена в A2780 клетках, что приводит кповышенной активности AKT, S6K1 и 4E-BP1 киназ, которые подавляют апоптоз клеток и29активируют трансляции многих белков, повышая тем самым скорость пролиферацию клеток.Для оценки влияния данных лекарств на скорость роста PE04 и A2780 клеток были проведенырасчеты относительного изменения скорости роста клеток = (0 − )/0 , где 0 и скорости роста клеток в отсутствии и присутствии ЛП.

Расчеты покали, что относительныеизменение рост клеток при действии данных лекарства на PE04 и A2780 клетки различаютсянесущественно (Рис. 18Б). Анализ экспериментальных результатов также показал, чтоингибитор двойного действия BEZ-235 оказывает наибольший ингибирующий эффект на росткак PE04, так и A2780 клеток по сравнению с другими рассмотренными ингибиторами.Рис. 18. Результаты анализа экспериментальных результатов по ингибированию ростаклеток (А) и относительного изменения скорости роста  (Б) в популяции PE04 и A2780опухолевых клеток при действии ЛП, рапамицина, L294002 и BEZ235.Учитывая высокую степень резистентности многих линий раковых клеток крапамицину в работе анализируется предложенные в клинических исследованиях биомаркерычувствительности к данному ЛП, такие как дополнительная активация AKT и мутации PTENгена.

Исходя из полученных экспериментальных данных (Рис. 18), можно заключить, что, хотяA2780 клетки с PTEN мутацией проявляют повышенную чувствительность к рапамицину (90%ингибирование роста клеточной популяции) по сравнению с PE04 клетками (30%),относительная степень ингибирования скорости роста, , в этих клеточных линиях почтиодинакова (50% и 57% для PE04 и A2780 клеток, соответственно). Также показано, чтодополнительная активация AKT при полной делеции PTEN гена не может служитьбиомаркером эффективности рапамицина, т.к.

указанная активация исчезает при полнойпотере активности PTEN.Также в работе проанализировано влияние ингибирования различных сигнальныхбелков на подавлении роста раковых клеток. Учитывая, что mTOR1 ингибитор, рапамицин,приводит не к ингибированию, а к дополнительной активации рAKT сигнала в PE04 и A2780клетках, в работе делается вывод, что основным механизмом ингибирования роста популяцийPE04 и A2780 опухолевых клеток является подавление активации субстратов mTOR1 киназы,S6K1 и 4E-BP1, которые регулирует процессы трансляции многих белков, обеспечивающихпролиферацию клеток. Ингибитор двойного действия BEZ-235 оказывает наибольшийингибирующий эффект за счет ингибирования S6K1 и 4E-BP1 киназ и подавлениядополнительной активации AKT в результате ингибирования PI3K киназы.В седьмой главе приводятся результаты моделирования клеточной системы регуляцииантиокислительного ответа клетки при действии ингибиторов клеточных рецепторов.

Цель30работы заключалась в исследовании влияния ингибирования выходных сигналов pAKT иpERK на антиокислительную систему (АОС) клетки, которая находится под контролемфактора транскрипции NRF2. В рамках разработанной модели учтено, что киназа pERKактивирует фактора транскрипции, что вызывает увеличению экспрессии NRF2 (см. главу 4).Возрастание pAKT сигнала, в свою очередь, приводит к подавлению деградации NRF2 за счетинактивации киназы GSK3 при ее фосфорилировании киназой pAKT. Этот процесс ведет кнакоплению NRF2 в ядре клетки (Рис. 1). При ингибировании pAKT и pERK сигналов врезультате действия ингибиторов клеточных рецепторов происходит понижение уровня NRF2и, как следствие, снижение активности антиокислительной системы клетки, что приводит квозрастанию концентрации активного кислорода и перекиси водорода H2O2 в клетке.

С цельюисследования механизма регуляции антиокислительного (АО) ответа раковых клеток надействие ингибиторов клеточных рецепторов была развита модель NRF2-сигнальной системы,контролирующей АО ответ в клеточных линиях рака яичников.Рис. 19. Схема модели NRF2-KEAP-зависимой сигнальной системы, контролирующейокислительно-восстановительный баланс клетки.Развитая модель включает в себя 3 системы: сенсорную, генетическую иантиокислительную системы, которые связаны между собой отрицательными обратнымисвязями регуляции (Рис.

Характеристики

Список файлов диссертации

Свежие статьи
Популярно сейчас
А знаете ли Вы, что из года в год задания практически не меняются? Математика, преподаваемая в учебных заведениях, никак не менялась минимум 30 лет. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6384
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее