Главная » Просмотр файлов » Автореферат

Автореферат (1090325), страница 3

Файл №1090325 Автореферат (Структурные и каталитические свойства ферментов перекисного окисления липидов – 1215-липоксигеназ) 3 страницаАвтореферат (1090325) страница 32018-01-18СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 3)

1. ЯМР-спектр двумерной гетероядерной 1H/13C корреляции соединения32.однозначная корреляция между ближними(C-15/H2-16) и удаленными атомами (C-15/H17, C-15/H2-13). Кроме того, наличие трехперекрестныхсигналовуказывалонадополнительную корреляцию в ряду: C14/H2-13, C-14/H-12 и C-14/H2-16.Кислота [3Н8]-17(R)-HETE (30), меченаятритием по четырем двойным связям2, былавпервыеполученакаталитическимгидрированиемсоединения29с3использованиемН2накатализатореЛиндлара в бензоле с высокой удельнойактивностью(175-180Ки/ммоль)ирадиохимической чистотой более 98%. Вслучае предшественника rac-(16)-HETE (18)введение метки по всем тройным связям неприменялосьиз-занеобходимостиприменения ВЭЖХ для отделения побочногопродукта 24, а так же дальнейшегохроматографического разделения рацематаРис.

2. Разделение энантиомеров мети- на оптически активные соединения 21a,b иловых эфиров rac-16-НЕТЕ (21) и ее 25a,b. Энантиомероы метиловых эфиров 16моноацетиленового предшественника (25)с использованием колонки Chiralpack AD в НЕТЕ (21) и его 14,15-дегидроаналога 25системе растворителей: н-гексан/метанол получалиразделениемрацемических(98:2; по объему).смесей с использованием хирально-фазовойВЭЖХ (рис. 2). Масштабирование хроматографической методики позволяло выделитьоптически чистые энантиомеры 16-НЕТЕ (оптическая чистота >99%) в количественескольких десятков миллиграмм. Конфигурацию асимметрической ОН-группыподтверждали измерением угла оптического вращения с последующим сравнениемэкспериментальных данных с литературными.

Для определения конфигурациихирального центра в соединениях 25а и 25b использовали гидрирование энантиомеров всоответствующие тетраеноаты, идентичные соединениям 21а и 21b. 17(S)-НЕТЕ (33b) иее моноацетиленовый аналог (34b) получали на основе (R)-энантиомера инверсиейхирального центра с использованием реакции Мицунобу.В силу того, что высокая удельная радиоактивность [5,6,8,9,11,12,14,15-3H8]-17(R)НЕТЕ (30), необходимая для ряда биологических исследований, затрудняет ееиспользование при проведении дальнейших модификаций в препаративном масштабе,14,15-дегидро-16- (26) и 14,15-дегидро-17-НЕТЕ (34) были выбраны в качествепредшественников азидов. Введение азидогруппы проводили через соответствующие птолуолсульфонаты, что приводило к инверсии хирального центра.

Синтез через бромидысохранял исходную конфигурацию асимметрического центра исходного и конечного2Введениерадиоактивной метки проводили в Институте молекулярной генетики РАН.11продукта, однако замещение бромида на азид происходило не полностью. Важноотметить, что каталитическое восстановление тройной связи в азидах 38 на катализатореЛиндлара в сухом бензоле не затрагивало азидогруппу, тогда как использованиеметанола приводило к восстановлению азида в амин. Кислоты [14,15-3Н]-17-N3-ЕТЕ (39а и39b) были получены с высокой удельной активностью ~40 Ки/моль и по своим свойствамидентичны немеченым производным 36а и 36b.

Использование энантиомеров 16-НЕТЕ(21) и их 14,15-дегидроаналогов (25) в рамках предложенной схемы приводило кобразованию лишь следовых количеств целевых продуктов вследствие низкойстабильности и высокой реакционной способности аллильных и пропаргильных азидов.1.1.3. Синтез терминальных и 2 субтерминальных замещенныхпроизводных арахидоновой кислоты. В основу синтеза новых азидопроизводных 46 иих меченых тритием аналогов 47 положена методология, разработанная для соединений22 и 33 (Схемы 3 и 4). rac-(5Z,8Z,11Z,14Z)-19- (44b) и rac-(5Z,8Z,11Z,14Z)-18- гидроксиСхема 5Условия: (a) CBr4, PPh3, CH2Cl2, 20oC, 1 ч; (b) 8, CuI, NaI, K2CO3, ДМФ, 20oC; (c) H2 /3H2катализатор Линдлара, бензол, 10oC; (d) NaOH, MeOH-H2O, 20oC; (e)TsCl, CH2Cl2, Py,20oC, 24 ч; (f) NaN3, ДМФ, 75-80 oC, 3.5 ч-5,8,11,14-эйкозатетраеновые (44а) кислоты использовались в качестве ключевыхпромежуточныхсоединений(Схема5).(5Z,8Z,11Z,14Z)-20-гидрокси-5,8,11,14эйкозатетраеновая кислота (44с) была использована в работе без дальнейшихмодификаций.

Из соображений безопасности введение азидогруппы в молекулурадиоактивно-меченых гидроксикислот 45 [радиохимическая чистота >95% и удельнаярадиоактивность в 160 Ки/моль] проводилось с использованием образцов разбавленныхнемечеными аналогами 44 в соотношении 1:100. Конечные продукты 47 были получены свыходом ~26% по 2-м стадиям с удельной радиоактивностью в интервале 0,79 - 1,612Ки/моль. Идентичность радиоактивно-меченых соединений 47 их немеченым аналогам 46показана с помощью аналитической ВЭЖХ.1.2. Синтез зондов активного центра на основе ингибиторов r12/15-LOXИспользованиеингибиторовявляетсяраспространеннымподходомприисследовании каталитического центра фермента, связывающих доменов регуляторныхбелков и пр. С целью изучения механизмов взаимодействия в ряду r12/15-LOX–лигандбыли получены новые соединения 48-52, дизайн которых основан на сходстве сРис. 3.

Структуры ингибиторов r12/15-LOХизвестными ингибиторами 5-LOX и r12/15-LOX (рис. 3), таких как целутон (53), эбселен(54) и салициловая кислота (55). (Z)-Изомер метилового эфира 2-бензилиден-3-оксо-2,3дигидробензо[b]тиофен-7-карбоновой кислоты (BODTCM) (48а)3 получали реакциейтиондоксила (56) с бензальдегидом (57) (Схема 6). Облучение раствора (Z)-BODTCM вДМСО при 405 нм приводило к изомеризации двойной связи с образованиемфотостационарной смеси (pss). Определения количественного соотношения Z- и Eизомеров в смеси pss (Z:E=38:62) проводили с помощью 1Н-ЯМР-спектроскопиисравнением интенсивности сигналов винильных протонов с химическим сдвигом =7,96 и=7,73 м.д. для Z- и E- изомеров, соответственно.

(Е)-BODTCM (48b) выделялиразделением смеси pss препаративной ВЭЖХ. УФ-спектры каждого из изомеров 48а и48b характеризовались наличием двух максимумов поглощения при 320 и 436 нм, и 320 и455 нм, соответственно.Схема 6Условия: (a) бензальдегид (57), 4М HCl в диоксане, 20oC; (b) MeOH, 70oC, 1,5ч; (c) облучение при 405 нм.3Выполненосовместно с Институтом химии Технического университета г.

Берлин, Германия.13Соединения, содержащие связи типа Se-N, Se-O, помимо связывания с активнымцентром фермента (прямое ингибирующее действие), обладают также редокспотенциалом и, следовательно, могут оказывать непосредственное воздействие настепень окисления каталитического железа,Схема 7восстанавливая фермент в его неактивнуюFe2+-форму. С целью создания новыхпотенциальныхселеносодержащихингибиторовLOX,обладающихвосстанавливающими свойствами, предложенсинтез 5-селенопроизводных салициловойкислоты49-52сиспользованиемтетрахлорида селена (Схема 7). Водныйгидролиз промежуточных 5-арилтрихлоридовселена, полученных в мягких условияхприводил к образованию 5-арилпроизводныхселенистой кислоты (50c-e) и/или ангидридов(49a-b). Следует отметить, что только вслучае,когдамонозамещенныеамидысалициловойкислоты(55)содержали(a) SeCl4, TГФ, 20oC, 1 ч; (b)свободную карбоксильную группу, в реакции Условия:oH2О, 20 C, 24ч; (c) SeCl4, TГФ, 70oC, 1 ч.образовывались соответствующие ангидриды49a-b (Схема 7).

Эти данные свидетельствовали о возможности протекания такназываемой спонтанной этерификации в присутствии заместителя, содержащегосвободную карбоксильную группу, что косвенно подтверждалось данными массспектрометрии высокого разрешения соединения 50e, для которого массовое число (m/z264,96031), соответствующее молекулярному иону метилового эфира, было получено прииспользовании метанола в качестве растворителя. В более жестких условиях прикипячении в ТГФ промежуточные 5-трихлорселенильные производные салициловойкислоты разлагались с образованием смеси так называемых «желтого» диселенида 51 и«белого» моноселенида 52, которые разделяли с помощью флеш-хроматографии.

Всесоединения были выделены в кристаллическом виде, охарактеризованы спектральнымиданными, включая 77Se-ЯМР, физико-химическими константами и даннымирентгеноструктурного анализа (для соединений 50c-e).2. Изучение взаимодействия r12/15-LOX с лигандом2.1. Исследования r12/15-LOX с использованием аналогов их природных субстратов2.2.1. Введение фотоаффинной метки в r12/15-LOX. В основу разработаннойстратегииисследованияструктурныхэлементовфермента,непосредственновзаимодействующих с молекулой ПНЖК, положен принцип подобия структур природногосубстрата LOX – АК и синтезированных азидо-ETE. Кинетический анализ параметровокисления фотоаффинных зондов 36 и 46a-b показал, что параметры окисления5Выполненов Институте биохимии Медицинского университета Charité, г.

Берлин, Германия14Рис. 4. Введение фотоаффинной метки в r12/15-LOX с использованием азидопроизводных АК. (А) Кривые окисления фотоаффинных зондов под действием r12/15LOX; (Б) Анализ продуктов окисления 19-азидо-ETE методом ВЭЖХ; (В) Введениефотоаффинной метки в r12/15-LOX на основе [3H8]-19-азидо-ETE (47b); (Г) ВЭЖХ анализ19-азидо-ETE; (Д) Хроматограмма пептидов протеолитического расщепления меченойr12/15-LOX под действием трипсина; (Е) Распределение радиоактивности по фракциям.19-азидо-ETE (46b), КМ* 10,9 мкМ и kcat 20 с-1, наиболее близко сопоставимы схарактеристиками, полученными для АК (рис. 4А)6.

Анализ ВЭЖХ продуктов окислениясоединения 46b позволил обнаружить образование основного продукта с максимумом6Вработе использовались природная r12/15LOX, выделенная из клеточной суспензии кровикролика, обогащенной ретикулоцитами (Rapoport S.M. et al. J. Biochem.

1979, V. 96, P. 545–561), атакже рекомбинантные препараты (фермент дикого типа r12/15LOX и мутанты). Рекомбинантныепрепараты, содержащие 6-His ТАГ, получали экспрессией фермента в Escherichia coli,обогащением ферментных фракций на смоле Ni-NTA (Quiagen) с последующей очисткой методомжидкостной экспресс-хроматографии белков (FPLC) на анионно-обменных смолах и гельфильтрацией.

Чистота полученных препаратов составляла >98%.15поглощения при 235 нм (рис. 4Б), характерным для сопряженного диенового хромофора с(Z,E)-конфигурацией. Присутствие незначительных количеств побочного продукта современем удерживания 9,9 мин и максимумом поглощения при 231 нмсвидетельствовало о наличии (Е,Е)-геометрии двойных связей в его структуре.

Хотя, вслучае 17-азидо-ЕТЕ (36) и 18-азидо-ETE (46а) основная доля продуктов окисления исодержала ОН-группу при C-15, наличие ряда побочных изомерных продуктовсвидетельствовало о более низкой степени субстратной специфичности реакции. Такимобразом, на основе высокого субстратного сходства с АК 19-азидо-ETE и ее меченныйтритием аналог (46b и 47b) были выбраны в качестве зонда для введения фотоаффиннойметки. В целях оптимизации процесса (рис.

Характеристики

Список файлов диссертации

Свежие статьи
Популярно сейчас
Почему делать на заказ в разы дороже, чем купить готовую учебную работу на СтудИзбе? Наши учебные работы продаются каждый год, тогда как большинство заказов выполняются с нуля. Найдите подходящий учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6374
Авторов
на СтудИзбе
309
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее