Frenkel, Smit - Understanding molecular simulation - 2002 (523144), страница 88
Текст из файла (страница 88)
В]аЬ |с де1в а соп(пЬибоп $/М, (гоп| а д)чеп ра$г (1, |), вгпеге М, [в йе 1о1а! пигпЬег о1 в)аЬв вЫсп )п1егвес$ й1в Ипе. И сап Ье впочгп йа1 йе бе$!и!1!оп о$ йе 1п1ебас|а) 1епвюп (7) $в (гее 1гогп ап|Ь|диИ1ев [497]. Тпе |п(ег1ас1а$1епв!оп сап Ье са$си)а1еб Ьу |п1едгабпд йе б!$(егепсе о$ йе погп|а! апб 1апдеп11а) сотропеп1в о1 йе ргеввиге 1епвог асговв йе !п1ебасе.
|п йе саве о$ оиг вув1егп чг1й Ьчо 1п)ебасев,у геабв (17.1.15) Тпе (ас1ог -' соггес1в йе (чго 1п16(асев вге паче Ьесаиве о$ йе рег1осИс Ьоипбагу сопб!1юпв. !п р(доге 17.2, ||че паче р)о(геб йе виг(асе 1епвюп о1 йе вув1егп ав а 1ипс1юп о1 1егпрега1иге. С1еаг|у, йе виг(асе 1епвюп с$есгеавев ||ч]1Ь |псгеав1пд 1етрега1иге. С!ове 1о йе сг!1!са) ро1п1, йе с$пч)пд 1огсе $ог йе (оггпабоп о1 а виг(асе (виг(асе 1епвюп) !в чегу !оа апб йеге(оге И $в по1 ровв1Ые 1о 1опп ап 1п1ег(асе с!ове 1о йе сг!1(са) ро1п1. 17.1 Резст)р6ои оЕ йе Тес)гп))ие 0.6 оа 0.6 2 ~- 04 '- 0.З 02 04 0.5 0.6 Н4т 0.0 0.З Р)8иге 17.2: Биг)асе 1епяоп аз а Еипс6оп оЕ Еетрега)иге.
17.1,3 ]:1Р]Э апс] Епегду СопвегчаЕ)оп 0164 = ~' кц [ — — — / 40[гц)й+ ~' Ец, )'1 1 ) г ) ) (17.1.16) зчЬеге го[т) 15 а Еипс6оп г)егепп)п)пд 1Ье гап8е оЕ )п))иепсе Ъепчееп раг6- ТЬе пате 01)аярабче раг6с1е г)упаписз ипр))ез )Ьа1 г)иг)п8 а 5)ти)а6оп епег8у 15 йаяра1ей ТЬе Еасг ЕЬаг епег8у 15 по) сопзегчес) |п а РРР япш1а6оп сап Ье а йзас)чап)а8е Еог зоте арр1)са6опя Рог ехатр1е, 6 зче Ьаче а зуз1ет )п МпсЬ 1Ьеге 15 а Еетрегагиге 8гайеп6 зисЬ а )етрегаШге 8гайеп) сап оп1у Ъе зиз!атес) аг66с|а)1у |п а РРР япш1а6оп [489].
А зо1и6оп )о ЕЫ5 15 1о )п1гос1исе ап ас)616опа) чапаЫе сЬагас)ег)гт8 ЕЬе 1п1егпа1 епег8у 1п а РРР япш!а6оп [499, 500]. То 6из епй 4че аааос)а)е 4ч))Ь ечегу РРР раг6с!е ап тгегпа)-епег8у "гезегчо)г." Ппз гезегчо)г аЪзогЬ5 ог ге1еазез 1Ье епег8у ЕЬа) зчои)6 погта))у 8о т)о )Ье т)егпа) г)е8геез оЕ Егеег)от оЕ ЕЬе дгоир оЕ пю1еси)ез ЕЬа) аге гергезепЕег) Ьу а яп8)е РРР рагбс1е. Риг)п8 а со!!1яоп )Ье епег8у оЕ )Ь|з гезегчо!г сап )псгеазе ог с)есгеазе. ТЬе т)егпа) епег8у оЕ а РРР раг6с1е 15 с)епо)ег) Ьу 6,. ХНЬ ЕЫ5 чап'- аЪ)е зче сап аззос!а)е ап епггору чапаЫе з, = 5 [6,) апс) Еетрега)иге Т; = [дз;/дег] '. ТЬе пех) 5)ер 15 )о т)гог)исе ап ес)иа6оп оЕ пю6оп Еог 6из |п)ета1 епег8у. ТЬеге аге Пчо ргосеззез ЕЬа1 сап сЬап8е ЕЬе )п)ета1 епег8у.
ТЬе 6гз) )5 "Ьеа) сопс)ис6оп" саизес) Ъу 1етрега1иге йЕЕегепсез Ье)4чееп Ьчо раг6с!ез. ТЬе зесопс1 15 "ч)зсоиз Ьеа6п8" 01ие )о ЕЬе Ег)06опа) Еогсез. 11 )Ье РРР раг6с1ез аге а) ге56 )Ье 6те 0)ег)ча64 е оЕ ЕЬе т)егпа) епег8у 15 8)чеп Ъу СЬаргег ! 7. Ргвв(раг(ее Рагйс!е Рупат(св 474 с)ев. Егц [в а гапбот Ьеаг йих 1Ьаг оссигв вропгапеоив1у Ъесаиве о! 1Ьеппа1 йис1иа6опв. ЪЧе сап аввос(аге а 1о1а1 тесЬап)са1 епегйу 1о а вув1егп о! РРР рагйс!его Е -=~ 1((гц)+~- Ичг. 1 г !! ее сопв1бег йе сЬапйе $п тесЬагбса1 епегйу, ап тсгеаве $п 1Ье ро1епба1 епегду в ои1б Ье сотрепвагеб гч$1Ь а бесгеаве )п 1Ье ]бпейс епегду $! йеге и~еге по б(вв!раиче апб гапбот Еогсев.
Хе пои ппрове 1Ьа1 1Ье вит о! йе $пгегпа1 епегду апб 1Ье тесЬагбса! епегду $в сопвгап1: бЕ=бЕ „+б2 е,=0. ТЫв ппр)!ев 1ог йе 6те бег! чабче о! йе !пгегпа! епегйу: бе, = — ~~ [усе~(тц)(чц 1г!)г — ггг(иР(гц))г] 61 2 ! — ого~(гц)(уг! чц)йц ! (17.1.17) ТЬе 1о1а1 епегду сЬапде $в а сотЬ(пайоп о! сопчесйоп (17.1.16) апб ч(всоив Ьеайпд (17.1.17). Рог г1е1айв оп 1Ье !тр(етепга1$оп о1 $6еве тегЬобв, 1Ье геабег (в ге!еггеб го ге(в. [499-504].
Вхагпр1е 27 (Нубгодупагп!св апд РЬаве Верагайоп) В)ос)г соро)угпегв гевегпЫе виг!ас1ап(в $п йе вепве йа1 Ьчо спет(са))у сИ- !егеп1 ип(1в, вау А апб В, аге $!п)геб 1одейег Ьу а спеппса! Ьопб. $! йе $п(егас1юпв Ьегаееп йеве ипйв аге чегу б)йегеп1, йе вув1егп ччои)б рпаве верага1е ччеге й по1 (ог йе !ас1 йа1 ас$)асеп1 ипйв аге соппес(ес$ Ьу спегп)са) Ьопбв. Новчечег, опе ойеп оЬвегчев т)сгорпаве верага1юп $п висЬ вув1егпв йа1 гевийв )п а гп)сговсор)с 1ех1иге о! а)1егпабпд А-псЬ апб В-г)сЬ богпа(пв. ТЬеве бота(пв сап йеп аггапде $п1о $агдег-вса)е вггис1игев висЬ ав врпегев, гобв, впее1в, апб ребога1еб впее1в, ог ойег, тоге сотрдса(ес$, вропде-$$)ге в1гис(игев.
ТЬе бупагп)св о(1Ье !оггпа1юп о! йеве ггпсгов1гис1игев Ьав Ьееп в(иб)еб ехрептеп1а()у апб йеоге1)са))у. Ноагечег, йе ейес1 о( йе Ьубгобупат)св оп йе )г(пе1)св о! !оггпайоп о! йеве в1гис1игев )в по1 $0$)у ипбегв(ооб. Йгоо1 ег а1. [505] сотрагес$ йе (оппа1юп о! йеве т(сгов(гис(игев ив)пд б)вв(ра- 1)че раг1(с)е бупатюв (РРР) апб Вгоагп)ап бупат)св. Вгочгп(ап бупат)св ) 7.) Реас (рг)па оЕ $)ге Тес)ггбг)ие 475 6 Ъ га сг о 4 2 0 20 10 1)гпе Р)доге 17.3: Огг)ег рагатегег ехргевяпд 1Ье сопЕ)дога))опа) епггору оЕ йе вггисгиге (вее геЕ. (505) Еог бега))в) ав а Еипсбоп оЕ Еппе Еог а 0Р0 япш)абоп апб а Вгогчшап бупатк япш)абоп. ТЬе 0Р0 япш)абоп Еогпь йе Ьехаеопа) ьггисШге, жЬ|)е йе Вгогчгпап бупат)с япш)абоп геша)пь ггарреб )п а РЬаве гч)1Ь т1егсоппесЫщ 1иЬев (атее 1Ье в1пк1игев вЬои и гп Р)доге 17.4). (В0) 3в а 1еспп$г)ие йа1 геветЫев 0Р0 Ьи) )п вЫсЬ еасЬ раг)3с!е !ее!в а гапбот Еогсе апс$ а с)гад Еогсе ге)а1Ме 1о а Вхеб Ьас)гдгоипб.
ТЬе $трог1ап1 б$$)егепсе ЬеФмееп В0 апб 0Р0 $в йа1 В0 боев по1 ва)$в)у Ь)юг)оп'в й$гб )ачг апб попсе Н боев по1 сопвегче гпотеп1ит. Ав а сопвег)иепсе, В0 сап печег гергобисе Ьубгобупат)с ЬеЬачюг. $п соп1гав1, 0Р0 )в в$т$3аг 1о М0 )п йа1 Н боев сопвегче гпогпеп1ип!. И сап йеге$оге Ье ивеб 1о тобе! ЬубгобупагЫс !п)егас1юпв. А согпраг)воп о$ йе ргеб3с1юпв о) а 0Р0 апб а В0 в3гпЫа)$оп Еог йе 1)те ечо$и1юп о$ йе вагпе пюбе) 1е$$в ив вогпе)Ыпд аЬои1 йе $трог)апсе о) йе ЬубгобупагЫсв Еог йе ргосевв ипбег оспа!бега))оп.
вгоо) арр$3еб йе Ьчо )еспп$с)иев 1о в1ибу йе Еоппа1$оп о$ гЫсгов1гис)игев $п Ыос$г соро)утегв. Рог висЬ вув1етв, Мо)еси$аг 0упат$св агои!б гег)и)ге 1оо тисЬ СР)) йпе. вгоо1 ег а!. [505) в1иб)еб йе Еоггпа1$оп о) йе Ьехадопа! рпаве Егогп ап $пП$а$!у гапбогп АзВг Ыос$с-соре)утег $$г)и)б. !п Р)диге 17.3 1Ье ечо$и)$оп о$ йе огбег рагате1ег спагас1егвбпд йе чапоив рЬавев 3в р$о)1еб. ТЬ)в $)доге впочгв йа1 $п йе 0Р0 в$ти$а1$оп а Ьехадопа! рпаве $в Еогтеб, чгЬ3)е йе вув1егп гпобе$еб Ьу В0 гета)пв 1гарреб )п а те1ав1аЫе в1а1е. Аррагепбу, Ьубгобупаппс $п1егас1юпв аге пеебеб 1о Еас)$31а1е йе огоев)пд о) $г$пе)$с Ьагпегв.
с.!таргет 17. Ртаярайие Ратйс!е Рунаттсь Р18ите л7.4т 51тисилгеа оЬ!а!пей Еготп РРР япш1а6оп (!ей) апд а Вготттп!ап с1упанис япш1а6оп (г18ЬЕ) оЕ а ауЯетп оЕ АаВт Ь!ос)с соро1утпегя айег ЕЬе ьатпе питпЬег оЕ Енпеь егеря 1п ЕЬе РГР япш1а6оп а Ьехайопа! рЬаье Еа оЬ- аегттед и Ьт1е ЕЬе Вготттп1ап дупаппса япш1абоп га 1тарретЕ ш а 61аогдегед рЬаье оЕ !птегсоппесгей илЪея ТЬе Е(йоге аЬоъча ЕЬе 6!ч!6шй аиг(асе ап6 Еа Ьааес1 оп йага рточтйей Ъу Рг.
лсР. Сгоой 17.2 О1ЕТЕТ СОаТВЕ-СЕаЕПЕЙ ТЕСЕТПЩиЕ5 1п а6611!оп Ео Ейе 61еа!ра6тте раг6с1е с1 упатп(са тпетЬод девсгЕЬед !п йте ргейоиа аесг!оп, 1Ьеге ех(а!а а Ьоаг оЕ сиате-йга!пей тпейюда Ео пюйе1 ЕЬе тпеаоасорк дупагп1сь оЕ йшйя Моа1 оЕ Ейеае аге Ьааед оп а сопйпиитп берст(рйоп оЕ ЕЬе йшд ипйег сопят(ета6оп. 5исЬ гесЬп!т)иеа Еа)! оШяде ЕЬе асоре оЕ ЕЬ)ь Ьоо1с. Неге, лхе Ьпейу ЕоисЬ ироп Ги о тпеаоьсорк япш1а6оп всЬетпеа ЕЬаг аге, 6)те РРР, 1пЬегепт1у рагбс1е Ьааес1.
ТЬе йгаг Еа ЕЬе зоса11ес1 Ьай(се Во11хлпапп (1.В) тпеЕЬод [50б-508). Аа тЬе патпе аиййеагя ЕЬе ЕВ тпеЕЬой !а а 1агйсе асЬетпе. !Е !а Ъааей оп а!ат6се Ваа се!!и!аг аиготпатоп пют(е1 оЕ а йшс1 !509]. 1п ялсЬ а тпойе!, Ейе йшс1 Еа гергеаептес1 Ьу а гейи1аг 1а6!се. Вбегу!а!Все рошг Ьаа а пеагевг пе!ВЬЬога (!п ттго 6!тпепа!опя г 1а иана!1у етрла1 то б, апд ш ЗР, йте пюа1 Егес(иеп11у иаей пюре!а Ьаче а =- 18).
Хо! оп1у арасе !а 61асге6гей, Ьиг типе тоо. Оп ет егу !а!Все ро(пй ЕЬеге сап Ье аГ тпоаг опе рагбс!е гному)пй тп йте йнес6оп 11п)ащ ЕЬе 1абйсе ро)пг го апу 81чеп пеагеЯ пе18ЬЬог. 1п а яп81е Енпе аГер, а раг6с!е тпот еа а1опй Ега Вп)т !тоти йа от!8!па! 1ат6се яге то ЕЬе соггеаропд!пй 1!п)т оп ЕЬе пеагеайпе!8ЬЬот Еа16се яте. ТЬ!а ргорайаг(оп егер Еа сагг!ед оит Еог а11 рат- Е!с!еа ятпи11апеоиа1у.
ТЬе пехг агер Еа ЕЬе со1166оп егер. Риппй со116йопя ЕЬе тола! питпЬег оЕ раггк1еа апд 6те гота! тпотпепгитп (апс1, !п сег1агп пюд- 17.2 ОС)тег Сотттае-Сгтттет( Тес)ттттт)Стем 477 е1я йе гога! епег8у) оп а 8!чеп !агбсе яте !а ша!пгашет(, ЬШ арагС (гопт СЬта сопаггашС, рагт!с1еа сап сЬап8е йе!г че!ос!Су. ТЬеге !а сопят) егаЬ!е (геедотп !п ае1ест!п8 СЬе соП!а!оп ги1ея аа )оп8 аа СЬеу тпашга!и йе ЬтП аупипеггу о! СЬе !аС6се. Х!СЬ СЬСа чету аппр!е пют1е!, И та роаяЫе Со пшпк Ьут1гос1упапис ЬеЬаъюг. Ноъчечег, йе сеПи!аг аитошагоп теСЬос1 та чету "потау" апс1 аи((ега (гота а пшпЬег о( оСЬег ргас6са! с)гаъчЬас)та. Могеоь ег, Ьу соп- аггисС!оп, СЬе 1агбсе тпос1е1 !ас)са СаП!еап ип апапсе. ТЬе !а!Все Войатапп тпеСЬот1 ъчаа с1ечтаес1 Со очегсотпе аотпе (Ьиг поС аП) о( йе ргоЬ!епь о( 1агбсе Ваа сеПи1аг аиготпата.