Frenkel, Smit - Understanding molecular simulation - 2002 (523144), страница 76
Текст из файла (страница 76)
1Е и е бепоге йе рогеп6а! епегеу оЕ ЕЬе о16 (пеи~) сопЕ(утга6оп Ьу ЕЕа (ЕЬ ), йе с1ега11е6 Ъа1апсе соп616оп гег)шгев йаг 14.3 С1иагег Моюеа 4О3 гечегве пют ев. Ргот ес(иасюп (С4.3.5), и е с(епче ап ехргевв(оп (ог йе гаС(о о( СЬе ассергапсе ргоЬаЬ$1Жееа асс(п — о) — — ехР( — 3[и(п) — и(о)!)П С,г[! Ц ' ю С1еаг1у, тапу сЬо[еев Сог рю аге рова(Ые. А рагбси!аг1у вппр1е (огт вав сЬовеп Ъу туи ег а!. [43б), и1ю аявигпеб йаС р(1,1) = ! Сот ти !евв СЬап а спС(еа1 йвСапсе т, апс1 р(1,1) = 0 Ьеуопс1 СЬа1 йвгапсе (атее Ехатпр1е 24). ХоСе 1ЬаС йе ассергапсе ги(е [п ес(иабоп (14.3.5) диагапгеев йаС Си о рагСС- с(еа СЬа1 с1[б поС Ье!опд Со СЬе вате с!иагег гп йе о1б соп((у~та!(оп и д! поС епб ир аС а йвгапсе 1евв йап т,.
Ехатр[е 24 (М(сеС(е ГоппаЕоп) Зиг(ас1ап1в аге атрЬ$рЬ$Ис гпо1еси(ев йа1 сопв(в1 о(1во спет1саИу сИвбпс1 раг1в. И йеве 1во раг1в саппо1 Ье соппес1еб, йеп опе раг1 вИС рге(егепИаИу сИвво(че (п апойег во(чеп1 сотрагеб Со йе ойег рагС. ТЬе пюв1 соттоп саве (в 1Ьа1 опе рагС о( йе то(еси(е (в ваСег во(иЫе апс$ йе ойег о(1 во1иЫе. Ви1, ав йе Сво раг1в о( йе пю(еси(е аге соппес1ес$, йе сИвво1иИоп о( виг(асСап1 то(еси1ев й а риге во(чепС (вау, ваСег) саивев Сгив1гаИоп, ав йе о$1 во(иЫе раг1 о( йе то(еси(е Св бгаддеб а(опд 1п1о йе ва1ег рЬаве. Веуопс$ а сег(а(п сгйса( сопсеп1гаСюп, йе то1еси$ев гево(че СЫв Сгив1га1юп Ьу ве11-авветЬИпц (пСо т(сеИев. М1сеИев аге (о(Сеп врЬепса1) аддгеда1ев о( виг(ас1апС то(еси(ев Сп вЫсЬ йе виССасСапСв аге огдап1гес$1п висЬ а вау йа1 йе ЬубгорЫИс Ьеабв ро1пС 1оччагб йе чча1ег рпаве апб йе ЬубгорпоЫс СаИв Совагс$ йе (пСег!ог о( йе т1седе. 11 Св о( сопвк(егаЫе 1п1егев1 1о в1ис$у йе едаИЬпигп ргорег11ев о( висЬ а гп(сеИаг во1иИоп.
Новечег, Мо1еси(аг $)упагп1св в(ти!аС(опв оп пюбе1 гп(се1(ев паче вЬовп йа1 йе т1сеИев пюче оп а Игпе вса1е йаС (в Сопд сотрагеб 1о йе 1(те И Са(сев 1псИчк$иа( виг(ас1ап1 пю1еси(ев 1о точе [437). 'с)в(пд сопчеп1юпа( МС, гайег йап М0, боев по1 (гпргоче 1Ье в(СиаС(оп: И (в ге1абче(у еаву 1о точе а в(пд(е виг(ас1ап1, Ьи1 $1 Са(сев гпапу сйвр1асегпеп1в о( в(пд1е виг(асСапСв 1о асЫече ап арргес1аЫе геаггапдепсеп1 о( йе т(седее Сп 1Ье вув1ет. Уе1, 1о ватр1е йе ес(иИ1Ьпит ргорегбев о( гтсеИаг во(иС(опв, йе гтсеИев тивС Ье аЫе 1о гпоче очег сИвСапсев йа1 аге Сопд сотрагес$1о йе1г овп сИате1ег, йеу тив1 Ье аЫе 1о ехспапде виг(асСап1 то1еси(ев, апб йеу тив1 ечеп Ье аЫе 1о гпегде ог Ьгеа(с ир.
Ав а сопвес(иепсе, в1апс$агс$ в$ти(а1юпв о( гп1сеИаг ве11-аввепсЫу аге чету в1очч. ууи ег а!. [436) паче ивеб с(ив1ег гпочев 1о вреес$ ир йе в1ти1абоп о( т(седаг во(ибопв. ТЬеу иве а с1ив1ег МС вспепсе йа1 спаяв И рова(Ые 1о б(вр!асе еп1(ге СЫсеИев в1й геврес1 1о еасЬ ойег.
ТЬе врес($(с тобе! Сот а виг(ас1ап1 во1идоп йа1 ууи ег а[. в1исИеб вав Ьавеб оп а (айсе тобе! ргоровеб Ьу ВСИИпдег [438[. (п й(в псобе1, йе с$евсг(р1юп о( виг(ас1ап1в (в ЫдЫу в1трИС(еб: йе ЬубгорЬ(11с апб ЬубгорпоЬ(с дгоирв аге сопв(бегеб С)гаргет 14. Ассе!егаЕЕпе Мопге Саг(о Яатр)(пе ° ф фОООф о~о ° а1~ ° Оф ° ° О~Оф ОфО фОф ~1о ° О ° г(доге 14.3: БпараЬог оЕ а Еур)са1 сопйулга6оп оЕ ЕЬе вигЕасгапг пюс1е1 оЕ Юи е! а!. [436], !п гчЬ)сЬ ЕЬе ЬубгорЬ$11с апб ЬубгорЬоЫс раггз оЕ зигЕасгапг гпо1еси1еа аге гергезепгес1 Ьу сЬагцез (Ъ|ас(с Ьеас1 апб гчЫЕе Еад). ЕЕпбег арргорпаге сопб!Ьопз, ЕЬе вигЕасгапЕз яе1Е-аваетЫе !пго гшсе11ез. )пс$ерепбеп1 (ипЬопс$еб) раг1$с!ез. ТЬе сопв1га$п1 йа1 йе Ьеас$ апб 1аП о$ а виг(ас1ап1 Ье рпув1саПу Ппкес$ $з 1гапз!а1еб 1п1о ап е!ес1гов1а1$с а11гас1$оп Ье)гчееп йезе дгоирз.
Тпе тацппибе оЕ йезе еЕЕес1$че спагдев берепбз оп бепз$1у апб 1етрега1иге. А 1ур(са! сопддигабоп $в впоггп $п Е$диге 14.3. 1п висЬ а зуз1егп $1 $в па1ига$1о с1из1ег йе гпо1еси!ев 1п а т)сеПе апб виЬ- вег(иеп1$у пюче епдге т1се!$ез. Тпе с1из1ег сг11епоп ивеб Ьу ууи ег а!.
$в р(',$) = =! ЕЕ гг$сг, =О ЕЕ ги >гс асс(о — ~ и) = т(п($, ехр( — $3гШ)). Р)диге 14.4 впогчв зисп а с!ив1ег тече. Тпе Е(гв1 в1ер (1ор) (з 1пе сопз1гисПоп оЕ 1Ье с1ив1ег, ЕоПогчеб Ьу а б$зр(асегпеп1 оЕ опе оЕ йе с1из1егв (т$бб!е). И чге ассер1 й1в гпоче гч$й йе ргоЬаЬ$1Пу д$чеп Ьу йе ргесеб$пд ег(иа1$оп, ууи ег аl. ивес$ г, = $, ггЫсЬ !гор!!ее 1Ьа1 1гчо рагбс1ев Ье1опд 1о йе вате с1ив1ег П йеу аге оп пе(дЬЬоппд !а1$$се зПев.
$п йе Пгз1 з1ер оЕ йе а$дог$йт, йе с)из1егв аге сопз1гис1еб из$пд йе ргесеб1пц сп1епоп. ЗиЬзег)иеп1$у, а с!ив1ег $в ве1ес1еб а1 гапс$от апб д!чеп а гапбот б(вр$асетеп1. 11 $в $пв1гис11че 1о сопвк$ег йе сазе 1п чгйсп гче чгои!б иве йе огб(пагу ассер1апсе ги(ев 1о пюче йе с!ив1ег; йа1 $з, 405 !4.3 С)ивГег Моиев чге чгои)б чю)а1е т)сговсор)с гечегв)Ь)36у. 8)псе ае паче точеб йе с)ив1егв й висп а ччау йа1 йеу 1оисп еасп ойег, )п йе пех1 в1ер, йеве Ьчо с)ив1егв чгои!б Ье сопв)бегеб а в)пд)е с!ив1ег. 31 йеп чг)33 Ье )тровв)Ые 1о верага1е йет 1о ге1пече йе )п)1)а) сопбдига1юп. И чче иве йе соггес1 ассер1апсе ги)е, ег)иа1)оп (14.3.6), пеи 33 Ц ~! асс(о — г и) = пип 3, ехр( — 35ЛЩ П хг рога(3с Ц йеп й)в точе чгои)б Ье ге)ес1еб Ьесаиве р"'"(3с, Ц = !.
8)псе йеве с)ив1ег точев бо по1 спапде йе сопЕ)дига1юп оЕ йе раг1)с)ев )п а с)ив1ег апб бо по1 спапде йе 1о1а! питЬег о! раг1)с)ев )п а с)ив1ег, 6 )в )трог1ап1 1о согпЬ)пе йеве с!ив1ег точев чг)1Ь вад)е рагбс)е точев, ог иве а с)ив1ег сп1ег)оп р(Ц !) йа1 а))очгв йе питЬег о! рагбс)ев )п а с)ив1ег 1о спапде.
Ог)сои)ав апб Рападю1орои)ов паче ивеб висЬ с)ив1ег точев 1о в)ти)а1е йе чарог-3)г)и)б соех)в1епсе сигче оЕ йе гев1г)с1еб рг)т)1)че тобе! о! ап юп)с 6и)б [439, 440). 14.3.2 Еаг1у Ке)есЕЕоп 8сЬегпе Опе оЕ ЕЬе б)ЕЕегепсев оЕ япш1а6опв оЕ тобе)в чбй соп6пиоив йгегас6опв сотрагеб го йове оЕ любе)в ичко Ьагб-соге рогеп6а!в Ев йе мау Мопге Саг1о точев аге ор6ш!геб. рог ехатр!е, 11 Ьап)-соге йгегас1юпв аге ргевеп1, опе сап ге)ес1 а пюче ав вооп ав а в1пд!е очег)ар 1в бе1ес1еб.
рог соп6пиоив ро1еп6а1в, а)3 ииегас6опв пшв1 Ъе сотригеб Ье(оге а гпа! точе сап Ье ассер1еб ог ге!есгеб. Ав а сопвес)иепсе, оп ачегаде, 6 Ев сЬеарег го регЕопп а Епа! пюче оЕ а Ьагб-соге раг6с1е ЕЬаг геви114 Еп ге)ес6оп ЕЬап Еп ассергапсе. ТЫв !еабв 1о йе в!гапке в11иабоп иЬеге И Ев арргес)аЫу сЬеарег Ео регЕопп а МС япш1а6оп оЕ а Егие Ьагб-соге пюбе! ЕЬап оЕ а соггевропб)па тобе! 3 Ьа1 Ьав чегу вгеер Ьиг сопбпиоив гери)в)че Епгегас6опв. 1п1шбче1у, опе ~чои)б ехрес1 ЕЬа1, а1во Еог соп6пиоив рогеп6а1в, И вЬои16 Ъе ровяЫе 1о ге)ес1 а1 ап еаг1у в1аде 1Ьове Епа1 пючев ЕЬа1 аге а1гпов1 сегЕа1п1у "боотеб" Ьесаиве 1Ьеу сыч)! геви11 й а )агде 1псгеаве оЕ 1Ье ро1еп6а1 епегду.
!и ргас6се ЕЫв 1в оЕгеп асЫечег1 Ьу аввипипд йа1, Ъеуопб а сег1а(п с66са1 б)вгапсе, ЕЬе сопбпиоив ро1еп6а1 сап Ъе гер)асеб Ьу а Ьап1-соге роЕеп6а!. !и ЕЫв вес6оп и е вЬои ЕЬа1 6 1в по1 геа!!у песеввагу 1о гпа1се висЬ ап аввигпрбоп. ЕаЕЬег, и е сап иве 1Ье (беа ЬеЬ(пб йе Би епбвеп-Хаим всЬете 1о Еогпш1аге сгдепа 1Ьаг а))отч ив го ге)есг аг ап еаг1у агаве "боотеб" Епа1 гпочев Еог рагбс!ев и 1й а сопблиоив Епгегпю!еси1аг рогеп6а! (441]. То вес Ьоъч й!в арргоасЬ ~чог)гв, сопв!бег а 1па1 б)вр)асетепг оЕ раг6с1е 1 1о а певуч роя6оп. Хе подач сопвггис1 "Ьопбв" Ъепчееп ЕЫв раг6с1е апб а пе16ЬЬог)пц раг6с1е ! иг)й а ргоЬаЬйгу р~ „а(Ц)) =шах(0,1 — ехр( — 35Лих;)), (!4.3.7) СЪаргег ! 4.
Ассе!егаЕЕпч ЕЧЕопье Саг!о алагир!т Р!Виге 14.4: Мо1а!!оп оЕ г)еГа!!ест Ъа!апсе !и а с!иьгег пюче; ГЬе !ор Е!Виге ьЬоыь ЕЬе Еоиг с1иьгегь )и 1Ье ьуьгегп; !и ЕЬе гпЫ61е ВВиге опе оЕ йе с1иьгегь Еь В!чеп а гапдогп 6!ьр1асегпепЪ МпсЬ Ъг!пВь 6иь с1иьгег !пГо сопгас! гч!ГЬ апогЬег с1иьгег; апс1 йе Ъобогп Е!Виге ьЬогчь ЕЬаг пегч сопЕ!Вига6оп Ьаь оп1у ЕЬгее с1иьгегь !Е !Ье пючеь Ьаче Ъееп ассергес1. гчЬеге г!и;,; = и" (1, !) — и'(1, !) !ь сЬапВе!п ЕЬе пггегас6оп епегду оЕ раг6- с1еь1 апгЕ ! саиьегЕ Ъу йе гг!а! сВьр1асегпеп! оЕ раг6с1е 1. 11 ! !ь по! соппесгес1 Го Ъ и е ргосеес1 гч!ЕЬ йе пех! пе!ВЬЪог !с, апд ьо оп. ВиГ аь ьооп аь а Ъоп6 !ь Еоипс1 Ъепчееп 1 ап6 апу оЕ !Еь пе!ВЬЪогь, гче ге!ее! ЕЬе гг!а1 пюче. Оп!у !Е рагбс1е 1 !ь по! Ъопс1е6 Го апу оЕ Иь пе!ВЬЪогь с1о гче ассерГ ГЬе Гг!а! пюче.
ВеЕоге с1!ьсиьь)пВ ЕЬе ас1чапГаВеь апс1 6!ьаг!чапГаВеь оЕ 6иь ьсЬепге, ъче Ягьг депюпьггаге ЕЬаг ЕЫь ьсЬегпе ьа6ьйеь г)ега!1ег! Ъа1апсе (ьее ьес6оп 5.2). ТЬе ргоЪаЪВ!Еу йаг ~че ассерг а пюче Егопг ЕЬе о16 Ео йе пеи рог46оп !ь Огпр1ет 14. Ассе!ега1(пч Мапге Сайо Батр!т~ а!! ра1г епега1ев ЕЬаг 1псгеаве с(ие Ео ЕЬе Епа1 61вр1асетеп1, а гапйот пшпЬег пшв! Ье йгагчп Ео Еев! чгЬеЕЬег а Ьопс1 ъч61 Ье !опием.
1Е а раг6с1е гпгегасгв ъч11Ь !папу оЕЬег раг6с1ев, ЕЬеп !Ьгв всЬете гег(шгев 6ге са1си1а6оп оЕ а 1агее пшпЬег оЕ гапдот пшпЬегв. ТЬЬ сап Ье амо16е6 6 мче иве ЕЬе еаг1у ге)есбоп всЬете оп1у Еог пеагевг пе1цЬЬогв (Е.е., ЕЬове 1Ьа! аге пюв! Исе1у 1о соп16Ьи1е 1о в1гопа гери1в1че гп1егас6опв чгЬеп раг6с1е 1 1в точес1).! 1Е ЕЫв в1аее оЕ ЕЬе 1г1а1 томе Ев раввес1, ЕЬе тгегас6оп гч!1Ь 1Ье гетат)па раг6с1ев 1в ЕЬеп сотри1ес1 т ЕЬе ивиа1 мчау, апй ассер1ей ог ге!ее!ей гч11Ь ЕЬе сопчеп6опа1 МеЕгороЬв ги(е.