Frenkel, Smit - Understanding molecular simulation - 2002 (523144), страница 70
Текст из файла (страница 70)
(п й(в соп1ех1, И Св )п1егевбпд 1о по1е йа$ Мое)] е1а/. [356], ЯЬепд ега/. [398], апб ЕвсоЬебо апб бе РаЫо [399] ивеб Моп1е Саг)о в)пси)а1)опв 1о в1ибу йе чарог-$)с(и)б сигче о1 а ро!угпепс Ьеаб-врппд пюбе!1ог чагюив спай )епдйв. ТЬеве в1иб)ев а(во впочч а бесгеаве о1 йе сг(1)са( бепв)Су ав а 1ипсдоп о1 сЬа)п )епд1Ь. Яисп а бесгеаве о1 йе сг)1)са) бепв)Су ч/$1Ь спа)п (епдй Св а депега! 1еагиге о1 (опд-спа(п гпо)еси(ев, ав ччав а)геабу ро)п1ес$ ои1 Ьу Р)огу. ТЬе 13)ЬЬв епвегпЫе СесЬп)с(ие гпа)Сев В рова(Ые 1о согпри1е е$$)с(епС)у йе $)г(и)б-чарог соех)в1епсе сигче о1 геа!)вС)с пюбе(в 1ог пю)есЫаг 1)и(бв. ТЬ)в гпа)сев $1 рова)Ые 1о орСип)ге йе рагапсе1егв о1 1Ье пюбе! 1о у)е)б ап ассига1е с$евспр1юп о1 йе еп1)ге соех)вСепсе сигче, га1Ьег йап о1 а в(пд(е в1а1е рой1.
$1 )в !!!се(у, ЬиС по1 )печ)1аЫе, йа1 а гпобе! йа1 бевспЬев йе рЬаве Ьепачюг соггес1!у, ъч/$! а!во у(е)б геавопаЫе евдгпа1ев о1 ойег ргорег1$ев, висЬ ав ч(асов)Су ог сйдивМ1у. Мопбе((о апб 8гев1 Ьаче вЬоап йа1 й)в Св )пс$ееб 1гие 1ог йе б)$$ив)оп сое$$)с)еп1 о1 Ипеаг ЬубгосагЬопв [400, 401], ччЫ(е СосЬгап, Сигпгп)пдв, апб со-ъчог)сегв [402, 403] 1оипб йе вагпе 1ог йе ч!асов)Су. ТЬе ЬубгосагЬоп пюбе( йа1 ччав ивеб й йеве вСиб)ев Ьаб Ьееп ордгп)геб 1о гергобисе ехрепгпепга! чарог-$)г)и)б соех)в1епсе ба1а [386, 390].
Сгпргочеб 1огсе Ве)с$в паче в)псе Ьееп ргоровес$1ог Ипеаг а)(гапев [358,404,405], Ьгапспеб а))гапев [363], а))сепев [406,407], а)$су)Ьепгепев [406], апб а)сопо)в [408,409]. 13.7 КЕСО11 СГОМйЬ То Япс1 пшпепса1 всЬепгев СЬаС аге пюге еЕВс$еп1 СЬап сопЕоппа11опа!-ЪСав Мопге Саг(о (СВМС), ъче вЬои)б Вгв1 ипбегвгапб ю Ьу СВМС ъчог)св Ьеггег 1Ьап а всЬегпе 1ЬаС егпр1оув гапбогп Спа! гпонев. 5иррове СЬа1 нче Ьане а яувгегп гчССЬ Ьагб-соге Спгегасбопв апб 1Ье ргоЬаЬССЬу оЕ виссеввЬлйу Спвегбпд а пюпогпег Св а. !Е ье авьигпе йаС СЬе Епвегг(оп оЕ ап гп-гпег Св ег(и!на)епС 1о СпвегНп8 гп Спс1ерепс1епС гпопогпегь, 1Ьеп йе ргоЬаЪ$$$1у оЕ а виссеев/и! гапбогп Спвегбоп оЕ ап и-гпег 1в галоп~ т Уш -а рог а бепве вувгегп, а «1, апс1 СЬегеЕоге гапс1огп Спвегбоп оп(у тчог)св Еог чегу вЬогС сЬайв.
ХССЬ СЬе СВМС всЬепге хе Сгу Сс Спа! опепСабопь апб оиг Вгоълпд всЬепге Еа$!в СЕ аП оЕ СЬе Сс Сг(а! опеп1агюпв геев Еп ап очег!ар. ТЬе ргоЬаЬ$1ду СЬаС ъче Вгонч а сЬа(п виссеев/и$)у !в СЬегеЕоге рсамс и [! — ($ — и)~] иЪш — 1 375 13.7 КесЫЕ Сгажг)г Р!Ваге 13.13: ТЬе сопЕоппа6опа1-Ь!аа Мои!с Саг1о асЬеше ЕаПв ЕЕ ЕЬе пю1еси1е !а 1гаррес( Еи а с1еас1 аПеу (1е(1); птеарес6че оЕ йе пшпЬег оЕ Ег(а! опепга6опа ЕЬе СВМС асЬегие ъл11 печет депегаге ап ассер1аЫе соп(оппа6оп. 1п ЕЬе гесоП дгои ЕЬ асЬете (г(ВЬЕ) ЕЬе а1еог(йш "гесоПа" Ьас1с 1о а ргеч(орла шопогиег апс1 абетрга Ео гедгоъч Егогп йеге.
ТЫа сгис(е еьбпъа1е ащдеага йаг Ьу !исгеаяид !с, йе пшпЬег оЕ гг(а! опеп1а6опя чче сап та1се Ь агЬ(1гап1у с1оае Ео 1 апс1 Ьепсе оЫа)п а геааопаЫе шаегг!ои ргоЬаЫШу Еог апу сЬа1п 1епдЕЬ апс( а1 апу г(еиягу. 1п ргас6се, а(шр1у шсгеаяие )с тчП! по! ьо1че йе ргоЫет. Нгьг оЕ аП, йеге !а а ргас6са1 !ппИа6оп: ЕпсгеаяпВ )с 1исгеаьеа йе сотри1а6оиа1 соа6 Моге ппрог1апг!у, !Ье аааширгюп ЕЬаг ЕЬе ргоЬаЬЖ!у оЕ а аиссеааЕи! шшаег6оп оЕ а пюпошег Еа еаза! аис( !пс1ерепбепг Еог еасЬ Ьта1 роя6оп Еа по1 согтеси Рог ЕиаГапсе, 1Е чче Ьаче дгогчп 1п1о а "с1еас1 аПеу" ччЬеге 1Ьеге Еа ядр!у по арасе Еог ап ас(с66опа! пюпотег (аее ГЕВиге 13.13), йеп по табег Ьою о(геп ее 1гу, 1Ье !паег6оп млИ по1 Ье ассер1ед.
Аг 1щЬ с(епа!6еа ягсЬ аеас( аПеуа аге ЕЬе та(п геааоп ЕЬе СВМС теЕЬос( Ьесотев шеЕВс(еии ТЬ!ь ацеееага 1Ьаг ъче пеес! а сошри1абопа! асЬете ЕЬаг аПом а оа 1о еасаре !гоги ЕЬеае с(еас( аПеуя ТЬе гесоП дгою 1Ь (КС) асЬете !а а с(упаш1с Моп1е Саг!о а!дог!ЕЬгп йа1 ччаа дече1орес( вчгЬ йе Пеаб-аПеу ргоЫет Еи гшпс1 (410,411!. ТЬе а1Вог(ЕЬш Еа ге1агес( го еаг!(ег аЕабс МС асЬешеа дие го Ме(гочПсЬ [412) апс1 А1ехапдгоъч(ск аис! ЪНЫ1пд (413). ТЬе Ьаяс аЕгагеду оЕ ЕЬе те1Ьос( Еа !Ьаг П аПоъча оа !о еасаре Егот а !гар Ьу "гесоПшд Ьас)с" а Ееыпопогиега апс1 гефту(ие ЕЬе егоъчЕЬ ргосеаа па!пд апоЕЬег !па! опеп1а1юп.
1п соп1гаа6 1Ье СВМС асЬете 1оо)са оп1у опе аЕер аЬеай Опсе а !па! опепга6оп Ьаа Ьееп ае!есгес(, м е саипо! "Йеве1есг" !6 ечеп 1Е 11 Еигпа ош 1о !еас! шго а с(еаг( а1- С(!ар!ег 13. В!авес( Мол!е Саг1о Бс)!стев 37о 1еу. ТЬе гесоП дгоъч!Ь всЬегпе 1оо(св вечега! пюпотегв аЬеас( !о вее ъчЬе!Ьег !гара аге !о Ъе ехрес!е6 Ье1оге а гпопотег !в !ггечосаЫу асЫес! !о !Ье !па1 соп(огта6оп (вее Е!диге 13.13). 1п йпв ъчау ъче сап аПеч1а!е (Ьи! по! гепюче) !Ье с(еас(-аПеу ргоыет.
1п рппс!р1е, опе сои16 а1во 6о воте!ЬтВ в!тПаг ъч!Пъ СВМС Ьу асЫтВ а вес)иепсе о! 1 топотегв рег в!ер. Ноъчечег, ав Пъеге аге !с рова!Ые йгес6опв !ог ечегу пюпотег, Пив ъчои16 !лчо)че сотри6пВ 1с' епеге!ев рег Вгоир. Ечеп йюиВЬ тапу о! !Ьеве !па1 пюпотегв с(о по! 1еас1 !о ассер!аЪ)е соп1оппа6опв, ъче ъчоиЫ в6П Ьаче !о сотри!е аП т!егасбоп епегВ!ев. 13.7.1 А1допйпп 1л огс1ег !о ехр1агп !Ье ргас6са1 ипр1етеп!абоп о! Пъе КС а1Вог!!Ьт, 1е! ив Пгв! сопвЫег а !о!аПу ипргас!Ыа!, Ьи! сопсер!иаПу випр1е всЬегпе !Ьа! ъчП! !игл ои! !о Ьаче !Ье вате пе! е1(ес!. СопвЫег а сЬа!л о( 1 пюпотегв. )Гъге р1асе !Ье Вгв! пюпотег а! а гапс1от роИюп.
Ь(ех1, ъче еепега!е !с !па! ров!Попа (ог !Ье весоп6 пюпотег. гогот еасЬ о! !Ьеве !па1 ров!Попа, ъче Вепега!е 1с !г!а! ров!!!опв !ог !Ье 6игс1 пюпотег. А! 6ив в!аВе, ъче Ьаче Вепега!е6 1св "!гппег" сЬатв. чъ!е соп6пие т !Ье вате таппег ип61 ъче Ьаче Вгоъчп 1с' ' сЬа(пв о( 1епВ!Ь 1. ОЪчюив1у, !лов! о( !Ье соп1оппабопв Пшв Вепега!ей Ьаче а чап!вЬтд Во1!втапп (ас!ог апс1 аге, !Ьеге(оге, !гге1ечапЬ Ноъчечег, воте тау Ьаче а геавопаЫе Во!!гтапп ъче!ВЬ! апс1 П !в баеве соп(огтабопв !Ьа! ъче вЬои16 П)се !о Япй То в!трП(у !Ыв веагсЬ, ъче гп!гос1исе а сопсер! !Ьа! р1аув ап !трог!ап! го1е !п !Ье ЙС а!Поп!Ьгп: ъче вЬаП йв6пВи!вЬ Ье!ъчееп !г!а! йгес6опв !Ьа! аге "орел" апс1 !Ьоаве !Ьа! аге "с1овей" То с(есЫе ъчЬебъег а В!чеп Упа1 йгес!юп, вау Ь, !ог топотег ! !в орел, ъче сотри!е !!в епегВу и;(Ь). ТЬе ргоЬаЪППув Пъа! !г!а! ровЬПоп Ь !в орел !в В!чеп Ьу р;" (Ь) = лип(1,ехр( — (3и1(Ь)]), (13.7.1) рог Ьагс1-соге т!егас6опв, !Ье с(ес!в!оп ъчЬейъег а !па1 с1!гес6оп !в орел ог с1ове6 1в ипатЬ!Виоив, ав р';"'"(Ь) !в еПЬег лего ог опе.
Рог соп6пиоив т!егасбопв ъче сотраге р',.Реа(Ь) ъч!!Ь а гап6от пшлЬег Ье!ъчееп 0 ап6 1. П 6ъе гапйот пшпЬег !в 1евв !Ьап р'Рса(Ь), Пъе йгес6оп 1в орел; объегъч!ве 6 !в ! с1овес1. 'ъгъге поъч Ьаче а !гее ъч!!Ь 1с' ' ЬгапсЬев Ьиг тапу о! !Ьеве ЬгапсЬев аге "с(еа6," т !Ье вепве Пъа! Пъеу етегВе 1гот а чс1овес)" пюпотег. С1еаг1у, !Ьеге 1в!Ж!е ро!и! гп ехр1ог!пВ !Ье гетаЬтЫег о( а ЬгапсЬ П И с1оев по! соггевроп6 !о ап "орел" йгес6оп. ТЬ)в !в ъчЬеге !Ье ПС а!дог!Йт сотев 1п. Кабъег Пъап телега!тВ а Ьов! о1 иве1евв соп(огта6опв, К телега!ев !Ьет "оп Пъе Яу." 1п асЫ16оп, Пъе а1Вог!!Ьт ивев а сЬеар !ев! !о сЬес1с П а В!чеп аТ!г!и ргоЬаЬ|!!ъу сап Ье саоаеп |п гпапу а!ъегпапче ъчауа апс! гпау Ье овес! го оргпгпге а аппп!аг!оп.
Ноъчечег, г!ге рагс!со!аг с!ъо!се с!!асоааег! Ьеге арреага го ъчог!с гчеП гог !.еппагд)опеа апг! !ъагс!-саге рогепва!а. 377 13.7 Кесо(! Сгожг)Г ЪгапсЬ гч61 "61е" гч11Ып а врес!Е!ес! пшпЬег оЕ вгерв (ЕЬ(в пшпЪег 1в 6епоге6 Ъу 1,„). ТЬе а1Вог!йгп ЕЬеп гапс1огп)у сЬоовев апюпВ ЕЬе ача11аЫе ореп ЪгапсЬев. Ав тче Ьаче оп1у 1оо1сес1 а сПв1апсе 1,х аЬеас(, И гпау в611 Ьарреп йа1 ъче Ьаче ргс!сес1 а ЪгапсЬ ЕЬа1 !в с!оогпес(. Вп1 ЕЬе ргоЪаЬ!!Пу оЕ еп6!пВ ир 1п впсЬ а 6еас( а11еу !в пшсЬ 1ои ег йап 1Ьаг ш 1Ье СВМС всЬегпе. !п ргасбсе, ЕЬе гесог1 дгогчй а1дог61пп сопв!в!в оЕ ги о вгерв. ТЬе Вгвг вГер 1в го Вгогч а певуч сЬагп сопЕоппа6оп ив щ оп1у "ореп" с!1гесбопв.
ТЬе пехг вгер !в Го согпрыге йе и ей!в оЕ 1Ье пеи апс1 ЕЬе о1с1 сопЕоггпабопв. ТЬе Ео!!огч!пВ вгерв аге !пчо!чео й йе депегабоп оЕ а пеиг сопгоппа6оп: 1. ТЬе Вгвг гпопогпег оЕ а сЬа!п гв р(асес! аг а гап6от роябоп. ТЬе епегду оЕ й!в пгопотег !в са1си1агес1 (ггг ). ТЬе ргоЬаЬЕП1у йаг ЕЫв роя6оп!в "ореп" !в а!чеп Ъу ес(иа6оп (13.7.1).
!Е ЕЬе роябоп Ев с1овес1 иге саппо1 сопбпие Вгогч!пВ ЕЬе сЬа!п апс1 тче ге!ес1 йе гпа1 соп1огта6оп. П ЕЬе Пгвг ров!6оп Ев ореп, гче сопбппе гч!ЕЬ ЕЬе пех1 вгер. 2. А Гпа1 роя6оп Ьг ЬГ Еог пюпогпег 1 + ! !в Вепегагес( вгаг6пВ Егогп пюпогпег 1. ЧГе согпрШе йе епегду оЕ Гав Епа1 гпопогпег ггвег(Ь) апс1, ив!пе ес!пабоп (13.7.1), и е с!ес!6е ъчЬегЬег 6пв роя6оп !в ореп ог с1овед. П ЕЫв 61гесбоп Ев с1ове6, ив Гту апоЕЬег Епа! роябоп, ир Ео а пгах1шшпв оЕ 1с Гг!а! опеп1а6опв.
Ав вооп ав и е Впс1 ап ореп роя6оп и е сопбпие и ИЬ вгер 3. П пог а яппи!е ореп Гпа! роябоп !в Еоипс1, иге гпа1се а гесоВ вгер. ТЬе сЬа!п ге!гас!в опе в1ер 1о пюпотег 1 — 1 (!Е ЕЬ(в пюпотег ех!вгв), апс1 ЕЬе ипивес1 сПгес6опв (П апу) Егогп вгер 2, Еог 1 — 1, аге ехр1огей. 1Е а1! ТПгес6опв а1 !ече1 1 — 1 аге ехЬаивге6, гче а11егпр1 1о гесоЛ Ео 1 — 2. ТЬе сЬа1п Ев а!1ои ес! Ео гесог1 а го1а1 оЕ 1,„в1ерв, !.е., догчп 1о 1епфЬ 1 1агах + 1. !Е, а1 йе гпахнпшп гесо!1 !епВГЬ, а11 гпа1 с!!гесбопв аге с1овес1, ЕЬе 1па1 сопЕоппабоп !в сПвсаг6ей 3. !аГе Ьаче пои Еоппс1 ап "ореп" Гпа1 роя6оп Еог гпопогпег 1+ 1.