Frenkel, Smit - Understanding molecular simulation - 2002 (523144), страница 66
Текст из файла (страница 66)
1п а|Ы16оп, |че 61всивв во|пе а!|егпа6че Моп|е Саг1о ГесЬп1|[иев, висЬ ав сопсег|ед го|абопв ап6 еисми-Ъ|ЫПи|П Моп|е Саг1о, |ч[исЬ Ьаче Ъееп Пече1оре6 Ъу ТЬео|1огои ап|1 со-|чог1сегв [ЗЕ|5). 13.4.1 ЕаШсе Моде[в Е.ег ив Пгв| сопябег сопЕЕПига6опа1-Ъ|ав Моп|е Саг1о Ъе||чееп Пхе|1 еп|1- ро1п|в Еог а сЬа1п |по1еси1е оп а випр1е сиЪ|с 1а61се.
П |че ге|поче и вед|пеп|в оЕ |Ье |по1еси1е Ъеичееп Пчо Пхес1 епс1ро|п|в г| ап|1 где саппо| я|пр!у геПго|ч |Ье гпо1еси1е Ъу йе поппа1 КовепЪ[иЕЬ всЬе|пе, Ъесаиве Нив |1оев по! епвиге йаг а Ег1а! соп|оппа6оп в|агбпд аг г| |чП! еп|1 а| гп С1еаг1у, СЬар?ег 13. В?аьг? Л4опге Саг!о Вс?|етеь 354 ъчЬеге и'"'Ц ) ъ?епогеыЬе роеепба? епегцу оЕ |па1 ьеП|пепг ! с?ие го аП оЕЬег рагбс1еь а!геаду |и 6|е ьуьгет. 1п |Ье ргеьеп! саье, |че иье а с??ЕЕегепг ъче?еЫ Еасеог Ео ье?ес! 1Ье |па1 ьеагпепЬ па|пе?у, РЦ) ехр[ — Вй"'Ц)Я(г| + ЛгЦ), гг;п — 1) ехр[ — (ьиеяЦ!)]й(г| + ЛгЦ~) г2,'п — 1) (13.4.1) ?п ойег ъчогбь, йе ргоЬаЬПИу оЕ ье?ес6па а П?неп Ег?а! сПгес6оп ?ь ргорог6опа1 Ео ГЬе пшпЬег оЕ !ъ?еа! гапс1о|п ъчаП|ь о? ?епПй п — ! ЕЬа? ьГагг аг йе роя6оп о? йе Ег?а? ьеП|пепг ап|1 Еег|п?паге аг гп ?п |Ыь ъчау, ъче чиагалЕее ЕЬаг ъче цепегаге оп1у сопЕоппа6опь йаг ь1аг! а1 г| апс? Геппйа|е аГ гп Ноъченег, аь ЪеЕоге, |че пшя соггес| Еог йе Ъ|аь йа| ъче Ьаче иигосЬъсед.
ъые с1о Пиь Ьу сопьггисйщ а пюсППес1 КоьепЫий ъче!ПЫ ън: И~ = ] ],, ън| ъчМЬ , ехр[ — Рй"'Ц')Щг| + ЛгЦ'), гг,п — 1] ън| , ?Т[г|+ ЛгЦ'),г|,п — |] . | ехр! — Ри " Ц )]й[г| + ЛгЦ ), Г2; и — |] О. [г|, гг, п — | + 1) М ъче поъч пш16р1у |Ье ргоЬаЫ1?гу оЕ Пепегабпа а П?неп Епа1 сопЕоппа6оп Г ъч?ГЬ йе ПоьепЫиЕЬ ъчефЫ оЕ ГЬа1 сопЕоппабоп, ъче Е!пс1 йаг г-т ехр[ — Вй"'Ц)Ю[г| + ЛгЦ),гг,п — 1] ьеп[ ) х [~) , ехр( — Вй"'Ц')]й[г| + ЛгЦ'), гг, п — 1] х Е?[г|, гг,п — |+ !] ]'ехр[ — ?ъиех|Ц)]Щг|+ ЛгЦ) г|.п 1] П[г;, гг, и — |+ 1] ъче |пиь1 Ь|аь оиг гедгоъчй ьсЬе|пе ?п ьисЬ а ъчау ЕЬаГ ЕЬе |па1 сопЕоппабоп |ь Еогсес? Ео Еег|пшаЕе а| гп То асЫеь е ЕЬ!ь, ъче иье йе ЕоПоичщ ьсЬегпе.
Бирроье ГЬаГ ъче Ыаг! оиг гедгоъч|Ь а| роя6оп г|. Оп а ЕЬгее-с?1|пепяопа? ?а6?се, |Ьгь соогсПпа|е !ь гергеьепгес? Ьу йгее ?п1ецег соогсПпа|еь (!с|, 1|, пъ| ). ТЬе Еша? роябоп |ь депогес? Ьу ()сп 1|, пы). ТЬе !ига? пшпЬег оЕ !с?еа? (!.е., попье?Е-ано?6йП) гап6о|п ъчаП|ь оЕ ?епд?Ь п Ье|ъчееп г| апс? п гг !ь бепо?ес? Ьу Щг|, г|, и).
Ч/е сап а1ъчауь со|приге йе пшпЪег оЕ !с?еа? гапс?о|п ъчаП|ь Ье?ъчееп Пхенц епс1ро?п?ь апа1убсаПу аь М |ь я|пр1у а Япйе яип оЕ пш16попиа1 соеЕЯс?еп|ь [ЗЕ|6,367]. 1.е| иь пех| сопыс?ег ЕЬе роъчГЬ оЕ опе ьеа|пепЬ ыагг?пд аг г| . 1п ЕЬе ог?П?па? сопйцигабопа1-Ь~аь Мопге Саг1о ьсЬеп|е, ъче ъчои?с? сопыс?ег аП )с роьяЫе !па? с??гес6опь. Апс? ъче ъчои?с? ье1ес| опе оЕ йеье |Пгес6опь, ьау сПгесбоп |, ъч!й а ргоЬаЬПМу РЦ)= х ехр[ — !ьй"'Ц)] , ехр) — ДипаЦ')] 13.4 Есхес( Епс(рот!в 355 () П Ег(гс, Г2, 'и) ъ=! ехр( — (3(Еехс(Р)!1 Щг!, гг,и] (13.4.4) ТЬе гепъа1пй8 Еасгог ЕТ гв !Ье вагпе Еог а11 сопЕоппабопв оЕ 1еп8ЕЬ и ЕЬа! в1агг а! Г! апс1 ЕегпипаЕе ас гг, Ьепсе, Й Йгорв оиг ъчЬеп ъче сои!рисе йе ге1абче ргоЬаЬ2116ев оЕ йе оЫ апс1 пеъч сопЕоппабопв. Ав ЬеЕоге, йе асгиа! Моп!е Саг1о всЬепъе ъпчо1чев депега6п8 ЕЬе 66а1 сопЕоппа6оп ияп8 йе всЬегае Еп6ка!е6 Еп ес(па!!оп (13.4.1) ап6 ассер6пд йе пеъч соп(оппа6оп ъч(ЕЬ а ргоЬаЬЕЫу 81чеп Ьу асс(о — ъ и) = пип (1, Ит(и)!Ч/(о)) .
(13.4.5) А !оса! Ге8гоъчЕЬ оЕ а Г)п8 ро! у!пег оЕ 1еп8!Ь Е сап Ье ассопър11вЬес1 Ъу сЬоов- 1п8 г! = гг апс1 и = Е. 13.4.2 Ги11у Нех1Ые СЬа1п А8аю, И (в ровяЫе Ео ех!епс1 соп(18игас!опа1-Ь(ав МопСе Саг1о го вагар1е сЬасп сопЕоггаа6опв Ьегъчееп 6хес1 епбро)ппв ияъ8 оиг )споъч!ес18е оЕ ЕЬе ехас! ехргеввюп Еог ЕЬе пшпЬег (ог, гпоге ргес(ве1у, йе ргоЪаЪ|16у слепя!у) оЕ Ыеа1 (попве1Е-ачоЫЫ8) сопЕоппабопв оЕ и ве8пъепсв ЬеГъчееп Е)хек епс1- ро(пгв г! апс1 Гг. 1Е ъче с1епоГе ГЬе ргоЬаЬ116у с1епв!Еу Ео Епс1 ве8пъепс ъ + ! а! а 6(вгапсе т Его!и ве8пъеп! ъ Ьу р! (т), ЕЬеп ъче Ьаче ЕЬе Ео1!оъч(п8 гесигыоп ге1абоп Ьегъчееп йе ргоЬаЬГ16у с1епя!у оЕ йе епс1-Ео-епс1 верага!юп оЕ сЬашв оЕ 1еп81Ь и апс1 и + 1: Р(г!г,и+ !) = 6АР(г!г — Л;и)рс(Л). (13.4.6) Ргопь есрла6оп (13.4.6) апс1 йе Еас! ЕЬаг р ! (т) !в погпъа11г ест, ъче итппе61аге1у с1ейисе ГЬе 1пчегве ге1абоп: Р(гсг,и) = ЙЬР(г!2+А;и+ !). (13.4.7) 1п йе врес!а1 саве ЕЬаг а11 ве8пъепгв аге оЕ ЕЕхе6 1епфЬ а, ЕЬе ехргеввюп Еог 6нв ргоЬаЬ116у бепв1гу Ев (368) ~хе~" ""~'62( — !д)х( ) (и — 2)с — т га)" — 2 2 "(и — 2)' а' ъчЬеге тсг = ~г! — гг(.
ТЫв ехргевяоп Ев ча1Ы Еог а11 и > 1. Ав ЬеЕоге, ъче ъч)вЬ Ео пъосНу ЕЬе сопЕ18ига6опа1-Ыав МопСе Саг1о вапър1!п8 оЕ сопЕоппа6опв оЕ а Еи!!у Е)ехсЫе сЬай сп висЬ а ъчау ЕЬаг 6ъе сЬаъп 1в Еогсес1 !о ТЬе пъо61Е!ест РъовепЫи!Ь ъче18ЬЕ Ьав Ьееп сЬовеп висЬ ЕЬа! а11 Ьиг опе оЕ ЕЬе Еасгогв йчо1чй8 йе пипъЬег оЕ Ыеа! сопЕоппабопв сапсе1 еасЬ ойег: 13.4 РЕхесЕ Епс(рот!в 357 ехргевяоп Еог Нив ргодисЬ ъче йпд Ейаг П ! вел (Г! (1))ьчъ ъ=-1 с рз(гс — гъ ~)Р(гъ — гг;Š— 1)ъ[ ( ехр( — Рипа(Г;(1))) Р(гс — з — гх;Š— 1+1) / [ ~ ", ехр( — (Зй"'[Г; (1)))/ < ~ ехр( — (Зй"'[Г> (1))) ехр[ — 0ЕЕ "'(Гс„си)) П;.
р~ (гъ — гъ ~ ) (13.4.10) )с (.„;Е) Ав Нъе 1аЯ 1[пе оЕ Нйв ес!иайоп вЬоъчв, Ейе сопЕоппабопв аге шйееН Еепегагес1 ъчПЬ !Ье соггесг вгас!в6са! ъче(ЕЫ. 1п геЕ. [369) Нив всЬегпе Ьав Ьееп ар- р11еН 1о япш1аге иъоде! Ьоиъоро1угиегв, гапс1оги Ье1егоро!уиъегв, апс1 гапдоги соро1уиъегв сопяв!!пц оЕ ир Ео 1000 Ьеппагд-)опев Ьеадв. Рог то1еси1ев ъчйЬ вггопй Еиггаиъо1еси1аг шгегасг!опв, ЕЬе ргевепг всЬегпе ъчй! по! ъчог)с апй огйег арргоасЬев аге пеейес1. 13.4.3 %гопы 1пЕгагпо[еси)аг 1п1егас1[опв 1п !Ье ргечюив вес6оп ъче Ьаче вЬоъчи Ейа! ъче сап иве Ейе сопййигайопа!- Ыав Моп1е Саг1о всЬегие !о Егоъч а сЬагп оЕ 1епд!Ь п ЬеЕъчееп Ичо Е!хек епс1ройав г~ апд гх )Е ъче Еспоъч !Ье ргоЬаЬ!16у Непысу оЕ сопЕоппа6опв оЕ 1еи51Ь и Ьеичееп ЕЬеве ро!п1в.
Рог ЕЬе врес1а1 саве оЕ а Еийу йехЕЫе сЬа!п Нив ргоЬаЫ111у с1!в!пЬи!!оп !в (споъчп апа1у6сайу. Рог сЬа!пв ъчйЬ в1гоий ЕиЕгапю!еси!аг ЕпЕегас6опв висЬ ап апа1убса1 Н(вгпЪи6оп Ев по! Еспоъчъь. Х!с!с апН 5(ериъапп [370) апд СЬеп апН ЕвсоЬейо [371) Ьаче вЬоъч Ейаг опе сап иве ап арргохппаЕеН 61в!пЪибоп. СЬеп апН ЕвсоЬес1о [371) евбиъаге Нив й)въг!Ьийоп ива а япш1айоп оЕ ап Ево1агеН сЬаш ъч!ЕЬ Ьопс1ес1 !п1егас6опв оп1у. ЧГъс)с апН 5!ергпапп [370) ргоровеН а всЬете!п ъчЬ!сЬ 1Ь(в ев6гпагеН ргоЬаЬ!!Иу с11вгг!Ьи6оп !в ЕигЕЬег гейпес1 с1ипий ЕЬе яиш1абоп. 13.4.4 КеЬгЫущ МопЕе Саг)о П ъче пюйе! а геа!рв6с ро1уиъег ог рерййе ъче Ьаче Ео Епс1ис1е Ьопс1-Ъепй!пй апН 1огяопа1 рогепйа1в.
5иррове Ейаг ъче гогаге!п !Ье шгепог оЕ а ро1уиъег а гапс1оиъ(у ве1есгеН Еогяопа1 апд1е Ъу ап аиъоипг Лф. П ъче ъчои!6 1сеер а1! ойъег Еогв(опа! ап51ев оЕ Нъе геташйег оЕ ЕЬе сЬагп йхей, а Нпу сЬаийе оЕ Нъ!в гога!опа! апд1е ъчои16 1еаН Ео а !аде сйвр1асетеп! оЕ Ейе 1авг агопь оЕ !Ье сЬа)п. П, оп Нъе ойъег Ьапй, опе ъчои1д оп!у с1[вр)асе ГЬе пе(ЕЬЬоппй 358 СбарЕег 13. Виае8 Мопге СагЕо Бс8етеь 2' р!8иге 13.8: 8сЬета6с дгаъч!п8 оЕ ЕЬе геЬг!68!п8 Мопге Саг1о асЬете. Яирроае ъче 8!не ЕЬе агота ! апс1 5 а пеън роябоп, Еог ехатр1е, Ьу гога6п8 агоип6 ЕЬе — 1,0 апд 6,7 Ьопда Ьу ап81еа Лфа ап6 Лфг, геаресбне!у.
1Е ъне ънои16 по! сЬап8е !Ье роьН!опа оЕ !Ье Египег, сопяа6п8 оЕ йе 8гау агота 2, 3, апд 4, ЕЬе !пггато1еси1аг епег8у ъчои16 !псгеаае я8п!ИсапИу. ТЬе геЬп68т8 ргоЫет !а Ео Япс1 а пенн сопЕоппагюп оЕ ЕЬе гптег ъч!ЕЬ ЕЬе вате Ьопс1 1еп8й апс1 Ьопс1 ап81е аа ЕЬе о!с1 сопгоппа6оп йа! Ь|168ев ЕЬе пеъч роа!Иопа 1' апс1 5'. а!опт, ЕЬе !пггапю1еси1аг !пгегасгюпв оЕ ЕЬе сЬа!и ънои16 тсгеаае я8тИ- сапИу, а8а1п Йпибп8 Иге тахигиип гога6оп. !'ъе ънои16 1!Еъе Ео епаиге ЕЬа! ЕЬе гогабоп а!!ее!а оп1у а япа!1 раг! оЕ ЕЬе !и!епог оЕ ЕЬе сЬа!и ап6 йа! И гевиЬа !п а гесс!агг!ЬиИоп оЕ агопъь ЕЬа! с1оеа по! геаи1! !п а !аг8е тсгеаае т ЕЬе !пггапю1еси!аг епег8у. Сопсеггед тгабоп ап6 гг8гЕг18Еп8 апс! епгЕ-ЬгЕгЕ81а8 Мопге Саг1о аге асЬетеа ЕЬа! Ьане Ьееп Иене!пред Ьу ТЬеодогои апИ соъног1сега 160,365,372) Ео регЕопп аисЬ Мопге Саг1о пюъ ею 1п Р!8иге 13.8 ЕЬе геЬг!с18!п8 ргоЫет !а аЕсегсЬес1 асЬета6саПу, 8ирроае ъче 8!не ЕЬе агота 1 ап6 5 а пеън роябоп Ьу а гапдот госа6оп оЕ ЕЬе ИгЕнег ап8!еа фа апд фг.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
