Frenkel, Smit - Understanding molecular simulation - 2002 (523144), страница 64
Текст из файла (страница 64)
ТЬе попЬопбеб $п1егасбопз аге безспЬеб Ьу а 1гипса1еб апб вЬ!Иеб ~еппагб-3опев ро1епда1. ТЬе ро1епба1 !в 1гипса1еб а1 х, = 2.5о. ТЬе Ьопс$еб 1п(егас1юпв аге с$евспЬеб чг!й а Ьаггпоп|с врппд „|ь „) 1' 0.5$с~|ь(1 — 1) 05(1(15 и"' (1) = ~ (1) о1Ьеггч!зе ччпеге 1 !з йе Ьопб !епдй, йе ег)и!!!Ьг!ига Ьопб )епдй Ьаз Ьееп зе1 1о 1, апб $с ь =400 ТЬе з1пи1адопз аге рег1оппеб 1п сус!ев. !п еасЬ сус(е, чче рег(оггп оп ачегаде Ь|да апегпр1в 1о йвр!асе а рагбс1е, 1Ч,ь„, а11егпр1в 1о (рагбу) гедгочч а спа!п, апс! 1Ч„! а6егпр1в 1о спапде йе чо|игпе (оп!у 1п йе саве о! )х|,Р,Т в!|пи!а1!опз). И чче гедгочч а спа|п, йе сопддигагюпа1-Ыав Моп1е Саг|о вспегпе !з изеб. 1п й)в гпоче чче ве|ес1 а1 гапбогп йе гпопогпег Егогп ччЫсЬ чче з1аг1 1о гедгочч. И й|в Ьаррепз 1о Ье йе 11гв1 пюпогпег, йе еп11ге гпо|еси|е 1в гедгоччп а1 а гапс$огп ров!1!оп.
Еог а11 йе в!п$01абопв, чче ивеб е19Ы Ег1а| опеп1абопв. ТЬе |епдйв оЕ 1г1а1 Ьопс$в аге депега1еб ччИЬ а ргоЬаЫ(Иу ргезспЬеб Ьу йе Ьопс)-в1ге1сЬ)пд ро1епба! (вее Сазе 81ибу 19). 1п Е1диге 13.4 йе ег(иа11оп о1 з1а1е ав оЫа|пеб 1гогп Ь$;ч',Т в1гпЫа1юпз |в согпрагеб ччИЬ опе оЫа!пеб Егогп Ь|,Р,Т в1гпи!а11опз. ТЫз 1войеггп !в чче!1 аЬоче йе сг16са! 1егпрега1иге о$ йе соггевропб1пд пюпогпег1с Е!о!б (Т, = 1.085, вее Е1диге 3.3), Ьи1 йе сг!1!са1 1егпрега1иге о1 йе спа$п гпо|еси(ев $в арргес)аЫу Ь!дпег [356). 13.3 Сепееа6оп оЕ Тпа1 Опепйа6оп3 ТЬе еЕВс!епг депегабоп оЕ 8ооб Епа! сопЕоппа6опв $з ап еазепба1 авресг оЕ йе сопаулгабопа$-Ъ$аз Мопге Саг1о зсЬегпе Еог сопбпипгп споре)в тч(й вггоп8 1п1гапю1есп1аг Епгегас6опз. Рог зогпе гпос1е1в (Еог еха| пр(е, Сааза(ап сЬа!пз) И $в роза)Ые Ео Вепега1е й(з б(згг(Ъи6оп йгес1$у.
рог ап агЬИгагу гпобе! и е сап иве йе ассергапсе-ге)есбоп ЕесЬпи)ие [33) оЕ депега6пд йе 1па! опепгабопз. Неге, гче зЬотч Ьогч а ге!ес6оп ЕесЬп(с)ие сап Ъе ивеб Ео депегаге Ьба1 роз$6опз еЕВс(еп11у. ТЬе пшпЪег оЕ гпа1 йгесгюпв )п 1Ье СВМС зсЬегпе сап Ье сЬозеп аг тчд!. ОЕЕеп, 1Ье оргппа1 пшпЪег оЕ Епа1 б)гес6опв $з с1егегт(пеб егор(г(са!!у. Нотчечег, гпоге яузге| пабс ЕесЬпн)иев ех)зг го сотприге ЕЬ)в орйпа1 пшпЬег [357). 342 СЬарсег !3. В1гаес( Мол!е Саг!о 5с)сетеа 0.7 0.2 -О.! 0.40 0.80 0.80 0.70 0.80 Р р!циге 13.4: Ес(иайоп оЕ а!аге оЕ ап е!3И-Ъеас( Е,еппагс(-)опеа сЬа!и аа оЪ- га!пес( !гога ХУ,Т апс1 Ь),Р,Т а!гпи1а6опа импе ГЬе сопЕ!3игаг!опа1-Ь!аа Мопсе Саг1о аеЬегпе. ТЬе аипи1аг!опт аге рег(оппес( ъПЬ 50 сЬа!па аг а 1егпрега!ше Т = !.9.
13.3.1 81гощ 1п1гагпо1есп1аг 1п1егас6оп8 Е.е! иа сопя!с(ег аа ап ехагпр1е а тос(е! оЕ а пю1еси(е !п и Ь!сЬ ЕЬе Ьопс1ес1 шгегасг!опа !пс1ис(е Ьопс1 а1гегсЫпд, Ьопс( Ьепс(!пд, апс( !ога!оп. ТЬе ехгегпа1 ш1егасйопв аге ЕЬе попЬопс(ес( 1пгегасг!опя А ипйес( а!огп пюс(е! оЕ ап аПсапе !а а !ур(еа1 ехагпр1е оЕ аисЬ а пю1еси!е.
ТЬе ргоЪаЬ!1!Еу ЕЬа! ссе депега1е а !па! сопЕ!аига6оп Ь !а рчеп Ьу, (аее ес)иа6оп (13.2.10)) Р(Ь)с1Ъ = С ехр( — !3и~'""(Ь)]с(Ъ. (13.3.1) 11 !а сопчеп!еп! Ео гергеаеп1 ЕЬе роа!1!оп оЕ ап а!ого иа!п3 йе Ьопс( 1ещЕЬ г, Ьопс1 апре О, апс( !оса!опа! апд1е ф (атее Р!диге 13.5). Х!ЕЬ !Ьеае соогс(гпагеа ЕЬе ио1шпе е1егпеп! с1Ь !а учеп Ъу с!Ь = гг с(гс(соа 8с(ф. (13.3.2) ТЬе Ьопс(ес( епегду Еа ЕЬе яип оЕ ЕЬе Ьопс(-а!ге!сЬ!п3 ро!епг!а1, ЕЬе Ъопс(- Ьепйпд рогепиа1, апс( ЕЬе гога!оп ро!ела!: и " (г,д,ф) =и,ь(г)+иь,„д(8)+и„„(ф).
(13.3.3) 5иЬа!!си!!оп оЕ ес]иа!!опа (13.3.3) апс1 (13.3.2) оп!о ес]иаг!оп (13,3.1) р~еа Р(Ь) с(Ь = Р(г, 8, ф)г~ с!гс(соа Ыф С ехр( — (3и„;ь(г)]т~с(г х ехр( — (3ис „,с(В)]с1 соа 8 х ехр( — Ри„(ф)]с(ф. (13.3.4) ?3.3 Сепегагюп о Тпа1 Отгеп?аг(опя 343 ф з 1 Р?биге 13.5: 5сЬета6с я?ге1сЬ о1 а раг| о? а пю1еси1е. Мапу пюг?е?я ияе а 6хес? Ъопг? !еп61Ь, ?п |чЫсЬ саяе 1Ье 6гя| гегш |и ег?иа- 1?оп (13.3.4) ?в а сопвгапи 1.е1 ия сопя?6ег |Ье то1еси1е яЬо|чп ш р?биге 13.5. ТЬе 1!гяг а|ош ?я р!асег? аг а гапг?ош роябюп апг? |че по|ч Ьаче |о асЫ |Ье яесопг? а|ош. Рог сопчешепсе, 6 ?я аяяишес? ГЬаг ?Ье пю|1е! Ьая а 6хес? Ьопс1 ?епд?Ь, ТЬе яесопг? агош Ьая по Ьопс?ес? шгегас6опя о?Ьег |Ьап |Ье сопв|гашгя оп 6|е Ьопг? ?еп61Ь.
ТЬе с1?я?г?Ьи6оп о? |па1 опеп|а6опя, е|!иабоп (13,3.4), гег?исея го Рг(Ь)г?Ь сг с?соя 9|1ф. (13.3.5) Непсе, 6|е гг?а? опеп?а6опя аге гапс?ош?у йя|пЬи|ес1 оп |Ье яиг1асе о1 а ярЬеге (яисЬ а йя|пЬи6оп сап Ье депегагег? |ч?ГЬ А16оп6ип 42 Ы Аррепйх ?) рог 1Ье 1Ь?гс? агош, 6|е Ьопс?ес? епег5у соп|ашя 1Ье Ъопд-Ьепйпц епег5у ая |че!!. ТЬ?я учев, 1ог 1Ье д?я?г?Ъи6оп о1 Гг?а? опеп1а6опя, Рз(Ь)с?Ь сс ехр( — 5и~ „д(9)] с?соя 9с?ф.
(13.3.6) То депега?е !с гг?а? опеп?а6опя йя1г?Ьигес? ассог6?пд 1о е|р|а6оп (13.3.6), ъче а5аЫ депегаге а гап|1от чесгог оп а ип6 ярЬеге ап|1 г?егепшпе ?Ье апд?е 9. ТЬ~я чесгог ?я ассер?ес? |ч?1Ь а ргоЬаЪ|16у ехр( — ]?и| „д(9)]. 11 ге!ес|е|1, ГЬ?я ргосег?иге ?я гереагес? ип?6 а ча1ие о? 9 Ьая Ьееп ассер1ес1. 1п [33], ГЫя ассер1апсе-ге?ес6оп те6|ос? |я яЬо|чп |о Ыг?еес? 6?че ГЬе г?ея?гес? йя?г?Ьи6оп о1 гг?а? опеп|а6опя. 1п 1Ыя |чау, ?с (ог ?с — 1, ?ог ?Ье о?с? соп?оппа6оп) гг?а? опеп1а|юпя аге еепегагес?. Ап аИегпа|п е ясЬеше |чои?г? Ъе |о депегаге апд?е 9 ип??огш?у (9 Е (О, тг]) апс1 го с?егепшпе 6|е Ьопд-Ьепйп5 епегду соггеяропйпд го 6ия ап6?е.
ТЫя апд?е 9 ?я ассергес? |ч?ГЬ а ргоЬаЬ61|у яп(9) ехр( — 5ив,„д (9)].?1 ге]ес|ей 6ия ргосейиге ?я гереагес? ип61 а ча1ие о1 9 Ьая Ьееп ассергей ТЬе яе?есгес? ча1ие о? 9 1в яирр1ешеп|е|1 |ч?1Ь а гапс?ош1у яе?ес?ес? апд!е ф. ТЬеяе Г|чо ап6?ев с?е1егпипе а пе|ч гг?а? опеп1а6оп. 344 С)глр(ег 13. В(авеб Моп(е Саг!о Вс)гетез 11 (пет сопв) гпеп 1Ь=впс(гап1()*е11)а1 1Ьпетсопг=!.Ь е1яе 1Ь=ЕЬпетсопз епбН бо 1=1,1Ь-1 хп(1)=х(1) епббо и=1 бо 1=1Ь,е11 1й (1Ь.ед.1) ГЛеп Н (песг сопз) ГЬеп хг(1)=гаиш()*Ьох е1яе хс(1)=хп(1) еисми са11 епегех(хс(1),епз) т=)с*ехр(-Ьега*епв) е1ее яипы= О до ] =1,)с вз (.пес.пет сепг .апб.
).ес!.1) ГЛеп хг (1) =х (1) е1яе са11 пехг с1 (хг (б ), хп, 1) епбН са11 епегех(хс(б),епв) мс(б)= ехр(-Ьега*еп1) вите=витт+чг(б) епббо тс в*витт 11 (пет сопв) СЛеп са11 яе1есс(мг,витт,п) хп(1)=хе(п) хясоге(1)=хг(п) е1яе хп(1)=х(1) еп<21й епбвй епббо гегигп етая цгв1 а1ой А1цоп1Лгп 25 (Сгиб(пц ап АПсапе) яиеео(3т1ие дгот (пет сопй, ы) цгиа ог ге1гасе ап а))сапе апб са)си)а(е (!в (с)овепЫи!Л 1ас(ог т пет сопв =. Сгие.; Паас СОП1. з!аг1 (о цгоег 1!ой розйоп сЬ в1оге з(агбпц розцюп песг сопг =.
Ва1яе.: ой соп1. вагпе в1аг!)Пц ров(юп 1о гедгое( ав ивеб 1ог йе пее( соп()дога()оп в1оге розйопз йа1 аге по1 гедгоагп депега1е гапбоп! ровйоп иве ой роз)поп са(си(а(е (ех!егпа!) епегду апб г!овепЫи!Л 1ас1ог зесопб апб Ыцпег а!огпв асюа! роибоп ав !Па! опеп1абоп депега1е 1г)а! ровйоп (ех!егпа!) епегцу о1 йй розйоп ирба(е г(овепЫи!Л (ас(ог зе(ес! опе о1 1Ле 1па! опеп1абопв йоге ве(ес(еб сопацигабоп 1ог Ьоо)с(сеер)пц 13.3 Сепетайоп оГ'Ттйг! От(еи!а!(оив 345 Соттеигв го !)бв а!8от(!Ьт: 1, биЬтоибпе епехех са!си!а!ее йе ехгетпа! епет8у о1 ап агат а! йе 8(оеп роя бои, апс( виЬтоибпе ее 1ес с ве!ес!в опе о) !Ье Ьба1 ров(г(опв ил!Ь ртоЬ- аЬ!!(!у р[!) = хч(ЦУ 2,.
хч(]) (А!8опйт 41). 2. 5иЬтои!те пехс ов ас(дв йе пех! а!от !о $Ье сЬат ав ртевспбес( Ьу йе Ьопдед тгетасбопв (А!чот(!Ьтв 2б, 27, аиН 28 ате ехатр1ев !от егбапе, ртораие, апс( ИпгЬет а!)сапев, теврес!(ое!у). Рог 1Ье 1оиггЬ апд Ь$8Ьег а!отав, 1Ье Ъопс1ед епегду йс1ис1ев Ъо1Ь ЬопдЬепд)пд апд гога(оп епегду. ТЬ(в 8$чев, 1ог ес(иа6оп (13.3.4), Рс "е(Ь)с1Ь ос ехР[ — 8иь,„4[8)] ехР[ — !ЗА (ф)] с$ сов ес1ф. (13.3.7) ЪЧе ада(п депегаге а гапдотп чесгог оп а врЬеге апд са1си1аге 1Ье Ьопс1- Ъепйщ ап81е В апд гогяоп ф.
ТЬеве ап8!ев аге ассергед сч(1Ь а ргоЬаЬ1111у ехр( — 0 [ив а(8) + иг п(ф)]]. 11 йеве ап8!ев аге ге)есгед, певуч чесгогв аге 8епега1ед ип61 опе дега ассергес1. Ада(п ап а11егпабче всЬегпе $в го с1егепшпе йгвг а Ьопс1-Ьепйпд ап81е О Ьу депега6п8 8 ипМопп1у оп [О, тс] апс1 са1си1абпд йе Ьопс1-Ьепйпд епегду соггевропсйп8 го 1Ыв ап81е. ТЫв апд1е 8 (в йеп ассер1ес1 сч(й а ргоЬ- аЫ1$(у в(п[8) ехр[ — 8иь,„а(6)]. ТЫв ргоседиге (в соп6пиес1 ип61 сче Ьаче ассергес1 ап ап81е. Ь(ехг сче депегаге а гога(оп ап81е гапдотп1у оп [О, 2тс] апс1 ассер1 1Ыв ап81е сч(1Ь а ргоЬаЫ16у ехр[ — 13иг„,(ф)], ада1п гереагигд бив ип- 61 а ча1ие Ьав Ьееп ассергед. 1п 6ив всЬетпе !Ье Ьопс1 ап81е апд гога(оп аге депегагед (пдерепс1епбу, счЫсЬ сап Ье ап ас1чап1аде )п савев счЬеге 1Ье соггевропсИщ рогепба1в аге вЬагр1у реа1сес1. ТЬе ассер1апсе-ге)есбоп гесЬп(с)ие (в $11ив1га1ед (п А!дог(йгпв 25-28 1ог сИ(егепг п-а))сапев. Рог а11-агота ог ехр1(с$1-Ьудгодеп гподе1в о! Ьус1госагЪопв, а д(Негепг в(га1еду (в пеес1ед Еог счЫсЬ сче ге1ег йе геадег го 1Ье ге1ечапг!дега( иге [358, 359].
Саве 81иду 19 (Сепегабоп о! Тпа1 Сопйдига6опв о1 Ыеа1 СЬа(пв) )п зесбоп 13.2.3, ьче егпрпаз1хеб йе Ьпрог1апсе о1 е($)с!еп1(у депегабпд 1па) зедгпеп1з 1ог пю1еси(ез ьч(й в1гопд 1п1гайо(еси!аг 1п1егасбопз. 1п й1в саве в1ибу, ьче с(иап1!(у й1в. ЧЧе сопз!бег йе 1011оьх1пд Ьеаб-зрппд пюбе! о1 а ро!уйег. ТЬе попЬопбеб )п(егас1(опв аге бевсг1Ьеб мй а (.еппагб-допев ро1епба) апб йе Ьопбеб )п1егасбопз ьч)й а Ьаппоп!с врг)пд: ль ( 0.5)с,гь(1 — 1)х 05 < 1< 15 й (Ц=~ (1) ойегсч(ве чепеге 1 )з йе Ьопб!епдй, йе ес(и(!!Ьпигп Ьопб 1епдй Ьав Ьееп ве1 1о 1, апб 1с„ь = 400. ТЬе Ьопбеб 1п1егас1!оп (з оп(у йе Ьопб з1ге1сЬ$пд.
ТЬе ех(егпа( (попЬопбеб) )п1егасбопз аге йе ~еппагб-,>спев )п1егасбопз. ЧЧе сопв)бег йе (о)1оа)пд Ьюо вспеп$ев о1 депегабпд а зе( о1 1па$ ров)1)опв: СЬар(ег !3. В1аеег( Моп(е Саг1о ВсЬетее 34б А)вопИпп 26 (Сгоичпа ЕИгапе) депега(е чес(ог оп ипа врпеге са11 сапог Соттеи( (о й(в а(аог(йт; 7. Т)ге еиЬгоиИие сапог ееиега(ее а гаиг(от оес(ог ои а иид ерйеге (А(еопйт 42), апг( йе ьиЬгоиИпе Ьопс11 (А!дог(1Ьт 43) аепега(ее Ме Ьопг( 1епой ргеесгдЬеИ Ьу йе Ьопг(ег( гп(егасИопа А)вопИпп 27 (Сгоилпа Ргорапе) са11 Ьопг(1 (1) 11 (1.еЧ.2! Шеп депега1е Ьоп(( (епдй весси(( а1огп Соттеп( (о йие а!уог((Ьт: 1. ТЬе ьиЬгоибпе сапог аепега1ев а гапг(от оес(ог ои а иид ерЬеге (А(аопйт 42), (Ье ьиЬгоиИпе Ьопс(1 (А!дог((Ьт 43) депега(ее йе Ьопг( !епфЬ ргеясг(Ьег( Ьу йе Ьопг(ег( т1егасИопв ((ог йе ьесопг( агат, оп!у Ьопг( сиге(сБ- (иу), апг( йе яиЬгоиИпе )оопг)а депега(ез а оес(ог оп а иид ьрЬеге ип(Ь Ьопг( апа(е ргеесг(Ьег( Ьу йе Ьопг(-Ьепг((пд ро(еп(ш! (А(аог(йт 45).