Frenkel, Smit - Understanding molecular simulation - 2002 (523144), страница 32
Текст из файла (страница 32)
Апа!о8оиь!у, Еог а аушев оЕ Х рагт!с1еа ат сопьЕап! ргеяшге Р апд ЕегпрегаЕиге Т, йе С!ЬЬь Егее епег8у 6:— Е + Р ч' Еа а! а пшшпшп. 1Е лче лч)аЬ Ео )тполч лч1исЬ оЕ Етчо рЬааеь (депоЕед Ъу сс апд (3) !а атаЬ!е а! а 8!чеп Еетпрегатиге апд депе!Еу, лче аЬои1д ягпр1у согпраге ЕЬе Не!пйо!Ек Егее епег8!еь Г апд Еа оЕ ЕЬеье РЬаьея И лчои1д аеегп ЕЬат йе оЬч!оиа Нпп8 Ео с1о !ь ятпр1у Ео тпеаялге Р„апд Га Ьу сотритег япш1адоп. !лп(ог- !б9 7.! Т)сеттос)углат(с!ллгеегабоп Шпа!е)у, И )в по! рояяЫе Ло теаялге ЕЬе Егее епегеу (ог ел!гору) йгес))у т а яиш1абоп (яее яес6оп 3.!.2). Ел!гору, Егее епегеу, ап6 ге)а)ест срлап66ев аге пол ялпр1у ачегааея оЕ Екпс)юпя оЕ ЕЬе рЬаве ярасе соогд)па)ея оЕ ЕЬе вув)ет, Кайег йеу аге с1Иесг!у ге1а1ес1 Ео ЕЬе чо1шпе !и рЬаве красе йа! )в ассеяяЪ)е Ео а яуягет. Рог )пялапсе, ил с1аяяса1 Яабвбса1 тесЬатсв, йе Не!пйоИл Егее елену Г Ея с1Иесг)у ге1аЕес1 Ео ЕЬе сапопка1 раг66оп Еипсбоп (,) (М, 'ч', Т), (яее ес)иабои (2.1.15)): Г = — 1с Т 1п Я ( М, Ч, Т ) = — 1с Т 1п ~ ~ (7.!.!) лчЬеге с1 1в ЕЬе 6)тепяопа)Иу оЕ !Ье вуя)ет.
И 1в с1еаг ЕЬа) Я(Х,У,Т) )я по! оЕ ЕЬе Еопп оЕ а сапопка1 ачегаае очег рЬаве ярасе. Апд ЕЫя )в ъчЬу Г ог, Еог ЕЬа! таИег, 5 ог с саппо) Ье теаяиге6 61гесл)у й а в!ти)алюп. гче са!! висЬ срлап66ев !Ьа) берепс1 йгес))у оп ЕЬе ачал1аЫе чо1шпе !и рЬаяе йеппа1 с)иап61)ея. ЫоЕЫпе Ея в)гапке аЬоиг йе Еасг ЕЬаг ЕЬеппа) с)иап)16ев саппо) Ье теавигед йгесг)у!п а яиш1абоп: ЕЬе вате ргоЫет оссигя !п йе геа1 лчог)6 — ЕЬепиа1 с!иап)Илев саппол Ье теаялгес1 6)гесс)у )и геа1 ехрегииеп)я еИЬег.
)'ч'Ьеп сопяЫег)па пшпепса1 ясЬетев 1о дегегиипе ЕЬе Егее елену, 1ЬегеЕоге, И )в !пвлгис6че Ео вее Ьолч йгя ргоЫегп 1я яо1лес1 т йе геа1 лчогЫ. Ехрептеп)я а)лчаув Йелегийпе а с1епчабче оЕ йе Егее епегцу, яисЬ ая йе с1епчалгче лчИЬ геврес) Ео чо1шпе Ч ог Еетрегагиге Т: (7.1.2) апд (7.1.3) д1/Т Ав ЕЬе ргевялге Р апд ЕЬе епегеу Е аге гпесЬапка1 срлапЕИ!ев, йеу сап Ье теавигед т а япш!а6оп. То сотри)е йе Егее епегду оЕ а яуялет а1 е)чеп Еетрегаплге апд с)еия)у, лче яЬои)6 Етс) а гечегяЫе раЕЬ т ЕЬе ч'-Т р1апе !Ьаг Ип)ся йе я)аЕе ипс)ег сопвЫега6оп Ео а влаге оЕ )споъчп Егее епегду.
ТЬе сЬапее лп Г а)оие ЕЬаг ра!Ь сап йеп яипр1у Ье еча)иаге6 Ьу йепиос1упаиис т)еега)юп, ЕЬаг )в, !плеегаг!оп оЕ ес)иа)!опя (7.1.2) аи6 (7.!.3). ТЬеге аге оп)у чесу Еелч йеппос1упаиис я!а)ев Еог лчЫсЬ ЛЬе Егее елену оЕ а виЬя!апсе )в )сполчп. Опе я!а!е )в йе Ыеа1 аав рЬаяе; ЕЬе оЕЬег гя ЕЬе )олч-Еетрегашге Ьаппошс сгуяга). А лче)1-)сполчп ехатр)е оЕ ЕЬе йеппос1упагтс тлеега6оп теЕЬо6 )в йе са1си1а6оп оЕ ЕЬе Егее епегду оЕ а 11с)иЫ ЕЬгоиф еткедгаг)оп оЕ ЕЬе ес)иа6оп оЕ влаге. 1п ЕЫв саяе ЕЬе геЕегепсе я!а)е лв 6ле Ыеа! еая. !и сотри1ег япш1абопя, йе вИиабоп 1в с)иИе яиш!аг.
То сотри)е ЕЬе Егее епегеу оЕ а с)еияе 1!с)иЫ, опе тау сопяиисг а гечегяЫе ра!Ь Ео ЕЬе 170 С)га Еег 7. Ггге Евегчу Са)си!абопв ъегу сИи1е дав рЬаве. 11 )в по1 геа11у песеввагу 1о ео аБ 1Ье и ау 1о 1Ье Ыеа1 Вав. Ви1 а1!еав) опе вЬоиЫ геасЬ а в1а1е 6ъа1 Ев виЕВс)епбу с)1)и)е 1о епвше 1Ьа1 1Ье Егее епегду сап Ье согпри)ес) ассша1е!у, Егот )споъч)едде еЬЬег оЕ 1Ье Е)гв1 Ееи 1еппв )п йе н1па! ехрапяоп оЕ йе согпргевв|Ьг)6у Еас)ог РЛЯМсвТ) ог йа1 6ъе сЬеписа1 ро)епба1 сап Ье сотри)е6 Ьу о1Ьег гпеапв (вее, Еог ехагпр)е, весбопв 7.2.1 апс1 7.2.3). Рог 1Ье во1Ы, 1Ье Ыеа1 дав геЕегепсе в1а1е 1в 1евв ивеЕи1 ап6 апо1Ьег арргоасЬ )в са))ес) Еог.
ТЫв ргоЫегп )в с))всивве6 1п с1е1а11 1п СЬар)ег 1О. 1п а ыпш!а6оп и е аге по1 1)пи1ес) 1о ияпе а рЬуяса1 йеггпобупаш)с )пгедга1юп ра)Ь, 1Ьа1 )в, а рай йа1 сап а!во Ье Ео11оъчес) гп ехрег)шеп)в. Вайег, и е сап иве а11 рагагпе)егв й 1Ье ро1еп6а1 епегВу Еипс1юп ав 1Ьегпюс1упапбс чапаЫев. Рог ехагпр)е, гЕ ъне 1спои 1Ье Егее епегду оЕ йе 1.еппагс1- )опев Вшй, ъче сап с1егеппйе 1Ье Егее епегду оЕ 1Ье 51ос1сгпауег Яи)с)г Ьу са)си)а)ЫВ 1Ье гечегяЫе иог1с гес!шгес1 1о ви ЬсЬ оп йе 6)ро)аг гп)егас6опв гп йе ).еппаг6-)опев ВиЫ [153[.
ТЬе Еоппа1!яп ивес1 1о са1си)а1е 6ив Егее епегду 6)ЕЕегепсе )в К)г)съчоо6'в соирИщ рагагпе)ег пъе1Ьос) [154[. 1.е1 ив сопвЫег ап Н-раг6с)е вув)егп ъч)1Ь а ро1епба1 епегду Еипсбоп ЕЕ. Хе аввшпе йа1 ЕЕ с)ерепс)в !гпеаг)у оп а соир))пц рагагпе1ег Л висЬ йа1, Еог Л = О, сЕ соггевропбв 1о 1Ье ро)епба1 епегду оЕ ош геЕегепсе вув)епь (с)епо1ес) Ьу 1), и Ьъ1е Еог Л = 1, и е гесочег йе ро)еп6а! епегду оЕ 1Ье вув)егп оЕ й)егев1 (с1епо)е6 Ьу 11): и(Л) = (! — Л)и,+Ю„ = и1 + Л(ии - и,). (7.1.4) 1п оиг ехатр)е, вув)егп 1 соггевропс)в 1о йе ).еппагс)-!опев Йшб, и Ы)е вув1егп П ге)егв 1о йе 51ос)апауег Вшй 1п ъчЬа1 Ео!1ои в, и е авяипе йа1 1Ье Егее епегду оЕ вув1егп 1 )в )споигп (е1йег апа)у6саПу ог пигпепса))у). ТЬе раг66оп Еипс6оп Еог а вув)епь ън)1Ь а ро1епба1 епегду Еипс6оп йа1 соггевропбв 1о а ча1ие оЕ Л Ье1ъчееп О апс1 ! )в )3(Р1,17,ТЛ) —.
„, ~" 6г р(-[3и(Л)). ТЬе с)ег!ча6че оЕ Въе Не)пъЬо!1г Егее епегВу Р(Л) иг)й геврес1 1о Л сап Ье ъчг!11еп ав ап епветЫе ачегаВе: с дР(Л)') ! д, 1 дЕЩЛУ,тЛ) дЛ / !3дЛ ' ' ' [)Я(~,Лг,ТЛ) дЛ вЂ” — — ЬСР(И,Лг,Т,Л) —— [6ггг (д)Е(Л)7дЛ) ехр[ — 5)Е(ЛП [ с)ггг ехр[ — 5)Е(ЛК д)Е(Л) (7.1.5) Л В!ог)опауег Вшг) солеиь ог Ьеллагг$-)олег рагиг!ее ъчгг)г ап епъЬегЫег) ролъг г))ро1е. 172 СЬар1тт 7. Ггте Епег Са1си1айолв тЬе арргоасЬ о! [170) 1в Ьавед оп йъе сопсерт о! ад1аЬа6с сЬащев. !! 1Ье Напи1тогйап о( а с1овед вувгелп 1в сЬапеед ви(1!с)епт)у в!оън!у (солпрагег1 то йъе в!оъневт паюга! типе вса1е 1п 1Ье вувтепь ипдег сопяс1ега6оп), йъеп 1Ье еп1тору о( тЬе вувтелп доев пот сЬапде.
Астиайу, ГЬе ге!а6оп Ьетънееп асйаЬайс !тапа(оггпат!опв лп тпесЬапкв апс1 1п йъеппот1упапйсв 1в виЫ)е. А 11тпе-дерепдеп! ехгегпа! реггигйа6оп о( йъе НапиИоп1ап о( а с1авяса1 гпапу-Ьоду вувтегп ънй1 по! сЬапде йъе тога! чо1шпе ш рЬаве врасе 1Ьат 1в оссир)ед Ъу йъе вувгет. Ноънечег, 11 1Ье ехтегпа! ретплтЪа6оп ргосеедв Гоо гар)д!у, ГЬеп !Ье Йпа! епегеу о! йъе вувтелп ънй! дерепд оп тЬе ш(йа! сопт1йюпв. Ав а сопвеь!иепсе, а вувтелп йъат ънав лп16аПу сЬагасгег)тед Ъу тЬе 1Ьепподупапис чапаЫев )ъ), 'ът, апд Е епдв ир 1п а в!а!е гЬат доев пот соггевропд го апу 1ъпоънп епветпЫе. 1п сои!гав!, й гЬе сЬапде о( 1Ье Напи!топлап 1в лги!у ас1лаЬайс, тЬеп йъе епегду о! йле вувтелп 1в а ипирле !ипсйоп о! Шпе (Е(ъ)).
ТЬе вувтелп сап 1Ьеп Ье сЬагасгег)гед ат ечегу йлпе ! Ьу а вет о! рагагпетегв Х, Ъ', Е(!), ънЫ1е йъе еплгору о( тЬе вувтелп гегпашв сопв!апг (Ъесаиве о( йъе сопвегча6оп о! рЬаве врасе чо!шпе). ТЬе тес(и(гелпепт 1Ьа1 ап агйаЬайс !тапа(огпъа6оп сопчегтв а писгосапогйса! вуяетп сЬагасгегеаес1 Ьу чапаЫев )Ч, У, апд Е~ 1пто апотЬег вув1егп сЬагастег(гед Ъу )ъ), 'ъл, апс1 Ел сап Ье ивед ав а д1адпов!1с тоо! лп а япш!айоп. 1деайу, д11(егепт соп!1дигатюпв Ьач(пе ап епегду Еъ вЬои!д оп аррйсайоп о( тЫв адлаЬайс Ггапв!огпъайоп аП епд ир ънйЬ йъе вапъе епегду Ел.
11 тЫв сопд11!оп 1в пот вайвйес1 йъе тгапв!огпъа6оп Ьав Ьееп сагпес1 оит тоо гар161у апд 6ъе ггапв!огтпа6оп, втг(сйу вреа)дпд, 1в пот ад)аЬа6с. Ноънечег, !тъла!апаЬе апд КеиъЬагд! ро)п1 оит тЬай ш ргасйсе, тЫв сопд)тюп 1в 1оо вттопд. КатЬег опе вЬои1д чей(у 1Ьат йле анетте йпа1 епегду Ел Ъесолпев гпдерепдеп! о! йъе вън)тсйщ ргоседше. С!еаг!у, йъе тпетЬод о( 'ъ'ълатапаЬе апс1 Ке)пЬагд! 1в дев!дпед 1ог Мо1еси1аг Рупаписв, гатЬег тЬап 1ог Моите Саг!о, япш1айопв. Ноънечег, йъе гпе1Ьос1 1в по! 1ипйед то тЬе тп(сгосапоп(са! епвелпЫе, П сап Ье ехтепдед !о отЬег епвелпЫев (е.д., )Ч'ътТ), ш ъчЫсЬ саве й Ьесолпев а тесЬпп!ие 1ог сопьри6пд (гее епегду сЬапдев (170).
11 вЬои1д Ъе потей тЬа! вечега! аитЬогв Ьаче ивес1 Мо1еси1аг Рупаписв япш1айопв ънйЬ а 6гпе-дерепс1епт Напъйтошап то согпрше (гее епегау сЬащев !17Ц. ТЬеве япш1агюпв аге с1ове лп врлгй то йъе Моите Саг1о всЬелпе, а11ЬоидЬ, ав ро)плед оит 1п (170], йъеу сап Ъе дег(чед Ьогп гЬе агйаЪа6с ъгапв(огпъа6оп всЬепъе. АП 1Ьеве "в)оън- дгоънтЬ" пъейюдв сап Ье сопв1дегед ав вресла! савев о! йъе пюге лепета! попег!ий(Ьг1илп гпейюг1 (ог лпеаялпщ 1гее епегду сЬапдев йъат 1в девст(Ьед 1п весйоп 7.4.1. 7.2 ОТЕППСа1 РО1ЕП6а16 !и 1Ье рген1оив весйоп ъне д)всиввед вечега! д(тест, апд иялайу тоЪивй тесЬ- п1г!иев (ог сопъриг!щ йъе йъеппа1 ргоретйев о! а гпапу-Ьот1у вув1ет.
Ноън- 7.2 Орет!са! Росепйа!в 7.2.1 ТЬе Раг6с1е 1пвек11оп Ме11гос! А рагг1си1аг!у ятр!е апс1 е!едапг те!Иост 1ог теавиг(пд гЬе сЬеписа! ро- ГепГ!а! !л о( а врес!ев т а риге йиЫ ог !и а пах!иге !в ГЬе рагйс1е !пвегбоп тегЬос1 (ойеп геЕеггес1 Го ав ГЬе ХЫот тегЬос! [172]). ТЬе всайвйса1 тесЬатсв йлаГ 1в Иге Ьаяв (ог ййв тегЬой !в с!ийе випр1е. СопвЫег Иле с1ейп1- 6оп о( !Ье сЬеписа1 рогепг!а! !л, о( а врес!ев а. Ргогп ГЬегтос1упат!св, ъче 1спои гЬаг !л !в с1ейпес1 ав ( д дд, ) (ддд ) -т ( — ) (7.2.1) и Ьеге с", Р, апс1 5 аге Иле С1ЬЪв (гее епегду, Иге Не1тЬо!гг (гее епегау, апс1 !Ье епггору, геврес6че1у. Неге апс1 т ГЬе пехГ (еир рагадгарЬв и е (осив оп а опе-сотропепг вувгет; Ьепсе лче с(гор гЬе виЪвсг(рг а.
Могеочег, го 1сеер гЬе по!а!!оп сотрасе и е вЬай пи6айу аввшпе гЬа! ире йеа! лчйЬ а вувгет о! )х) аГотв !п а сиЬлс чо!шпе лч(ГЬ сйатеГег 1. апс1 чо1шпе др'= !.а, аг сопвГапГ 1етрегаилге Т. ТЬе с1авяса1 раг661оп йлпс6оп оЕ висЬ а вувГет !в й!чеп Ьу у~~ гл г1 ЩМ, Ъ', Т) = „, ~ ~ йв~ ехр! — ~3И(в~; !.)), (7.2.2) о о !и счИсЬ ГЬе вса1ес) соогс)!паГев врд = грдрр!.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
