Frenkel, Smit - Understanding molecular simulation - 2002 (523144), страница 30
Текст из файла (страница 30)
11 $з $пв1гисбче 1о вее Ьочч йе зув1егп геас1з 1о а зиббеп 1псгеазе $п йе (трозес$1етрега1иге. Е$диге 6.5 зпоччв йе ечо$идоп о( йе Ыпе1$с 1етрега(иге о1 йе вув1ет. А($ег 12,000 1$гпе в1ерз йе 1гпрозес$1егпрега1иге $в вис$беп1у $псгеазеб !гоги Т = 1 1о Т = 1.5. Тпе Ндиге !Низ(га1ев йе го1е о1 1пе соир11пд сопв1ап1 (;$. А вгпаН ча!ие о( Я соггевропс$в 1о а $очч $пег1(а о$ йе Ьеа1 Ьай апс$1еабз 1о гар!б 1етрега1иге $(ис1иаНопв. А (агде ча1ие о$ $ $ 1еас$в 1о а в)очч, г$пд)пд гевропзе 1о йе!егпрега1иге 1итр. Ь)ех$, чче сопя!бег йе е((ес1 о$ йе Н)ове-Ноочег соирНпд сопв1ап1 () оп йе б$$$ивюп соеП1с1еп1.
Ав сап Ье зееп 1п Е$диге 6.6, йе е((ес1 $з тисЬ втаНег йап 1и Апс$егзеп'в те1поб. Ноччечег, П ччои$б Ье ччгопд 1о сопс!ис$е йа1 1пе б($$из$оп сое($$с)еп1 $в 1пберепбеп1 о1 Я. Тпе Иове-Ноочег тейоб з1тр(у ргоч!с(ез а ччау 1о Меер йе 1етрега1иге сопз1ап1 гпоге деп!$е йап 755 6.7 Мо!еси!аг Вупат!ся а! СопвГапГ Тетрега!иге 0.08 0.08 0.04 0.02 0.00 0.00 0.10 0.20 0.30 Р)апге 6.6: Е11есг о1 1Ье сопр!!пд сопягапЩ оп 1Ье гпеап-яс)пагес) с)!яр1асегпепг гог а 7.еппагс)-)спея йшс1 (Т = 1.0, р = 0.75, апс1 1Ч = 256).
6.1.3 )Мове-Ноочег Огагпв 1п йге ргесег))па ехагпр!ея, тче Ьаче арр!!ей 1Ье Апс1егяеп апс1 Ь)оя6-Ноочег ГЬегпюягагя го 1Ье ).еппагс)-)спея йо!г1. Рог 1Ье Кояе-Ноочег 1Ьеппоя1а1 и е Ьаче яЬои и 1Ьаг 1ог а яуягегп )п гчЬ!сЬ 1Ьеге аге по ехгегпа1 1огсея апд ГЬе сепгег о1 гпаяв гегпа!пя йхес), а сапогйса1 с)!ягг!Ьпйоп илй Ье депегагес1. Ноигечег, ечеп йгопаЬ 1ог яуягегпя иг!1Ь ехгегпа1 1огсея йге Ь)оя6-Ноочег 1Ьегпюягаг аепега1ея гйе с)ея!тес) с)!ягг!Ьпйоп, 1Ьеге сап Ъе ехсерйопа! саяея Ы и Ь)сЬ и е с)о пог йпс) 1Ье ехресгес1 ЬеЬачюг.
То й1ыяггаге 1Ь!я, иге сопгйс1ег а рагйсп!аг1у ра1Ьо1ой)са1 саяе, пагпе!у, гйе опе-с!!шепа!опа! Ьаппошс ояс)11а1ог. Саяе й)ш)у 12 !Наппоп)с Ояс)1!а)ог !1)) Ав 1пе ег)оа1!опв о1 пюйоп о1 1пе Ьаппоп!с овс111а1ог сап Ье во!чес) апа!у1- !са!!у, 1Ь!в пюг)е! вув1егп !в ойеп овег) 1о 1ев1 а!дог!1Ь!пв. Ноччечег, 1Ье Ьаггпоп1с овс!!!а1ог !в а!во а га)пег а)ур!са! бупагп!са! вувгепз. ТЬ!в илП впоиг ор с1еаг1у мгпеп иге арр!у оог 1Ьепповга1!пд а!дог!1Ьгпв 1о 1Ь!в в!гпр!е гпобе! ВУВ!ЕП7. Тпе ро1еп1!а! епегду 1цпсйоп о1 1Ье Ьагпюп!с овс!!!а)ог гя п(т) = -т . ! г 2 Тпе Ь)еиг1оп!ап ег)оа1!опв о1 гпойоп аге Ф е = — т. С)яр!ег 6. Л4о)еси!аг Оупат(са )а Ъ'аг(оиа Епаетй)еа 156 "Г ио "Г -~ О га ° О ~о 40 20 ОО 20 40 г!дите 6.7: Тга)есгог!ез о! йе Ьаппошс озс1$$а1ог: ((гост !е(1 1о г$6Ы) $п 1Ье писгосапоп)са! епзептЫе, из$пц йе Апбегзеп птесЬоб, апс1 из!од йе Ь)оз6- Ноочег пге1Ьоб.
ТЬе у ах1з Ы 1Ье че!ос!!у апс1 йе х ах!в $а йе роябоп. !п 1Ье ргечюиз зесбоп !1 )з агдиес1 1Ьа1 йе Ь)озз-Ноочег а!дог!бпп оп!у депегасез а соггес1 сапоп)еа1 с1$зсг$Ьибоп 1ог пю1еси1аг зуз1ептз $п вЫсЬ 11 ве во1че йе ес(иайопв о1 пю1юп о1 йе Ьагпюп)с овсШа1ог 1ог а д!чеп ве1 о1 1п Ша1 сопсйюпв, ве сап !гасе йе 1га1ес1огу о1 йе вуз1еги 1и р Ьаве врасе. Е1циге 6.7 зиовв а 1ур1са! рЬазе врасе 1га)ес1огу о1 йе Ьаппоп!с овсй1атог, 1и а с1озеб!оор, вЫсЬ!в сЬагас1еивйс о1 реиосйс пюгюп. 11 !в в1га)цЫ1огвагб 1о в!гии1асе а Ьагиюп)с озсШа1ог а1 сопв1ап1 1егпрега)иге из1пц йе Апбегвеп йепиоз1а1 (зее зес1юп 6.1.1).
А 1га1ессогу 1в виовп 1и Е1диге 6.7. $п 1Ыв саве йе 1га1ес1оиев аге ро!п1з йа1 аге по1 соппестеб Ьу диез. ТЬ!в 1в бие 1о йе втосЬавйс сой1в1опз в!й йе Ьай. $п 1Ыв ехагпр1е, ве айотчеб йе овс$йа1ог!о $п1егас1 в!й йе Ьеа1 Ьай а1 васЬ 1!гие з1ер. Аз а гезий, йе рЬаве врасе бепзйу $в а сойес1юп о1 сйзсге1е ро1п!в.
ТЬе гезий1пц че!осйу б1в1г)Ьийоп !в $3аивв1ап Ьу сопв1гиссюп; а!во 1ог йе ровйопв ве йпб а 8аивв)ап б!з1г!Ьийоп. Ю/е сап а)во ребоггп а сопв1ап1-1егирега1иге Ь)озе-Ноонег в!!пи!а!!оп ив1пд йе а1цоийги бевсг1Ьеб !и Аррепб)х Е.2. А 1ур1са! 1га)ес1огу о1!Ье Ьагпюп)с овей!а1ог депега1ес$ в1й йе Ь(озе-Ноочег зсЬегпе 1в зиовп 1и Е(дите 6.7. ТЬе пюв1 в1г1Шпц 1еа1иге о1 Е$циге 6.7 1з йа1, ипй)се йе Апбегвеп зсиегие, йе Ь)озе-Ноочег гиейоб боев по1 у1е!с$ а сапоп$са! сйв1пЬийоп !и рпаве зрасе. Ечеп 1ог чету!опд в!!пи(а1!опв, йе еп11ге 1га)естогу вои!б йе 1и йе загсе иЬЬоп вЬовп 1и Е1циге 6.7. Могеочег,!Ыз Ьапб о1 1га1естопев берепбз оп йе 1пйа$ сопйцига1юп. ТЫз попегдоб)с Ьеиачюг о1!Ье Ь)овеНоочег а!допйги вав 1$гв1 сйзсочегеб Ьу Ноочег (131).
Тохчаегб апб 01зоп паче з$ювп йа! з1гийаг е$$ес1з сап а!зо Ье оЬзегчеб !и йе в!!пи!айоп о1 а геайзйс гпобе! 1ог Ьи1апе (1 34). ТЬе геавоп вЬу ве бо по1 йпс$ а сапоп!са! сйвтг1Ьи1юп !з йа1 сопвегчайоп о1 епегду !в по1 йе оп1у сопзегчагюп (ав. Тис$сеггиап ег а!. (135) паче вЬовп 1Ьа1 ап абсй!опа1 сопвегча1юп 1ав ех1з1з. !и Аррепб1х В.2.1 ве вЬов йа1!и йе ргевепсе о1 висЬ ап аббйопа! сопвегча1юп!ав йе а!дог11Ьги боев по1 депега1е йе без1геб б$в1г!Ьийоп. 6.! Мо!еси!аг Рупаоисв а! Сопв!ап! Тетрега!иге 157 !Ьеге 1и оп1у опе сопвегчес1 с)иапИгу ог И !Ьеге аге по ехгегпа! (огсев апс1 !Ье сеп!ег о1 тавв гета!пв Вхес1. ТЬе 1ав1 сопйИоп сап Ье оЬеуес1 т тов! ргасИса1 вувгетв Ьу ни!!а1Ыпд 1Ье вув1ет лч1!Ь а кего сепгег-о1-тавв че1осИу.
Нолчечег, И опе !в !пгегевгес1 !и яти!а!!пе тоге еепега1 вувгетв опе саппо! ге1у оп Иле ятр1е )х!ов6-Ноочег а1Вопйт. Аг Иив рот! И !в !трог1апг !о по!е 1Ьа! !Ье АпИегвеп !Ьеппов!ал с1оев по! ви((ег ггот висЬ ргоЫетв, Ьиг Ив Иупаиисв !в 1евв геа1!вИс. То а1!еч!а!е !Ье гев1псИоп 1ог 1Ье Ков6-Ноочег ИЬеппояаЬ Маг1упа е! а!. (136] ргоровес1 а всЬете !и лчЫсЬ Иле 1хов6-Ноочег 1ЬеппоЯа! !в соир1ес1 !о апо!Ьег !Ьепповга! ог, И песеввагу, Го а лчЬо!е сЬа!п о( ИЬепиовгаяв Ав лче вЬолч т АррепИ!х В.2.2 !Ьеве сЬа!ив !а)се т!о ассоип! асЫИИопа1 сопвегчаИоп 1алчв.
1и [136) И !в вЬолчп 1Ьаг 1Ыв депега1!га!!оп о1 Иле ог!а!па1 Ков6-Ноочег теИлод в631 аепега!ев а саиоп!са! И!вгпЬиИоп (ргоч!ИеИ ИЬа! И !в егдоИ!с). ТЬе ес)иаг!опв о! тоИои 1ог а вув!ет о1 'г! рагИс!ев соир1ес1 лч!!Ь М Ковб-Ноочег сЬа!пв аге и!чеп (лп геа1 чапаЫев, Ьепсе 1. = ЗМ) Ьу рс тс (6.1.29) р — — р Рм л !с= 1,...,М Я~ (6.1.30) (6.1.31) г — — 1.!свТ( — — Рс, ч- р, Рс, щг 7' Ог ! ,г !с Т (ек-1 ~ Якл1 ем~ 1Т (6.1.32) (6.1.33) (6.1.34) Рсм Рог Илеве ес)иаИопв о! тоИоп !Ье сопвегчеИ епегду !в м м Нюанс = 'Н(г, р) + ~ — + ПвТЕ1+ 2 )сваг (6 1 35) х — 1 к 20в )с=.г ЪЧе сап иве Иив сопвегчеИ с!иапг!1у !о сЬес(с Иле !пгеагаг!ои всЬете. 11 !в !трог1ап! !о по!е Ила! 1Ье асЫЬИопа1 М вЂ” 1 ес)иаИопв о1 тоИоп 1опи а ятр1е опе-с1ипепяопа! сЬалп апс1 1Ьеге(оге аге ге! аИче1у випр1е !о ипр1етепв 1п Аррепйх Е.2, лче с1евспЬе ап а!допИлт 1ог а вувгет лчИЬ а )х)ове-Ноочег сЬа!и гЬепповгаи 6.2 Мо!еси!аг 0уплттсв а! Сопв!ап! Ргеввиге 159 Рг Р» г; = — + — гг тп.г И» (6.2.1) р; = рг — 1+ — 7! — р,— Р» Рс| ЙХ/ И' Я1 (6.2.2) жЬеге М !в !Ье пшпЬег оЕ раг6с1ев.
1и ЕЬеве ес!иаИопв оЕ пю6оп и е гесодшге а ЕЬептювгаг ЕЬа! !в !п!гойисей ч!а ГЬе чапаЫев Еи р» „апИ Я и впш!аг Ео ЕЬе 1Ч,'ч',Т чегяои оЕ ЕЬе Иове-Ноочег сЬаш а!дог!ЕЬш. А Ьагов!а! !в !иЕгос1исес1 ч!а ЕЬе чапаЫев е, р „апй !'г', е !в с1ейпес1 ав ЕЬе 1одапйпп оЕ ЕЬе чо1шпе У оЕ ЕЬе вувЕеш е = !п(У1У(0)), и~Ьеге Ч (О) !в ЕЬе чо!шпе а! Г =- О, (4» !в ЕЬе шаве рагагпегег аввос!а!ей го е, апс1 р, !в ЕЬе пюшепЕигп соп]щаге го е. ТЬе ес!иаг!опв оЕ пю6ои (6.2.1) апс1 (6.2.2) аге сошр1егпеп!ей й!!Ь ап ес[иаИои оЕ шоИои Еог !Ье чо1шпе, и ЫсЬ геаИв 1и й с1ппепяопв У с('1/р, (6.2.3) Р» = с(1» (Р»а Р»и) + ~ Р» ° р', (6.2.4) Хг, 01 роЫюп оЕ ЕЬе воЬ епг оп ЕЬе ргорегИев оЕ а вуяегп опе Ьав йо аИ]ив! ЕЬе чо1ише оЕ аи 1М,'ч',Т япш1аИоп Ео епвиге ЕЬа1 ЕЬе ргеввиге геша!пв сопвгапи Рог висЬ а вувгеш И !в !ЬегеЕоге пшсЬ гпоге сопчеи)еп! Ео яши!аге а! сопв!ап1 ргеввиге.
То япш!аЕе а1 сопв1ап1 ргеввиге Еп а Мо1еси1аг Рупаш!св в!ши)аг!оп ЕЬе чо1шпе !в сопв(Иегес1 ав а Йупаписа! чапаЫе ЕЬаг сЬаиеев стиг!пВ ЕЬе яппЛа6оп. 1п СЬаргег 5 и е Ьаче вееп ЕЬаг опе сап регЕопп Мопге Саг!о япш!а6опв аг сопвгаиг ргеввиге Ьу сЬапе!щ ЕЬе чо1шие оЕ ЕЬе япш1а6оп Ьох. Неге гче сопв(Иег ЕЬе ес(и!ча1епг Еог а Мо1еси1аг 1)упаш!св яши!а6оп.
5!ш!1аг го ЕЬе Моп1е Саг1о саве, ИИв Ев ап ехсе11епг шеИюс1 Еог Ьошоцепеоив Ви!с(в. Рог !иЬошодепеоив вувгешв, Ьоччечег, опе гпау пеев !о сЬаиее 1Ье вЬаре оЕ ЕЬе япш1аИоп Ьох ав иеП [102,103]. 1п Аррепб!х В ые Ьаче вЬои и ЕЬа! !Ье соггесГ ЕЬеггповгаИие оЕ а Мо1еси1аг 1)упаш!св япш1а6оп Ьав шапу виЫ1еИев ге!а!ест го ЕЬе сопвегчаИоп !ачгв апс( и ЬеЕЬег а в!ши1аг!оп !в рег(оггпед гч!ЕЬ а Вхес( сепгег оЕ шавв. Впп!1аг ргоЫешв аг!ве ьчгЬ ЕЬе (вогЬегша1-1воЬаг(с епвешЫе. ТЬе еаг!!ег всЬеше оЕ Ноочег [132] сап оп1у арргохипаге ЕЬе дев!гесс йвГг!Ьиг!ои [137].
5(псе ЕЬе всЬеше оЕ МагГупа е! а!. доев уче ЕЬе с1еягес1 с1!впчЬиИоп, и е Еосив оп ЕЫв всЬеше. А11 ЕЬеве всЬешев аге Ьавес1 оп ЕЬе ехгепдей епвешЫе арргоасЬ рюпеегес1 Ъу Апс1егвеп [104]. ТЬе ес[иаг!опв оЕ тпоИои ргоровес1 Ьу МагГупа е! а!. [138] Еог ЕЬе ров(- 6опв апй ЕЬе пюшепга аге с)гаргет б.
Мо!еси(аг Оупатгсв т чапоив Епветб!ев 160 1п 6теве ес)иа6опв Р,„г !в ЕЬе ехтепъа1 ргеввиге, ъчЫсЬ !в !шровей (Ысе ЕЬе Еегпрегатиге). Ргог !в ЬЬе шгегпа1 ргеввиге, ъчЫсЬ сап Ъе са1си1атей с1иг!п8 ЕЬе яши1а6оп с)Те (втпс ъчЬеге 0 !в ЕЬе ротеп6а1. ТЫв ес(ыа6оп с!!ЕЕегв Егош ЕЬе сопчеп6опа1 ъчпа! ес)иабоп Еог а сопвгапЕ-чо1ише яши1а6оп. ТЬе ес)иат!опв оЕ ЕЬе сЬаш оЕ !еп86т М агег Рс» Еог !с = 1,..., М г — '+ — '— та! И' 2 — 1с Т— — в — Рс. Еек-! !евое! г — 1с Т вЂ” в . аМ вЂ” ! (6.2.5) (с!ЬЕ+ !)1свТ вЂ” 'Рс, !Ег (6.2.6) РЕ,1 Еог Ес = 2,..., М вЂ” ! (6.2.7) (6.2.8) ТЬе сопвегчес1 с(иапг!Еу Еог ЕЬеве ес!иа6опв оЕ шо6оп !в М 2 Нвг,гиа,т = 7((р, г) + — ' + ~ А' + (с!й + ! )ЕсвТЕ! +1свТ ~ 4, + Р,„гТЕ.
(6.2.9) 1п Аррепй!х В.З ъче с1ешопвтгаге 6тат ЕЫв шеЕЬос1 !пс1еес1 депегатев ЬЬе сог- гес! й!втг!Ъиг!оп. ТЬе ипр1ешептабоп оЕ ЕЫв а18ог!6тш !в зевсе!Ъей ш Ар- реп6!х Е.2.2. 6.3 ЯиЕВ6ОПВ аПЙ ЕХЕТС1ВЕВ Е.гиев6оп 14 (Апс!егвеп ТЬеппов!аО 1. 'чч(ту Ев ЕЕ ЕЕ!а! Е)ее вЕа6с ргорег6ея са!си(агесЕ (гу Р4 ъЕТ-МР ив(п8 Е)те Апг(етвеп Е)геттов!а! е(о поЕ ЕЕерепс( оп чу Неге ъче В!че ЕЬе есръайопв оЕ гпоиоп Еп ъчвъсЬ ЕЬе рагис1ев апъЕ Въе Ьаговгаг аге сопр!ес1 Ео ЕЬе яапъе !ъовв-Ноочег сваъп. ТЬе гааге Вепега! саве 1в Со сопр1е Еъе рагас1е впсЕ Въе Ьаговсас Го Гъчо ЙИЕегепс ГЬепповсасв.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
