Frenkel, Smit - Understanding molecular simulation - 2002 (523144), страница 25
Текст из файла (страница 25)
А гаплат гоа!!с т !п'1( !в ре~огтес( ив!па ассер!апсе ги1е (5.4.14). 2. ТЬс в иЬгоибпе с о с егс( са1 си!агев Яе (о!а( епегуу. (2виа!!у 1Ье епанчу о) Яе о10 сопЯига(!оп !в Йпогоп; Йегсуоге !Ь!в ви Ьгоибпе !в са!!ес( оп(у опсе. 5.4.3 АррИса6опв Саве Миду 7 (Ег)иа6оп о( 5(а(е о( 6ге Ьеппагд-) спев Ии(б) Яппи(а1юпв а( сопв!ап! ргеззиге сап Ье ивеб а!во (о бе(еггп(пе (Ье е()иа((оп о1 в1а(е о1 а риге соп)ропеп1. 1п висп а вппи1абоп (пе бепв)(у гв бе(епп!пеб ров(11опв о! йе пю1еси1ев вЬои!б Ье вса!ес1 (п а чо)игпе пюре, печег бге ге1а6че роябопв о! (Ье сопв6(иеп( а(опь (п (Ье пю1еси1е.
ТЬ(в Ьав опе ргас6са1 сопвес)иепсе, пагпе1у, Ни( 1Ье вппр1е вса!(пе ге1а6оп (5.4.1б) сап печег Ье ивеб (п гпо!еси1аг вувгепгв ич(Ь вйе-я(е пйегас6опв. ТЬе геавоп (в 1ЬаЬ реп 11 йе сеп(ег-о(-гпавв верага6опв Ье~и ееп пю1еси1ев вса1е ав а ягпр1е рои ег о( йе вувгегп яве, (Ье вйе-вйе верагабопв бо поб 123 5.4 1воЬаг(г-1вог)гегта( ЕпветИе 4.0 2.0 0.0 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 Р Р18иге 5.3: Ег(иа11оп о( вгаге о( 1Ье 1 еппагб-)спев ()и$б ав оЬгайеб (гого М,Р,Т япш1а1$опв; $вогЬеппв аг Т = 2.0. ТЬе во1Ы 11пе $8 1Ье едиабоп о( вгаге о( 1 оЬпвоп ег 41. (62] апб 1Ье вг)иагев аге 1Ье геви116 (гопь йе в$пъи1а1$опв (М = $08).
ав а (цпс1$оп о1 йе аррПеб ргеввиге апб 1егпрегагиге. Е(доге 5.3 вЬоъгв йа1, $ог йе $ еппагб;Зопев 1)ц)б, йе геви(16 о1 ап Х,Р,Т в(пъц(а1)оп согпраге чегу ъчеП ъч$й йове оЫа(пеб 1п Саве 81ибу 1. (п 6$гпи(а1юпв о$ гпобе!в о$ геа! гпо1еси!ев опе ъъои(б !!ге 1о хпоъг чгпейег ипбег а1гповрпепс сопб$1(опв йе гпог$е! 1$0$б пав йе вагпе с$епвду ав йе геа(ди1б. Опе ъчоиЫ пееб 1о рег(опп вечега! $ъ$;ч',Т випи!а11опв 1о бе1еггп$пе йе бепв(1у а1 ъъп$0Ь йе ргеввиге )в арргох$гпа1е1у 1 а1гп. 1п ап $ъ$,Р,Т 6$гпи!а11оп опе ъъои!б оЬ1а)п й$6 гавот $п а 61пд1е в$гпи(абоп. Ецгйеггпоге, 1 а1гп $6 а ге)а1$че)у 1оъч ргеввиге, апб опе чгоц)б пееб $опд 6$пъи(а1(опв 1о бе1епп(пе йе ргеввиге (гого ап $ъ$;ъг,Т 6$пъи!а1)оп, ъчпегеав йе бепвПу $п депега! $6 бе1егпдпеб ассига1е1у (гого ап $ъ$,Р,Т в)пш)а1$оп.
Саве 81ибу 8 (РЬаве Ег(и$11Ьпа (гопь Сопв1ап1-Ргеввиге 5(нш1аъ(опв) (п Саве 81иб(ев 1 апб 7 $ъ$,Ъ',Т ог й,Р,Т ебпш1а1юпв аге ивеб 1о бе1епп(пе йе ег)ца1$оп о( в1а1е о1 а риге согпропеп1. Н йеве ег(иа1(оп-0$-61а1е ба1а аге 8$1еб 1о ап апа)убса! ег)иа1(оп о( 61а1е (1ог ехагпр)е, йе чап бег Ч/аа(в ег(иаПоп о$ 61а1е ог гпоге ворЬ$81$са1еб $оггпв о1 й$6 ес(ца1$оп), йе чарог-Пс(ц)б соех(61епсе сигче сап Ье бегепп$пеб (гогп МахъчеП'в ег(иа) агеа сопв1гис1юп.
А$йоидп 1Ь$6 чгау о1 бе1еггп1п)пд а соех)61епсе сигче $6 диагап1ееб 1о ъчогХ 1ог аП вув1егпв, $1 гег)и!гав гпапу в(пъи!а1(опв апб, йеге1оге, $в а га1пег сцгпЬегвогпе гоиге. АИегпа1)че гои1ев паче Ьееп бече!ореб 1о бе1еггп$пе чарог-Пг(ц$б соех(в1епсе 1гогп а в(пд(е вппи!а1юп. (п й(в саве 61ибу ъче $пчевбда1е опе о( йе$п: гаго ргеввиге 6$пъи(а1$оп. А лего ргеввцге в(пъц!а1)оп ргочЫев а г(ц$с(г (апб б$г1у) ъчау 1о оЬ1а)п ап 124 С)таргет 5.
Мопке Сат)о 5(ти$46озв т Мапоив ЕпветЫев 1.2 |- 1.0 0.8 0.8 0.0 0.2 0.4 0.8 0.8 1.0 Р г!дите 5.4: Чарог-$|т(и(б соех(вгепсе о! Йе !.еппагб-)спев ИиЫ; 1ог еасЬ гетпрегагиге йе во1Ы 1йев 5$че а1 а 5(чеп 1етпрегагиге 6|е соех(в6пд дав бепя1у (!е!1 сигче) ап|1 йе сое|бвбпд !|с)и)б бепя1у (г|ф1 сигче). ТЬе с|ге(ев аге 1Ье ачегаде бепя6ев оЬташе|1 1готп Ь),Р,Т япш(абопв а1 лего ргеввиге. !тпрог1апг го поте |в 1ЬаС 1ог Т = $.2 йе лего ргеввиге тпейот! !а|!в то ргебЫ1 соех(вгепсе.
ез1|гпа1е о! йе $)т)и(б соех|з1епсе бепвду. 6 вче рег(оггп а в|гпи!абоп а1 лего ргеввиге апб з1аг1 чк)16 а бепв|1у дгеа|ег йап йе Идаб бепв|$у, йе ачегаде бепзИу оЫа|пеб !гоги а в(гпи(а!!оп йа1 (з по1 1оо (опд мл(! Ье с|ове 1о йе соех(81епсе бепзИу. Яисп а знпи|абоп зпои(б по1 Ье 1оо |опд Ьесаизе йе ргоЬаЬИИу ех|в1з йа1 йе зув1еп1 в)$$ ипбегдо а |агде Иис1иа1юп |п г$епвИу. $1 й|з Иис1иабоп |з 1очкагбв а (отчет бепзду йе зув1егп вые сап Ьесогпе |пИпде)у (агде, в(псе йе еди|ИЬпигп бепв|1у 1па1 соггевропбв 1о лего ргевзиге |в ехас1(у лего. Р(дике 5.4 зЬовчв йе тези(18 !ог йе $ еппагб-,!опев Ии)б.
5101 1оо с|ове 1о йе спбса! 1егпрега1иге, а геазопаЫе ез1|гпа1е о$ йе $|с)и)б бепвйу сап Ье оЫа|пеб ч|а а в|пд!е з|гпи(а!!оп. )гпрог1ап! 1о по1е $з йа1 й|з евбп1а1е беч|а1ев вув1егпабса(|у 1гогп йе 1гие соех(в1епсе бепз(без апб й|з 1есЬп|г)ие зпои|б по1 Ье ивеб 1о бе1еггп|пе йе соех|в|епсе сигче. ТЬ|в 1есПп(т)ие (з чеку изе(и! $ог оЫа|п(пд а Игв1 езбкпа1е о! йе соех|в1епсе сигче. Ав ехр(ашеб Ье!отч екртагюп (5.4.17), 'Р( тк), йе ргоЬаЬ$$$1у бепв|ту оЕ Ипб)пд а вувгетп тч$1Ь чо)шпе тк $в рторог6опа! 1о ехр( — ф(Р( тк) + РЪк)).
ТЫв ргоЬаЬ|$|ту с1епягу сап Ье оЬ1а)пес! Егош а сопв1апг-ргеввите япш!а6оп Ьу сопвггис6пд а Ывгодгатп о1 1Ье пшпЬег о! 6тпев а сегга|п чо1шпе ч' $в оЬ- ветчеб бит(пд йе япш1а6оп. Опсе тче )тпотч Т(Ъ') ав а !ипсбоп о! 'ч', и е сап !осаге 1Ье соех(вгепсе роштв. !и соп1гавт то 1Ье лего ргеввиге в(тпи!а- 125 5.5 !воЕепвгоп-ЕвоЕ(сеута! Епвет(г!е 6опв ияес1 гп Саяе 8!иду 8, Ния Ь|я!ойгаш 1есЬп(с(ие доев !ей 1о а соггесг еяйгпа!е оЕ ЕЬе соех(ягепсе депя11у. Опе оЕ ЕЬе ппрог!ап! аррйсайопя оЕ Ния ЕесЬпк!ие 1я 1Ье 1пчевййайоп оЕ йп1!е-я(хе еЕЕесйс 1п ргасйсе !Ь(в всЬегпе Еог с(егййпй Г( гг') Егош Р(У) оп1у вчог(св пеаг !Ье спйса! ро(п! [98 — 101] ип1евя врес1а1 вагпрйпй !есЬпк)иев аге ияес1 (яее весйоп 7.4).
5.5 1НО1ЕП81ОП-18О1ЬЕППа1 ЕПНЕТПЫЕ ТЬе !х)РТ-МС гпе1Ьой 1я рег(есйу айес(иа!е Еог Ьопюйепеоия йшйв. Ногчечег, Еог шЬопюйепеоив вуя1епгв, Еп рагйси1аг сгув!ай1пе во1иЬ, Н гпау по! Ье яиЕЕ(с!епг ЕЬа! 1Ье я(пш1айоп Ьох сап сЬапйе я(ле. Ойеп арче аге Епгегевгес1 Еп ЕЬе !гапя(оггпайоп оЕ а сгув!а1 Епнп опе яггис!ше Ео апоЕЬег ог ечеп гп ЕЬе сЬапйе оЕ ЕЬе яЬаре оЕ ЕЬе сгув1айше иш! сей вч1ЕЬ Еегпрега!иге ог вч!ЕЬ аррйед вггевя.
1п висЬ савев Й !я еввепйа! ЕЬа1 1Ье яЬаре оЕ Ейе я(гпи1айоп Ьох Ьав епоийЬ Егеес1огп !о айовч Еог висЬ сЬапйев ш сгув!а1 вггисгиге гч(йгои! сгеайпй йгарп Ьоипдапея ог оЕЬег Ь|8Ь)у я!геввед сопййигайопв. Т)ия ргоЬ1егп тчая йгв1 !ас)с)ед Ьу Рагплейо апд Ка1ппап [102,103], гчЬо свече!оред ап ех!епейоп оЕ 1Ье сопя!ап1-ргевяиге Мо1еси!аг Оупагп(св !есЬп!с)ие ш1годисес1 Ьу Апдегвеп [104]. ТЬе ехгепя(оп оЕ Нге Рагг(пейо-ЕаЬгпап шейюс1 !о Моп!е Саг1о я(гпи1айопв (я ягга(НЬ!Еогвчагс1 (ас!иайу, ЕЬе тейве!в сргйе а ЬН яипр1ег ш Моп1е Саг1о !Ьап гп Мо1еси1аг Вупагп(св).
То оиг )сповч)езде, Нге йгя! Риы(яЬес1 ассоип! оЕ сопя!ап1-я1гевв МопСе Саг1о 1я а рарег Ьу Ь)а]аЕаЬай! апд 'ггр [90]. А! !Ье соге оЕ ЕЬе сопя!апгв!геев Моп!е Саг1о гпеЕЬод Иея ЕЬе ЕгапяЕоггпайоп !гоги !Ье вса1ес1 соогйпа!ея в !о !Ье геа! соогйпа1ев с1. ЕЕ ЕЬе я(пш!айоп Ьох Ы по1 сиЬгс апс1 по1 огйюгЬошЬ(с, !Ье !ТапвЕоппа6оп ЬеГгчееп в апс1 г 1в 8!чеп Ьу а ша!г!х Ь: т = Ь„яяя. ТЬе чо1шпе о! ЕЬе випи!а6оп Ьох Ъ'1я ес(иа! !о [с1е! Ь!. 'ггЪЬои1 !ояв оЕ йепегайгу ь е сап сЬоояе Ь !о Ъе а вупиперйс гпа!Нх, 1п !Не сопя!ап1- я1гевв Моп1е Саг1о ргоседиге сег1а!п гпочея сопя(я! оЕ ап аНегпр!ей сЬапйе оЕ опе ог пюге оЕ !Ье е1егпеп!в оЕ Ь. Ас!иайу, Н вчои!д Ъе есргайу геайяйс (Ьиг по! согпр!е!е!у ес(шча!еп1) Ео яагпр!е !Ье е1егпепгя оЕ ЕЬе гпегпс Еепяог 6 = ЬТ6, и Ьеге Ь е 1в 1Ье !гапврове оЕ Ь.
!Е оп1у Ьудгов!айс ех1егпа! ргеявиге гв аррйей !Ье сопвгап1-я!геяя Моп!е Саг!о гпе!Ьой 1в а!гпоя1 ес!и(ча!еп1 !о сопв1апг-ргеввиге Моп!е Саг1о.~ 1)пс1ег попЬудгов1айс ргеввиге (е.й., ишах)а1 я!гевя), ЕЬеге 1я айа(п вогпе Егеейогп оЕ сЬогсе 1п дес1йпй Ьогч Ео арр!у яисЬ с1еЕогпипд я1геяяев. РгоЬаЫу !Ье пюв! е1ейап! гпе!Ьос1 (апд ЕЬе гпе1Ьод Нга! гейес!в шов! с!ове!у ЕЬе в!а6ябса1 ЕЬеггподупаш(ся оЕ деЕоггпес1 яоййв) вйхсер! !Ьаг опе вЬоп!с! печег пве !Ье сопвгап1-впевв пгегЬосЕ Еог пп!Еопп ЕЕЫс!в, Ьесапве 1Ье !апег оЕЕег по геив!апсе Ео ЕЬе с1еЕоггпагюп оЕ ЕЬе ппи Ьох апс! чегу вггапяе (яаг, е!опяагегЕ, его.) Ьох вЬарев гпау гевп1г. ТЬЕв пгау Ьаче вепопв сопвес!пепсев Ъесапве Ыпш!а!юпв оп вув!епгв !Ьа! Ьаче вЬгпп1с сопвЫегаЫу гп апу опе сЕЬпепв1оп сепг! го ехЫЫ! арргес!аЫе яппе-вие еЕЕесях ЕгЬ СЬаргег 5.
Моп1е Саг)о 5(ти(вЕ(епв т Ъаг(пив Епвет0!ев Р(рпе 5.5: АбвогЬеп1 (Еог ехагпр1е, а веоИе) 1п йгест соптаст гч(ГЬ а дав. 1в го ехргевв а11 ехгегпа1 де(оггп(п5 ягеввев 1п гетпгв оЕ ЕЬе во-са11ег( ЕЬетгпо- г1упаппс гепв)оп (вес, е.д., (105)). 5.6 Стапй-Сапоп1са1 ЕпаетЫе ТЬе епвегпЫев гче Ьаче йвсиввед во Еаг Ьаче ЕЬе Ео1а! пшпЬег оЕ рагбс1ев ппровей Рог вите вув1егпв, Ьогчечег, опе гчои16 11(се го оЫа(п ш(оппа6оп оп ЕЬе ачегаде пшпЬег оЕ раг6с1ев 1п а вувгегп ав а Еипс6оп оЕ гЬе ехгегпа1 сопй6опв. Рог ехагпр1е, ш аавогр6оп вШйев опе гчои16 11)се го )огогч 6ге агпоипг оЕ гпагепа1 аавотЬед ав а Еипс6оп оЕ 6те ргеввиге апд гегпрегаШге оЕ ГЬе гевегчо1г илГЬ тчЬгсЬ ЕЬе гпатепа1 1в 1п соп1ас6 А па(че Ьит ГЬеоге11са11у ча116 арргоасЬ тчоиы Ье го иве ЕЬе Мо1еси1аг Оупагп(св ГесЬ- пк(ие (писгосапошса1 епвегпЫе) апд япш1а1е ГЬе ехрегипепта! яШат(оп; ап аг(вогЬепт ш соптаст гч(ЕЬ а 5ав (вее Р15иге 5.5).
5исЬ а япш1а6оп 1в ровяЫе Еог оп1у чету вппр1е вувгегпв. 1п геа1 ехрет(гпептв, ес)шИЬга6оп гпау га)ге пипигев ог ечеп вечега! Ьоигв, 6ерепйпд оп ЕЬе гуре оЕ дав пю1еси1ев. ТЬеве ес(и111Ъга6оп 6гпев гчои16 Ье геЕ)есгес1!п а Мо1еси1аг Оупаписв вппи1а6оп, ЕЬе 61ЕЕегепсе Ье(п5 ЕЬаг а пипиге оЕ ехрепгпепга1 типе га)сев оп ЕЬе огг!ег оЕ 10г весопбв оп а согпритег. РигГЬеппоге, Еп пювт савев, тче аге пот штегевтес1 Еп ЕЬе ргорет6ев оЕ ЕЬе дав рЬаве, уе1 а я5п(йсапт апюипг оЕ СР\1 Гппе гч(Н Ье врепг оп ЕЬе япш1а6оп оЕ ЕЫв рЬаве, апд Еша11у, (п висЬ а вппи1а6оп, ЕЬеге Ев ап Епгег(асе Ьепчееп ЕЬе 5ав РЬаве апс( ЕЬе абвотЬепг.
!п ЕЬе штегЕас(а1 ге51оп ЕЬе ргорег6ев оЕ ГЬе вувтегп аге с11ЕЕегепт Егогп ГЬе ЬиИг ргорег6ев (п гчЫсЬ тче аге шгегевгес1. 5!псе ш а япш!а6оп ЕЬе вувгегп 1в ге1а6че!у япа!1, и е Ьаче го випи1аге а чету 1агде вувгегп го пишпиле ЕЬе 127 5.6 Сгапд-Сапоп)са! Епвеп$5)е Рщиге 5.6: АдвогЬеп1 !п сопгас1 гч)й а гевегчогг 61а1 ппровев сопв1ап! сЬеписа1 ро1епба1 апд !етрега!иге Ьу ехсЬап5!п5 рагбс1ев апд епегду. )п))иепсе оЕЕЫв гп1егЕасга! ген)оп.в Мовг оЕ 61еве ргоЫетв сап Ье во)чед Ьу а сагеЕи1 сЬоке оЕ епветЫев. Рог адвогр6оп в1ид!ев, а па!ига1 епветЫе Ео иве )в йе 5гапд-сапошса) епветЫе (ог $$У,Т епветЫе). 1п 6ив епветЫе, 1Ье !етрега!ше, чо1ите, апд сЬепдса1 ро1еп6а1 аге Вхес1. 1п йе ехрептепга1 ветр, 61е адвогЬед 5ав )в 1п ег!ш11Ьпшп чч!1Ь йе дав т 1Ье гевегчо1г.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
