Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1145822), страница 10

Файл №1145822 Диссертация (Структура и функции сигнальных белков PII у одноклеточных зеленых водорослей Chlamydomonas reinhardtii и Chlorella variabilis) 10 страницаДиссертация (1145822) страница 102019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 10)

reinhardtii локализован в хлоропласте.3.1.2. Иммунологическая идентификация CrPIIИммунологическая идентификация СrPII проводилась с использованиемполиклональных антител к зрелому белку с С-концевой меткой StrepII (StrepCrPIItp), синтезированному в мутантном штамме E. coli RB9060 (с делецией по генуglnB) (Bueno et al., 1985). Поскольку биоинформационный анализ показалхлоропластную локализацию белка, это было проверено экспериментальнометодом Вестерн-блоттинга. Как видно из рисунка 11, белок PII C.

reinhardtiiможет быть обнаружен в белковых экстрактах, полученных как из клеток, так и изпредварительно изолированных хлоропластов.МолекулярнаяпоследовательностимассакДНКбелкаGLB1,CrPII,рассчитаннаясоставляетисходя22070,40Да.изБелоксоответствующего размера был обнаружен при анализе тотального клеточногобелка. Однако, как видно из рисунка 11, в препаратах, полученных из клеток,детектируется также вторая полоса с молекулярной массой около 18 кДа. Следуетподчеркнуть,чтовычисленнаянаосновепервичнойаминокислотнойпоследовательности молекулярная масса зрелого CrPII (без транзитного пептида)составляет 17535,13 Да.

Примечательно, что в изолированных хлоропластахмолекулярная масса белка, выявленного с помощью Вестерн-блоттинга,действительно, составляет порядка 18 кДа, что указывает на то, что белок,находящийся в хлоропласте, процессирован. Полученные данные подтверждаютлокализацию зрелого белка CrPII в хлоропласте водоросли, что хорошосогласуется как с данными биоинформационного анализа, так и с результатами полокализации соответствующих гомологов, описанных ранее у растений.ХлоропластыКлетки55Рисунок 11. Определение субклеточной локализации белка PII. В качестве контроляиспользовались антитела к белкам, локализованным в цитозоле (NAB1), хлоропласте (CGE1) имитохондриях (AOX1).3.1.3.

Транскрипция гена CrGLB1, кодирующего белок CrPIIЭкспрессия CrPII на разных этапах гаметогенеза. Ранее была показанатканеспецифичная экспрессия гена, кодирующего PII у высших растений (см. гл.1) (Uhrig et al., 2009). В связи с этим был проведен сравнительный анализ уровнейэкспрессии гена CrGLB1 методом ПЦР в режиме реального времени в клетках,находящихся на разных этапах жизненного цикла (вегетативных клетках,прегаметах и гаметах) (рисунок 12А). Уровень транскрипции гена CrGLB1 неповышается в прегаметах (22 ч в среде без азота в темноте) относительновегетативных клеток, тогда как в гаметах, полученных после освещения прегаметв течение 2х часов, выявлено некоторое увеличение (в 3-4 раза) транскрипциигена.56A100100Относительная экспрессия8Lg10000Lg1000010,0110,016420CC-124lrg6БCrPIIВКПГВКПГРисунок 12. Экспрессия CrPII в вегетативных клетках, прегаметах и гаметах штамма дикоготипа СС-124 и инсерционного мутанта lrg6.

Вегетативные клетки выращивались синхронно всреде TAP (□), а затем были перенесены в среду TAP-N на 24 часа в темноту ( ). Гаметы былиполучены в результате освещения прегамет в течение 2 часов (■).А Уровни относительной экспрессии CrGLB1. В качестве положительного контроля действиясвета и голодания по азоту использовался ген CrAMT1;1, экспрессии которого повышается вответ на действие этих факторов (вставки).Б Оценка уровней белка CrPII в вегетативных клетках, прегаметах и гаметах методом Вестернблоттинга с использованием PII-специфичных антител.Далее был поставлен вопрос: связан ли наблюдаемый световой контроль сдифференциацией вегетативных клеток в гаметы? У C. reinhardtii гаметогенезпредставляет собой двухэтапный процесс (Beck и Acker, 1992).

Он инициируетсяудалением аммония из среды, что приводит к формированию в темноте прегамет(незрелых гамет), которые не способны к формированию пары с гаметамипротивоположноготипаспаривания.Длязавершенияпрограммыдифференцировки прегамет в гаметы необходимо действие второго сигнала –света. Чтобы разграничить гаметогенез и потенциально-возможное действие светабыл использован инсерционный мутант lrg6, демонстрирующий гаметогенез57(Dame et al., 2002) и теряющий хемотаксис в отсутствие светового сигнала(Ermilova et al., 2006). Характер экспрессии гена CrGLB1 у мутанта lrg6определялся методом ПЦР в режиме реального времени в вегетативных клетках идвух типах гамет: «темновых» и полученных после освещения последних втечение 2 ч (рисунок 12А).

Интересно, что уровень экспрессии этого гена умутанта lrg6 увеличивался только после освещения, тогда как для «темновыхгамет» оставался неизменным. Т.о., повышение уровней мРНК CrGLB1 послеосвещения прегамет в течение 2 часов в клетках дикого типа, а такжеинсерционного мутанта lrg6, указывает на то, что эти изменения не связаны спроцессом гаметогенеза.Методом Вестерн-блоттинга были проанализированы уровни белка CrPII ввегетативных клетках, прегаметах и гаметах обоих штаммов (рисунок 12Б).Дополнительного увеличения уровней этого белка в гаметах выявлено не было, аповышение уровней экспрессии за счет интенсификации транскрипции в 3 раза(рисунок 12Б) остается за пределами разрешения данного метода.Регуляция экспрессииCrPII светом. Для более детального анализасветового контроля уровней транскрипции гена CrGLB1 клетки C.

reinhardtiiвыращивались на среде ТАР в темноте в течение 72 часов, а затем подвергалисьосвещению белым светом в течение 30 мин, 2, 4, 6, 8 и 24 ч (рисунок 13А). Былоустановлено, что уровень транскрипции гена CrGLB1 повышается в течение 2часов освещения, достигая трехкратного увеличения, по сравнению с клетками,выращеннымивтемноте.Придальнейшем освещенииклетокуровеньтранскрипции этого гена снижается.

Методом Вестерн-блоттинга было показано,что наблюдаемое увеличение не оказывает значительного воздействия на уровнибелка PII (рисунок 13Б).В соответствии с полученными данными, можно заключить, что уровнитранскрипции и трансляции CrPII достаточно постоянны на свету и в темноте, заисключением небольшого повышения транскрипции, наблюдаемого в ответ напереноc клеток из темноты на свет.58Относительная экспрессияAБ8642000.5246ТемнотаСвет, чТемнотаСвет, ч00.524688242424CrPIIРисунок 13. Экспрессия CrPII в темноте и после освещения белым светом. Выращенные втемноте вегетативные клетки штамма СС-124 освещались в течение 0,5; 2; 4; 6; 8 и 24 ч.А Уровни относительной экспрессии CrGLB1.Б Оценка уровней белка CrPII методом Вестерн-блоттинга с использованием PII-специфичныхантител.Экспрессия CrPII в условиях недостатка азота. Поскольку быловыявленоповышениеуровнятранскрипцииCrGLB1впрегаметах,инкубированных в течение 4 часов в темноте (данные не приведены), далее намибыла проанализирована роль азота в регуляции накопления мРНК CrGLB1.Транскрипция CrGLB индуцируется уже после 30 минут удаления аммония изсреды и достигает максимальных уровней в течение 2-4 часов инкубации в средебез азота в темноте (рисунок 14А).Ранее было показано, что синхронно растущие вегетативные клеткидифференцируются в прегаметы в среде без азота в темноте только за 4 часа(Ermilova et al., 2004).

Т.о., увеличение уровня мРНК CrGLB1 в прегаметах посравнению с вегетативными клетками является реакцией именно на удалениеазота. Эти данные дополнительно подтверждают заключение о независимостирегуляции CrGLB1от гаметогенеза. Что касается уровней белка PII, то в данном59эксперименте также не было выявлено значительных различий при перенесенииклеток в среду без азота (рисунок 14Б).Относительная экспрессияA10864200Б0.524TAPTAP-N, чTAPTAP-N, ч00.524CrPIIРисунок 14. Экспрессия CrPII в вегетативных клетках в условиях недостатка азота.Выращенные в темноте вегетативные клетки штамма СС-124 переносились из полной среды(TAP) в среду без азота (TAP-N).А Уровни относительной экспрессии CrGLB1.Б Оценка уровней белка CrPII методом Вестерн-блоттинга с использованием PII-специфичныхантител.3.1.4. Олигомерная структура CrPIIСигнальныепредставляютбелкисобойPIIувсех(гомо)тримерныепроанализированныхбелки.организмовСравнительныйанализаминокислотных последовательностей демонстрирует, что все необходимые дляобразования тримерной структуры консервативные основания, характерные дляPII-белков бактерий и растений, также присутствуют в белке C.

reinhardtii(рисунок 10). Чтобы экспериментально подтвердить формирование тримерныхструктур белка CrPII, соответствующий рекомбинантный белок (StrepCrPII-tp),очищенный до уровня электрофоретической гомогенности. По данным гельфильтрации размер белка составляет около 49 кДа (рисунок 15). Поскольку вденатурирующем SDS-ПААГ белок мигрирует с молекулярной массой порядка 17кДа, был сделан вывод о тримерной структуре белка CrPII.60Рисунок 15. Анализ олигомерной структуры белка СrPII методом эксклюзионнойхроматографии (гель-фильтрации). mAU – уровень сигнала УФ-детектора при длине волны 280нм; Ve/Vo – объем элюции.А Стандартная калибровочная кривая по белкам с известными молекулярными массами.Б Профиль элюции CrPII.3.2.

Характеристики

Список файлов диссертации

Структура и функции сигнальных белков PII у одноклеточных зеленых водорослей Chlamydomonas reinhardtii и Chlorella variabilis
Свежие статьи
Популярно сейчас
Как Вы думаете, сколько людей до Вас делали точно такое же задание? 99% студентов выполняют точно такие же задания, как и их предшественники год назад. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6390
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее