Диссертация (Свободные и координированные ионами Pt(II), Pd(II) тетразолилуксусные кислоты как перспективные скаффолды в синтезе новых биологически активных веществ), страница 15

PDF-файл Диссертация (Свободные и координированные ионами Pt(II), Pd(II) тетразолилуксусные кислоты как перспективные скаффолды в синтезе новых биологически активных веществ), страница 15 Химия (47654): Диссертация - Аспирантура и докторантураДиссертация (Свободные и координированные ионами Pt(II), Pd(II) тетразолилуксусные кислоты как перспективные скаффолды в синтезе новых биологически ак2019-06-29СтудИзба

Описание файла

Файл "Диссертация" внутри архива находится в папке "Свободные и координированные ионами Pt(II), Pd(II) тетразолилуксусные кислоты как перспективные скаффолды в синтезе новых биологически активных веществ". PDF-файл из архива "Свободные и координированные ионами Pt(II), Pd(II) тетразолилуксусные кислоты как перспективные скаффолды в синтезе новых биологически активных веществ", который расположен в категории "". Всё это находится в предмете "химия" из Аспирантура и докторантура, которые можно найти в файловом архиве СПбГУ. Не смотря на прямую связь этого архива с СПбГУ, его также можно найти и в других разделах. , а ещё этот архив представляет собой кандидатскую диссертацию, поэтому ещё представлен в разделе всех диссертаций на соискание учёной степени кандидата химических наук.

Просмотр PDF-файла онлайн

Текст 15 страницы из PDF

Однако гидродинамические измерения позволяютполучить более конкретную информацию, необходимую для определениямеханизма взаимодействия комплекса с нуклеиновой кислотой [129].Вязкость растворов ДНК зависит от изменений её длины, котораяможет изменяться в результате ее взаимодействия с комплексом металла.Так, интеркалирующий металлический комплекс вызывает разделение пароснований, что приводит к удлинению спирали нуклеиновой кислоты иувеличению ее вязкости. В случае частичной и/или неклассическойинтеркаляции (бороздочное связывание, взаимодействие комплекса ссахарофосфатным остовом) наблюдается изгибание двойной спирали ДНК,приводящее к менее заметным изменениям (увеличению или уменьшению)вязкости, либо вообще не вызывая изменений в вязкости раствора ДНК [130].В настоящем исследовании, влияние тетразолсодержащих транскомплексов на гидродинамические свойства ДНК рассмотрено на примерекомплекса 28 (транс-[PdCl2L2], L = этиловый эфир-2-трет-бутил-2Нтетразол-5-илуксусной кислоты).Полученные данные свидетельствуют отом, что добавление комплекса к раствору ДНК тимуса телёнка вызываетуменьшениевязкостираствора.Связываниеможетсопровождатьсяперегибами двойной спирали ДНК, которые вызывают уменьшение еёразмера[131].Следуетотметить,чтоэкспериментальныекривые,полученные как сразу после смешивания (через 20 мин) раствора ДНК сраствором комплекса, так и после суточного хранения растворов при 4°С,имеютсхожийпредварительнохарактер.Полученныеобсуждаемуюгипотезурезультатыовозможномподтверждаютбороздочномсвязывании комплексов металлов с ДНК тимуса телёнка [132]1151.0red/red(DNA)0.80.60.4120.20.00.000.050.100.150.200.25Ccomplexx104, MРисунок 3.14.

Зависимость вязкости ДНК-растворов от концентрации комплекса 28 (trans[PdCl2L2], L = этиловый эфир-2-трет-бутил-2Н-тетразол-5-илуксусной кислоты) в 5 мМNaCl. [ДНК] = 0,0066% (66 мкг/мл): 1 - после смешивания (20 мин); 2 – спустя сутки послехранения смеси при 4 °C.1163.5.1.5.

Исследование методом гель-электрофорезаИзвестно,чтометод,основанныйнаисследованииэлектрофоретической подвижности ДНК чрезвычайно информативен длямониторинга изменений, происходящих в третичной структуре ДНК[133,134]. Исследование электрофоретической подвижности проводили сиспользованием плазмидной суперспирализованной ДНК бактерий. Нативнаяплазмидная ДНК находится в обычном состоянии в суперспирализованнойформе,такжеизвестнойкакковалентно-закрытаякольцеваяДНК,обозначенная здесь как форма I. Одноцепочечные разрывы приводят кобразованию, так называемой, открытой кольцевой ДНК (обозначенной какформа II), в то время как двухцепочечное расщепление приводит кобразованию линейной ДНК (обозначенной как форма III). Скоростьмиграции ДНК в агарозном геле зависит как от длины полинуклеотида(количества пар оснований), так и от конформации, причем более коротокаяи/или конденсированная ДНК мигрирует быстрее, чем более длинная и/илираскрученная ДНК.

Суперспирализованная ДНК (форма I) имеет плотноупакованную конформацию и, следовательно, быстрее переносится черезагарозный гель, чем линейная ДНК (имеет промежуточную скоростьмиграции) или открытая кольцевая ДНК (имеет самую низкую скоростьмиграции) [121].В настоящей работе исследовали способность комплексов 27, 28, 30,31,33связыватьираскручиватьДНКпослепревращениясуперспирализованной формы плазмидной ДНК pBR322 в открытуюкольцевую форму с использованием электрофореза в агарозном геле (рис.3.15,3.16).Результатыгель-электрофорезасуперспирализованнойплазмидной ДНК pBR322 в присутствии 0,1-0,4 мМ комплексов говорят отом, что при рН 7.2 все соединения взаимодействуют с ДНК (Рис. 3.15).Электрофореграммадемонстрируетэлектрофоретическойподвижности.концентрационнуюзависимостьКромеувеличениемтого,с117концентрациикомплексовPd(II)31,33наблюдаетсявозможноепревращение суперспирализованной ДНК (форма I) в открытую кольцевуюДНК (форма II).

Образования линейной ДНК (форма III), не наблюдается нидля одного из комплексов.Рисунок 3.15. Электрофореграмма плазмидной ДНК pBR322 (300 нг) в агарозном геле,после обработки комплексами 33 и 28 (0,1-0,4 мМ) и 16 ч инкубации (в зависимости отконцентрации) Дорожка 1: контроль; дорожка 2: 0,1 мМ компл. 33 + ДНК; Дорожка 3: 0,2мМ компл.33 + ДНК; Дорожка 4: 0,4 мМ 33 + ДНК. Дорожка 5: 0,1 мМ 28 + ДНК;Дорожка 6: 0,2 мМ 28 + ДНК; дорожка 7: 0,4 мМ 28 + ДНК, дорожка 8: маркер в трисбуфере (5 мМ Трис-HCl / 50 мМ NaCl, pH 7,2 при 25 °С).Заметное количество формы II образуется в случае комплексов 33, 28,27 при концентрации 0,4 мМ. Малое влияние на ДНК оказывают соединения30и31,содержащиевкачествелигандаэтиловыйэфир2-гидроксиэтилтетразол-5-илуксусной кислоты (рис.

3.16).Рисунок 3.16. Электрофореграмма плазмидной ДНК pBR322 (300 нг) в агарозном геле,после обработки комплексами 27, 30 и 31 (0,1-0,4 мМ) и 16 ч инкубации (в зависимостиот концентрации): дорожка 1: 0,1 мМ компл.27 + ДНК; дорожка 2: 0,4 мМ компл. 27 +ДНК; дорожка 3: 0,1 мМ компл. 30 + ДНК; дорожка 4: 0,4 мМ компл. 30 + ДНК. дорожка5: 0,1 мМ компл. 31 + ДНК; дорожка 6: 0,4 мМ компл. 31 + ДНК, дорожка 7: контроль,дорожка 8: маркер в трис-буфере (5 мМ Трис-HCl / 50 мМ NaCl, pH 7,2 при 25 ° С).1183.5.1.6. Молекулярный докинг комплексов Pd(II) и Pt(II)с додекамером ДНК d(CGCGAATTCGCG)2Для выяснения способа взаимодействия и аффинности связываниякомплексов с ДНК была проведена молекулярная стыковка додекамераd(CGCGAATTCGCG)2 {PDB ID: 1BNA} с комплексами Pd(II) и Pt(II) 28 и 29,содержащие этиловый эфир 2-трет-бутил-тетразол-5-илуксусной кислоты вкачестве лиганда.

Исследование показало, что данные комплексы металловэффективно взаимодействуют с ДНК, связываясь с ее малой бороздой (рис.3.17). При этом металлокомплексы принимают конформацию оптимальнуюдля образования vdW контактов с фрагментом GAAT 1BNA. Следуетотметить, что ось Cl-M-Cl ориентирована перпендикулярно ДНК (рис.3.18А). Для комплексов Pd(II) или Pt(II), наблюдается один и тот же способразмещения комплексов (рис. 3.18Б). Важно отметить, что кластеризацияпоказывает, что три наиболее энергетически предпочтительные кластерырасположены именно в области малой борозды (рис. 3.18В).AБРисунок 3.17.

Молекулярная модель докинга металлических комплексов 28 (модель A)и 29 (модель Б) с ДНК (PDB ID: 1BNA).119АБВГРисунок 3.18.Докиинг комплексов 28 и 29 с молекулой ДНК в различных проекциях120аКомплексСвободная энергиясвязванияa (ΔGbinding)Vdw_hb_desolvenergy(ΔGvdW +hb + desolv)Электростатическаяэнергия(ΔGelec)Общая внутренняяэнергия(ΔGtotal)Свободнаяторсионная энергия(ΔGtor)Энергия несвязанной системы(ΔGunb)Предполагаемаяконстантаингибированияb, Ki,μMТаблица 3.6Результаты докинга комплексов 28 и 29 с додекамером B-ДНК d(CGCGAATTCGCG)2{PDB ID: 1BNA}, ккал моль-127-5.56-8.75-0.10-2.06+3.29-2.0684.1928-6.12-9.39-0.02-0.97+3.29-0.9732.73ΔGbinding = ΔGvdW + hb + desolv + ΔGelec + ΔGtotal + ΔGtor- ΔGunbТемпература 298.15 KbКомплекс Pt (II) 29 демонстрирует более высокую энергию связыванияс ДНК 1BNA (наименьшая свободная энергия связи ΔGсвязывания = -6,12 ккал.моль-1) по сравнению с комплексом Pd (II) 28 (самая низкая свободнаяэнергия связи ΔGсвязывания = -5,56 ккал моль-1).Таким образом, расчеты методом молекулярной механики хорошокоррелируются со спектральными данными и подтверждают именномеханизм бороздочного связывания.1213.5.2.

Исследование взаимодействия между БСА и комплексамиметаллов с производными тетразолилуксусных кислотПриродаисилавзаимодействияальбуминаслекарственнымпрепаратом влияет на абсорбцию, распределение, метаболизм и выведениепрепарата из организма. Кроме того, взаимодействие лекарственногосредства с белками плазмы непосредственно влияет на концентрациюлекарства в крови и его биологический эффект.

Одним из самых важныхпреимуществ альбуминов в том, что они обратимо связываются сразличнымисоединениями.Белокчастоувеличиваетрастворимостьгидрофобных лекарственных средств в плазме и влияет на кровообращение,обмен веществ и эффективность препаратов [135]. Как правило, слабоесвязывание препарата с белками говорит о его плохом распределении ибыстром выведении из организма, в то время как сильное связываниеприводит к уменьшению концентрации активной формы лекарственногосредства. [136]Таким образом, исследование механизма взаимодействия малыхмолекул с сывороточным альбумином имеет важное значение для пониманияфармакодинамики и фармакокинетики лекарственных препаратов.

[137,138].Сывороточные альбумины являются наиболее распространеннымибелками в системе кровообращения, которые играют важную роль втранспорте иосажденииразличныхэкзогенныхсоединений.Средисывороточных альбуминов бычий сывороточный альбумин (БСА) являетсяподходящейбелковоймодельюдляизучениявзаимодействияслекарственными средствами из-за его лигандсвязывающих свойств иструктурной гомологией с человеческим сывороточным альбумином (ЧСА)[125].В рамках данного исследования с помощью УФ-спектроскопиипоглощения и флуориметрии экспериментов тушения триптофана изученаспособность металлокомплексов 28, 34, 38 связываться с БСА. Наиболее122благоприятные сайты связывания были определены теоретически с помощьюмолекулярного докинга.3.5.2.1. Исследование взаимодействия металлокомплексов с БСАметодом УФ-спектроскопииОдним из распространенных методов, используемых для определениямеханизмасвязыванияБСАскомплексомметалла,являетсяУФ-спектроскопия.

Свежие статьи
Популярно сейчас
Зачем заказывать выполнение своего задания, если оно уже было выполнено много много раз? Его можно просто купить или даже скачать бесплатно на СтудИзбе. Найдите нужный учебный материал у нас!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
5288
Авторов
на СтудИзбе
417
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее