Диссертация (1174185), страница 21
Текст из файла (страница 21)
Присвоение индекса «_a», означает, что уровеньгетероплазмии мутаций митохондриального генома представлен для участковинтимы с липофиброзной бляшкой; если данный индекс в названии мутацииотсутствует, то уровень гетероплазмии исследуемой мутации указан длянормальных участков интимы аорты [89].Данные в таблице 22представлены в виде среднего, стандартногоотклонения и межквартильных значений [89].Таблица 22. Показатели уровня гетероплазмии исследуемых мутациймитохондриального генома в липофиброзных бляшках и нормальныхучастках интимы аорт [89].МутацияСреднееСтандартноеотклонениеПроцентили (квартили)25%50% (медиана)75%m.652delG5,910,30,00,09,0m.652delG _a7,68,90,02,017,0m.652insG2,44,60,00,05,0m.652insG _a2,44,20,00,08,0m.716T>G1,72,40,00,03,0m.716T>G_a1,31,70,00,03,0m.750A>G4,61,83,04,07,0m.750A>G_a6,04,53,05,06,0m.961delC0,92,30,00,00,0m.961delC_a0,00,00,00,00,0m.961insC16,912,74,023,027,0154m.961insC_a22,716,611,023,029,0m.1555A>G14,619,20,014,019,0m.1555A>G_a4,74,60,07,08,0m.3256C>T11,08,28,010,013,0m.3256C>T_a14,611,28,012,022,0m.3258T>C6,75,63,05,010,0m.3258T>C_a7,92,75,08,011,0m.3271T>C0,00,00,00,00,0m.3271T>C_a2,46,40,00,00,0m.3280A>G1,32,40,00,03,0m.3280A>G_a1,93,50,00,04,0m.3285C>T2,72,10,03,05,0m.3285C>T_a3,42,02,04,05,0m.3316G>A3,13,50,02,07,0m.3316G>A_a4,62,92,05,06,0m.3336T>C9,924,80,00,03,0m.3336T>C_a4,36,40,00,07,0m.5132delAA0,91,60,00,02,0m.5132delAA_a3,36,00,00,08,0m.5132insAA5,66,50,03,013,0m.5132insAA_a3,95,30,00,09,0m.5178C>A12,39,57,010,014,0m.5178C>A_a9,06,75,07,018,0m.5540G>A6,74,63,08,011,0m.5540G>A_a6,33,84,06,07,0m.5692T>C5,94,34,05,08,0m.5692T>C_a5,02,43,05,05,0m.5814T>C2,32,50,02,05,0m.5814T>C_a3,45,00,00,06,0155m.6489C>A6,46,73,04,08,0m.6489C>A_a3,12,52,03,04,0m.8362T>G0,00,00,00,00,0m.8362T>G_a0,00,00,00,00,0m.8363G>A0,00,00,00,00,0m.8363G>A_a0,00,00,00,00,0m.8993T>C0,00,00,00,00,0m.8993T>C _a0,00,00,00,00,0m.8993T>G44,73,642,046,047,0m.8993T>_a43,71,643,044,045,0m.9379G>A2,32,70,02,02,0m.9379G>A_a4,72,83,06,07,0m.9480del153,34,50,00,07,0m.9480del15_a6,35,93,04,09,0m.9537delC15,924,40,09,022,0m.9537delC_a15,313,02,012,027,0m.12315G>A3,75,00,00,08,0m.12315G>A _a14,414,75,06,035,0m.13513G>A30,712,720,030,045,0m.13513G>A_a40,016,125,040,060,0m.14459G>A3,63,52,03,04,0m.14459G>A_a11,718,43,04,010,0m.14482C>A47,45,142,049,051,0m.14482C>A_a46,04,842,048,049,0m.14482C>G2,32,50,02,05,0m.14482C>G_a8,414,60,04,07,0m.14484T>C1,12,00,00,04,0m.14484T>C_a2,33,70,00,04,0m.14487T>C4,42,23,04,07,0156m.14487T>C_a5,32,43,05,08,0m.14709T>C2,43,80,00,05,0m.14709T>C_a4,13,52,03,06,0m.14846G>A4,73,12,05,08,0m.14846G>A_a6,74,16,06,08,0m.15059G>A14,618,70,00,031,0m.15059G>A_a38,629,10,041,066,0m.15084G>A0,41,10,00,00,0m.15084G>A_a0,30,80,00,00,0m.15452C>A74,033,280,082,090,0m.15452C>A_a73,434,372,086,098,0m.15498del242,44,60,00,05,0m.15498del24_a2,65,00,00,05,0m.15762G>A5,04,30,06,07,0m.15762G>A_a5,34,13,04,09,0величиныгетероплазмииСравнениевнормальныхиатеросклеротических участках сосудистой стенки аорт проводили методаминепараметрической статистики с использованием рангового теста Уилкоксона(таблица 23) [89].Таблица 23.
Сравнение уровня гетероплазмии 42 мутаций мтДНК внормальных участках интимы аорт и липофиброзных бляшках с помощьюрангового теста Уилкоксона [89]МутацииВид рангаm.652delGКоличество Средний СуммарныйранговрангрангОтрицательный00,00*0,00*Положительный53,00*15,00*Нейтральный2157m.652insGm.716T>Gm.750A>Gm.961insCm.961delCm.1555A>Gm.3256C>Tm.3258T>Cm.3271T>Cm.3280A>GОтрицательный22,505,00Положительный22,505,00Нейтральный3Отрицательный21,50*3,00*Положительный00,00*0,00*Нейтральный5Отрицательный24,509,00Положительный43,0012,00Нейтральный1Отрицательный32,678,00Положительный34,3313,00Нейтральный1Отрицательный11,001,00Положительный00,000,00Нейтральный6Отрицательный42,50*10,00*Положительный00,00*0,00*Нейтральный3Отрицательный21,50*3,00*Положительный56,00*42,00*Нейтральный0Отрицательный16,006,00Положительный53,0015,00Нейтральный1Отрицательный00,000,00Положительный11,001,00Нейтральный6Отрицательный11,501,50Положительный22,254,50158m.3285C>Tm.3316G>Am.3336T>Cm.5132insAAm.5132delAAm.5178C>Am.5540G>Am.5692T>Cm.5814T>Cm.6489C>AНейтральный4Отрицательный23,256,50Положительный43,6314,50Нейтральный1Отрицательный11,50*1,50*Положительный43,38*13,50*Нейтральный2Отрицательный12,00*4,00*Положительный34,00*6,00*Нейтральный3Отрицательный33,009,00Положительный23,006,00Нейтральный2Отрицательный21,50*3,00*Положительный23,50*7,00*Нейтральный3Отрицательный44,00*11,00*Положительный12,75*4,00*Нейтральный2Отрицательный44,0016,00Положительный34,0012,00Нейтральный0Отрицательный43,0012,00Положительный24,509,00Нейтральный1Отрицательный21,503,00Положительный13,003,00Нейтральный4Отрицательный43,38*13,50*159m.8362T>Gm.8363G>Am.8993T>Gm.8993T>Cm.9379G>Am.9480del15m.9537delCm.12315G>Am.13513G>AПоложительный11,50*1,50*Нейтральный2Отрицательный00,000,00Положительный00,000,00Нейтральный7Отрицательный00,000,00Положительный00,000,00Нейтральный7Отрицательный53,4017,00Положительный25,5011,00Нейтральный0Отрицательный00,000,00Положительный00,000,00Нейтральный7Отрицательный22,25*4,50*Положительный54,70*23,50*Нейтральный0Отрицательный32,33*7,00*Положительный34,67*14,00*Нейтральный1Отрицательный24,008,00Положительный43,2513,00Нейтральный1Отрицательный11,00*1,00*Положительный54,00*20,00*Нейтральный1Отрицательный13,58*6,50*Положительный66,50*21,50*Нейтральный0160m.14459G>Am.14482C>Am.14482C>Gm.14484T>CM.14487T>Cm.14709T>Cm.14846G>Am.15059G>Am.15084G>Am.14598del24Отрицательный22,00*4,00*Положительный33,67*11,00*Нейтральный2Отрицательный44,0016,00Положительный22,505,00Нейтральный1Отрицательный11,00*1,00*Положительный33,00*9,00*Нейтральный3Отрицательный12,002,00Положительный22,004,00Нейтральный4Отрицательный22,00*4,00*Положительный44,25*17,00*Нейтральный1Отрицательный23,256,50Положительный43,6314,50Нейтральный1Отрицательный22,25*4,50*Положительный44,13*16,50*Нейтральный1Отрицательный00,00*0,00*Положительный53,00*15,00*Нейтральный2Отрицательный12,002,00Положительный11,001,00Нейтральный5Отрицательный22,254,50Положительный22,755,50161m.15452C>Am.15762G>AНейтральный3Отрицательный24,759,50Положительный42,8811,50Нейтральный1Отрицательный32,337,00Положительный24,008,00Нейтральный2Примечание: * более, чем двухкратное отличие между положительными иотрицательными значениями рангов.Согласно ранговому тесту Уилкоксона было выявлено 18 мутаций, укоторых арифметическая разница между количеством положительных иотрицательных рангов была не менее 2, направление связи совпадало как посреднему значению ранга, так и по суммарным рангам.
Разница междузначениями одного из видов рангов (или среднего или суммарного) была неменее двухкратной. Такими мутациями оказались m.652delG,m.716T>G,m.1555A>G, m.3256C>T, m.3316G>A, m.3336C>T, m.5132delAA, m.5178C>A,m.6489C>A,m.9379G>A,m.9480del15,m.12315G>A,m.13513G>A,m.14459G>A, m.14482C>G, m.14487T>C, m.14846G>A и m.15059G>A [89, 114].В то же время, корреляционный анализ, проведенный методом бутстрэп,показал, что мутации m.652delG, m.3256C>T, m.12315G>A, m.14459G>A иm.15059G>A высокодостоверно ассоциированы с липофиброзными бляшкамиаорты (p≤0,05), а m.13513G>A и m.14846G>A – значимо на уровне p≤0,1.Мутации m.1555A>G и m.5178C>Aоказались связаны с отсутствиемлипофиброзных бляшек на уровне значимости p≤0,05 (таблица 24).
Для рядазначимых мутаций достоверность отличий отображена на блочных диаграммах(рисунки 2633) [89, 114].Помимо формального статистического подхода, был использован подход,использующий в качестве критерия частоту выявления различий между162показателями гетероплазмии в нормальных и атеросклеротических пораженияхв образцах, полученных от одного и того же донора аутопсийного материала[13, 27, 45, 83, 87-98, 100-102, 104-116, 119, 120, 160, 463, 482, 483, 493, 495-500,502, 505, 528-532].Обнаружено11митохондриальныхмутаций,принадлежащихмитохондриальным генам MT-ND6, MT-RNR1, MT-CYTB, MT-TL2, MT-ND1,MT-ND2, MT-TL1 и MT-ND5, которые ассоциированы с атеросклеротическимипоражениями [13, 27, 45, 83, 87-98, 100-102, 104-116, 119, 120, 160, 463, 482,483, 493, 495-500, 502, 505, 528-532].Данные по образцам аорт, имеющихзначительные отличия в проценте гетероплазмии по данным мутациям влипофиброзных бляшках по сравнению с нормальной сосудистой тканью,представлены в таблице 25.
Как видно из таблицы, по мутациям m.652insG иm.3336Т>С такие отличия имеются в 29% аорт;по мутациям m.3256C>T,m.14459G>A, m.14846G>A и m.15059G>A – в 43%. Более половины образцовимеют значительные отличия в проценте гетероплазмии по мутациямm.652delG, m.1555A>G и m.5178C>A – в 57%. И, наконец, в наибольшемколичестве липофиброзных бляшек преобладают, по сравнению с нормальнойинтимой, мутации m.12315G>A и m.13513G>A – в 71% и 86% (соответственно)[13, 27, 45, 83, 87-98, 100-102, 104-116, 119, 120, 160, 463, 482, 483, 493, 495-500,502, 505, 528-532].Такимобразом,приколичественнойоценкемутантногоаллелямитохондриального генома отмечаются значительные отличия процентагетероплазмии по 11 мутациям между образцами из липофиброзной бляшки инормальной интимы аорты [13, 27, 45, 83, 87-98, 100-102, 104-116, 119, 120, 160,463, 482, 483, 493, 495-500, 502, 505, 528-532].После анализарезультатов как формального, так и неформальногостатистических подходов было принято решение продолжить исследование 11мутаций митохондриального генома на образцах интимы аорты и клеток кровипораженных атеросклерозом индивидов.163Рисунок 26.
Демонстрация достоверности отличий уровня гетероплазмиимутации m.652delG в липофиброзной бляшке и нормальной интиме аорт наблочной диаграмме [89].Рисунок 27. Демонстрация достоверности отличий уровня гетероплазмиимутации m.1555A>G в липофиброзной бляшке и нормальной интиме аортна блочной диаграмме [89].164Рисунок 28. Демонстрация достоверности отличий уровня гетероплазмиимутации m.3256C>T в липофиброзной бляшке и нормальной интиме аортна блочной диаграмме [89, 114].Рисунок 29. Демонстрация достоверности отличий уровня гетероплазмиимутации m.5178C>A в липофиброзной бляшке и нормальной интиме аортна блочной диаграмме [89].165Рисунок 30.