Диссертация (1150270), страница 22
Текст из файла (страница 22)
На примере обнаружения вирусов птиц вреальных образцах показано, что разработанная микрочиповая аналитическаясистема позволяет существенно сократить время анализа и затраты надорогостоящие реактивы и оборудование.~ 153 ~Перечень используемых сокращенийПЦР ‒ полимеразная цепная реакцияРНК ‒ рибонуклеиновая кислотаОТПЦР ‒ полимеразная цепная реакция с обратной транскрипциейкДНК ‒ комплементарная дезоксирибонуклеиновая кислотаБСА ‒ бычий сывороточный альбуминДНК ‒ дезоксирибонуклеиновая кислотадНТФ ‒ дезоксирибонуклеозидтрифосфатыНК ‒ нуклеиновая кислотаПЦР РВ‒ полимеразная цепная реакция в режиме реального времениМЭМС ‒ микроэлектромеханическая системаПХО ‒ плазмохимическое осаждениеГМДС ‒ гексаметилдисилоксанЭИС ‒ электрохимическая импедансная спектроскопияДЭС ‒ двойной электрический слойСЭМ ‒ сканирующая электронная микроскопияКРС ‒ комбинационное рассеяние светаПВП ‒ поливинилпирролидонПАВ ‒ поверхностно-активное веществоЭДТА ‒ этилендиаминтетрауксусная кислотаНБ ‒ Ньюкасла болезньИБК ‒ инфекционный бронхит курРГА ‒ реакция гемагглютинацииРТГА ‒ реакция торможения гемагглютинацииИФА ‒ иммуноферментный методROX ‒ карбокси-Х-родаминFAM ‒ карбоксифлуоресцеинPECVD ‒ plasma enhanced chemical vapor deposition~ 154 ~ЛИТЕРАТУРА1.Yoon-Kyoung Cho, Jintae Kim, Youngsun Lee, Young-A.
Kim. Clinicalevaluation of micro-scale chip-based PCR system for rapid detection of hepatitis Bvirus. Biosensors and Bioelectronics 21 (2006) 2161–2169.2. Shi-Hua Wang, Ji-Kai Wen, Ya-Feng Zhou, Zhi-Ping Zhang, Rui-Fu Yang, Ji-BinZhang, Jia Chen, Xian-En Zhang. Identification and characterization of Bacillusanthracis by multiplex PCR on DNA chip. Biosensors and Bioelectronics 20 (2004)807–813.3. Ребриков, Д.В. ПЦР в реальном времени [Электронный ресурс] / Д. В.Ребриков [и др.] ; ред.д.б.н.Д.В.Ребрикова.
— 4-е изд. (эл.). — М.:БИНОМ.Лаборатория знаний, 2013. — 223 с..4. E. van Pelt-Verkuil Principles and Technical Aspects of PCR Amplification/ E. vanPelt-Verkuil, A. van Belkum, J.P. Hays// Springer Science. - 2008, - p. 332.5. Сляднев, М.Н.. Микрочиповые системы для молекулярно-генетическогоанализа / М.Н. Сляднев// Рос. хим. ж. (Ж. Рос. хим.
общества им. Д.И.Менделеева). 2011, т. LV. № 2.6. Alberts, B., Johnson, A., Lewis, J. Raff, M., Roberts, K., Walter, P. 2008. MolecularBiology of the Cell, 5th ed. Garland Science, Taylor & Francis Group, NY, pp 538-539.7. Alwine JC, Kemp DJ, Stark GR (December 1977). "Method for detection of specificRNAs in agarose gels by transfer to diazobenzyloxymethyl-paper and hybridizationwith DNA probes". Proc. Natl. Acad.
Sci. U.S.A. 74 (12): 5350–4.8. Michael J. McPherson PCR Second Edition / Michael J. McPherson, Simon GeirMøller// - 2006. - p. 209-212.9. Bustin SA, Benes V, Nolan T, Pfaffl MW (June 2005). "Quantitative real-time RTPCR-a perspective". J. Mol. Endocrinol. 34 (3): 597–60110. Hierro N, Esteve-Zarzoso B, González A, Mas A, Guillamón JM (November2006)."Real-time quantitative PCR (QPCR) and reverse transcription-QPCR fordetection and enumeration of total yeasts in wine". Appl. Environ. Microbiol. 72 (11):7148–55.~ 155 ~11.
Slomka MJ, Pavlidis T, Coward VJ, et al. (July 2009). "Validated RealTime reversetranscriptase PCR methods for the diagnosis and pathotyping of Eurasian H7 avianinfluenza viruses". Influenza Other Respi Viruses 3 (4): 151–64.12. Schmittgen TD, Zakrajsek BA, Mills AG, Gorn V, Singer MJ, Reed MW (October2000). "Quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction to study mRNAdecay: comparison of endpoint and real-time methods".
Anal. Biochem. 285 (2): 194–204.13. Rajeevan MS, Vernon SD, Taysavang N, Unger ER (February 2001). "Validation ofarray-based gene expression profiles by real-time (kinetic) RT-PCR". J MolDiagn 3 (1): 26–31.14. Deepak S, Kottapalli K, Rakwal R, et al. (June 2007). "Real-Time PCR:Revolutionizing Detection and Expression Analysis of Genes".
Curr. Genomics 8 (4):234–51.15. Yang DK, Kweon CH, Kim BH, et al. (December 2004). "TaqMan reversetranscription polymerase chain reaction for the detection of Japanese encephalitisvirus". J. Vet. Sci. 5(4): 345–51.16. Holden, M. J.; Wang, L. (2008). "Quantitative Real-Time PCR: Fluorescent ProbeOptions and Issues". Standardization and Quality Assurance in FluorescenceMeasurements II. Springer Series on Fluorescence 6. p. 489.17. Wong ML, Medrano JF (July 2005). "Real-time PCR for mRNA quantitation".BioTechniques 39 (1): 75–85.18 Sharkey FH, Banat IM, Marchant R (July 2004). "Detection and quantification ofgene expression in environmental bacteriology".
Appl. Environ. Microbiol. 70 (7):3795–806.19. Elnifro EM, Ashshi AM, Cooper RJ, Klapper PE (October 2000). "Multiplex PCR:optimization and application in diagnostic virology". Clin. Microbiol. Rev. 13 (4): 559–70.20. Зорина, В.В. Основы полимеразной цепной реакции (ПЦР). Методическоепособие. М.: ДНК-технология, 2012.
— 80 с.21. Антонова О.С., Рудницкая Г.Е., Тупик А.Н. и др. Полимеразная цепнаяреакция: приборная и методическая реализация. Обзор аналитическиххарактеристик // Научное приборостроение. - 2011. - Т. 21, № 4. - С. 120-136. /Antonova O.S., Rudnitskaya G.E., Tupik A.N. et al. Polymerase chain reaction:~ 156 ~instrumental and methodological realization. A review of analytical characteristics //Scientific Instrument-Making [Nauchnoye Priborostroyenie]. - 2011.
- Vol. 21, № 4. P. 120-136 [Russian]..22. Hyun-Sop Choe a, Dong Sup Lee a, Seung-Ju Lee a, Sung-Hoo Hong b, DongChoon Park c, Mi-Kyung Lee d, Tae-Hyoung Kim e, Yong-Hyun Cho. Performance ofAnyplexTM II multiplex real-time PCR for the diagnosis of seven sexually transmittedinfections: comparison with currently available methods. International Journal ofInfectious Diseases (2013) xxx.e1–xxx.e7.23. Shiao YH (December 2003).
"A new reverse transcription-polymerase chainreaction method for accurate quantification". BMC Biotechnol. 3: 22..24. Gettemy JM, Ma B, Alic M, Gold MH (February 1998). "Reverse transcriptionPCR analysis of the regulation of the manganese peroxidase gene family". Appl.Environ.
Microbiol. 64 (2): 569–74.25. Ramakers C, Ruijter JM, Deprez RH, Moorman AF (March 2003). "Assumptionfree analysis of quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR) data". Neurosci.Lett.339 (1): 62–69.26. Zhang C., Xing D. // Nucleic Acids Res. 2007. Vol. 35. P. 4223-37.27.
Zhang Y., Ozdemir P. // Anal. Chim. Acta. 2009. Vol. 638. P. 115-125.28. Geschke O., Klank H., Telleman P., eds. Microsystem Engineering of Lab-on-aChip Devices. Wiley-VCH, 2008.29. Herold K.E., Rasooly A., eds. Lab-on-a-Chip Technology (Vol. 1): Fabrication andMicrofluidics. Caister Academic Press, 2009.30. Madou M.J. Fundamentals of Microfabrication and Nanotechnology (Vol.3) FromMEMS to Bio-MEMS and Bio-NEMS: Manufacturing Techniques and Applications.CRC Press, 2011.31. Nge P.N., Rogers C.I., Woolley A.T. // Chemical Reviews.
2013. Vol. 113. P. 25502583.32. Choi J., Jeong Y., Han H.S., Lee K.H. // Biosci Rep. 2014. Vol. 34.33. West J., Becker M., Tombrink S., Manz A. // Anal. Chem. 2008. Vol. 80. P. 440319.~ 157 ~34. Chang C.-M., Chang W.-H., Wang C.-H., Wang J.-H., Mai J.D., Lee G.-B. // LabChip. 2013. Vol. 13. P. 1225-1242.35. Wang J.-H., Wang C.-H., Lee G.-B. // Ann Biomed Eng. 2012. Vol. 40. P. 13671383.36. Day E., Dear P.H., McCaughan F.
// Methods. 2013. Vol. 59. P. 101-107.37. Sedlak H.R., Jerome K.R. // Expert Review of Molecular Diagnostics. 2014. Vol.14. P. 501-507.38. Northrup M.A., Ching M.T., White R.M., Watson R.T. // In Transducers’93,seventh international conference on solid state Sens Actuators, Yokahama, Japan,. 1993.P. 924.39. Neuzil P., Zhang C., Pipper J., Oh S., Zhuo L. // Nucleic Acids Res. 2006.
Vol. 34.P. e77.40. Hong J., Edel J.B., deMello A.J. // Drug Discov Today. 2009. Vol. 14. P. 134-46.41. Lee H., Han N., Choi I.H., Han K.H. // Biomed Microdevices. 2013. Vol. 15. P. 915.42. Easley C.J., Karlinsey J.M., Bienvenue J.M., Legendre L.A., Roper M.G., FeldmanS.H., Hughes M.A., Hewlett E.L., Merkel T.J., Ferrance J.P., Landers J.P. // Proc NatlAcad Sci U S A.
2006. Vol. 103. P. 19272-7.43. Lien K.Y., Lin J.L., Liu C.Y., Lei H.Y., Lee G.B. // Lab Chip. 2007. Vol. 7. P. 86875.44. Seung-min P., Sabour A.F., Jun Ho S., Sang Hun L., Lee L.P. // BiomedicalEngineering, IEEE Transactions on. 2014. Vol. 61. P. 1506-1521.45. Tan J.J.L., Capozzoli M., Sato M., Watthanaworawit W., Ling C.L., Mauduit M.,Malleret B., Grüner A.-C., Tan R., Nosten F.H., Snounou G., Rénia L., Ng L.F.P.
//PLoS Negl Trop Dis. 2014. Vol. 8. P. e3043.46. Petralia S., Verardo R., Klaric E., Cavallaro S., Alessi E., Schneider C. // Sensorsand Actuators B: Chemical. 2013. Vol. 187. P. 99-105.47. Teo J., Di Pietro P., San Biagio F., Capozzoli M., Deng Y.M., Barr I., Caldwell N.,Ong K.L., Sato M., Tan R., Lin R. // Arch Virol.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
