Диссертация (1145736)
Текст из файла
Санкт-Петербургский государственный университетНа правах рукописиГинанова Виктория РинатовнаРазнообразие и тканеспецифичность продуктовгена Nxf1(nuclear export factor 1) Drosophila melanogaster,главного фактора ядерного экспорта мРНКспециальность: 03.02.07 – генетикаДиссертацияна соискание учёной степеникандидата биологических наукНаучный руководитель:доктор биологических наук, доцентМамон Людмила АндреевнаСанкт-Петербург20162ОглавлениеОглавление ..............................................................................................................................................
2Введение .................................................................................................................................................. 5Глава 1Обзор литературы.............................................................................................................
111.1Ядерно-цитоплазматический экспорт мРНК: история вопроса ...................................... 111.2Эволюционно консервативное семейство генов Nxf у разных эукариотическихорганизмов ........................................................................................................................................ 161.2.1Доменная структура Hs NXF1 (TAP) человека, наиболее изученного белкасемейства NXF ..............................................................................................................................
161.2.2Механизм экспорта мРНК эукариот ........................................................................... 191.2.3Гены семейства Nxf D. melanogaster........................................................................... 221.2.4Организация локуса Dm nxf1 у дрозофилы и мутации в этом локусе ..................... 231.2.5Известная функция sbr и результаты, не укладывающиеся в рамки известнойфункции ........................................................................................................................................
261.2.61.3Транскрипционный полиморфизм и органоспецифичные транскрипты гена sbr . 30Причины многообразия альтернативных транскриптов .................................................. 311.3.1Альтернативная инициация транскрипции ............................................................... 311.3.2Альтернативный сплайсинг ........................................................................................ 321.3.3Альтернативное полиаденилирование ....................................................................... 321.3.4Альтернативная транскрипция в семействе генов Nxf ............................................. 341.3.5Некодирующие РНК и интроны в эволюции ............................................................ 381.4Долгоживущие мРНК и РНК-связывающие белки: связь белков семейства NXF сразличными клеточными процессами ............................................................................................
42Глава 2Материалы и методы........................................................................................................ 452.1Линии D.melanogaster .......................................................................................................... 452.25’ и 3’ RACE-PCR для определения концевых последовательностей транскриптов генаNxf1 D. melanogaster ......................................................................................................................... 452.33’ RACE-PCR для определения концевых последовательностей транскриптов генаNxf1 M. musculus ...............................................................................................................................
462.4ОТ-ПЦР (ПЦР с обратной транскрипцией) с РНК, выделенной из семенников, вкачестве матрицы ............................................................................................................................. 462.5ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ) ................................................................................... 462.6Вестерн-блот анализ с антителами к фрагменту экзона 9 белка SBR............................. 4832.7Дизайн пептидов, получение и очистка поликлональных кроличьих антител напоследовательности экзона 1 белка SBR ....................................................................................... 492.8Получение рекомбинантных белков SBR в E.
coli............................................................ 502.9Вестерн-блот анализ с антителами к фрагменту белка SBR, соответствующему частиэкзона 1 .............................................................................................................................................. 51Глава 33.1Результаты......................................................................................................................... 52Определение состава транскриптов в семенниках взрослых особей линии дикого типаOregon-R ............................................................................................................................................
533.2Определение состава транскриптов в образцах из голов взрослых особей дрозофилылинии дикого типа Oregon-R ........................................................................................................... 573.3Определение состава транскриптов в яичниках взрослых особей линии дикого типаOregon-R ............................................................................................................................................ 593.4Транскрипты гена sbr с интроном 5 в различных органах взрослых самцов и самоклинии Oregon-R ................................................................................................................................
613.5Количественная характеристика некоторых типов транскриптов .................................. 643.6Существуют ли транскрипты, оканчивающиеся в интроне 10, в различных тканяхM. musculus? ...................................................................................................................................... 673.7Разнообразие транскриптов гена sbr в тканях головы, семенников и яичниковD. melanogaster .................................................................................................................................
693.8Потенциальное разнообразие белков, кодируемых геном sbr ........................................ 713.9Идентификация белка SBR, кодируемого специфичными для семенниковтранскриптами ..................................................................................................................................
723.10Идентификация белка SBR, кодируемого интрон-содержащими транскриптами ........ 743.10.1Характеристика двух типов антител к пептидам, соответствующимпоследовательностям экзона 1 .................................................................................................... 753.10.2Результаты вестерн-блот анализа белков, выделенных из разных органоввзрослых особей D.
melanogaster................................................................................................ 783.11Выявленные экспериментально белки SBR ...................................................................... 79Глава 44.1Обсуждение....................................................................................................................... 80Альтернативные сайты инициации транскрипции и полиаденилирования. .................. 804.1.1Альтернативное полиаденилирование транскриптов гена sbr ................................
804.1.2Альтернативные промоторы гена sbr (Dm nxf1) ....................................................... 844.2Роль белков SBR в сперматогенезе .................................................................................... 864.2.1SBR-t – изоформа белка SBR, специфичная для семенников .................................. 8644.2.2Делеция sbr12, затрагивающая домен NTF2-like белка SBR, приводит кстерильности самцов D. melanogaster ........................................................................................
874.3Белки SBR в функционировании нервной системы дрозофилы ..................................... 90Заключение ........................................................................................................................................... 93Выводы .................................................................................................................................................. 94Список условных обозначений ...........................................................................................................
95Список литературы .............................................................................................................................. 975ВведениеАктуальность темы исследованияСемейство генов Nxf эволюционно консервативно, его представители есть у эукариотгрупп Fungi и Metazoa, от дрожжей до человека (Serpeloni et al.
Характеристики
Тип файла PDF
PDF-формат наиболее широко используется для просмотра любого типа файлов на любом устройстве. В него можно сохранить документ, таблицы, презентацию, текст, чертежи, вычисления, графики и всё остальное, что можно показать на экране любого устройства. Именно его лучше всего использовать для печати.
Например, если Вам нужно распечатать чертёж из автокада, Вы сохраните чертёж на флешку, но будет ли автокад в пункте печати? А если будет, то нужная версия с нужными библиотеками? Именно для этого и нужен формат PDF - в нём точно будет показано верно вне зависимости от того, в какой программе создали PDF-файл и есть ли нужная программа для его просмотра.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
