В.М. Глазер, А.И. Ким, Н.Н. Орлова, И.Г. Удина, Ю.П. Алтухов - Задачи по современной генетике (1117657), страница 30
Текст из файла (страница 30)
Цифры справа указывают арф приблизительные размеры фрагментов в п. н. Построй- те рестрикционную карту плазмиды. Рис. 8. 40 кзадаче № 485 ~из иею 366 ЮВО ЯО ие ие 460 № 487. Плазмиду рВ!пезсНрг КЯ(+) обработали рестриктазами ВсеА1, ЕаН, Веа1 и их попарными смесями. Продукты реакций разделили в агарозном геле и окрасили бромистым этидием. Результаты электрофореза представлены на рис. 8.12. Цифры указывают приблизительные размеры фрагментов в п. н.
а) Постройте рестрикционную карту плазмиды. Рис. 8.11 к задаче Л6 486 177 б) Изобразите картину электрофореза при обработке вышеуказанной плазмиды смесью всех трех рестриктаз. 1000 1660 1«аю 1000 1660 000 № 488. В плазмиду встроили линейный фрагмент ДНК. Исходную плазмиду и плазмиду со вставкой обработали рестриктазами 0га1, Нра1 и их смесью. Продукты реакций разделили в агарозном геле и окрасили бромистым этидием. Электрофоретрамма представлена на рис.
8.13. Цифры указывают приблизительные размеры фрагментов в п. н. Постройте рестрикционную карту исходной плазмиды и плазмиды со вставкой. Рис. 8. 12 ч задаче № 487 Гз Г««ааааа № 489. В плазмиду встроили ли« аю а ю нейный фрагмент ДНК. Исходную «а Чюа Ч,а а аю ааа „аа плазмиду и плазмиду со вставкой об- работали рестриктазами ВВЛ1, Ьр1 и сача« их смесью.
Продукты реакций разделили в агарозном геле и окрасили броФ-1аа мистым этидием. Электрофореграмма 1®0 В 1«аюа аПрЕдетаВЛЕНа На рИС. 8.14. ЦИфрЫ уКах~щ зывают приблизительные размеры ю" фрагментов в п. н. Постройте рестрикФ- 100 106 ционные карты исходной плазмиды и плазмнды со вставкой. 660 — аа № 490. На практике размер фраг- мента определяют, сравнивая расстоя- ч 060 ние,пройденноефрагментомотстарта 4 в агарозном геле, с подвижностями набора фрагментов известной длины (такой набор называют набором маркеров молекулярной массы).
178 Линейный фрагмент ДНК обработали рестриктазой Рзт1, рестриатазойХ6о1 и их смесью(рис.8.15). Продукты реакций разделили в агарозном геле и окрасили бромистым этидием. На последнюю дорожку (М) нанесли набор маркеров молекулярных масс. Цифры справауказывают размеры маркеров в п. н. а) Постройте график зависимости пробега фрагмента от его размера. б) С помощью полученного графика определите размеры фрагментов ДНК, получившихся при обработке исходного фрагмента рестриктазами. в) Постройте рестрикционную карту исходного фрагмента. вв вв 11в вв 1 ве вв вв Рис.
8. 14 к задаче ЛЬ 489 № 491. В плазмиду р(ЗС4К (рис.8.16А) по сайту Яса1 встроили фрагмент ДНК (рис. 8.16Б), несущий ген (асГ Е. со1г. Получили плазмиды, отличающиеся друг от друга ориентацией фрагмента в плазмиде (клон 1 и клон 2). Зги плазмиды и исходную плазмиду р()С4К обработали рестрикгазой ВсЮ1, продукты реакции разделили в агарозном геле и окрасили бромистым этидием (рис. 8.16В). На последнюю дорожку геля (М) нанесли набор маркеров молекулярных масс. Цифры справа указывают размеры маркеров в п. н. Нарисуйте схемы плазмид с разными ориентациями встроенного фрагмента, соответствующие дорожкам 2 и 3 (клон 1 и клон 2).
Рис. 8. 15 к задаче ЛЬ 490 № 492. В плазмиду р()С4К (рис. 817А) по сайту Ята1 встроили фрагмент ДНК, несущий ген агаВ уа!тоиейа ГуРЬ1типит 179 ) 4 м ЭФвв атн! а ната нанна наа1 ннрватмт) Рис.8.16 к задаче Л$491 (рис. 8.17Б). Получили две плазмиды, отличающиеся друг от друга ориентацией фрагмента в плазмиде. Эти плазмиды, исходную плазмиду р11С4К и две другие произвольно выбранные плазмиды обработали рестриктазой 5а11, продукты реакции разделили в агарозном геле и окрасили бромистым этидием. Результаты электрофореза представлены на рис.
8.17 В. Цифры справа указывают размеры фрагментов в п. н. Найдите дорожки, на которых находятся фрагменты исходной плазмиды р11С4К и плазмид со вставками гена агаВ в одной и другой ориентации. А В !тввв внв мвв вма!таатми Ватранааанвва ячтапмнт «аао . 4 Рис. 8.17 к задаче М 492 12в 180 № 493. Представлены электрофореграммы исследования полиморфизма зкзона 9 гена ИИ-3 (ядерный рецептор витамина 0) рестриктазой Тад1 в контрольной выборке (дорожки 1 — 21) и у больных остеопорозом (22-42). Цифрами справа обозначены длины фрагментов ДНК в п. н.
Составьте возможные варианты рестрикционной карты аллелей Т(с одним сайтом рестрикции) и г (с двумя сайтами рестрикции), если исходная длина амплифицированного фрагментаэкзона 9 составляет 745 п. н. и в нем есть два сайта для рестриктазы Тпа71, один из которых полиморфный, а другой — нет. Определите частоту аллелей Т и г в контрольной выборке и у больных.
Предложите гипотезу о причинах различий частот. 1 а а ° а 1 а а 1а и и 1а 'а и 1а Г1 11 1а М М МО ж иа ыааааим аа Маа 31 аа аааа аааааааааа 1011М и № 494. В популяциях лося на Дальнем Востоке среди обычных вариантов митохондриальной ДНК выявлены варианты с делецией 75 п. н. в области гипервариабельного сегмента 1 (ГВС1) 0-петли.
Определите частоту делеции в выборке из 18 дальневосточных (дорожки 1-18) и 18 северо-американских лосей (дорожки 19-36) на основе представленных электрофореграмм продуктов ПЦР- амплификации их ГВС1 митохондриальной Р-петли. Цифрами справа обозначены длины полученных фрагментов ДНК в п. н. га ° а а а аааапагаа»1ааанаа 1а аа а1 таа га м м г1 в аа ю а1 аааааа м аа 181 Предложите объяснения причин возникновения наблюдаемых особенностей распространения гаплотипа митохондриальной ДНК с делецией 75 п.
н. у лосей в Азии и Америке. № 495. В 2'-хромосоме человека на участке, гомологичном Х-хромосоме, имеется вставка мобильного элемента А1п'уа протяженностью 329 п. н. Определите процент мужчин в изученной группе жертв теракта (дорожки 1-9) на основе представленной электрофореграммы продуктов ПЦР-амплификации участка генома, затронутого этой инсерцией. Цифрами справа обозначены длины фрагментов ДНК в п. н.
А1иуа Х.У гоиоаоги игагй у гасгои 1 2 5 4 5 Б 7 В 9 52В \99 № 496. В Х-хромосоме человека на участке, гомологичном '2'-хромосоме, имеется вставка мобильного элемента А1иХа протяженностью 322 п. н. Определите, какие дорожки на представленной электрофореграмме продуктов ПЦР-амплификации участка генома, затронутого этой инсерцией, соответствуют образцам ДН К женщин, погибших из-за теракта. Цифрами справа обозначены длины фрагментов ДНК в п. н. Анха Х.У игиасасичный учасгоа ! 2 5 4 5 Б 7 В 9 19 979 182 № 497. В гене фенилаланингидроксилазы обнаружен однонуклеотидный полиморфизм, затрагивающий сайт рестрикции Мзрй При отсутствии сайта Мзр1 в результате ПЦР-амплификации и последующей обработки ПЦР-продукта рестриктазой Мзр1 выявлен фрагмент размером 425 п.
н. (соответствующий аллелю А), в случае присутствия Мяэ1-сайта выявляются два фрагмента 300 п. н. и 125 п. н. (аплель а). Известно, что в популяциях человека из Европы выявлены частоты аллелей А (40 %) и а (60 %), а в популяциях из Азии — А (90 %) и а (10 %). В смешанных популяциях частоты зллелей промежуточные.
Результаты анализа 18 образцов человека, полученные при ПЦР-амплификации фрагмента гена с последующей их рестрикцией Мяэ1, представлены на электрофореграмме. Определите частоты генотипов и аллелей А и а, а также наиболее вероятную принадлежность изученной выборки к одной из перечисленных групп популяций. Цифрами справа обозначены длины фрагментов ДНК в п. н. 1ззв~этваммжжнжмпм № 498. В кодирующей части гена СИБ5 рецептора хемокинов встречается делеция 32 п. н.
(СИ~5Ые132). Известно, что рецептор хемокинов СКК5 используется также вирусом иммунодефицита человека ВИЧ-1 для проникновения в клетки человека. Данная делеция приводит к дефекту рецептора, препятствует его взаимодействию с вирусом и тем самым определяет устойчивость к инфекции ВИЧ-1 у гомозигот по присутствию делеции (Скк5~Ы32/ Скк5~Й132). На электрофореграмме представлены результаты ПЦР- амплификации участка гена СИИ, затронутого этой делецией, у группы с высоким риском заражения ВИЧ-1. Определите дорожки, на которых представлены образцы людей, устойчивых к инфекции. Цифрами справа обозначены длины фрагментов ДНК в п. н.
1 3 3 Ф э В 7 В 9 1О 183 № 499. В кодирующей части гена СЯЯ5 рецептора хемокинов описаны две мутации, приводящие к дефекту рецептора СКК5: делеция 32 п. н. (СЯЯ5й132) и замена одного нуклеотида в положении 303 (СЯЯ5т303), которая приводит к возникновению стоп-кодона и нарушению синтеза белка. Гомозиготы СЯЯЫе(32/ СЯЯЯЫ32 и СЯЯ5ш303/СЯЯ5т303, а также гетерозиготы по обеим мутациям в трансположении устойчивы к ВИЧ-1 инфекции, так как вирус не может использовать дефектный рецептор СКК5 для проникновения в клетку.