В.М. Глазер, А.И. Ким, Н.Н. Орлова, И.Г. Удина, Ю.П. Алтухов - Задачи по современной генетике (1117657), страница 31
Текст из файла (страница 31)
В таблице показаны результаты идентификации рассматриваемых мутаций после ПЦР-амплификации с последующим рестрикционным анализом продуктов рестриктазой НшсП (в случае мутации СЯЯ5тл303 сайт НтсП исчезает) в группе риска по заражению ВИЧ-1. Праймеры фланкируют фрагмент гена СЯЯ5, в котором возникают обе мутации. Размер ПЦР-продукта составляет 620 п. н., а с делецией — 588 и. н. Установите генотипы изученных людей и определите, кто из них может быть устойчив к ВИЧ-1 инфекции. № 500. В выборке из 33 человек выявлены генотипы с полиморфизмом длин минисателлитного повтора в интроне 7 гена фактора 7 свертываемости крови (мономер 37 и. н.), которые показаны в таблице.
Аллели Н8, Н7, Нб и Н5 имеют по 8, 7, 6 и 5 повторов, соответственно. Длина аллеля Н7 составляет 526 п. н. Известно, что носители генотипа Н7/Н7 имеют меньший риск летального инфаркта миокарда, а с носители генотипа Н5/НЗ вЂ” более высокий риск. Определите частоты аллелей с соответствующим м По материалам Пятой международной конференции по биотехнологии. Рахмаяалиев и др. Сборник трудов / Под ред. В. И. Покровского. Т. 1. М., 2004.
С. 217-218. 184 количеством повторов в изученной популяции и определите процент генотипов Н7/Н7 и Н5/Н8. Сделайте описательный прогноз о подверженности данной популяции инфаркту миокарда с летальным исходом на основе распределения генотипов изученного локуса. Номер образца 1 2 10 Длины фрагмен- тов ПЦР (и. н.) 563 563 563 563 563 526 526 489 489 526 526 526 526 526 526 526 15 Номер образца 12 13 17 18 19 20 Длины фрапаен- тов ПЦР (и. н.) 563 563 563 563 563 563 526 526 526 526 526 526 526 489 489 489 452 452 452 Номер образца 23 24 25 27 28 29 39 31 32 33 563 Длины фрагмен- тов ПЦР (и.
н.) 563 563 563 563 526 526 526 526 526 526 526 489 489 489 489 452 452 452 452 № 501". Представлена злектрофореграмма, полученная при окрашивании серебром 4%-го денатурирующего полиакриламидного геля, на который нанесены пробы с продуктами ПЦР-амплификации трех тетрануклеотидных микросателлитных локусов (СЯР1РО, ТРОХ и ТН01), применяемых для идентификации личности, в образцах ДНК матери (М), ребенка (Р) и трех предполагаемых отцов (01, 02 и 03).
1. — маркер, который состоит из амплифицированных фрагментов изучаемого локуса с различным количеством повторов, цифрами справа обозначено количество 185 повторов. Определите генотипы и установите, какой из предполагаемых отцов может быть исключен на основании этого анализа. м а а оа оаоаа М 502. Представлена электрофореграмма, полученная при окрашивании серебром 4%-го денатурируюгцего полиакриламидного геля, на который нанесены пробы с продуктами ПЦР-амплификации трех тетрануклеотидных микросателлитных локусов (0165539, П75820 и 0135317), применяемых для идентификации личности, в образцах ДНК матери (М), двух ее детей (Р1 и Р2) и двух предполагаемых отцов (01 и 02).
1. — маркер, который состоит из амплифицированных фрагментов изучаемого локуса с различным количеством повторов, цифрами справа обозначено количество повторов. Установите, какой из предполагаемых маа а аа ааааа омаааа оамап 186 отцов не является таковым, и определите генотипы у всех изученных лиц. М 503. Представлена электрофореграмма, полученная при окрашивании серебром 4%-го денатурирующего полиакриламидного геля, на который нанесены пробы с продуктами ПЦР-амплификации трех тетрануклеотидных микросателлитных локусов (П165539, Э75820 и ШЗБ317), применяемых для идентификации личности, в образцах ДНК отца (О), матери (М), троих их детей (Р1, Р2 и РЗ).
1 — маркер, который состоит из амплифицированных фрагментов изучаемого локуса с различным количеством повторов, цифрами справа обозначено количество повторов. Определите генотипы всех обследованных лиц. Установите, кто из детей не может быть ребенком этого отца. 1. М Р1 1. Р3 Рз 0 1. 0733М 0!И311 .1 в 504. Представлена злектрофореграмма, полученная при окрашивании серебром 4%-го денатурирующего полиакриламидного геля, на который нанесены пробы с продуктами ПЦР- амплификации трех тетрануклеотидных микросателлитных локусов (СЗР1РО, ТРОХ и ТН01), применяемых для идентификации личности, в образцах ДНК отца (О), матери (М), троих их детей (Р1, Р2 и РЗ). 1 — маркер, который состоит из амплифицированных фрагментов изучаемого локуса с различным количеством повторов, цифрами справа обозначено количество повторов.
Опре- 187 делите генотипы и установите, кто из детей не может быть ребенком этих родителей. а и г и и о Номе об азца Лок с 8 9 10 12 РУ5391 11 РУ53891 14 11 10 14 14 10 11 12 10 14 14 10 13 13 РУ5439 13 13 13 13 13 13 14 14 13 РУ538911 25 25 25 25 26 25 25 26 25 РУ393 14 РУ5390 21 14 14 21 21 14 14 21 21 21 21 21 21 21 РУ 5385 23 23 23 23 23 23 23 23 23 12 12 РУ5438 12 12 12 12 12 12 12 12 12 РУ5437 14 РУ519 12 14 15 14 14 12 12 14 14 12 12 12 12 12 12 12 15 РУ5392 15 15 15 15 15 15 16 15 15 16 М 505. В таблице представлены результаты индивидуального анализа 11 микросателлитных локусов У-хромосомы у 24 мужчин из одной деревни с одной фамилией.
Цифры указывают количество микросателлитных повторов в конкретном локусе. Кто из изученных мужчин может быть близкими родственниками на основе представленных данных7 188 Номе об азца 21 22 23 15 16 11 11 17 18 19 20 Лок с РУ5391 13 14 11 11 10 10 РУЯ3891 14 14 13 13 13 13 13 13 13 13 РУ5439 13 13 25 32 25 25 14 14 25 26 25 РУ5389П 25 25 14 14 РУ393 21 21 21 21 21 21 21 21 21 21 РУ5390 23 23 23 23 23 23 23 23 РУ5385 23 23 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 РУ5392 Примечание к задачам № 501-505: Близкие родственники дол- жны иметь одинаковый набор аллелей изученных микросател- литных локусов У-хромосомы. № 506. Проведен анализ девяти микросателлитных локусов У-хромосомы в группе из 16 мужчин. В таблице цифрами представлено количество повторов в каждом локусе. Известно, что в выборке были изучены дед, отец и сын.
Определите, какие номера могут соответствовать им. Лок с РУК 3891 РУЯ РУК 385а 385Ъ ВУЯ РУК 391 392 РУ8 393 РУК 394 РУЯ 390 РУ5 389П Номер об азца 10 11 11 17 17 11 13 13 11 12 11 11 15 15 11 15 10 16 25 25 10 17 13 15 14 14 10 11 26 19 14 15 11 11 17 14 10 11 10 11 11 15 15 18 11 15 16 17 13 16 10 25 11 11 17 25 14 14 10 18 13 15 25 10 17 11 14 10 11 13 РУ5438 РУ5437 РУЯ19 12 12 14 14 12 12 12 12 14 14 12 12 1 ! ! 189 Лок с ПК8 ВУ5 385 Ь 391 Номер об азца ВГ5 390 ВЪ'$ 3891 мъ 389И ВУ5 385а М"8 М"5 392 393 ПК5 394 10 гг 18 12 Ю !4 гг 16 19 11 Ю !4 15 15 1г 15 11 16 11 11 14 11 14 ю 17 1З 19 14 ю 26 !4 !О 11 14 15 В !З !6 26 18 !4 Ю 25 !о 17 15 11 н !з 16 № 507.
Результаты анализа девяти микросателлитных локусов У-хромосомы в шести образцах ДНК солдат, погибших в локальном военном конфликте (№ 1 — 6) представлены в таблице. Такой же анализ проведен у шести мужчин из семей солдат, пропавших без вести в том же конфликте Р а 7-12). Цифрь! соответствуют количеству повторов в каждом локусе. Определите, какие из образцов могут соответствовать близким родственникам.
Лок с Номер об азца ВЪ'Я ВУ8 390 3891 Вх'Б 38911 Вх'Я 385а ВЪ'Я 385Ь Вх'Я 391 ВЪ'Я 392 Вх'Б 393 Вт"Б 394 23 10 23 10 16 13 12 13 16 16 13 24 9 18 15 13 16 24 10 17 16 16 10 13 13 25 10 24 9 16 10 17 15 13 16 25 10 16 10 17 13 15 ю !з 23 10 16 13 16 13 23 10 16 13 16 12 10 12 13 16 17 24 10 16 10 13 М 508. У 25 мужчин из одной деревни получены данные по анализу девяти микросателлитных локусов т-хромосомы, представленные в таблице. Цифры соответствуют количеству 190 повторов в каждом локусе. Определите вероятные группы близ- ких родственников по мужской линии. Ло с !7УБ Во'Б 385а 385Ь Номер об ааца П'т'Б 391 1У!"Б 1Ут Б 392 393 М'Б 390 !ЗУБ 38911 1ут'Б 394 ОтГБ 3891 11 12 '11 12 13 13 13 13 23 16 10 16 23 10 11 13 14 15 16 11 13 11 12 10 17 16 16 13 13 13 10 23 16 10 11 13 18 14 15 16 11 13 25 17 11 15 10 16 17 16 10 25 17 10 16 10 10 17 13 10 10 23 16 10 12 11 13 11 13 11 15 !2 15 25 17 10 13 25 !О 16 17 13 12 14 23 17 14 16 15 10 13 13 !О 10 17 14 11 13 16 10 11 13 13 13 17 16 16 13 17 10 13 !О 17 23 13 11 13 18 14 15 16 19 11 13 11 15 25 17 16 10 20 11 13 11 12 18 14 15 12 18 16 21 10 16 15 23 11 12 22 !О 16 12 18 23 11 13 !2 15 25 16 10 17 11 13 11 13 16 12 15 14 15 10 17 18 16 М 509.
У 25 человек из одной деревни определены нуклеотидные последовательности гипервариабельногосегмента 1(ГВС1) митохондриальной Р-петли. В таблице предстаюены номера нуклеотидов ГВС! Г7-петли, которые был!и полиморфнымн. Неполиморфные нуклеотиды не указаны, В выборке изучены мать, ео три дочери и два сына. Определите образцы, которые могут соответствовать этим людям. 11 15 11 15 16 16 14 15 11 13 11 13 11 13 11 13 191 Номер нуклеотида в ГВС! Номер образ- а «з ее сч еч СЧ ФЪ ае С А Т А Т С С Т Т Т Т Т А Т 10 Т Т 15 17 Т А 18 Т 19 20 Т 21 Т Примеры решения задач ЗадачаЛз472 Решение Для решения задачи достаточно рассмотреть одну цепь ДНК. Каждый нуклеотид встречается в ДНК с частотой, близкой к 1/4.