В.М. Глазер, А.И. Ким, Н.Н. Орлова, И.Г. Удина, Ю.П. Алтухов - Задачи по современной генетике (1117657), страница 32
Текст из файла (страница 32)
Тогда частота 6-нуклеотидной последовательности Есей1-сайта будет равна (1/4)е =1/4096, т. е. расстояние между сайтзми должно быть -4 тыс. п. н. Для 4-нуклеотидного сайта частота встречаемости есть (1/4)4 =1/256, т, е. расстояние -0,25 т. и, з. 192 Задачи на рестринционное картироеание ДНК Основной принцип рестрикционного картирования ДНК основан на сопоставлении результатов гидролиза исследуемого фрагмента каждой рестриктазой в отдельности и совместного гидролиза обоими ферментами. Полученные фрагменты разделяют путем электрофореза в агарозном или акриламидном геле. По подвижности фрагментов оценивают их размеры в парах нуклеотидов (п. н.). Результат двойного гидролиза показывает, содержится ли внутри фрагмента, образуемого одной рестриктазой, сайт(ы) для узнавания второй рестриктазой. Если содержится, то такой фрагмент исчезает в геле и заменяется на два или более субфрагментов, при этом сумма размеров последних равна размеру фрагмента.
Сопоставление размеров фрагментов, образующихся в разных реакциях, позволяет локализовать сайты рестрикции. Рассмотрим это на примерах задач № 481 и 482. Задача М 48т Решение Из электрофореграммы видно, что исследуемый фрагмент содержит два сайта Ваш Н1 и два сайта Есор! (далее для упрощения будем использовать для них сокращения В! и Е1, соответственно). Чтобы построить рестрикцнонную карту фрагмента, сравним размеры фрагментов, полученных при раздельной и двойной рестрикции. Фрагмент Е1 350 п. н. не расщепляется при двойной рестрикции, следовательно, 2 Е!-сайта находятся на расстоянии 350 и.
н. друг от друга. В1-фрагмент 950 п, н. после обработки Е1 дает три фрагмента: 200, 350 и 400 п. н. Следовательно, фрагменты 200 и 400 п. н. располагаются по разные стороны фрагмента 350 п. н.: В! Е1 Е! В! 400 350 200 Е1-фрагмент 850 п. н. расщепляется на 200 и 650 и. н., следовательно, к фрагменту 200 и. н. примыкает фрагмент 650 п. н. Сам же фрагмент 650 п. н. не входит ни в какой другой фрагмент, следо- 193 вательно, он располагается на конце анализируемого фрагмента ДНК: В! Е1 Е1 В1 400 350 200 650 Для фрагмента 550 п.
н. остаются субфрагменты 400 и 150 п. н. Следовательно, субфрагмент 150 п. н. располагается на другом конце анализируемого фрагмента ДНК: В! Е! Е! В! 150 400 350 200 650 ЗадачаМ482 Решение Решение задачи удобно провести в такой последовательности. Сначала рассмотрим первую и третью дорожки. Можно считать, что любой фрагмент первой дорожки (Рии1) включает один, два или более субфрагментов, возникающих в результате дополнительной обработки рестриктазой №о1 (третья дорожка); при этом любой фрагмент третьей дорожки входит в состав только одного из фрагментов первой дорожки. На данном этапе надо определить, из каких фрагментов третьей дорожки состоит каждый иэ фрагментов первой дорожки.
Введем сокращения Р1 и И!для )Ъи! и №о1,соответственно. Удобно рассматривать фрагменты первой дорожки в порядке возрастания размеров. Таблица ! Аналогичным образом рассмотрим вторую и третью дорожки. 194 Уалувз Р Таблица 2 После этого строим карту. Удобно делать это, начиная с какого-либо фрагмента, расщепляющегося на два при обработке смесью рестриктаз (например, Х1-фрагмент 16 400 п. н.), а дальше заглядывая в первую и вторую таблицы попеременно.
Этапы построения карты представлены на рисунке. 1. Выписываем все фрагменты в порядке их размещения на дорожках (по мере локализации фрагментов будем удалять их из списка). Начинаем анализ 1ч1-фрагмента 16 400 п. н. (обведен прямоугольником). 2. Х1-фрагмент 16 400 п. н. расщепляется Р1на субфрагменты 8500 и 7900 п.
н., следовательно, сайт Р1 находится внутри. Отмечаем (исходя из табл. 1), что Р1+Ы1-фрагмент 8500 п. н. входит в состав Р1-фрагмента 12 700 и. н. вместе в фрагментом 4200 и. н. 3. Пририсовываем фрагмент 4200 и. н. к фрагменту 8500 и. н. Фрагмент 4200 п. н. не входит в состав никакого другого фрагмента, следовательно, он является концевым. Также из табл. 1 видим, что Р1+Х1-фрагмент 7900 п. н. входит в состав Р1-фрагмента 9500 и.
н. вместе в фрагментом 1600 п, н. 4. Пририсовы заем фрагмент 1600 и. н. к фрагменту 7900 п. н., переходим к рассмотрению Х1-фрагмента 4000 и. н. 5. Пририсовываем фрагмент 2400 и. н. к фрагменту 1600 п. н., переходим к рассмотрению Р1-фрагмента 14 400 и. н. 6. Р1-фрагмент 14 400 п. н. состоит из трех субфрагментов.
Из них фрагмент 4600 п. н. является Ы1-фрагментом, а Р1+Х1-фрагмент 7400 п. н. входит в состав 1ч1-фрагмента 19 300 п. н. Поэтому пририсовываем фрагменты 4600 и. н. и 7400 п. н. 7. Оставшийся Р1-фрагмент 11 900 п. н. является концевым. 195 И 9ИЮ ЯОЮ !2760 14409 Я 4000 4260 4669 ! 1ММ1 193М 91!И! 1ИЮ 2460 4ЗЮ 4660 7400 7900 ОВЮ 11960 2 и 4 Р ! и-! МОО 11969~12766944М 4660 4260 4МО 19ИЮ !469 2400 4260 4МО 7409 11960 ) 9Ю6~ 11999 14400 4ВЮ 4466 1МОО !ИЮ 3460 4469 7406 1!906 4 ИЮ! „„„, 1„И Р, 11900 14469 4400 19399 2460 40Ю 7400 4ЮО ООЮ 7МО ИОО ПМО 5 И771 970! И6 1 9761 И 61 ООМ Я 4490 !9360 4ЕЮ 7466 42М ОВЮ 7960 1ЕЮ 2469 11%и ! ЮОО !!960 7 ию! Ю01 ию! Ю0! Оы! Юю! Р ! 42М МОО 7МО 1ЭЮ 2469 ММ 7460 ПМО И 4 970М И !и аИОМ И ! РОМ !Мбе 412706 Е6666ОЮОИ 7И9260! И!066! )!. (4ВВОО п.
Ю.) Задача № 501 Решение Генотипы СБР1РО: М вЂ” 11/11, Р— 8/11, 01 — 11/11, 02— 12/10, ОЗ вЂ” 8/12; ТРОХ: М вЂ” 8/8, Р— 8/9, 01 — 8/9, 02 — 8/ 8, ОЗ вЂ” 7/9; ТН01; М вЂ” 6/7, Р— 6/9, 01 — 6/7, 02 — 7/9, ОЗ вЂ” 9/9. Исключаются 01 и 02. Если просчитать координаты сайгон рестрикции, то рестрикционная карта ДНК фага )О будет выглядеть следующим образом: № 510. Какое соотношение фенотипов вы ожидаете получить в потомстве, полученном при самоопылении автотетраплоида ААааВВЪЬ, если имеют место независимое наследование, полное доминирование по обоим генам и случайное хромосомное расщепление? № 511. Какое соотношение фенотипов вы ожидаете получить в потомстве, полученном при самоопылении автотетраплоида ААааВЬЬЬ, если имеют место независимое наследование, полное доминирование по обоим генам и случайное хромосомное расщеплением № 512".
Какие фенотипы и в каком соотношении могут возникнуть при реципрокных скрещиваниях двух трисомиков Ааа и ААа при условии полного доминирования; следует учитывать, что у отцовских растений жизнеспособны только гаплоидные гаметы. № 513. Какие фенотипы и в каком соотношении могут возникнуть при реципрокных скрещиваниях трисомиков с генотипом ААа при условии полного доминирования; следует учитывать, что у отцовских растений жизнеспособны только гаплоидные гаметы.
№ 514. У дрозофилы встречаются жизнеспособные трисомики по! Ъ' хромосоме. Самка с нормально развитыми глазами, трисомик по 1Ъ' хромосоме с генотипом ААа скрещивается с безглазым самцом с генотипом аа. Какое потомство получится от этого скрещивания? № 515. Скрещиваются два автотетраплоидных растения льни- ного зева с генотипами АААА и аааа. Определите окраску цветка 197 в Е, и расщепление по фенотипу в Рв если имеют место кумулятивное действие аллелей и случайное хромосомное расщепление.
АААА — темно-красная окраска цветка, АААа — красная, ААаа— светло-красная, Аааа — розовая и аааа — белая. М 516. Укажите ожидаемые соотношения генотипов и фенотипов в потомстве от следующих реципрокных скрещиваний диплоидов кукурузы с трисомиками при условии доминирования красной окраски зерна над белой: дАаа х саа, даа х о'Ааа, 9Ааа х с Аа, 9Аа х х ГАаа, дААа х ЮАа, 9Аа х ЮААа (у отцовских растений жизнеспособны только гаплоидные гаметы).
№ 517. Какое соотношение фенотипов вы ожидаете получить от скрещивания автотетраплоида ААаа с диплоидом Аа при условии полного доминирования и случайного хромосомного расщепления у полиплоида? № 518". Какое соотношение генотипов и фенотипов вы ожидаете получить от скрещивания автотетраплоидов с генотипом ААаа, если имеют место полное доминирование и случайное хромосомное расщепление7 № 519. Какое соотношение фенотипов вы ожидаете получить в потомстве от скрещивания автотетраплоидов с генотипами АААа и Аааа, если имеют место кумулятивное действие аллелей и случайное хромосомное расщепление7 № 520.
В каком поколении и с какой вероятностью появятся белоцветковые растения от скрещивания тетраплоидных гомозиготных пурпурноцветкового и белоцветкового растений дурмана при условии полного доминирования и случайного хромосомного расщепления7 М 521. При скрещивании тетраплоидных растений дурмана с пурпурными цветками в Р, было получено 3226 растений с пурпурными и 107 с белыми цветками.