Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1091769), страница 16

Файл №1091769 Диссертация (Прогнозирование метаболитов рилизинг-пептидов гормона роста в организме человека для разработки методики их определения в целях антидопингового контроля) 16 страницаДиссертация (1091769) страница 162018-01-18СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 16)

Субклеточные фракции приобретены у фирм-производителей,которые для изучения фармакокинетических процессов представляют широкоеразнообразие коммерчески доступных in vitro моделей. GHRP каждый вотдельности инкубировали с ферментами фракций в течение 24 ч при 37°С.Описание процедур очистки и анализа полученных реакционных смесейприводится в разделах 2.4.3.3 и 2.4.1, соответственно.

Метаболиты GHRP,полученные в процессе инкубации с различными субклеточными фракциями,представленывТаблице9.Длясравнениявтаблицеприведеныидентифицированные другими авторами метаболиты GHRP.В процессе инкубации с различными субклеточными фракциями намиполучено от 2 до 11 метаболитов для каждого исходного соединения. GHRP,имеющие ненатуральные аминокислотные остатки во втором положении,показали большую устойчивость к воздействию ферментов, в то время как GHRP1 и алексаморелин деградировали в результате гидролиза незащищеннойпептидной связи в первом положении.

Так же было отмечено гидролитическоерасщепление пептидной связи между остатками ненатуральной и D-аминокислотв составе ипаморелина с образованием метаболита ипаморелин (1-3) ОН. НаРисунке 12 в качестве примера приведены масс-хроматограммы по выделеннымионам каждого из метаболитов GHRP-6, полученных при инкубации смикросомальными фракциями почек и печени человека, печеночной S9 фракциейчеловека, а также человеческой сывороткой крови.При инкубации GHRP-6 с печеночной S9 и почечной микросомальнойчеловеческими фракциями образуется большее число метаболитов по сравнениюс сывороткой крови и печеночной микросомальной фракции человека.Аналогичные результаты получены для всех остальных GHRP.

В частности, приинкубацииссубклеточнымифракциямидетектированыметаболиты,соответствующие гидролитическому расщеплению связи Phe―Lys у пептидовGHRP-1, GHRP-2, GHRP-6, гексарелин, алексаморелин и ипаморелин. Послеинкубации исходных соединений с сывороткой человеческой крови данныеметаболиты не детектировали.85БВГОтностельная интенсивность, %АВремя, минРисунок 12 — Масс-хроматограммы по выделенным ионам GHRP-6 и его метаболитов, синтезированных в присутствиисыворотки человеческой крови (А), микросомальной (Б) и S9 фракций печени человека (В), микросомальной фракциипочек человека (Г)86В микросомальной фракции почек человека и печеночной S9 фракциидетектированыметаболитыGHRP-1,GHRP-2,GHRP-6,алексаморелина,гексарелина и ипаморелина с молекулярной массой большей примерно на 1 Да.Подобные метаболиты GHRP-4 и GHRP-5 детектированы не были.

Полученныемасс-спектры фрагментации указывают на увеличение молекулярной массы на1 Да во всей y-серии фрагментных ионов, что соответствует замене NH2-группына ОН-группу С-терминального аминокислотного остатка. В качестве примера наРисунке 13 представлены масс-спектры детектированных метаболитов GHRP-1:GHRP-1 (2-7) NH2 и GHRP-1 (2-7) OH.С-концевым амидированным аминокислотным остатком GHRP-1, GHRP-2,GHRP-6, алексаморелина, гексарелина и ипаморелина является Lys, в составбокового радикала которого входит дополнительная ε-аминогруппа.

На основанииполученных экспериментальных данных выдвинуты две гипотезы увеличениямолекулярноймассыметаболитов на 1 Да:в процессе инкубации смикросомальной фракцией почек и S9 фракцией печени человека происходитреакция дезаминирования по ε-аминогруппе у С6-атома углерода боковогорадикала аминокислотного остатка Lys или реакция дезамидирования поконцевой амидогруппе (Рисунок 14).Первое предположение может подтверждать тот факт, что метаболитыGHRP-4 и GHRP-5, в состав которых не входит Lys, со сдвигом молекулярноймассы на 1 Да детектированы не были.

Однако причиной этого может быть инеспособность использованных метаболических систем катализировать реакциюдезамидирования концевых аминокислот с объемными индольным и фенольнымкольцами боковых радикалов двух С-концевых аминокислотных остатков Trp иPhe у GHRP-4 и GHRP-5.АH110.0719K129.1028y1146.1287KОтносительная интенсивность, %84.08162+[ M+2H]442.7320b2335.1514a2W159.0922307.1563b3406.1888y3479.2769b4a4592.2683y4 564.2723550.3138b4+H2O610.2774a5y5747.3964b5+H2O711.3437757.3431m/zБHK 110.071984.0816KОтносительная интенсивность, %129.1028b2335.1505a2y1b3406.1877307.1553147.1133 W159.09222+y42+[M+2H]443.2258b4276.1710a4592.2666564.2715y3480.2633b5739.3341b4+H2O610.2770y5748.3836m/zРисунок 13 — Масс-спектры метаболитов GHRP-1 (2-7) OH (А) и GHRP-1 (27) NH2 (Б), синтезированных в процессе инкубации с микросомами почекчеловека88АБреакциядезамидированияреакциядезамидированияреакциядезаминированияРисунок 14 — Схемы сайтов отщепления NH2-группы в ходе реакцийдезаминирования или дезамидирования GHRP-6 (А) и GHRP-4 (Б).

Пунктиромвыделен участок полипептидной цепи GHRP-6, характерный для всех лизинсодержащих соединений ряда GHRPК настоящему времени деамидированные метаболиты GHRP такжеидентифицированы несколькими лабораториями [116,117,121]. Впервые вопрос онеобходимости доказательства процесса дезамидирования был поднят в работе[116]. Авторами представлено доказательство на основе разницы интенсивностисигнала при ионизации в положительном и отрицательном режимах сканированиядвух пептидов Trp―Ala―Trp―Phe―Lys-ОН и Trp―Ala―Trp―Phe―Lys-NH2.Исследователямипоказано,чтоинтенсивностьсигналапептидаTrp―Ala―Trp―Phe―Lys-ОН в 10 раз выше, чем амидированного аналога приотрицательнойионизации,чтоуказывалонасвободнуюС-концевуюкарбоксигруппу.В данной работе доказательство дезамидирования строится на основефермент-селективной реакции с использованием рекомбинантной амидазы,которая осуществляет протеолитическое отщепление амидной группы карбоксилаС-концевого аминокислотного остатка.

Стоит отметить, что данный фермент89авторы работы [116] предлагают использовать для получения референсныхстандартов деамидированных метаболитов GHRP без применения технологийхимического синтеза.Для получения деамидированных метаболитов каждый GHRP былпроинкубирован с амидазой при условиях, описанных в разделе 2.4.3.4. Анализполученных реакционных смесей показал, что деамидированные метаболитыGHRP с Lys-концевыми аминокислотными остатками образуются в большемколичестве. Таким образом, деамидированные метаболиты GHRP-4 и GHRP-5,возможно, не детектируются ввиду их небольшого количества, образовавшегося входе инкубаций с различными субклеточными фракциями.

На Рисунке 15представлены масс-хроматограммы по точным массам ионов исходных Lysсодержащих GHRP (GHRP-1 и GHRP-2) и Lys-несодержащего GHRP-4 и ихдеамидированныхметаболитов.Соотношениедеамидированныхметаболитовиинтенсивностейамидированныхисходныхсигналовпептидовзначительно различаются для GHRP-1 и GHRP-2 c С-концевым аминокислотнымостатком Lys и GHRP- 4, у которого С-концевой аминокислотой является D-Phe.Однакообразованиедеамидированныхметаболитов приинкубацииинтактных пептидов с ферментом амидазой не является доказательством процессадезамидирования при инкубации GHRP с субклеточными фракциями.

Дляустановления причины увеличения молекулярной массы метаболитов на 1 Да былвыполнен аналогичный эксперимент с рекомбинантной амидазой и реакционнымисмесями, полученными после инкубации исходных пептидов с фракциями печении почек человека. Для дезактивации протеолитических ферментов субклеточныхфракций полученные реакционные смеси после 24-часовой инкубации прогрелипри 95°С в течение 5 мин. К полученным смесям добавляли фермент амидазу,после чего смеси инкубировали в течение следующих 24 ч при 30°С, согласнопротоколуполучениядеамидированныхрекомбинантной амидазы.90метаболитовсиспользованиемRT: 18.09NL: 6.54E7m/z = 478.2497 (-1.7)GHRP-1Rel.

Ab. (деамид.)зRel. Ab. (амид.)RT: 18.63= 35.14NL: 1.66E9m/z = 478.7423 (-0.4)GHRP-1 (1-7) OHRT: 19.32NL: 2.50E8m/z = 409.7211 (0.2)GHRP-2Rel. Ab. (деамид.)Rel. Ab. (амид.)= 35.14= 5,58RT: 19.63NL: 1.22E9m/z = 410.2129 (-1.3)GHRP-2 (1-6) OHRT: 20.04NL: 1.84E8m/z = 608.2972 (-1.3)GHRP-4Rel. Ab. (деамид.)Rel. Ab. (амид.)RT: 20.64= 0,0027NL: 5.25E5m/z = 609.2834 (2.3)GHRP-4 (1-4) OHРисунок 15 — Масс-хроматограммы по точным массам ионов-прекурсоровинтактных GHRP и их метаболитов, полученных в ходе инкубации срекомбинантной амидазойПри реакции дезаминирования по ε-аминогруппе бокового радикалааминокислотного остатка Lys, как и при дезамидировании по С-карбоксильнойаминогруппы, NH2-группа замещается ОН-группой, что приводит к увеличению91массы на +0.9852 Да [10].

Таким образом, в случае реакции дезаминирования впроцессе инкубации с субклеточными фракциями с последующей инкубацией срекомбинантной амидазой масса полученных дезаминированно-деамидированныхметаболитов GHRP должна быть больше на +1.9704 Да по сравнению сисходными соединениями. На Рисунке 16 в качестве примера представлены массхроматограммы по точным массам GHRP-1 и его деамидированных метаболитовGHRP-1 (1-7) OHидезаминированныхGHRP-1 (2-7) ОН,метаболитоватакжеGHRP-1 (1-7) OHидеамидированноGHRP-1 (2-7) ОН,полученные при анализе инкубационных смесей с S9 фракцией печени ирекомбинантной амидазой.Согласно приведенным масс-хроматограммам, метаболиты GHRP-1 сувеличением молекулярной массы на +1.9704 Да после последовательныхинкубацийссубклеточнымифракциямиирекомбинантнойамидазойдетектированы не были, что указывает на дезамидирующую активностьферментов микросом почек человека и S9 фракции печени человека.В нашей совместной работе с испанской антидопинговой лабораторией поизучению влияния структуры пептидов на аффинность связывания с рецепторомгрелина, экспрессированного на поверхности клеток НЕК-293, показана большаяаффинность амидированных пептидов по сравнению с их деамидированнымианалогами [168].

Характеристики

Список файлов диссертации

Прогнозирование метаболитов рилизинг-пептидов гормона роста в организме человека для разработки методики их определения в целях антидопингового контроля
Документы
Свежие статьи
Популярно сейчас
А знаете ли Вы, что из года в год задания практически не меняются? Математика, преподаваемая в учебных заведениях, никак не менялась минимум 30 лет. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6374
Авторов
на СтудИзбе
309
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее