Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1091769), страница 14

Файл №1091769 Диссертация (Прогнозирование метаболитов рилизинг-пептидов гормона роста в организме человека для разработки методики их определения в целях антидопингового контроля) 14 страницаДиссертация (1091769) страница 142018-01-18СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 14)

ЭндопептидазаLys C – высокоспецифичный протеолитический фермент, характеризующийсянебольшой процентной ошибкой неспецифического расщепления пептиднойсвязи. Данная эндопротеаза является одним из наиболее используемыхпротеолитических ферментов для секвенирования пептидов и белков наряду спротеолитическими ферментами трипсин, Arg-C и Glu-C. Для установленияточной пептидной последовательности в области протеолитического расщепленияперспективным подходом является использование двух лизил-эндопептидаз Lys Cи Lys N с образованием четырех вариантных полипептидов [164]. Интерес к этомуферментуврамкахданнойработыобусловленналичиемС-концевогоаминокислотного остатка Lys у большинства GHRP.Ферментыхарактеризуютсяразличнойстепеньюспецифичностикопределенным субстратам.

Специфичность зависит от многих факторов:соотношения субстрат – фермент, рН раствора, температуры, присутствияпримесей, в том числе хелатирующих агентов. Поэтому при прогнозированиивозможных «канонических» метаболитов, образующихся в результате сайтспецифического гидролиза GHRP, также учитывали возможные продукты сайтнеспецифического расщепления. Во избежание ложноположительных результатовпри составлении списка возможных метаболитов GHRP с использованиемразличныхпротеолитическихферментовдетектируемых пептидов выбраны следующие:72критериямисоответствия1)длина гипотетического определяемого метаболита исходного пептидадолжна быть не менее трех аминокислотных остатков;2)один из аминокислотных остатков должен представлять собойискусственную аминокислоту или химическую модификацию, отличающуюметаболит от соединений эндогенного происхождения.Исходные соединения GHRP инкубировали по отдельности с каждым изописанных выше протеолитических ферментов в течение 24 ч при условиях,описанных в разделе 2.4.3.

Полученные образцы разводили в 100 раз ианализировали методом наноВЭЖХ-МСВР. Идентификацию синтезированныхметаболитов проводили по рассчитанной точной массе в режиме селективногомониторингазаданногоионадлякаждогосоединения(tSIM-tMSMS),подтверждение их структуры проводили по a-, b- и y-характеристичным ионам вмасс-спектрах высокого разрешения, полученных в результате фрагментацииионов-прекурсоров в ячейке соударения масс-спектрометра.В зависимости от соотношения количеств протеолитического фермента исубстрата (исходного пептида) в процессе инкубации образовывались различныенаборы метаболитов.

Однако прямой зависимости между соотношениемколичества протеолитического фермента и субстрата, а также специфичностьюпротеолитического фермента и химической структурой исходного соединения невыявлено. Большинство использованных протеолитических ферментовнепродемонстрировали явной специфичности, расщепляя молекулы исходныхсоединенийэндопротеазапонеспецифическимLys Cкатализироваласайтамрасщепления.гидролизПоказано,пептидныхсвязейчтомеждуаминокислотными остатками Ala―His, Ala―(D-β-Nal), Tyr―(D-Trp) и заменуNH2-группынаОН-группуС-концевогоаминокислотногоостаткаLys.Протеолитические ферменты rhCPB, rhCPM и rhAPN продемонстрировалибольшее разнообразие расщепляемых пептидных связей между аминокислотнымиостатками Ala―His, Ala―(D-β-Nal), Tyr―(D-Trp), (D-β-Nal)―Ala, Ala―Trp, (DPhe)―Lys,(D-Trp)―Ala,(D-Mrp)―Ala,His―(D-β-Nal),His―(D-Trp)снекоторыми дополнениями, заключающимися в реакции замещения NH2-группы73на ОН-группу С-концевого аминокислотного остатка Lys в случае пептидаз rhCPBи rhAPN и расщеплении связи His―(D-Mrp) пептидазой rhAPN.

Лейциноваяаминопептидаза, выделенная из свиной почки, катализировала гидролитическоерасщепление пептидных связей между аминокислотными остатками Ala―His,Tyr―(D-Phe), Ala―Trp, в то время как панкреатическая бычья СРВ – Ala―(D-βNal), Tyr―(D-Trp), (D-β-Nal)―Ala, Ala―His, (D-Phe)―Lys, соответственно.Показано, что ферменты катализировали гидролитическое расщепление связи водном соединении, но не катализировали протеолиз по этой же связи в другом.Например, эндопептидаза Lys C осуществляла гидролиз между аминокислотнымиостатками Ala и His в соединениях GHRP-1 и GHRP-2, но не воздействовала нааналогичную связь в алексаморелине. Корреляции составов смесей метаболитов,полученных с использованием ферментов одного класса, но выделенных изразныхисточников,например,рекомбинантнойчеловеческойибычьейпанкреатической карбоксипептидаз В, так же отмечены не были.

Стоит отметить,что рекомбинантные человеческие протеолитические ферменты, полученныегенно-инженерными методами, по сравнению с выделенными из биосырьяферментами, показали большую протеолитическую активность, заключающуюсяв заметном разнообразии полученных метаболитов. На Рисунке 11 схематическиизображены аминокислотные последовательности GHRP с указанием сайтов, покоторымпроисходилогидролитическоерасщеплениеподвоздействиемразличных протеолитических ферментов.

Все детектированные метаболиты,образовавшиеся в серии экспериментов с каждой протеазой, приведены вТаблице 8.74АGHRP-1Lys CrhCPBrhCPMLeu-APrhAPNAla — His ― (D-β-Nal) ― Ala ― Trp ― (D-Phe) — Lys — NH2Lys CCPBrhCPBrhCPMrhAPNCPBrhCPBrhCPMrhAPN Lys CrhCPBrhCPMrhAPN(D-Trp) ― Ala ― Trp ― (D-Phe)GHRP-4NH2Lys CCPBrhCPBrhCPMLeu-APrhAPNrhCPBrhCPMrhAPNrhCPBrhAPNrhCPBrhCPMrhAPNrhAPNrhCPBrhCPMrhAPN rhAPNCPB Lys CrhCPM rhCPBrhAPN rhAPNrhCPBrhCPM rhCPBrhAPN rhAPNLys CrhCPBrhAPNrhCPMLeu-APrhAPNTyr ― (D-Trp) ― Ala ― Trp ― (D-Phe)GHRP-5NH2Lys CrhAPNHis ― (D-Trp) ― Ala ― Trp ― (D-Phe) — Lys — NH2GHRP-6CPBrhCPBrhCPMLeu-APrhAPNAla — His ― (D-Mrp) ― Ala ― Trp ― (D-Phe) — Lys — NH2rhCPBrhAPNHis ― (D-Mrp) ― Ala ― Trp ― (D-Phe) — Lys — NH2ГексарелинИпаморелинГексарелинCPBrhCPB rhCPBrhCPM rhCPMrhAPN rhAPN(D-Ala) ― (D-β-Nal) ― Ala ― Trp ― (D-Phe) — Lys — NH2GHRP-2АлексаморелинLys CrhCPBrhAPNrhCPMrhAPNLys CCPBrhCPBrhCPM rhCPBLeu-AP rhCPMrhAPN rhAPNrhAPN Lys CAib — HisHis ―― (D-β-Nal)(D-Phe) —— Lys(D-Mrp) ― Ala ― Trp ― (D-Phe)Lys —— NHNH22БLys CCPBCPMLeu-APAPNEC 3.4.21.50EC 3.4.17.2EC 3.4.17.12EC 3.4.11.2EC 3.4.11.2- X-X-K-│-X- X-X-X-│-K- X-X-X-│-R- X-X-X-│-K- X-X-X-│-RA-│-X-X-XA- P-│-X-XA-│-X-X-XA- P-│-X-XРисунок 11 — Схематичное изображение аминокислотных последовательностейGHRP с указанием сайтов расщепления протеолитическими ферментами (А) испецифические сайты расщепления использованных протеаз, согласнолитературным данным (Б) [156]75Таблица 8 — Элементный состав, точные массы ионов-прекурсуров исходных пептидов и метаболитов,синтезированных в условиях in vitro в присутствии протеолитических ферментов: эндопептидазы Lys C, бычьейпанкреатической карбоксипептидазы В (CPB), человеческой рекомбинантной карбоксипептидазы В (rh CPB),человеческой рекомбинантной карбоксипептидазы М (rh CPM), лейциновой аминопептидазы (Leu-AP), человеческойрекомбинантной аминопептидазы N (hr APN)76Leu-APhr APN478.25052+478.74252+442.73192+443.22392+374.20252+479.2765+409.72102+410.21302+747.3977+748.3817+691.3239+550.3136+479.2765+608.2980+422.2190+771.3613+608.2980+422.2190+439.1976+437.22962+rh CPMC51H62N12O7C51H61N11O8C48H57N11O6C48H56N10O7C42H50N8O5C26H35N5O4C45H55N9O6C45H54N8O7C42H50N8O5C42H49N7O6C39H42N6O6C29H40N7O4C26H35N5O4C34H37N7O4C23H27N5O3C43H46N8O6C34H37N7O4C23H27N5O3C23H26N4O5C46H56N12O6Протеолитический ферментrh CPBAla-His-(D-β-Nal)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-NH2Ala-His-(D-β-Nal)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-OHHis-(D-β-Nal)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-NH2His-(D-β-Nal)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-OH(D-β-Nal)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-NH2Trp-(D-Phe)-Lys-NH2(D-Ala)-(D-β-Nal)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-NH2(D-Ala)-(D-β-Nal)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-OH(D-β-Nal)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-NH2(D-β-Nal)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-OH(D-Ala)-(D-β-Nal)-Ala-Trp-(D-Phe)-OHAla-Trp-(D-Phe)-Lys-NH2Trp-(D-Phe)-Lys-NH2(D-Trp)-Ala-Trp-(D-Phe)-NH2Ala-Trp-(D-Phe)-NH2Tyr-(D-Trp)-Ala-Trp-(D-Phe)-NH2(D-Trp)-Ala-Trp-(D-Phe)-NH2Ala-Trp-(D-Phe)-NH2Tyr-(D-Trp)-Ala-OHHis-(D-Trp)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-NH2БруттоформулаИонпрекурсор,m/zCPBGHRP-1GHRP-1 (1-7) OHGHRP-1 (2-7) NH2GHRP-1 (2-7) OHGHRP-1 (3-7) NH2GHRP-1 (5-7) NH2GHRP-2GHRP-2 (1-6) OHGHRP-2 (2-6) NH2GHRP-2 (2-6) OHGHRP-2 (1-5) OHGHRP-2 (3-6) NH2GHRP-2 (4-6) NH2GHRP-4GHRP-4 (2-4) NH2GHRP-5GHRP-5 (2-5) NH2GHRP-5 (3-5) NH2GHRP-5 (1-3) OHGHRP-6Аминокислотная последовательностьLys CСоединение++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++Продолжение Таблицы 877rh CPMrh CPB437.72162+736.3929+609.2820+413.1932+479.2765+444.23742+444.72942+375.70792+550.3136+551.2976+479.2765+479.7571+480.2501+444.23932+444.73122+380.68162+550.3136+479.2753+356.70012+357.19212+314.17372+314.66572+293.14462+245.64432+CPBC46H55N11O7C40H49N9O5C34H36N6O5C20H24N6O4C26H35N5O4C47H58N12O6C47H57N11O7C41H51N9O5C29H40N7O4C29H39N6O5C26H35N5O4C50H63N13O7C50H63N12O8C47H58N12O6C47H57N11O7C41H45N9O6C29H40N7O4C26H35N5O4C38H49N9O5C38H48N8O6C34H42N8O4C34H41N7O5C32H36N6O5C28H35N5O3Протеолитический ферментhr APNHis-(D-Trp)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-OH(D-Trp)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-NH2(D-Trp)-Ala-Trp-(D-Phe)-OHHis-(D-Trp)-Ala-OHTrp-(D-Phe)-Lys-NH2His-(D-Mrp)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-NH2His-(D-Mrp)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-OH(D-Mrp)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-NH2Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-NH2Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-OHTrp-(D-Phe)-Lys-NH2Ala-His-(D-Mrp)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-NH2Ala-His-(D-Mrp)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-OHHis-(D-Mrp)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-NH2His-(D-Mrp)-Ala-Trp-(D-Phe)-Lys-OHHis-(D-Mrp)-Ala-Trp-(D-Phe)-OHAla-Trp-(D-Phe)-Lys-NH2Trp-(D-Phe)-Lys-NH2Aib-His-(D-β-Nal)-(D-Phe)-Lys-NH2Aib-His-(D-β-Nal)-(D-Phe)-Lys-OHHis-(D-β-Nal)-(D-Phe)-Lys-NH2His-(D-β-Nal)-(D-Phe)-Lys-OHAib-His-(D-β-Nal)-(D-Phe)-OH(D-Phe)-(D-Phe)-Lys-NH2БруттоформулаИонпрекурсор,m/zLeu-APGHRP-6 (1-6) OHGHRP-6 (2-6) NH2GHRP-6 (2-5) OHGHRP-6 (1-3) OHGHRP-6 (4-6) NH2ГексарелинГексарелин (1-6) OHГексарелин (2-6) NH2Гексарелин (3-6) NH2Гексарелин (3-6) OHГексарелин (4-6) NH2АлексаморелинАлексаморелин (1-7) OHАлексаморелин (2-7) NH2Алексаморелин (2-7) OHАлексаморелин (2-6) OHАлексаморелин (4-7) NH2Алексаморелин (5-7) NH2ИпаморелинИпаморелин (1-5) OHИпаморелин (2-5) NH2Ипаморелин (2-5) OHИпаморелин (1-4) OHИпаморелин (3-5) NH2Аминокислотная последовательностьLys CСоединение+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++3.1.2 Сыворотка человеческой кровиБелки и пептиды характеризуются низкой мембранной проницаемостьюввиду их гидрофильных свойств и быстрой деградацией в организме, чтосокращает их терапевтический потенциал и значительно сужает спектрвозможных способов приема.

Биодоступность пептидных препаратов при самомудобномпероральномспособеприемаоченьнизкая[36,41],поэтомувнутривенное введение – один из потенциальных способов приема GHRP.Плазма является жидкой составляющей крови организма и содержитбольшое количество различных ферментов, участвующих в биотрансформациипептидных соединений. Альтернативным вариантом изучения метаболизмасоединений, запрещенных к применению в спорте, является инкубация всыворотке и/или плазме крови человека или подопытного животного.Метаболизм соединений класса GHRP был изучен в сыворотке и плазмекрови человека [116,117] и лошадей [6,121]. В работе [116] представлены данныепо метаболизму восьми GHRP в сыворотке человеческой крови, однако из работыне очевидно, в каком из экспериментов идентифицированы те или иныеметаболиты,поскольку вэкспериментовизученияисследованииметаболизматакжеGHRPпредставленывусловияхрезультатыin vivoпослевнутривенной инъекции пептидов крысам.

В статье [117] описаны 10 метаболитовGHRP-2, GHRP-6 и гексарелина, полученные при их инкубации с человеческойсывороткой крови. Согласно данным [6], при инкубации с лошадиной сывороткойкрови большинство GHRP идентифицируются в неизменном виде, в то время какалексаморелин и GHRP-1 претерпевают протеолитическое расщепление свысвобождениемN-концевогоаминокислотногоостатка.Значительнаядеградация GHRP-1 при инкубации с лошадиной плазмой крови также отмечаетсяв работе [121] при изучении устойчивости некоторых соединений GHRP. Авторыпредполагают, что метаболит GHRP-1 (2-7) NH2 образуется в результатеферментативногогидролизаGHRP-1сучастиемэкзопептидазилидипептилпептидазы V лошадиной плазмы.

Характеристики

Список файлов диссертации

Прогнозирование метаболитов рилизинг-пептидов гормона роста в организме человека для разработки методики их определения в целях антидопингового контроля
Документы
Свежие статьи
Популярно сейчас
Как Вы думаете, сколько людей до Вас делали точно такое же задание? 99% студентов выполняют точно такие же задания, как и их предшественники год назад. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6305
Авторов
на СтудИзбе
313
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее