1625915648-5ed1152c004edfe493dad6e5388afaf3 (843956), страница 16
Текст из файла (страница 16)
Кзк скззызж нщ ооньпнщшс РН рзг> норз из п<ншззцци кзрбоксн.>ьпых > рупп и нкпиин руин? 1,>. Нз.н>нито '>с>'>яр<' щ>з>>$>ых $<,>щсз оргз>$$$'нт>о<х >>ещсгтз орг пшзл>з !б. Очзрякн р>щуйге зри иолкл и <а углсяолон 17.
К каким подклзсгзм у>. >еь<цон отпосятсн < шоко ы, сзчзрозз, глнко>ен? 18. Кзк<еы хзрщосрньи гзоистнз липидпн> !9. Охзрзкчернзуйте иплклщ<.ы.>цнн.к>н. 20. /1>>и>е ицжк и 1нп> оку гпязян м<оклу,>л>ипоюн]и>гзмп прп обрззонзиип помин>полной цспп. 21. '!см >ц>>п>д огл>>из< чгя пт ос >кз? 22. Кзкне лнз фзкторз оирсдсляк>$ и< рни шун> г>руктуру >и>лшппчнлной цспн? 23. Нз>о>$$<т< ипил нззцмо*<ни-$ ннй, определяющие щш <йорк>$$$$><к> полипгпти,<пой испи.
24. Оииншп структуру <Н!К н РНК. 23>. Опишите мгхзпизмы сизриь>шин мсз<ду п] клсочидными оспоязппямп. АКТИВНОСТЬ БЕЛКОВ И КЛЕТОЧНЫЙ МЕТАБОЛИЗМ глдвд Белки связаны с осуществлением практически любой функции живой клетки. Для понимания функции белков н, таким образом, живого организма существенен следующий факт: каждый белок имеет уникальную форму илн конформацию, которая обеспечивает его способность связывать специфические молекулы с частью его поверхности, называемой участком связывания.
В этой главе мы начинаем рассматривать свойства связывающих участков белков н увидим, как эти свойства обеспечивают один класс функций белков — способность ферментов ускорять специфические химические реакции. Затем мы используем эту информацию для описания множественных химических реакций, называемых метаболизмом. 3.1. СВЯЗЫВАЮЩИЕ УЧАСТКИ БЕЛКОВ 3.1.1. Свойства связывающих Участков Способно<Я ь р>3<1пчпых молекул г называться со си<†ц)3<1>11чсскнм11 у'$3|Гп,зхи! еи ПОВсрхио('$ и б<'лкОе1 НВля<51- гя Основ(ш .1ля обсгпечснпя шир(жого рапп>оорашя функпнЙ 6<.>нов.
Лнганд ирс1()зв.|я('! (Об(>й .Эк>бу|<) Питанд Сеязыеающни участок |, Комплекс, образававынйся е результате связывания Рнс 3.1 Ксмплементарные формы пнгандз н связывающего учас|на белка определяют химическую спечнфичнас|ь связывания молскус1У. Кптпй||Я ('Вязь>пз('1тн ( <нпкйх|н)Гп 1О ОЬВ1кд с |нжнпцью Одной из слслукнцнх гнл: 1) з>!< К-три пт'ко! О при |яжспня между прптшюполпжнп даря;кспнымп НОИ- н|лмп п.
п! Полярны л|и |руп! Щмп лишила п бс ! Ла; 2) слабого притяжения, (ХЭусло|с>Сино!Т> вин Лср-щ>альсовымн силамн ьп х'Лу н< полярнь!лн> Облж тямн двух мол< кул. Огмегпы, что в ч гол! связы ванин нс учжтвукп ковж |снтныссвязп.
Облзсп белка, с коп>рой гвязынасп я лпганл, нззыВзе!ся сВ5ыыщ1книим у 33Г!кОм. В(<ЭОЛ мпжс! со>яр Я(дТЫ|СС КОЛЬ КО ГШ|ЗЬ|%|Н)ЩИХ )п|ЗГ| К(>Н. КЗЖДЫ $3 Ид КОТО. рых снсцнфичсн В оп>пшеинп опрс)тслспиого лнг |нлз. Химическая специфичность С'пла:>лсктрн исн<пъ прнтяжсп|ш хи жду противоположно ззряженшдмн об:ЩГ|ямп нз бе>И<с и .Эигапле значительно ул|щ|ыпается ш) мер< увелнчсння рассто5|пия ън'жлу ними. эсзжс (с|збыс' Взн-дсрмнщльсовь| силы дсйГН|31О3 только мсжлу и('|н)'ырными Групп><мн, изхолшпим пса Очень близко друг л другу. 11озтому для 1ОГО. чп)бы л|изнл сВ5|13>|ся Г 6<л$и)м. сп| лОлж(>н нахО- ди |ы я бл31дкО к < ГО п<пюрхнО(1 и.
Гзко(' со>1иж(нис ло- Г! и | щ тс)|, сс.п! форма.и|Санда ком Ил< мс |Ггц)>|а (133>рмс связывакнцсго ) чз< ! ка белка, |зк что О|ш НОЕ(хпэ|ят друг К ЛРУ|У, Наь Отде. и ИЫС КУГОЧКН В П)ЛОВОЛОЛ!КЕ «ПаЗЗЛЬ 1рис. 3.1). Связыван|ц между лпганлом и белком может быль настолько спецн(1П>чныы, ч го сяязывакнций участок ('Вязывзст тОлько Опрслс1спиый тп|3 ЛПГП|1лз. Тдка51 пзбнратс|ыннть п<ювпля(тб<лку «плснтпфпцпрпва|ь» Олпу определенную МО.
и'кулу, иахоэппцуюся в рзш ворс. (Одс)эжзп[(м со! 3и! раз 1И'|нь|х мол['ку.1.,)тз ('по('Обн(х 1 ь свя!ЫВ31Ощ<ГО э"п|стла гн лкз ГВ)33ы на и сп<И33ф|$ чс<кпе лнгапль! Ил|се гиа как химическая специфичность, |нн кольку связы вщ<яцп й участок <нцх'Лс. И|с г гни СВЯЗЫПЗКЛПСГОСЯ ХИМИЧЕЩИП О СОСЛППЩШЯ В |л. 2 мы оппга«ш, к:|кпм Образом 6>шголзря рзсположснпн> раз шчпых амшн >кислот вдоль полн по гпщипй цспн опрсдслястся л<|нформа! !Пя белка. В г<х> ! вы <и внн (':)ТИМ МОЛСКУЛЫ <ХЛКО13 С Р И |ИЧН ИМИ ЗМИ1Н)ЛП( 1О1Н! 1. мп послсдоватсльн(хтямп Имеют рз.щпчпу>О форму п.
слслОВ31сльно, сп5|зы13зкяц1к' )'часты! 1ж шнчпОЙ <роды!1, каждый из кОтОрых пх!се! ('ВО10 собст!3('Н13у|О хпм3>ч<' ( кук> спщшфнчность. К13к пока.ано пз рпс. 3.2. Змпнокпслпть|, |ыанмплсйствукнцн( с >шгзнлом в свядьиюняц(м у щсгке, нсобязз!слыло дол>хны р ни<>щгзться близко др) | к дру|у В и()лпнс! Г!п и|ОЙ ц(пп, 1Н)ск01ьку <13ор13Н1- в|пик бслка мо>лс'г прнвссти к тому, |то р|ы.п!ч|и к сс г лп>пты молекулы ок Оку|ся рагполпл<спным|! рял(ж!. ХОТЯ |ККОтОРЬП СВЯЗЫВШОЩПС У Шетю! ИМСКП. ХПЛШ. ч< ск) ю сисцнфпчш>ст ь.
котор ш ! Нх!воляс |. Им свядьшзп ь толыи) О И3Н п|п лпГзн>п!. лр) пн' 5п)лякл(я мен((' ( и< цп- (1)и'!н13ми н С1кхОбнь| связы>щи р5И ВОДГпкппых ли|(п! Ииганды Белок Х Белок У Инганл Связыаающии участок с промежуточным сродствам Связыеающии участок с высоким сродством Связывающий участок с низким сродством Рис. 32. Аминакисла)ы, взаимадеиствующне с ли(андам в связывающем участке, не могут находиться на соседних участках лалипептиднай цепи, как продемонстрирована на зтай модели, гкжазывающей сворачивание белка е пространстве. Несвернутая белковая цепь показана внизу лон. )(Знрилир, нв рнг. 3.3 покзгяи)о, что три различных зигвнлк лн)гут сосли))иться со связыва(о!Иил) учагткоч (к'лкЗ Л, и(3скольку '13ст'ь кзж)!Ого л3!Тзндз коз)и.т('з)снтзрнз форы( связывак)ик го учзг гкз.
! (Зирогив, белок !' илкет (х)льи)У)О (1.(. более оцхшичсннук)) специфичность н чожгт сяя.икищть только олни нз трех лн)зилов. Сродство (зффинность) Сила снязына!ия .чигвндз ( Гй лкоч янлягяся харак)ерной черт(кй связь)ввкнцп о участка, кап)!)зя !щлсст нз кзк сто сролство(зффиниогть Зйии!у). ( родство связывв)ощсго участка для ли)знлз оир(леляс), нзсколько нгроятныы являпся то, ч !о сия 33нный л)нннл покинет ионсрхно(я ь белка и Всриетгя В нггняззннос согтоянис. ( вязывзкцций у щеток, который прочно ГВЯЗЫЩКТ Л!ИЗНЛ, )щ!ЫВЗ(1 ГЯ Г(5И)ЫВЗ)ОЩИЧ УЧЗСТКОК! г высокич с!)Олст))ом (Высоков()х1яиноык) связы вакнцим участком); 3 тот учзги)к, с которью) .Иизнл снязыввст.
ся слабо. связыввющич участком с низкич сродством (НИЗКОЗ()х!)ИННЫЗ) СВЯ,)ЬШЗКИЦИЧ 1 ЧЗСТКОМ ) СРО)(СТВО Н ХИМИЧСГКЗЯ СИ('ЦИ((Н!ЧИОС)1 ДВУМЯ (ХЫЛИЧНЫМИ, ХОТ51 и РОЛСТВСИНЫМИ, СВОЛСТВЗЧИ сс связывзк)щих у'щсткОН. ((Зк ыы и!3лели, хнчичсск351 сиециф!шность ззВисит только От (!)Орх)ы сВязынз)О щего участка, в го Вр( мя кцк сродство (Зфи шин ть) отсилы нри гяже)нш мсжлу бе.н!(кч и лигзнлоч. ! яким ГЛАВА 3. Активность белков и клеточный метаболизм 47 Рис. 3 3.
Белок Х способен связывать три лиганда, которые имеют похожие химические струкгуры. Белок У нз-за формы ега связь)вающега участка может связь)вать только лиганд с Таким образам, белок У имеет большую химическую специфичность, чем белок Х образом, рвзличные белки лн)гу) бьп ь сиогобиь)ыи щшзывзть олин н тот жс лнгвнл, !.г. Иметь одинаковую хичичсскщо специфичность, ио ( родс) во лля зтого лнганлв булст рвзличныч.
! (Зирнлн р, лпгзнд чожш изн т) От ринзт(31 3н) ззр5)ж(нну)О ИОнизироВЗнн) ю группу, которая булст проч))о снязынзтьгя с учв!3 ком. сол(ржвшнч положи)сльио ззряженнук) боковук) цепь аминокислоты, однзко он будет связь)взгьгя ы(- иес прочно со связыншошич участком той ж( форли), НО н! ИмГ)оии)м НО))ох)п(ль310го 3;)ря;13 (рис. 3.4). Рис. Зтй Три связывающих участка с одинаковой «имнческай спе- цифичностью лля лиганла, на различным сродством 48 РАЗДЕЛ!. Основы молекулярно-клеточной физио<<огни Пи<вид .,' Б А 100 зз 75 ~ 50 а с <'- 25 0 А 5) С Концентрация пи<аида Рис. 3.5 Повышение концентрации лиганда увеличивает количества заполненных связывающих участков и, соответственна, процент насыщения При 100%-м насыщении все связь!веющие участки заполнены.
и дальнейшее павии>Ение ханцЕН грациИ ЛиГанда на увели- чивает количество связанного Кр<ми того, им ближе >он< рхиос>п л>!<ТО>да и «вязывакице>О участка, >им си.л исс щи< <яжсиис. Следовательно, чем более форма ли<аида со<п ест< твуст форме связьи>зкицгго учзгткз, тем больше сролство.!(ными (ловами, <)>Ории связы вз>О<цш О ) чш !из меж«3 вли>пь нз гродгтво тзк жг, кзк и из >ы<мичс< ку!О п)ецифичнш ты тков увгличивзетгя г увели шиисм шни1«итрации лигзидз до т<.х нор, ши<з в«у шл ки и< будут,яиииигны (Ри«.
3)). П(и>3>имзЯ ВО Вн3<мзиис, ч >О ли><и>д ЯВл5>сГ. ся л>олскулой, к<Порвя вызывз<т биологи и < кий зффск< нри гвязываиии с белком, ш личина к)х(кктз тзкж( булст ув<личиншъся с увели и нием количсглвв <.вязанных лигандов до тех иор, локз ш< гиязывзюиии участки Небу><ут ззиолисны.