Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1150552), страница 7

Файл №1150552 Диссертация (Развитие методов ЯМР для исследования состояния биологических молекул в условиях окислительно-восстановительных процессов) 7 страницаДиссертация (1150552) страница 72019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 7)

Суммарноечисло гидратации равно 14 для GLY (3 от NH3+ + 4 от COO- + 7 от CH2), 21 для bALA (как дляGly + 7 от СН2), 28 для GABA (как для bALA + 7 от СН2) и 35 для 6ACA (как для GABA + 14 отдвух CH2). Эти координационные числа дают значения концентрации 4,0, 2,6, 2,0 и 1,3 m ,соответствующие ситуации, когда все молекулы воды в растворе принадлежат гидратнойоболочке молекулы растворенного вещества. Панели a и c на Рисунок 1.1 иллюстрируютотклонения концентрационных зависимостей от линейности именно на вычисленныхконцентрациях (за исключением GLY, так как он не растворим при 4 ).

Этот фактподкрепляет уверенность в предлагаемых значениях координационных чисел для CH2, COO- иNH3+. С другой стороны, из концентраций, при которых наблюдается отклонение отлинейности, можно рассчитать координационное число для молекул растворенного вещества.Такой подход был очень плодотворным для растворов электролитов. Ранее были успешноопределены координационные числа и относительные времена корреляции вращательногодвижения молекул воды в гидратных оболочках различных ионов [35].Мы использовали координационные числа, полученные способом, описанным выше, ивычислили относительные времена корреляции вращения молекул воды в гидратных оболочкахвсей молекулы растворенного вещества (), метиленовой группы (2 ) и остальной частимолекулы растворенного вещества, содержащей карбоксильную и аммонийную группы ( ).Результаты расчетов представлены в Таблице 1.1.30Таблица 1.1.

Относительное время корреляции вращательного движения молекул водыв общей гидратной оболочке молекулы растворенного вещества (), в гидратной оболочке CH2(2 , рассчитано из 12 в уравнении (1.8), используя данные для пар разных аминокислот) ив гидратных оболочках COO- и NH3+ ( , рассчитано из 1 (см. уравнение (1.9)) сиспользованием данных для всех соединений).2˚C25˚C55˚C1,041,071,121,16GLYbALAGABA6ACA1,151,211,261,301,251,301,401,4121,61,92,02,22,12,1GLY, bALAGLY, GABAGLY, 6ACAbALA, GABAbALA, 6ACAGABA, 6ACA1,71,81,81,91,91,81,51,71,61,91,61,52Все соединения2,01,81,6Все соединения0,80,91,0Ранее относительное время корреляции вращательного движения молекул воды вгидратных оболочках метиленовой группы никогда не было оценено.

Поэтому мы не можемсравнить его с литературными данными, однако относительные времена корреляции для воды вгидратных оболочках молекулы растворенного вещества также могут быть вычислены изрелаксационных данных для ядер17O в водных растворах аминокислот, представленныхIshimura и Uedaira [37]. Они измерили 1 кислорода-17 для молекул воды в зависимости отконцентрации аминокислоты для GLY, bALA и GABA при 25°C. Опубликованные Bкоэффициенты для релаксации 17O соответствуют равным 1,13, 1,20 и 1,19 для GLY, bALA иGABA, соответственно. Эти результаты хорошо согласуются с соответствующими ,полученными в данной работе по релаксации дейтронов.Аддитивность вкладов гидратных оболочек метиленовых групп в наблюдаемую скоростьрелаксации можно рассматривать как достаточно общее правило.

Используя исходные данныеработ [5, 9, 37, 38] можно также выявить линейную зависимость B-коэффициентов от числа31метиленовых групп в молекуле растворенного вещества для растворов спиртов, бромидовтетраалкиламмония и некоторых других соединений. В принципе, могут возникать некоторыеотклонения от линейности, которые вызваны эффектом размера молекул (этот эффект такженаблюдали Uedaira и др. для олигосахаридов с различным числом ОН-групп) [8]. Тем не менее,общая тенденция для относительно небольших молекул прозрачна: (i) каждая дополнительнаяметиленовая группа меняет подвижность молекул воды в растворе на приблизительнопостоянный инкремент; и (ii) метиленовые группы замедляют ориентационное движениемолекул воды в их гидратных оболочках. Эти факты делают возможным применениеописанного выше подхода к изучению явлений гидратации для других молекулярных групп.Особенности температурных зависимостей молекулярного движения в гидратных оболочкахCH2, СОО- и NH3+ обсуждаются ниже.Скорости релаксации дейтронов в 1 m растворах GLY, bALA, GABA и 6ACA в D2O былиизмерены, как функции температуры.

Для каждой аминокислоты при всех температурах Вкоэффициент был рассчитан с использованием 10 и 1 при концентрации 1 m. Затем каждаятемпературная зависимость В-коэффициентов от числа метиленовых групп в молекулерастворенного вещества (2 ) была аппроксимирована уравнением (1.9) для полученияскорости релаксации дейтронов в гидратной оболочке метиленовой группы (12 ) и вгидратных оболочках карбоксильной и аммонийной групп (1 ). Полученные результатыпредставлены на Рисунок 1.3. Коэффициент детерминации для всех аппроксимаций был выше0,98.Рисунок 1.3. Температурные зависимости скоростей релаксации дейтронов воды в чистой D2O(сплошная черная линия), в гидратных оболочках метиленовой группы (1, синий) и в гидратнойоболочке с карбоксильной и аммонийной групп (2, красный).32Скоростирелаксациидейтроноввгидратнойоболочкеметиленовойгруппыаминокислот в 1,5 ÷ 2 раза выше, чем скорости релаксации для чистой D2O в рассматриваемомдиапазоне температур.

В первом приближении для описания температурных зависимостей 10 ,12 и 1 может быть использована одна экспоненциальная функция Аррениусова типа. Изаппроксимацийэкспериментальныхданныхуравнением(1.5)энергииактивациипереориентационного движения были оценены в 20, 23 и 18 кДж/моль для 10 , 12 и 1 ,соответственно. На основе полученных данных можно сделать вывод, что переориентациямолекул воды более затруднена в гидратных оболочках метиленовых групп в сравнении собъемной водой, однако переориентация молекул воды слегка ускорена в общей гидратнойоболочке гидрофильных карбоксильной и аммонийной групп. Эти выводы хорошо согласуютсякак с экспериментальными, так и c расчетными литературными данными [60, 72-74].1.4.3.

Обмен водорода между группой NH3+ глицина и водойДейтроные ЯМР спектры растворов GLY в D2O представлены на Рисунок 1.4а. Притемпературах выше 35°С спектры содержат один пик, соответствующий усредненнойрезонансной линии от OD группы воды и ND3+ группы аминокислоты. При температурах ниже35°С спектры содержат две резонансные линии: от D2O и ND3+. Таким образом, мы наблюдаемтипичный пример промежуточного и медленного обмена дейтронов между аммонийнойгруппой и водой. Влияние химического обмена было обнаружено и для протонных спектров,что было подтверждено путем наблюдения положительных обменных пиков в протонныхспектрах NOESY (данные не показаны).

Точка коалесценции дейтроных спектров расположенапримерно на 35°С, при этом:∆ ~1,здесь ∆ - разница между резонансными частотами для обменивающихся сайтов и постоянная времени для химического обмена. Из данных для дейтронов в точкекоалесценции оценивается приблизительно в 0,7 мс. Как следует из полученных данных,несмотря на то, что ниже 30°C обмен водорода между аммонийной группой и водой медленныйв шкале времени химического сдвига, этот процесс является быстрым в шкале времени спинрешеточной релаксации: намного меньше, чем наименьшее измеренное время релаксации(25 мс).

Поэтому уравнение (1.3) может быть применено во всем диапазоне исследованныхтемператур.33Рисунок 1.4. (а) 2H ЯМР спектры 1 m раствора GLY в D2O при различных температурах; (б)температурная зависимость скорости релаксации дейтронов: сплошная черная линия - чистаяD2O, синие круги (1) - D2O и красные круги (2) - ND3+ группа GLY в 1 m растворе в D2O сдобавлением 1,4 моль HCl.Для того, чтобы оценить вклад различных слагаемых в уравнении (1.3), скоростирелаксации дейтронов для линий ND3+ и D2O были измерены (см. Рисунок 1.4b). Температурнаязависимость спин-решеточной релаксации для линий ND3+ и D2O была записана для растворовс низким значением рН (добавлено 1,4 моль HCl) для замедления процесса химическогообмена. Даже при 2°С, когда скорость обмена имеет наименьшее значение в нашемэксперименте, разница в 1 дейтронов D2O и ND3+ составляет менее 20%.

Учет этой разницы иотносительной населенности аммонийных дейтронов (2,7% при 1 m концентрации) вноситизменения в рассчитываемые скорости ЯМР релаксации меньшие по значению, чем точностьизмерения1 .Поэтомуэффектомхимическогообменааммонийныхдейтроновсрастворителем, можно пренебречь при расчетах скоростей релаксации дейтронов воды. Крометого, в связи с этим обстоятельством не нужно, проводить оценку величины константы34квадрупольной связи (см. уравнение (1.1)) для дейтронов в группе ND3+, которая, скорее всего,отличается от константы для молекул воды.1.5. Заключение по главе 1Температурные и концентрационные зависимости скоростей релаксации дейтронов водыбыли изучены в широком диапазоне концентраций и температур в водных растворах (D2O)набора ω-аминокислот. При низких концентрациях наблюдаемые скорости релаксации ядеррастворителя зависят почти линейно от числа метиленовых групп в молекуле растворенноговещества.

Характеристики

Список файлов диссертации

Свежие статьи
Популярно сейчас
Как Вы думаете, сколько людей до Вас делали точно такое же задание? 99% студентов выполняют точно такие же задания, как и их предшественники год назад. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6384
Авторов
на СтудИзбе
308
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее