Диссертация (1144820), страница 4
Текст из файла (страница 4)
К ним относят заболевания беременных женщин (артериальнуюгипертензию беременных, гестоз, гестационный сахарный диабет и другие), атакжетакиераспространенныеболезникакгипертония,ожирение,метаболический синдром и некоторые другие.Гестоз (преэклампсия) является основной причиной материнской иперинатальной заболеваемости и смертности (Dekker et al., 1995; Cook et al.,2001). Артериальная гипертензия – наиболее частый диагноз средимультифакторной патологии у детей (Образцова, 2009). Артериальнаягипертензия и ожирение являются облигатными составляющими такогораспространенногоэкогенетическогозаболеваниякакметаболическийсиндром (Махрова, 2011).В настоящее время выделяют более 393 гена-кандидата риска развитиягестоза.
К ним относят гены различных метаболических систем: свертываниякрови и фибринолиза, ренин-ангиотензиновой, функции эндотелия иангиогенеза, иммунной и эндокринной, детоксикации и оксидативногостресса, липидного обмена (Chikosi et al., 2000; Kim et al., 2001; Plummer etal., 2004; Lin et al., 2005; Chappell et al., 2006; Зайнуллин, 2007; Баранов,2009; Баранов, Айламазян, 2009; Fitzpatrick et al., 2009; Akbar, 2009; Williams,Pipkin, 2011; Roten et al., 2011).
Помимо перечисленных систем определеннаяроль в развитии преэклампсии отводится микроРНК и гипометилированиюгенов плаценты (Yuen et al., 2010; Gunel, 2011).Известно более 160 генов-кандидатов риска развития артериальнойгипертензии (Wang et al., 2011; Johnson et al., 2011; International ConsortiumforBloodPressureGenome-WideAssociationStudies,2011;Delles,Padmanabhan, 2012). Продукты этих генов регулируют метаболизм липидов,обмен арахидоновой кислоты, ренин-ангиотензиновую систему и многиедругие.26Не менее 100 генов-кандидатов определяют риск развития ожирения иметаболического синдрома (Чазова и др., 2002; Дедов, Мельниченко, 2004;Walley et al., 2006; Дедов, Петеркова, 2006; Ройтберг, 2007; Fox et al., 2005;Баранов, 2009; Мычка и др., 2009; Bell et al., 2010; Wang et al., 2010;O’Donnell, Nabel, 2011).Очевидно, что этим заболеваниям свойственны многие общиеособенности патогенеза, сравнительный структурно-функциональный анализкоторых, на таких группах, как беременные женщины с гетозом и дети сгипертензией и МСО, может быть эффективным.
Именно такой комплексныймолекулярно-генетический подход и был предпринят в настоящей работе.Средиобширногоарсеналамолекулярно-генетическихметодов,применяемых в настоящее время для изучения МФЗ, важное местопринадлежит биочиповой диагностике (Nasedkina et al., 2006; Наседкина идр., 2007). Благодаря миниатюрности и низкой себестоимости, даннаятехнология даже в «эру NGS секвенирования» остается востребованной длябыстрой и точной детекция различных генетических вариантов (Patnala et al.,2013). В свою очередь, технология NGS секвенирования является наиболееэффективным методом поиска новых маркеров риска (SNP, мРНК,микроРНК) (Ong et al., 2013). Анализ МФЗ требует совершенствованиясуществующих и разработки новых подходов, среди которых все болеезначимоерольиграютметодыбиоинформатикиистатистическогомоделирования (Колчанов и др., 2008; Moore, Williams, 2009; Xu, Hu, 2010;Zhang et al., 2011; Gui et al., 2011; Demenkov et al, 2012; Lvovs et al., 2012).В своем большинстве, однако, такие исследования все еще имеютнесистемныйиузконаправленныйхарактер.Дляпрогрессаперсонализированной медицины необходимо использовать комплексныйподход, направленный на разработку новых методов диагностики МФЗ,исследование их патогенеза, и создание моделей, удобных для болееобъективной оценки риска МФЗ.
Такой комплексный подходбылиспользован и в данной работе для выяснения особенностей патогенеза и27совершенстования оценки генетического риска ряда частых МФЗ детскоговозраста и беременных женщин.Цель и задачи исследованияЦель – определить наследственные и средовые факторы риска гестозау беременных женщин, артериальной гипертензии и метаболическогосиндрома с ожирением у детей с помощью оригинальных биочипов вкомплексе с другими молекулярно-генетическими и биоинформатическимиметодами.Задачи:1.Провестиапробациюбиочиповдляоценкинаследственнойпредрасположенности к повышенному артериальному давлению «Кардио-биочип» и тромбозам - «Фибр-биочип».2.Провести анализ частот аллелей и их комбинаций для генов REN (83G>A, rs2368564), AGT (M235T, rs699), AGTR1 (1166A>C, rs5186),AGTR2 (3123C>A, rs11091046), BDKRB2 (-58T>C, rs1799722), ADRB2(48A>G (rs1042713), 81C>G (rs1042714), MTHFR (677C>T, rs1801133) сиспользованием «Кардио-биочипа» и для генов APOE (E2, E3, E4,rs429358, rs7412), LPL (Ser447Stop, rs328), NOS3 (-786T>C, rs2070744),ACE (I/D, rs4340) методом ПЦР-ПДРФ у беременных с гестозом, детейс гипертонией и детей с ожирением и метаболическим синдромом и всоответствующих контрольных группах.3.Провести анализ частот аллелей и их комбинаций для генов MTHFR(677C>T, rs1801133), F5 (1691G>A, rs6025), ITGB3 (196C>T, rs5918),SERPINE1(5G>4G,rs1799768),FGB(455G>A,rs1800790),F2(20210G>A, rs1799963) с помощью «Фибр-биочипа» у женщин сгестозом, у беременных контрольной группы и в популяционнойвыборке.284.Провести корреляционный анализ генетических и клиническихпоказателей у беременных женщин с гестозом, у детей, больныхартериальной гипертензией и у детей с метаболическим синдромом иожирением.5.Разработать и апробировать математические модели оценки рискамультифакторных заболеваний.6.Исследовать аллельные варианты генов CDH13 (rs11646213 A/T),MTHFR (rs17367504 A/G), CDKN2/BAS (rs4977574 A/G), а такжемаркера rs11191548 T/C в качестве кандидатов риска развития детскойгипертензии.7.Провестиреконструкциюассоциативныхсетейигестоза,анализпервичныхартериальнойгенетическихгипертензиииметаболического синдрома с ожирением.8.Проанализировать особенности нуклеотидной последовательности генаACVR2A у беременных с гестозом и у лиц контрольной группы.9.Изучить изменение уровня микроРНК в тканях плаценты при гестозе ив контрольной группе.10.Провести анализ метилирования промоторного региона гена H19 втканях плаценты у беременных с гестозом и в контрольной группе.Научная новизна полученных результатовНа основании исследования генов-кандидатов, анализа генных сетей иизучения полногеномных, транскриптомных и эпигеномных характеристиквпервые дана комплексная оценка риска гестоза у женщин, артериальнойгипертензии и метаболического синдрома с ожирением у детей.
Показано,что комбинации C/T (rs1801133) по гену MTHFR, 5G/4G (rs1799768) по генуSERPINE1, а также сочетание комбинаций APOE (E3/E3, rs429358, rs7412) xAGTR2 (C/A, rs11091046) являются маркерами повышенного риска гестоза.Впервые установлено, что сочетание комбинаций AGTR2 (A/A, rs11091046) xNOS3 (T/C, или T/T, или C/C, rs2070744) являются маркерами повышенного29риска артериальной гипертензии у детей; комбинация A/A, аллель А генаAGTR2 (rs11091046), а также сочетание комбинаций APOE (E3/E3, rs429358,rs7412) x NOS3 (T/C или T/T, rs2070744) являются маркерами повышенногориска артериальной гипертензии у мальчиков, а сочетание комбинаций AGT(M/T, rs699) x NOS3 (C/C, rs2070744) - фактором риска артериальнойгипертензии у девочек. Впервые показано, что сочетание комбинаций APOE(E2/E3, rs429358, rs7412) x BR1 (BDKRB2) (C/C, rs1799722) x LPL (C/C, rs328)является маркером повышенного риска метаболического синдрома иожирения у детей; сочетание комбинаций APOE (E3/E3, rs429358, rs7412) xAGT (M/M, или M/T, rs699) – характерно для мальчиков, а сочетание APOE(E2/E3, rs429358, rs7412) x BR1 (BDKRB2) (C/C, rs1799722) и аллель А генаAGTR2 (rs11091046) и С гена LPL (rs328) – для девочек.
Впервыеустановлено, что линейные модели на основе генетических и клиническихданных в сочетании с показателями преморбидного фона обладаютнаибольшейсбалансированнойточностьюпредсказаниярискамультифакторных заболеваний. Показано, что метод GLM позволяетформировать группы риска развития гестоза и артериальной гипертензии умальчиков на основании моделей, учитывающих только генетическиеданные: ~0,533 - 0,284*AGTR2 (rs11091046) + 0,333*MTHFR (rs1801133) 2,210*F2 (rs1799963) (гестоз) и ~ 0,370 - 0,438*AGTR1 (rs5186) +0,297*AGTR2 (rs11091046) - 0,330*MTHFR (rs1801133) (артериальнаягипертензия).
Впервые установлено, что модели, рассчитанные с учетомвозраста, гипертонической болезни, тромбозов в анамнезе, желчекаменнойболезни, ожирения, эндокринной патологии и полиморфизма генов REN(rs2368564) + F2 (rs1799963) позволяют предсказывать риск гестоза свероятностью до 94%. Модели, учитывающие возраст, вес, рост, наличиеповышенного АД у матери и полиморфизм генов AGTR1 (rs5186) + MTHFR(rs1801133) + ACE (rs4340) позволяют предсказывать риск артериальнойгипертензии у мальчиков с вероятностью около 85%.