Диссертация (1139571), страница 2
Текст из файла (страница 2)
Большинство инфекцийбактериальной этиологии связано с несколькими видами микроорганизмов ипрежде всего со стрептококками, среди которых лидирующие позиции занимаютStreptococcus pneumoniae (пневмококк) и Streptococcus pyogenes (пиогенныйстрептококк, β-гемолитический стрептококк серогруппы А – БГСА) [15, 16, 29,42, 51, 75]. С пневмококками ассоциирован широкий спектр заболеваний, впервую очередь у детей, начиная от острого среднего отита и синусита,мукозальнойпневмонииизаканчиваятяжелымижизнеугрожающимиинвазивными пневмококковыми инфекциями (ИПИ), включая бактериемию именингит [49, 168, 363].
По данным ВОЗ, пневмококковые инфекции являютсянаиболее распространенной причиной детской заболеваемости и смертности вмире, вызывая около 0,7-1 млн смертей ежегодно у детей младше 5 лет [11].Пиогенный стрептококк является возбудителем инфекционных пораженийверхних дыхательных путей (тонзиллофарингиты, отиты), кожи и мягких тканей(пиодермия, импетиго рожистое воспаление, некротический фасциит) и служитпричиной скарлатины, эндокардита, гнойного артрита, остеомиелита, омфалита итяжелых генерализованных процессов с синдромом токсического шока [14, 53,9117].
Наблюдения последних лет показали возрастание (до 22%) роли S. pyogenesв этиологии острого отита у детей и особенно его тяжелых форм (до 47%) [30, 57].Для лечения стрептококковых инфекций в течение долгого времени суспехом применялись препараты пенициллинового ряда. Однако за последние 30лет во всем мире наблюдается неблагоприятная тенденция возрастанияустойчивости пневмококков к β-лактамным антибиотикам (S. pyogenes сохраняетполную чувствительность к пенициллину). В зависимости от региона, долянечувствительных к пенициллину изолятов колеблется от 5 до 50%, а появлениепневмококков, обладающих МЛУ, вызывает большую обеспокоенность [7, 26, 36,38, 58, 246, 316, 352]. В качестве альтернативы β-лактамам при респираторныхинфекциях широкую популярность, в том числе в педиатрической практике,приобрелипрепаратыизгруппымакролидныхантибиотиков.Массовоеиспользование макролидов, зачастую неадекватное и/или необоснованное, быстропривело к появлению устойчивых форм пневмококков и S.
pyogenes. В настоящеевремя резистентность к макролидам у стрептококков в различных регионах мираварьирует от 5-10% до 100%, как это наблюдается в ряде стран Юго-ВосточнойАзии [352]. Российские данные по стрептококковой резистентности имеютсущественные региональные различия, что требует проведения регулярнойоценкиместныхособенностейпрофиляантибиотикочувствительностииопределения механизмов устойчивости.Внедрение в практику вакцинации пневмококковыми конъюгированнымивакцинами (ПКВ), охватывающими от 7 до 13 серотипов пневмококков, ожидаемовывело из циркуляции бактерии, обладающие вакцинными серотипами [56, 321,377].
Вместе с этим резко снизилась заболеваемость ИПИ, которые былиассоциированы преимущественно с этими серотипами. В то же время, ПКВоказали выраженное влияние на структуру пневмококковой популяции, в которойпоявились невакцинные серотипы и выросла доля ранее редких генетическихлиний (клонов). В первую очередь это относилось к не-ПКВ7 серотипу 19А и егоклонуST320[103,194].СложившуюсяситуациюобъяснялиПКВ-опосредованным феноменом замещения серотипов, то есть экспансией ранее10существовавших минорных популяций пневмококка с не-ПКВ7 серотипами поддавлением вакцины.
Однако ПКВ7-независимое увеличение частоты 19Апневмококков, наблюдавшееся в ряде стран, указывает на то, что на клональнуюэволюцию пневмококков может влиять не только тип капсульного полисахарида,но и другие бактериальные факторы, в частности, устойчивость к антибиотикам.Вакцинация ПКВ была введена в Российский национальный календарьпрофилактических прививок в 2014 году [62]. В связи с этим мониторингсеротипового состава пневмококковой популяции и отслеживание ее клональнойструктуры является актуальной задачей.Актуальные данные о частоте и механизмах резистентности конкретноговида возбудителя инфекционного процесса лежат в основе эффективностиантибактериальной терапии.
В связи с этим изучение приоритетных патогенов сиспользованием микробиологических и молекулярно-генетических методов,нацеленное на определение распространенности и механизмов устойчивости кантибиотикам,характеристикугенетическойструктурыбактериальныхпопуляций, будет способствовать рациональному выбору антимикробныхпрепаратов и разработке мер по преодолению устойчивости.Степень разработанности темы исследованияВотечественнойимировойлитературепроблемамантибиотикорезистентности уделяется серьезное внимание. Так, недавно былиопубликованы результаты многоцентрового исследования МАРАФОН, в которомпредставлены данные о динамике устойчивости грамотрицательных патогенов в2013-2014 гг.
в более чем 20 городах России [90, 83, 82]. Отдельные публикациидополнительноописываютчастотуантибиотикорезистентностивСанкт-Петербурге [2, 48] и Москве [19, 44]. Кроме того, исследуется эпидемиологиямеханизмов резистентности, в первую очередь характеристики бета-лактамаз [90,83, 82, 2, 48, 44, 65, 179].11Изучение серотипового пейзажа пневмококков в России проводилось сконца 1980-х гг.
[32] и получило новый импульс накануне включения вакцинацииПКВвНациональныйкалендарьиммунизации.Былпроведенрядмногоцентровых исследований, которые показали серологические особенностиинвазивных изолятов пневмококков и штаммов, выделенных от носителей [11, 17,35, 50].Анализ резистентности стрептококков, в первую очередь пневмококков и S.pyogenes, стал темой ряда публикаций последнего десятилетия. Полученныеданные свидетельствуют о выраженной региональной вариабельности уровнярезистентности пневмококков к основным группам антибиотиков, используемыхв педиатрической практике, но в целом отмечают неблагоприятную тенденциюнарастания устойчивости и расширения ее географии [7, 26, 33].
Несмотря на то,что S. pyogenes сохраняет абсолютную чувствительность к β-лактамнымантибиотикам, актуальной проблемой является появление у этого патогенаустойчивости к макролидам, которая в некоторых регионах мира превышает 30%.Исследования, проведенные в нашей стране, свидетельствуют об умереннойрезистентности S.
pyogenes к этой группе антибиотиков, однако регистрируетсяпостепенное возрастание доли устойчивых к макролидам изолятов [5, 76, 22].Методымолекулярнойэпидемиологииприобретаютвсебольшуюзначимость для изучения бактериальных популяций. При помощи МЛСТ былопоказано, что многие из них построены по клональному принципу, и лишь вотдельных,немногочисленных клонахсосредоточивается основное числорезистентных изолятов. Это оказалось справедливо для приоритетных патогенов,включая Enterobacteriaceae spp., A. baumannii, P.
aeruginosa и S. pneumoniae, араспространение некоторых успешных клоновс МЛУ-фенотипом носитглобальный характер [383, 246]. В отечественной литературе эта тема получилаосвещение лишь в редких исследованиях [7, 2, 72, 162].12Цель исследованияЦельисследования–датьмикробиологическуюимолекулярно-генетическую характеристику внебольничных и госпитальных штаммов условнопатогенных бактерий, выделенных у детей, определить механизмы устойчивостик антибиотикам в этой группе микробов для обеспечения рациональногоприменения антимикробных препаратов в педиатрической практике.Задачи исследования:1.
Охарактеризовать микробиоту клинически значимых локусов у детей,находящихся в реанимационных отделениях, и оценить ее динамику.2. Дать характеристику антибиотикочувствительности госпитальных изолятовA. baumannii, K. pneumoniae, P. aeruginosa.3. Описать клональное разнообразие и молекулярно-генетические механизмыустойчивости к карбапенемам у карбапенемрезистентных изолятов A.baumannii, K. pneumoniae, P. aeruginosa.4. Определить спектр серотипов носоглоточных изолятов S. pneumoniae,выделенных у детей, и описать его динамику.5. Оценить профиль чувствительности к антибиотикам и его динамику уизолятов S.
pneumoniae и S. pyogenes.6. Описать клональную эволюцию S. pneumoniae серотипов 14 и 19А в призмеих чувствительности к антибиотикам.Научная новизнаОпределена динамика колонизации слизистых оболочек респираторноготракта у детей, находящихся на искусственной вентиляции легких. Впервыепоказано, что грамотрицательная госпитальная микробиота быстро колонизирует13поступающих в ОРИТ пациентов и отличается высокой резистентностью косновнымантибактериальнымпрепаратам,втомчислекарбапенемам.Доминирующими представителями микробиоты, выделенными из трахеальногоаспирата, были A.
baumannii, K. pneumoniae и P. aeruginosa.Впервые установлены доминантные клоны карбапенемрезистентных (карбаР) А. baumannii, включавшие распространенный по всему миру СС92Oxf/СС2Pas иСС944Oxf/ST78Pas, который может оказаться эндемичным не только длямосковского региона, но и для России в целом.Впервые исследован биопленочный рост карба-Р А. baumannii. Былопоказано, что биопленочный потенциал выше у изолятов СС92 Oxf по сравнению сСС944Oxf и другими клонами: высокой способностью к образованию биопленокобладало 95% исследованных представителей СС92Oxf.Получены новые данные о распространенности β-лактамаз у карба-Ризолятов А.