Автореферат (1139570), страница 3
Текст из файла (страница 3)
Установлена связь между ростом резистентности пневмококковсеротипа 14 к пенициллину и макролидам с клональными перестановками в циркулирующейпопуляции этих бактерий.В международных базах данных МЛСТ A. baumannii, K. pneumoniae, P. aeruginosa и S.pneumoniae аннотированы 43 новых сиквенс-типа и 14 новых аллелей генов «домашнегохозяйства».Теоретическая и практическая значимость работыВыявленные особенности микробиоты и знания о распространенности устойчивых кантибиотикамгоспитальныхизолятовграмотрицательныхбактерийвпедиатрическихстационарах позволяют уточнить спектр препаратов, используемых для эмпирическойантимикробной терапии, и будут способствовать повышению ее эффективности.
Данные одинамикеколонизацииобосновываютвнедрениемеринфекционногоконтроляпригоспитализации пациентов в ОРИТ.Полученные данные о генетических механизмах устойчивости к антибиотикам у ведущихгоспитальныхоппортунистическихпатогеноввпедиатрическихстационарахвносятфундаментальный вклад в понимание природы резистентности грамотрицательных бактерий, атакже обосновывают значимость использования молекулярных методов для ее детекции.Исследованиепопуляционнойструктурыгенотиповкарба-Ризолятовосновныхвозбудителей ИСМП при помощи метода МЛСТ позволило установить их взаимосвязь смеждународными клонами высокого эпидемического риска, а также выявить эндемичные клоны.Сведения о современном спектре серотипов S. pneumoniae свидетельствуют о его высокомохватесуществующимиПКВ,чтопозволяетпрогнозироватьэффективностьсеротипспецифической вакцинации.Полученные данные о разнообразии генотипов S.
pneumoniae и его динамике вскрываютзакономерности эволюции генетической структуры пневмококковой популяции и указывают нато, что одним из важных факторов этой эволюции является устойчивость к антибиотикам.11Нарастание устойчивости S. pneumoniae к пенициллину и макролидам обосновываетнеобходимость динамического наблюдения за их популяцией. Доминирующий механизмрезистентности S. pneumoniae и S.
pyogenes к макролидам, а именно ermB-опосредованноеметилирование мишени антибиотика, предопределяет перекрестную устойчивость ко всеммакролидам, в том числе 16-членным, линкозамидам и стрептограмину В, что не позволяетрекомендовать указанные группы антибиотиков для эмпирической терапии инфекций в детскойпопуляции. Сохранение на высоком уровне активности амоксициллина в отношении S.pneumoniae подтверждает обоснованность выбора данного препарата и его модификаций вкачестве основы эмпирической терапии острых респираторных инфекций бактериальнойэтиологии в педиатрии.По результатам исследования в международные базы данных внесены сведения о новыхвариантах генотипов бактерий A.
baumannii, K. pneumoniae, P. aeruginosa и S. pneumoniae,которые будут способствовать осуществлению мониторинга за циркуляцией актуальныхбактериальных возбудителей.Результаты исследований и разработок внедрены в научно-исследовательскую работулаборатории молекулярной генетики и клеточной биологии и лаборатории микробиологии ФГАУ«НМИЦ здоровья детей» Минздрава России, а также в материалы лекций по рациональнойантибактериальной терапии у детей, и используются в учебной программе на кафедре педиатриив ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет).Методология и методы исследованияМетодология настоящего исследования спланирована согласно поставленной цели.Предметом исследования стали проблемы, связанные с увеличением антибиотикоустойчивостиклинических штаммов A.
baumannii, P. aeruginosa и K. pneumoniae, выделенных у детей. Крометого, были проанализированы серотипы и профиль чувствительности к антибиотикам штаммов S.pneumoniae и S. pyogenes, выделенных у детей в г. Москве.Анализ научной литературы, посвященной проблеме, проведен на основе формальнологических методов исследования. Планирование и проведение исследований, направленных нарешение поставленных задач, осуществлялось на основе общенаучных и специфических методов.Основные положения, выносимые на защиту1. В педиатрических ОРИТ выявлено преобладание грамотрицательных возбудителей A.baumannii, P. aeruginosa, K. pneumoniae.122. Устойчивостьккарбапенемамграмотрицательныхбактерийпреимущественнообусловлена выработкой карбапенемаз: A. baumannii – продукция OXA-72, ОХА-23, P.aeruginosa – VIM, K. pneumoniae – ОХА-48.3. Подавляющее большинство изолятов A. baumannii принадлежит к двум клональнымлиниям, СС92Oxf/СС2Pas и СС944Oxf/ST78Pas, представленным 14 различными Oxfordсиквенс-типами.4.
В популяционной структуре карба-Р изолятов P. aeruginosa лидировали представителипяти сиквенс-типов: ST111, ST235, ST446, ST654 и ST2592, которые суммарно составляли78%.5. Шесть ведущих педиатрических серотипов S. pneumoniae, включая серотипы 3, 6А, 6В, 14,19F и 23F, суммарно составили 63%. Множественной устойчивостью к антибиотикамобладают 23% циркулирующих в Москве штаммов S. pneumoniae. Основная долярезистентных изолятов приходилась на пневмококки пяти наиболее распространенныхсеротипов (6А, 6В, 14, 19F и 23F) и серотипа 19А.6. В последние годы произошло нарастание устойчивости стрептококков к макролидам: S.pneumoniae до 35-45%, S.
pyogenes до 15%.Личное участие автора в получении результатовЛичное участие соискателя в получении результатов, изложенных в диссертации,заключалось в проведении микробиологической части исследования (культуральный посев,идентификациямикроорганизмов,определениерезистентностикантибиотикамдиско-диффузионным методом и методом Е-тестов, определение минимальных подавляющихконцентраций меропенема и имипенема, фенотипические методы определения МБЛ уграмотрицательных бактерий и MLSв-фенотип у стрептококков) в лаборатории микробиологииФГАУ «НМИЦ здоровья детей» Минздрава России.Молекулярно-генетическая часть исследования (выделение ДНК, постановка ПЦР, учет иинтерпретация результатов ПЦР) осуществлялось автором совместно со старшим научнымсотрудником к.м.н. Алябьевой Н.М.
в лаборатории экспериментальной иммунологии ивирусологии ФГАУ «НМИЦ здоровья детей» Минздрава России. Секвенирование культур A.baumannii, P. aeruginosa, K. pneumoniae, S. pneumoniae проводилось совместно с к.б.н. ПушковымА.А. в лаборатории молекулярной генетики и клеточной биологии ФГАУ «НМИЦ здоровьядетей» Минздрава России. Выявление генов карбапенемаз проводилось совместно с к.б.н.Савиновой Т.А. (лаборатория молекулярной микробиологии ФГАУ «НМИЦ здоровья детей»13Минздрава России). Биоинформатическая обработка результатов (генетических исследований)проводилась совместно с Маянским Н.А.
(ФГАУ «НМИЦ здоровья детей» Минздрава России),Карасевой О.В. «НИИ неотложной детской хирургии и травматологии» Департаментаздравоохранения города Москвы).Внедрение результатов в практикуРезультатыисследованийвкачестведиагностическихтехнологийвнедренывпрактическую работу подразделений ФГАУ «НМИЦ здоровья детей» Минздрава России, «НИИнеотложной детской хирургии и травматологии» Департамента здравоохранения города Москвы,ГБУЗ«Городская клиническаябольница № 15 им.О.М.Филатова» Департаментаздравоохранения города Москвы.Степень достоверности и апробация результатов исследованияО достоверности результатов работы свидетельствует использование сертифицированныхмикробиологических методов, которые характеризуются высокой чувствительностью испецифичностью.
Проведен достаточный объем исследований, что позволило корректноосуществить статистическую обработку полученных данных. Комплексное молекулярногенетическое определение генов β-лактамаз позволило получить сопоставимые результаты страдиционными микробиологическими методами оценки чувствительности, что свидетельствуето достоверности полученных результатов.Диссертация апробирована на заседании лабораторного отдела НИИ педиатрии ФГАУ«НМИЦ здоровья детей» Минздрава России (протокол № 4 от 22.12.2017г.).Материалы диссертации были доложены и обсуждены на XVII, XVIII, XIX Конгрессепедиатров России, Москва, 2014, 2015, 2016; на XVI, XVII, XVIII, XIX, XX Международныхконгрессах по антимикробной терапии МАКМАХ/ESCMID, Москва, 2014, 2015, 2016, 2017; на 26(Амстердам, 2016), 27 (Вена, 2017), 28 (Мадрид, 2018) Европейском конгрессе по клиническоймикробиологии и инфекционным заболеваниям (ECCMID); на XIX, XX Кашкинских чтениях,Санкт-Петербург, 2016, 2017.Соответствие диссертации паспорту научной специальностиНаучные положения диссертации соответствуют формуле специальности 03.02.03 –«микробиология», области исследований «Морфология, физиология, биохимия и генетикамикроорганизмов».14ПубликацииРезультаты проведенного диссертационного исследования в полном объеме изложены в 22научных работах.